FuNGI

A0A550CBH9

Protein Details

Accession

A0A550CBH9

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
363-388	AKAPAGAKPKSKKKARSPVSGKKAKK	Basic
423-449	EEATEKVRADKKKKQKKAKAEGVNALE	Hydrophilic
467-500	IDEPDFKKKRAGKAGEKKKEKVAKARPGKPSAKE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
303-330	ARAKGKRRADADQEPEQPKKRAKGEKGH
340-349	LKKKKSKATK
363-402	AKAPAGAKPKSKKKARSPVSGKKAKKAGKEKAAGKEKAAS
430-441	RADKKKKQKKAK
473-510	KKKRAGKAGEKKKEKVAKARPGKPSAKEGLLGKKTARA

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 12.833, cyto 12.5, nucl 12, mito_nucl 6.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR023674 Ribosomal_L1-like IPR028364 Ribosomal_L1/biogenesis IPR016095 Ribosomal_L1_3-a/b-sand
Gene Ontology	GO:0005840 C:ribosome
Pfam	View protein in Pfam PF00687 Ribosomal_L1
CDD	cd00403 Ribosomal_L1

Amino Acid Sequences

MAVDLIDGHVSPTQCEKAVNALLAHATKRAQAKAETELLPSREQHVWLNIAEKTIPADRKLKPQRIPLAYPIVDPRVASICLITKDPQRQYKDLLETQKIRFISRVVGMEKLKGKFKPFEARRGLLKDHDMFLADERIIPLLPKLLGSTWFKAKKQPIPVCLTRKDLKGELERAVSSTYMSQQQGTQTSVKIGTLSQKPAHILANLKTALPAIAARITGGWDNIQNVHIKTSSSASLPVWSCDLSADALGRWGGAADVEAADVEMGEASDSEDSDKEEDEEDEEMDGDEADEEMEVDIPAPPARAKGKRRADADQEPEQPKKRAKGEKGHAVVLADSVELKKKKSKATKDAAPSVDAAPSVDAKAPAGAKPKSKKKARSPVSGKKAKKAGKEKAAGKEKAASEDKAASKAAPVPDVVIAADAEEATEKVRADKKKKQKKAKAEGVNALEAAAVVALPAEADTAAKEIDEPDFKKKRAGKAGEKKKEKVAKARPGKPSAKEGLLGKKTARA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.21
3	0.2
4	0.24
5	0.28
6	0.29
7	0.24
8	0.22
9	0.25
10	0.26
11	0.26
12	0.21
13	0.19
14	0.21
15	0.26
16	0.28
17	0.29
18	0.31
19	0.33
20	0.37
21	0.42
22	0.38
23	0.37
24	0.39
25	0.37
26	0.36
27	0.33
28	0.32
29	0.28
30	0.29
31	0.29
32	0.28
33	0.28
34	0.27
35	0.3
36	0.26
37	0.25
38	0.23
39	0.2
40	0.2
41	0.23
42	0.25
43	0.25
44	0.32
45	0.34
46	0.45
47	0.55
48	0.61
49	0.61
50	0.67
51	0.73
52	0.72
53	0.73
54	0.68
55	0.67
56	0.58
57	0.54
58	0.49
59	0.42
60	0.35
61	0.3
62	0.27
63	0.21
64	0.21
65	0.19
66	0.16
67	0.17
68	0.18
69	0.21
70	0.22
71	0.25
72	0.33
73	0.41
74	0.48
75	0.5
76	0.51
77	0.54
78	0.59
79	0.59
80	0.58
81	0.57
82	0.56
83	0.56
84	0.55
85	0.55
86	0.48
87	0.42
88	0.36
89	0.3
90	0.27
91	0.25
92	0.28
93	0.24
94	0.29
95	0.29
96	0.33
97	0.38
98	0.36
99	0.38
100	0.35
101	0.39
102	0.38
103	0.43
104	0.49
105	0.47
106	0.55
107	0.56
108	0.57
109	0.58
110	0.58
111	0.55
112	0.47
113	0.49
114	0.41
115	0.36
116	0.33
117	0.28
118	0.23
119	0.22
120	0.21
121	0.15
122	0.13
123	0.12
124	0.12
125	0.1
126	0.1
127	0.09
128	0.09
129	0.09
130	0.08
131	0.09
132	0.09
133	0.14
134	0.18
135	0.2
136	0.27
137	0.32
138	0.33
139	0.39
140	0.46
141	0.48
142	0.55
143	0.58
144	0.55
145	0.58
146	0.65
147	0.64
148	0.61
149	0.6
150	0.54
151	0.51
152	0.48
153	0.43
154	0.41
155	0.4
156	0.4
157	0.36
158	0.34
159	0.31
160	0.28
161	0.26
162	0.2
163	0.14
164	0.12
165	0.12
166	0.14
167	0.14
168	0.14
169	0.15
170	0.17
171	0.19
172	0.2
173	0.19
174	0.15
175	0.16
176	0.16
177	0.15
178	0.13
179	0.11
180	0.15
181	0.18
182	0.21
183	0.21
