FuNGI

A0A550CSH1

Protein Details

Accession

A0A550CSH1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1015-1044	YREEVSGKKSPQKRQSPRKPTSPRKDGSSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1022-1039	KKSPQKRQSPRKPTSPRK

Subcellular Location(s)

mito 11, cyto 8.5, cyto_nucl 8, nucl 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MVNRSRPSGSRAPPDTSCAVALPVDSERLAAPDFGPPKDSSLDSIGGGTQSSIWEGDDDFKSFALQMPSTQDTAPNSQATDPPDSAEGSCASLVALGKRKSITSSPQRPTKVPRLDSDQNVFLEVTPNIADPHAPFVVSSNERLESILRAKHVPYGSQWEMAYLLSTGQLKSDEIEIEHVVELGRYKTNASAVPVTAYILSKGRIDAGLNARSTSSPEQLAKLPYAEQDKEEAMLAKNEHAALGFNEDDPSWFGGKIHYTARIKETGSRSNPFTVVLRRPELGVSSQFYRRYGSASFLTVRLSKGISGDRGNGEAIDVFVRRPLIVLGRVFRTVRRADDSFIYFRTNELFVGDSVSPNQTISGAPSFWDFFNAQNPLTHNTAQTMGKWSTRIALGFSTSVPGCVVKKRNVFKTDDVVSKEGSDMTDGAGFMNKATARALRDVAGCRDVPTAAQVRIDGAKGLLILHPDDASEEPRVWLRPSQRKICYADGEQDRSTLIVNLLRTSKTRTVCRLSVETVIIMAENRVKCDAFKALFEESVSSIYEPLLDWDGENAMQRLYAAVNSLGGVVAARAARQDVQRARLHGHVDRHSEVLDDADEETTYEETTDDAVVDGADTPYAIAGWEDPTSGCPAMPAEIVCMMLQAGFRPQECDFLRERLQTFTRTFTSRSIQRMRIDVMHSFSAWIVPDPTSSLQPNEMYFRSSSRDLIGLDGAPTDQVLGPALITRNPCKLPTDVQKWTFVDKPELRHLLDVIVLPVTGKRRPADFLGGGDYDGDKGTVYFDPTLVEHFKNASPCYADEPASLAYEFDSDVEKVTPFLERTSNMTPDERRIELQKFLLPRPHFAVATYSKLHLFSTIKQGTRANESVRFAYKFTKSLDGPKVGVTVKPDVLAKDSRDRKWACRLPAWKEAIDEKEEVNNNNPRCTRPKEIAAKLGPFVMDELHKHSRKLDAERISKIQQFYEALPKSEVDDDLTSPWREAEGRAARMRNEGGASLMEDELERIREHVAQVHREYREEVSGKKSPQKRQSPRKPTSPRKDGSSSFWKMPPEYIQRRLRAHSIKFGSAPLGLLTMSAEEVVRVRASYAYQYAWEPTKKTTKEQTEEQTKDPSFPWRVAMAALCDIKAKARGPTTFTTMTTDFADNMRMRKFASK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.53
3	0.45
4	0.39
5	0.29
6	0.25
7	0.2
8	0.18
9	0.15
10	0.14
11	0.14
12	0.13
13	0.13
14	0.12
15	0.14
16	0.15
17	0.13
18	0.12
19	0.18
20	0.22
21	0.22
22	0.25
23	0.24
24	0.26
25	0.28
26	0.29
27	0.24
28	0.25
29	0.26
30	0.22
31	0.22
32	0.2
33	0.17
34	0.16
35	0.13
36	0.1
37	0.08
38	0.09
39	0.09
40	0.08
41	0.09
42	0.1
43	0.15
44	0.16
45	0.18
46	0.18
47	0.17
48	0.18
49	0.17
50	0.2
51	0.2
52	0.18
53	0.18
54	0.24
55	0.27
56	0.28
57	0.28
58	0.27
59	0.26
60	0.31
61	0.32
62	0.28
63	0.26
64	0.27
65	0.3
66	0.3
67	0.32
68	0.28
69	0.25
70	0.25
71	0.25
72	0.24
73	0.22
74	0.19
75	0.15
76	0.14
77	0.12
78	0.11
79	0.12
80	0.13
81	0.16
82	0.24
83	0.23
84	0.27
85	0.28
86	0.29
87	0.31
88	0.35
89	0.4
90	0.43
91	0.52
92	0.57
93	0.64
94	0.68
95	0.69
96	0.72
97	0.73
98	0.71
99	0.65
100	0.63
101	0.63
102	0.66
103	0.68
