Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CJT9

Protein Details
Accession A0A550CJT9    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-50QVQAVLKERKRKEAERRKQQEERDRKERELBasic
95-114LHGLKKAPPAHKKNRFLEEDBasic
314-336SEEDYPKPRKRRPLDEDEKAKKLBasic
387-410AAEQERRHEEEKRRRRMKEKRGKVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-108KERKRKEAERRKQQEERDRKERELEKARIQRKLEEDRREQERIKRREEEQRAKEAARLKREEEAREQALHGLKKAPPAHKKN
136-137RK
143-144RR
150-151KS
322-325RKRR
393-410RHEEEKRRRRMKEKRGKV
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MTSFADLLQLANTQTQQAESQVQAVLKERKRKEAERRKQQEERDRKERELEKARIQRKLEEDRREQERIKRREEEQRAKEAARLKREEEAREQALHGLKKAPPAHKKNRFLEEDEAHASTSRSSSVPLTREEKRERKIQAELRRAFALPKSAKRAGGYSKYGARLPGGAMDIIDNGDQAGAPGMSTKQRLLSGPIGLTKLNQNKRDTRTTAEIIEAHQQQAHALNGEEARHFDDWFGNKKESRSPSAAGTPARPALPSFKKSTSSSLPSQPSGKSAMSSSKPRPSQPKPSTSSVARISKSTKRPRSLTPSDYDSEEDYPKPRKRRPLDEDEKAKKLSQEIWGLFGKNRDRYVGQDVESDDDMEADAMALEREEKRSMRLARQEDIEAAEQERRHEEEKRRRRMKEKRGKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.15
3 0.15
4 0.16
5 0.19
6 0.17
7 0.19
8 0.2
9 0.2
10 0.2
11 0.27
12 0.33
13 0.36
14 0.46
15 0.47
16 0.54
17 0.62
18 0.7
19 0.74
20 0.76
21 0.81
22 0.83
23 0.88
24 0.88
25 0.88
26 0.88
27 0.88
28 0.88
29 0.86
30 0.85
31 0.81
32 0.75
33 0.76
34 0.72
35 0.71
36 0.7
37 0.67
38 0.67
39 0.71
40 0.74
41 0.73
42 0.69
43 0.65
44 0.64
45 0.68
46 0.67
47 0.66
48 0.68
49 0.68
50 0.72
51 0.71
52 0.68
53 0.66
54 0.68
55 0.66
56 0.66
57 0.64
58 0.64
59 0.68
60 0.74
61 0.76
62 0.72
63 0.73
64 0.7
65 0.65
66 0.63
67 0.6
68 0.56
69 0.54
70 0.51
71 0.44
72 0.47
73 0.51
74 0.52
75 0.5
76 0.5
77 0.44
78 0.42
79 0.4
80 0.37
81 0.38
82 0.35
83 0.29
84 0.27
85 0.25
86 0.32
87 0.37
88 0.41
89 0.46
90 0.55
91 0.65
92 0.7
93 0.78
94 0.78
95 0.8
96 0.76
97 0.7
98 0.68
99 0.59
100 0.53
101 0.46
102 0.39
103 0.31
104 0.27
105 0.23
106 0.16
107 0.14
108 0.11
109 0.09
110 0.1
111 0.13
112 0.17
113 0.19
114 0.23
115 0.27
116 0.31
117 0.39
118 0.46
119 0.51
120 0.5
121 0.56
122 0.55
123 0.54
124 0.58
125 0.58
126 0.59
127 0.61
128 0.59
129 0.55
130 0.53
131 0.49
132 0.42
133 0.35
134 0.34
135 0.28
136 0.31
137 0.35
138 0.36
139 0.37
140 0.37
141 0.39
142 0.36
143 0.38
144 0.36
145 0.32
146 0.33
147 0.34
148 0.33
149 0.3
150 0.24
151 0.19
152 0.16
153 0.15
154 0.11
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.03
166 0.04
167 0.03
168 0.03
169 0.04
170 0.05
171 0.07
172 0.08
173 0.08
174 0.1
175 0.11
176 0.12
177 0.15
178 0.16
179 0.16
180 0.16
181 0.17
182 0.16
183 0.15
184 0.15
185 0.17
186 0.23
187 0.28
188 0.32
189 0.35
190 0.41
191 0.45
192 0.51
193 0.47
194 0.43
195 0.42
196 0.38
197 0.35
198 0.3
199 0.25
200 0.21
201 0.24
202 0.21
203 0.16
204 0.15
205 0.14
206 0.13
207 0.14
208 0.13
209 0.08
210 0.07
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.1
220 0.13
221 0.15
222 0.22
223 0.24
224 0.25
225 0.26
226 0.27
227 0.34
228 0.34
229 0.36
230 0.33
231 0.32
232 0.31
233 0.33
234 0.35
235 0.29
236 0.26
237 0.24
238 0.22
239 0.2
240 0.18
241 0.15
242 0.2
243 0.25
244 0.27
245 0.3
246 0.31
247 0.35
248 0.36
249 0.41
250 0.38
251 0.38
252 0.38
253 0.41
254 0.41
255 0.39
256 0.4
257 0.35
258 0.31
259 0.3
260 0.26
261 0.19
262 0.18
263 0.22
264 0.24
265 0.31
266 0.34
267 0.39
268 0.42
269 0.46
270 0.54
271 0.55
272 0.62
273 0.63
274 0.67
275 0.64
276 0.66
277 0.66
278 0.59
279 0.58
280 0.55
281 0.53
282 0.44
283 0.42
284 0.42
285 0.45
286 0.53
287 0.58
288 0.59
289 0.6
290 0.63
291 0.69
292 0.73
293 0.73
294 0.68
295 0.62
296 0.58
297 0.53
298 0.5
299 0.43
300 0.36
301 0.31
302 0.28
303 0.25
304 0.25
305 0.32
306 0.38
307 0.45
308 0.5
309 0.57
310 0.63
311 0.73
312 0.76
313 0.79
314 0.81
315 0.82
316 0.86
317 0.82
318 0.78
319 0.69
320 0.62
321 0.53
322 0.46
323 0.41
324 0.37
325 0.38
326 0.34
327 0.36
328 0.37
329 0.37
330 0.35
331 0.37
332 0.37
333 0.34
334 0.35
335 0.34
336 0.34
337 0.37
338 0.42
339 0.41
340 0.35
341 0.34
342 0.33
343 0.33
344 0.32
345 0.28
346 0.2
347 0.16
348 0.14
349 0.1
350 0.09
351 0.05
352 0.05
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.07
357 0.09
358 0.12
359 0.17
360 0.17
361 0.21
362 0.3
363 0.35
364 0.41
365 0.49
366 0.51
367 0.52
368 0.55
369 0.53
370 0.47
371 0.45
372 0.38
373 0.31
374 0.27
375 0.27
376 0.25
377 0.25
378 0.28
379 0.28
380 0.29
381 0.36
382 0.45
383 0.52
384 0.62
385 0.7
386 0.76
387 0.81
388 0.88
389 0.9
390 0.91