Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CQ31

Protein Details
Accession A0A550CQ31    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
119-138DEWEKKLQRKRRRADYEFNDBasic
222-246GKVNRDIEKKQKFHRKRINEEEGDIBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MTTPRPAAEDIPKADDIDVDDADNEEAGEHSNDAAADKDSRASLQARFSALQKRRAQSQRANMQSLQETTQQTRQRVRDEARLARQRKIAEELRLKADASDPEDVERAKNWSYSIEENDEWEKKLQRKRRRADYEFNDDADASRRKYKKDLDLIKPDLTAYEEQKAQALAGGSSSSALVRREDGGEVIPTANEAHDALYRTANTLLYGDHKPSEEAIDRVVGKVNRDIEKKQKFHRKRINEEEGDITYINEQNRVFNKKISRYYDKYTAEIRASFERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.31
3 0.26
4 0.22
5 0.19
6 0.15
7 0.14
8 0.14
9 0.14
10 0.13
11 0.1
12 0.06
13 0.06
14 0.07
15 0.08
16 0.08
17 0.07
18 0.08
19 0.08
20 0.09
21 0.1
22 0.1
23 0.11
24 0.11
25 0.13
26 0.12
27 0.13
28 0.15
29 0.17
30 0.18
31 0.21
32 0.24
33 0.25
34 0.26
35 0.29
36 0.36
37 0.39
38 0.46
39 0.48
40 0.48
41 0.55
42 0.61
43 0.66
44 0.64
45 0.69
46 0.69
47 0.67
48 0.69
49 0.6
50 0.55
51 0.51
52 0.44
53 0.36
54 0.31
55 0.28
56 0.27
57 0.34
58 0.36
59 0.38
60 0.44
61 0.46
62 0.45
63 0.5
64 0.51
65 0.52
66 0.54
67 0.57
68 0.59
69 0.64
70 0.62
71 0.59
72 0.59
73 0.52
74 0.47
75 0.47
76 0.42
77 0.41
78 0.45
79 0.43
80 0.42
81 0.41
82 0.39
83 0.32
84 0.3
85 0.24
86 0.2
87 0.2
88 0.16
89 0.16
90 0.17
91 0.17
92 0.15
93 0.14
94 0.14
95 0.12
96 0.13
97 0.12
98 0.12
99 0.15
100 0.17
101 0.18
102 0.2
103 0.19
104 0.2
105 0.23
106 0.22
107 0.21
108 0.21
109 0.23
110 0.25
111 0.33
112 0.41
113 0.47
114 0.57
115 0.64
116 0.73
117 0.78
118 0.78
119 0.8
120 0.77
121 0.76
122 0.67
123 0.59
124 0.49
125 0.38
126 0.32
127 0.27
128 0.23
129 0.15
130 0.21
131 0.22
132 0.24
133 0.29
134 0.34
135 0.38
136 0.46
137 0.53
138 0.53
139 0.6
140 0.62
141 0.57
142 0.52
143 0.43
144 0.34
145 0.27
146 0.21
147 0.14
148 0.13
149 0.13
150 0.13
151 0.14
152 0.13
153 0.11
154 0.1
155 0.09
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.05
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.1
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.08
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.08
183 0.11
184 0.11
185 0.13
186 0.13
187 0.14
188 0.15
189 0.14
190 0.12
191 0.11
192 0.1
193 0.13
194 0.14
195 0.15
196 0.15
197 0.15
198 0.16
199 0.16
200 0.19
201 0.18
202 0.17
203 0.16
204 0.19
205 0.18
206 0.18
207 0.23
208 0.2
209 0.2
210 0.24
211 0.29
212 0.31
213 0.35
214 0.39
215 0.44
216 0.53
217 0.57
218 0.62
219 0.68
220 0.71
221 0.78
222 0.84
223 0.84
224 0.84
225 0.89
226 0.89
227 0.81
228 0.75
229 0.69
230 0.59
231 0.51
232 0.41
233 0.31
234 0.23
235 0.23
236 0.2
237 0.2
238 0.18
239 0.22
240 0.29
241 0.35
242 0.35
243 0.38
244 0.46
245 0.51
246 0.6
247 0.62
248 0.65
249 0.65
250 0.7
251 0.74
252 0.68
253 0.63
254 0.58
255 0.55
256 0.5
257 0.46
258 0.42
259 0.38
260 0.38
261 0.34