104	0.64
105	0.59
106	0.49
107	0.46
108	0.41
109	0.32
110	0.28
111	0.21
112	0.17
113	0.13
114	0.13
115	0.12
116	0.12
117	0.13
118	0.11
119	0.16
120	0.15
121	0.14
122	0.13
123	0.14
124	0.22
125	0.22
126	0.24
127	0.22
128	0.22
129	0.23
130	0.24
131	0.23
132	0.2
133	0.24
134	0.25
135	0.24
136	0.25
137	0.26
138	0.31
139	0.32
140	0.29
141	0.27
142	0.33
143	0.33
144	0.34
145	0.33
146	0.27
147	0.26
148	0.24
149	0.21
150	0.12
151	0.1
152	0.09
153	0.11
154	0.1
155	0.1
156	0.11
157	0.11
158	0.12
159	0.14
160	0.12
161	0.12
162	0.15
163	0.14
164	0.14
165	0.14
166	0.13
167	0.11
168	0.11
169	0.11
170	0.11
171	0.12
172	0.11
173	0.12
174	0.14
175	0.17
176	0.18
177	0.21
178	0.22
179	0.2
180	0.21
181	0.21
182	0.2
183	0.18
184	0.16
185	0.14
186	0.13
187	0.14
188	0.13
189	0.13
190	0.14
191	0.13
192	0.14
193	0.18
194	0.23
195	0.27
196	0.27
197	0.27
198	0.26
199	0.25
200	0.29
201	0.26
202	0.22
203	0.22
204	0.23
205	0.25
206	0.28
207	0.3
208	0.26
209	0.24
210	0.22
211	0.22
212	0.27
213	0.25
214	0.23
215	0.23
216	0.22
217	0.22
218	0.22
219	0.2
220	0.15
221	0.17
222	0.17
223	0.15
224	0.16
225	0.16
226	0.15
227	0.13
228	0.13
229	0.1
230	0.13
231	0.12
232	0.11
233	0.12
234	0.12
235	0.12
236	0.13
237	0.15
238	0.12
239	0.11
240	0.11
241	0.13
242	0.15
243	0.17
244	0.18
245	0.24
246	0.25
247	0.27
248	0.31
249	0.32
250	0.31
251	0.36
252	0.39
253	0.4
254	0.44
255	0.44
256	0.44
257	0.43
258	0.42
259	0.36
260	0.34
261	0.32
262	0.33
263	0.34
264	0.34
265	0.32
266	0.32
267	0.31
268	0.29
269	0.25
270	0.22
271	0.2
272	0.21
273	0.25
274	0.26
275	0.26
276	0.27
277	0.24
278	0.24
279	0.22
280	0.23
281	0.2
282	0.21
283	0.22
284	0.2
285	0.22
286	0.2
287	0.2
288	0.17
289	0.16
290	0.13
291	0.15
292	0.17
293	0.18
294	0.18
295	0.21
296	0.21
297	0.21
298	0.21
299	0.18
300	0.15
301	0.12
302	0.1
303	0.09
304	0.08
305	0.07
306	0.08
307	0.09
308	0.08
309	0.09
310	0.09
311	0.11
312	0.14
313	0.17
314	0.18
315	0.2
316	0.23
317	0.23
318	0.24
319	0.26
320	0.25
321	0.26
322	0.29
323	0.28
324	0.27
325	0.31
326	0.34
327	0.3
328	0.29
329	0.28
330	0.22
331	0.21
332	0.21
333	0.17
334	0.13
335	0.12
336	0.12
337	0.09
338	0.13
339	0.13
340	0.11
341	0.11
342	0.12
343	0.12
344	0.1
345	0.11
346	0.08
347	0.08
348	0.1
349	0.11
350	0.1
351	0.1
352	0.11
353	0.12
354	0.11
355	0.14
356	0.12
357	0.11
358	0.17
359	0.18
360	0.17
361	0.18
362	0.2
363	0.21
364	0.24
365	0.24
366	0.19