184	0.22
185	0.23
186	0.24
187	0.24
188	0.2
189	0.19
190	0.17
191	0.21
192	0.2
193	0.19
194	0.18
195	0.17
196	0.15
197	0.12
198	0.1
199	0.06
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.06
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.07
208	0.06
209	0.07
210	0.08
211	0.09
212	0.11
213	0.11
214	0.12
215	0.11
216	0.11
217	0.11
218	0.12
219	0.12
220	0.1
221	0.11
222	0.1
223	0.14
224	0.14
225	0.14
226	0.13
227	0.12
228	0.11
229	0.1
230	0.1
231	0.06
232	0.06
233	0.06
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.04
239	0.04
240	0.03
241	0.03
242	0.03
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.03
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.02
251	0.02
252	0.02
253	0.02
254	0.02
255	0.03
256	0.03
257	0.03
258	0.04
259	0.04
260	0.05
261	0.06
262	0.06
263	0.06
264	0.07
265	0.07
266	0.07
267	0.08
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.06
272	0.06
273	0.05
274	0.04
275	0.03
276	0.03
277	0.03
278	0.03
279	0.03
280	0.03
281	0.03
282	0.03
283	0.03
284	0.04
285	0.05
286	0.05
287	0.06
288	0.06
289	0.08
290	0.14
291	0.22
292	0.27
293	0.37
294	0.46
295	0.52
296	0.56
297	0.59
298	0.61
299	0.61
300	0.62
301	0.59
302	0.57
303	0.54
304	0.55
305	0.54
306	0.51
307	0.47
308	0.47
309	0.49
310	0.5
311	0.54
312	0.59
313	0.63
314	0.68
315	0.67
316	0.62
317	0.54
318	0.45
319	0.37
320	0.27
321	0.2
322	0.1
323	0.08
324	0.07
325	0.12
326	0.13
327	0.15
328	0.21
329	0.25
330	0.34
331	0.44
332	0.53
333	0.57
334	0.65
335	0.71
336	0.72
337	0.74
338	0.67
339	0.58
340	0.5
341	0.4
342	0.33
343	0.25
344	0.17
345	0.11
346	0.1
347	0.1
348	0.1
349	0.09
350	0.08
351	0.11
352	0.12
353	0.13
354	0.2
355	0.22
356	0.29
357	0.38
358	0.48
359	0.56
360	0.64
361	0.71
362	0.75
363	0.83
364	0.83
365	0.85
366	0.85
367	0.86
368	0.87
369	0.87
370	0.79
371	0.76
372	0.77
373	0.71
374	0.71
375	0.7
376	0.69
377	0.69
378	0.75
379	0.74
380	0.75
381	0.79
382	0.71
383	0.62
384	0.59
385	0.51
386	0.5
387	0.47
388	0.37
389	0.31
390	0.36
391	0.35
392	0.31
393	0.3
394	0.23
395	0.21
396	0.25
397	0.24
398	0.18
399	0.17
400	0.16
401	0.16
402	0.16
403	0.14
404	0.1
405	0.08
406	0.07
407	0.07
408	0.06
409	0.05
410	0.05
411	0.05
412	0.06
413	0.08
414	0.08
415	0.13
416	0.21
417	0.3
418	0.38
419	0.48
420	0.59
421	0.68
422	0.78
423	0.84
424	0.88
425	0.9
426	0.92
427	0.93
428	0.92
429	0.88
430	0.86
431	0.78
432	0.7
433	0.58
434	0.47
435	0.36
436	0.25
437	0.18
438	0.09
439	0.05
440	0.03
441	0.03
442	0.03
443	0.03
444	0.03
445	0.03
446	0.03
447	0.04
448	0.04
449	0.06
450	0.06
451	0.06
452	0.07
453	0.07
454	0.12
455	0.19
456	0.21
457	0.31
458	0.39
459	0.39
460	0.48
461	0.53
462	0.59
463	0.62
464	0.69
465	0.7
466	0.74
467	0.84
468	0.86
469	0.88
470	0.83
471	0.82
472	0.82
473	0.78
474	0.78
475	0.77
476	0.77
477	0.8
478	0.84
479	0.84
480	0.84
481	0.84
482	0.78
483	0.76
484	0.72
485	0.64
486	0.6
487	0.56
488	0.57
489	0.54
490	0.52

A0A550CBH9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer