Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CXF5

Protein Details
Accession A0A550CXF5    Localization Confidence Low Confidence Score 7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-29SQTSRVYKCCRKTSTGRRCSPSDRRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 6, cyto 6, cyto_nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022042  snRNA-activating_su3  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF12251  SNAPC3  
Amino Acid Sequences MVSTSQTSRVYKCCRKTSTGRRCSPSDRRAQAFIRPAKNTDYNAISNLKAMTSQECPYRADEAVITISIHSKFKHNPSYLERASQHVFLSWHTLEDLAQTFPCASRELVRTNSTGNRPRPGHLICIEGLVYGDGRDEDDYASKFVEHLRKTGQDRDIQVAKAPTKTWETRLDDLTLRINEPCFILHEGNCEHYAVVDEIRMRHPRDPVVGYPITIRLMPILPTNCKACGNVQPLWSIVNDVRLGESPCLLCDPCWKAMGHPGDPNVFVVPLPVHVSGW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.7
3 0.77
4 0.8
5 0.81
6 0.82
7 0.82
8 0.78
9 0.79
10 0.8
11 0.8
12 0.78
13 0.77
14 0.74
15 0.69
16 0.7
17 0.67
18 0.65
19 0.64
20 0.63
21 0.6
22 0.55
23 0.53
24 0.53
25 0.55
26 0.5
27 0.45
28 0.41
29 0.35
30 0.36
31 0.36
32 0.3
33 0.26
34 0.24
35 0.19
36 0.15
37 0.15
38 0.15
39 0.16
40 0.19
41 0.21
42 0.23
43 0.24
44 0.25
45 0.28
46 0.25
47 0.22
48 0.19
49 0.17
50 0.16
51 0.15
52 0.13
53 0.1
54 0.12
55 0.13
56 0.14
57 0.13
58 0.17
59 0.22
60 0.29
61 0.38
62 0.37
63 0.42
64 0.46
65 0.55
66 0.51
67 0.53
68 0.46
69 0.41
70 0.41
71 0.36
72 0.3
73 0.23
74 0.23
75 0.17
76 0.22
77 0.17
78 0.16
79 0.14
80 0.14
81 0.11
82 0.13
83 0.13
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.1
90 0.09
91 0.09
92 0.12
93 0.15
94 0.18
95 0.22
96 0.23
97 0.23
98 0.24
99 0.29
100 0.31
101 0.36
102 0.36
103 0.39
104 0.39
105 0.4
106 0.43
107 0.39
108 0.37
109 0.31
110 0.3
111 0.23
112 0.22
113 0.2
114 0.14
115 0.13
116 0.08
117 0.07
118 0.04
119 0.04
120 0.03
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.05
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.1
132 0.17
133 0.16
134 0.17
135 0.19
136 0.25
137 0.28
138 0.33
139 0.33
140 0.31
141 0.32
142 0.35
143 0.35
144 0.3
145 0.29
146 0.27
147 0.25
148 0.22
149 0.21
150 0.18
151 0.21
152 0.22
153 0.24
154 0.29
155 0.33
156 0.34
157 0.36
158 0.35
159 0.31
160 0.31
161 0.32
162 0.24
163 0.19
164 0.17
165 0.16
166 0.14
167 0.14
168 0.13
169 0.11
170 0.13
171 0.14
172 0.13
173 0.16
174 0.17
175 0.19
176 0.19
177 0.17
178 0.13
179 0.12
180 0.13
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.1
185 0.11
186 0.17
187 0.22
188 0.23
189 0.25
190 0.28
191 0.29
192 0.33
193 0.35
194 0.32
195 0.34
196 0.32
197 0.29
198 0.27
199 0.26
200 0.22
201 0.18
202 0.16
203 0.11
204 0.11
205 0.12
206 0.16
207 0.19
208 0.21
209 0.24
210 0.26
211 0.26
212 0.26
213 0.27
214 0.25
215 0.29
216 0.32
217 0.33
218 0.32
219 0.31
220 0.3
221 0.3
222 0.27
223 0.21
224 0.17
225 0.18
226 0.17
227 0.15
228 0.17
229 0.18
230 0.2
231 0.18
232 0.2
233 0.16
234 0.16
235 0.19
236 0.18
237 0.16
238 0.22
239 0.26
240 0.26
241 0.28
242 0.28
243 0.27
244 0.35
245 0.41
246 0.37
247 0.38
248 0.38
249 0.38
250 0.39
251 0.38
252 0.31
253 0.24
254 0.19
255 0.17
256 0.14
257 0.13
258 0.16