367	0.18
368	0.21
369	0.19
370	0.18
371	0.21
372	0.19
373	0.19
374	0.2
375	0.19
376	0.17
377	0.18
378	0.17
379	0.13
380	0.12
381	0.12
382	0.12
383	0.12
384	0.12
385	0.1
386	0.1
387	0.09
388	0.1
389	0.1
390	0.16
391	0.21
392	0.25
393	0.33
394	0.39
395	0.47
396	0.5
397	0.53
398	0.5
399	0.52
400	0.5
401	0.47
402	0.43
403	0.37
404	0.32
405	0.28
406	0.25
407	0.19
408	0.14
409	0.1
410	0.07
411	0.07
412	0.08
413	0.07
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.06
418	0.09
419	0.08
420	0.08
421	0.09
422	0.11
423	0.12
424	0.14
425	0.15
426	0.14
427	0.17
428	0.19
429	0.2
430	0.2
431	0.18
432	0.17
433	0.17
434	0.15
435	0.13
436	0.14
437	0.15
438	0.13
439	0.14
440	0.12
441	0.13
442	0.14
443	0.14
444	0.1
445	0.07
446	0.07
447	0.06
448	0.07
449	0.06
450	0.06
451	0.07
452	0.07
453	0.07
454	0.06
455	0.07
456	0.08
457	0.09
458	0.09
459	0.09
460	0.09
461	0.11
462	0.12
463	0.12
464	0.16
465	0.23
466	0.31
467	0.38
468	0.46
469	0.48
470	0.52
471	0.55
472	0.55
473	0.5
474	0.42
475	0.44
476	0.39
477	0.4
478	0.34
479	0.3
480	0.26
481	0.22
482	0.21
483	0.13
484	0.1
485	0.08
486	0.08
487	0.1
488	0.11
489	0.12
490	0.13
491	0.17
492	0.22
493	0.24
494	0.28
495	0.32
496	0.36
497	0.37
498	0.4
499	0.37
500	0.33
501	0.31
502	0.27
503	0.21
504	0.16
505	0.14
506	0.1
507	0.08
508	0.06
509	0.09
510	0.08
511	0.09
512	0.1
513	0.1
514	0.1
515	0.12
516	0.16
517	0.13
518	0.13
519	0.15
520	0.15
521	0.15
522	0.15
523	0.14
524	0.1
525	0.11
526	0.1
527	0.07
528	0.07
529	0.06
530	0.06
531	0.05
532	0.06
533	0.06
534	0.06
535	0.06
536	0.06
537	0.06
538	0.06
539	0.07
540	0.06
541	0.05
542	0.05
543	0.05
544	0.05
545	0.05
546	0.04
547	0.05
548	0.04
549	0.04
550	0.05
551	0.05
552	0.04
553	0.04
554	0.03
555	0.03
556	0.04
557	0.04
558	0.04
559	0.04
560	0.05
561	0.07
562	0.08
563	0.14
564	0.15
565	0.21
566	0.23
567	0.24
568	0.26
569	0.27
570	0.29
571	0.27
572	0.3
573	0.28
574	0.3
575	0.3
576	0.28
577	0.25
578	0.22
579	0.19
580	0.14
581	0.1
582	0.06
583	0.06
584	0.05
585	0.05
586	0.05
587	0.06
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.04
592	0.04
593	0.05
594	0.05
595	0.04
596	0.04
597	0.04
598	0.04
599	0.04
600	0.04
601	0.03
602	0.03
603	0.03
604	0.03
605	0.03
606	0.03
607	0.03
608	0.02
609	0.03
610	0.04
611	0.05
612	0.05
613	0.05
614	0.06
615	0.08
616	0.08
617	0.07
618	0.06
619	0.06
620	0.07
621	0.07
622	0.07
623	0.06
624	0.06
625	0.07
626	0.06
627	0.06
628	0.05
629	0.05
630	0.05
631	0.05
632	0.07
633	0.07
634	0.08
635	0.1
636	0.11
637	0.17
638	0.18
639	0.22
640	0.21
641	0.24
642	0.28
643	0.28
644	0.29
645	0.26
646	0.27
647	0.28
648	0.27
649	0.26
650	0.26
651	0.25
652	0.25
653	0.24
654	0.28
655	0.28
656	0.34
657	0.37
658	0.39
659	0.39
660	0.4
661	0.39
662	0.37
663	0.34
664	0.29
665	0.25
666	0.21
667	0.19
668	0.16
669	0.14
670	0.12
671	0.1
672	0.09
673	0.07
674	0.07
675	0.07
676	0.09
677	0.1
678	0.11
679	0.12
680	0.12
681	0.13
682	0.14
683	0.15
684	0.16
685	0.15
686	0.15
687	0.15
688	0.15
689	0.17
690	0.17
691	0.17
692	0.15
693	0.16
694	0.15
695	0.15
696	0.15
697	0.11
698	0.1
699	0.09
700	0.08
701	0.06
702	0.05
703	0.05
704	0.04
705	0.04
706	0.05
707	0.04
708	0.04
709	0.06
710	0.07
711	0.09
712	0.11
713	0.13
714	0.17
715	0.18
716	0.19
717	0.2
718	0.22
719	0.26
720	0.33
721	0.39
722	0.41
723	0.42
724	0.47
725	0.45
726	0.47
727	0.43
728	0.35
729	0.37
730	0.33
731	0.35
732	0.37
733	0.39
734	0.36
735	0.34
736	0.32
737	0.24
738	0.22
739	0.18
740	0.11
741	0.08
742	0.07
743	0.07
744	0.08
745	0.11
746	0.11
747	0.14
748	0.15
749	0.16
750	0.19
751	0.21
752	0.25
753	0.23
754	0.23
755	0.23
756	0.22
757	0.2
758	0.18
759	0.16
760	0.1
761	0.09
762	0.08
763	0.05
764	0.05
765	0.07
766	0.07
767	0.09
768	0.09
769	0.09
770	0.1
771	0.1
772	0.14
773	0.14
774	0.14
775	0.13
776	0.15
777	0.17
778	0.19
779	0.2
780	0.18
781	0.17
782	0.17
783	0.22
784	0.22
785	0.21
786	0.17
787	0.19
788	0.18
789	0.17
790	0.16
791	0.11
792	0.09
793	0.09
794	0.09
795	0.07
796	0.08
797	0.07
798	0.08
799	0.09
800	0.09
801	0.09
802	0.09
803	0.11
804	0.1
805	0.12
806	0.13
807	0.14
808	0.19
809	0.23
810	0.25
811	0.25
812	0.28
813	0.28
814	0.31
815	0.34
816	0.3
817	0.28
818	0.3
819	0.3
820	0.3
821	0.3
822	0.29
823	0.28
824	0.3
825	0.36
826	0.32
827	0.33
828	0.34
829	0.35
830	0.31
831	0.28
832	0.32
833	0.27
834	0.3
835	0.29
836	0.25
837	0.23
838	0.23
839	0.23
840	0.21
841	0.2
842	0.18
843	0.27
844	0.31
845	0.31
846	0.33
847	0.36
848	0.34
849	0.39
850	0.39
851	0.33
852	0.33
853	0.34
854	0.35
855	0.36
856	0.35
857	0.29
858	0.32
859	0.31
860	0.29
861	0.3
862	0.33
863	0.3
864	0.37
865	0.42
866	0.39
867	0.37
868	0.35
869	0.36
870	0.3
871	0.3
872	0.25
873	0.23
874	0.2
875	0.21
876	0.21
877	0.18
878	0.21
879	0.24
880	0.24
881	0.3
882	0.37
883	0.38
884	0.45
885	0.48
886	0.49
887	0.56
888	0.6
889	0.55
890	0.57
891	0.62
892	0.6
893	0.65
894	0.64
895	0.55
896	0.5
897	0.5
898	0.44
899	0.4
900	0.34
901	0.26
902	0.29
903	0.3
904	0.29
905	0.31
906	0.35
907	0.34
908	0.4
909	0.4
910	0.38
911	0.43
912	0.48
913	0.48
914	0.46
915	0.54
916	0.57
917	0.6
918	0.65
919	0.63
920	0.58
921	0.52
922	0.47
923	0.37
924	0.27
925	0.23
926	0.16
927	0.13
928	0.12
929	0.19
930	0.27
931	0.29
932	0.29
933	0.31
934	0.37
935	0.41
936	0.47
937	0.48
938	0.49
939	0.53
940	0.58
941	0.61
942	0.58
943	0.56
944	0.5
945	0.42
946	0.36
947	0.32
948	0.3
949	0.35
950	0.32
951	0.29
952	0.29
953	0.28
954	0.27
955	0.27
956	0.25
957	0.18
958	0.18
959	0.17
960	0.19
961	0.23
962	0.21
963	0.2
964	0.19
965	0.17
966	0.16
967	0.16
968	0.23
969	0.26
970	0.32
971	0.38
972	0.4
973	0.4
974	0.43
975	0.43
976	0.36
977	0.29
978	0.24
979	0.19
980	0.17
981	0.17
982	0.14
983	0.13
984	0.11
985	0.09
986	0.1
987	0.1
988	0.11
989	0.1
990	0.09
991	0.11
992	0.13
993	0.14
994	0.2
995	0.25
996	0.3
997	0.35
998	0.42
999	0.42
1000	0.41
1001	0.43
1002	0.38
1003	0.4
1004	0.36
1005	0.34
1006	0.34
1007	0.39
1008	0.42
1009	0.49
1010	0.54
1011	0.57
1012	0.64
1013	0.73
1014	0.76
1015	0.81
1016	0.88
1017	0.9
1018	0.9
1019	0.91
1020	0.92
1021	0.92
1022	0.92
1023	0.9
1024	0.84
1025	0.8
1026	0.8
1027	0.72
1028	0.69
1029	0.68
1030	0.62
1031	0.56
1032	0.55
1033	0.51
1034	0.45
1035	0.45
1036	0.46
1037	0.46
1038	0.49
1039	0.54
1040	0.59
1041	0.63
1042	0.67
1043	0.68
1044	0.68
1045	0.67
1046	0.63
1047	0.64
1048	0.6
1049	0.57
1050	0.53
1051	0.5
1052	0.42
1053	0.33
1054	0.29
1055	0.2
1056	0.15
1057	0.11
1058	0.1
1059	0.09
1060	0.08
1061	0.07
1062	0.07
1063	0.06
1064	0.06
1065	0.07
1066	0.09
1067	0.09
1068	0.09
1069	0.1
1070	0.11
1071	0.13
1072	0.17
1073	0.19
1074	0.18
1075	0.19
1076	0.21
1077	0.24
1078	0.29
1079	0.31
1080	0.29
1081	0.33
1082	0.42
1083	0.43
1084	0.49
1085	0.56
1086	0.59
1087	0.62
1088	0.68
1089	0.72
1090	0.72
1091	0.74
1092	0.69
1093	0.68
1094	0.59
1095	0.55
1096	0.48
1097	0.47
1098	0.4
1099	0.37
1100	0.38
1101	0.3
1102	0.3
1103	0.29
1104	0.3
1105	0.24
1106	0.26
1107	0.26
1108	0.22
1109	0.23
1110	0.22
1111	0.23
1112	0.26
1113	0.25
1114	0.26
1115	0.32
1116	0.35
1117	0.39
1118	0.43
1119	0.47
1120	0.45
1121	0.44
1122	0.43
1123	0.37
1124	0.36
1125	0.33
1126	0.3
1127	0.24
1128	0.22
1129	0.28
1130	0.25
1131	0.29
1132	0.29
1133	0.27

A0A550CSH1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer