FuNGI

A0A550BY67

Protein Details

Accession

A0A550BY67

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
33-53	SQEARRQKALEEQKRRRADRV	Hydrophilic
113-148	GLPTQFTGKGRRRKGKKKKRKAAPERKPNPKWADKC	Basic
540-559	FTRLIQRRWEWRQRMQGPGD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
121-143	KGRRRKGKKKKRKAAPERKPNPK

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017336 Snurportin-1 IPR024721 Snurportin-1_N
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0061015 P:snRNA import into nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF11538 Snurportin1

Amino Acid Sequences

MDNKMSESPPSEFSSRKATFKLPPNAVRDKVSSQEARRQKALEEQKRRRADRVDSARLQLESFANMTLDDNSSDEDLQPSVVKNKGVAEYKTMLNEEEPMEQQQQQDPPADDGLPTQFTGKGRRRKGKKKKRKAAPERKPNPKWADKCMYAELLEMSEDAPWDADGIPDDIETGWVAVAPVPVGKRCLVVTAMSSGAAGTVPNTTLRSRLLGKSLMPPFPSPLPQATVLDCVLDDGWRDNGILHVLDVLKWKGRDVTECETAFRLWWRDTRLSELPPSVTVPSSTSAFPSAPFVFRSSSATAATDGLSGVSGIPPLLPSTPPTSTHPPTSTHAKTSNHPPSHGTDTCEQRFAYPVLFVPIPYHRDTTVSNLLNMVLPLARATRQIEVPPIRHVQMPLPSGAPEAQGDMDVDAVDVSAAPPPRPSSAHHPSSSHHPSSTRPGATISIHTSITTEPLVRSCPYPNGADTADVLPDGLLLYVAEASYEAGTSPLSSWLPLRSYERPEYPHPAGERAQETTRNMQAIMGSGVQRGPNDGPLDVFTRLIQRRWEWRQRMQGPGDVNMEV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.4
3	0.41
4	0.41
5	0.42
6	0.47
7	0.55
8	0.63
9	0.61
10	0.64
11	0.67
12	0.72
13	0.69
14	0.65
15	0.59
16	0.53
17	0.49
18	0.5
19	0.5
20	0.47
21	0.53
22	0.58
23	0.59
24	0.59
25	0.56
26	0.5
27	0.53
28	0.59
29	0.6
30	0.63
31	0.67
32	0.73
33	0.81
34	0.83
35	0.8
36	0.76
37	0.74
38	0.73
39	0.73
40	0.73
41	0.66
42	0.66
43	0.63
44	0.56
45	0.48
46	0.4
47	0.31
48	0.23
49	0.2
50	0.17
51	0.13
52	0.13
53	0.14
54	0.12
55	0.12
56	0.11
57	0.11
58	0.11
59	0.13
60	0.13
61	0.12
62	0.12
63	0.11
64	0.11
65	0.12
66	0.13
67	0.16
68	0.18
69	0.18
70	0.18
71	0.22
72	0.27
73	0.31
74	0.31
75	0.32
76	0.32
77	0.33
78	0.35
79	0.32
80	0.26
81	0.21
82	0.23
83	0.19
84	0.19
85	0.18
86	0.19
87	0.21
88	0.22
89	0.23
90	0.25
91	0.27
92	0.26
93	0.29
94	0.27
95	0.27
96	0.26
97	0.25
98	0.2
99	0.18
100	0.19
101	0.16
102	0.15
103	0.14
104	0.15
105	0.17
106	0.27
107	0.34
108	0.41
109	0.49
110	0.59
111	0.69
112	0.77
113	0.87
114	0.89
115	0.91
116	0.93
117	0.94
118	0.95
119	0.96
120	0.96
121	0.96
122	0.95
123	0.95
124	0.94
125	0.94
126	0.88
127	0.86
128	0.83
129	0.82
130	0.75
131	0.73
132	0.71
133	0.63
134	0.62
135	0.55
136	0.48
137	0.38
138	0.34
139	0.26
140	0.18
141	0.15
142	0.11
143	0.08
144	0.07
145	0.06
146	0.05
147	0.05
148	0.04
149	0.05
150	0.05
151	0.05
152	0.06
153	0.07
154	0.07
155	0.06
156	0.07
157	0.06
158	0.06
159	0.06
160	0.05
161	0.04
162	0.04
163	0.04
164	0.05
165	0.05
166	0.05
167	0.06
168	0.07
169	0.08
170	0.1
171	0.1
172	0.11
173	0.11
174	0.13
175	0.12
176	0.11
177	0.12
178	0.12
179	0.12
180	0.1
181	0.1
182	0.08
183	0.07
184	0.06
185	0.05
186	0.04
187	0.04
188	0.05
189	0.06
190	0.08
191	0.08
192	0.1
193	0.11
194	0.13
195	0.16
196	0.17
197	0.19
198	0.19
199	0.2
200	0.27
201	0.3
202	0.3
203	0.28
204	0.27
205	0.26
206	0.26
207	0.27
208	0.2
209	0.18
210	0.18
211	0.18
212	0.19
213	0.17
214	0.17
215	0.15
216	0.13
217	0.12
218	0.09
219	0.08
220	0.07
221	0.07
222	0.05
223	0.06
224	0.06
225	0.07
226	0.06
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.06
231	0.07
232	0.06
233	0.07
234	0.09
235	0.1
236	0.11
237	0.11
238	0.12
239	0.13
240	0.14
241	0.17
242	0.2
243	0.25
244	0.28
245	0.29
246	0.29
247	0.27
248	0.26
249	0.23
250	0.2
251	0.17
252	0.13
253	0.15
254	0.19
255	0.22
256	0.22
257	0.28
258	0.29
259	0.28
260	0.28
261	0.26
262	0.22
263	0.19
264	0.19
265	0.14
266	0.11
267	0.1
268	0.09
269	0.09
270	0.1
271	0.1
272	0.09
273	0.1
274	0.1
275	0.1
276	0.12
277	0.12
278	0.11
279	0.12
280	0.13
281	0.13
282	0.13
283	0.17
284	0.14
285	0.15
286	0.14
287	0.14
288	0.13
289	0.12
290	0.12
291	0.08
292	0.07
293	0.06
294	0.05
295	0.05
296	0.04
297	0.03
298	0.03
299	0.03
300	0.03
301	0.03
302	0.04
303	0.05
304	0.05
305	0.07
306	0.11
307	0.13
308	0.15
309	0.2
310	0.26
311	0.28
312	0.31
313	0.32
314	0.31
315	0.32
316	0.39
317	0.35
318	0.33
319	0.37
320	0.35
321	0.36
322	0.43
323	0.5
324	0.43
325	0.43
326	0.41
327	0.39
328	0.44
329	0.43
330	0.35
331	0.31
332	0.37
333	0.37
334	0.37
335	0.33
336	0.26
337	0.26
338	0.24
339	0.19
340	0.13
341	0.12
342	0.12
343	0.12
344	0.12
345	0.12
346	0.15
347	0.18
348	0.19
349	0.2
350	0.17
351	0.19
352	0.2
353	0.24
354	0.29
355	0.26
356	0.24
357	0.23
358	0.23
359	0.22
360	0.21
361	0.15
362	0.06
363	0.05
364	0.06
365	0.07
366	0.07
367	0.09
368	0.11
369	0.12
370	0.14
371	0.15
372	0.22
373	0.26
374	0.27
375	0.29
376	0.3
377	0.29
378	0.29
379	0.29
380	0.25
381	0.27
382	0.27
383	0.23
384	0.21
385	0.2
386	0.2
387	0.19
388	0.16
389	0.1
390	0.1
391	0.09
392	0.08
393	0.08
394	0.07
395	0.07
396	0.06
397	0.06
398	0.04
399	0.04
400	0.03
401	0.03
402	0.03
403	0.06
404	0.08
405	0.08
406	0.1
407	0.12
408	0.15
409	0.16
410	0.2
411	0.27
412	0.35
413	0.41
414	0.42
415	0.43
416	0.42
417	0.5
418	0.54
419	0.47
420	0.4
421	0.35
422	0.35
423	0.43
424	0.48
425	0.39
426	0.32
427	0.32
428	0.33
429	0.33
430	0.33
431	0.28
432	0.22
433	0.22
434	0.21
435	0.2
436	0.17
437	0.18
438	0.15
439	0.13
440	0.11
441	0.13
442	0.16
443	0.16
444	0.18
445	0.18
446	0.22
447	0.23
448	0.25
449	0.24
450	0.26
451	0.25
452	0.24
453	0.23
454	0.19
455	0.17
456	0.14
457	0.13
458	0.09
459	0.08
460	0.07
461	0.05
462	0.04
463	0.03
464	0.04
465	0.04
466	0.04
467	0.04
468	0.04
469	0.05
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.05
474	0.05
475	0.06
476	0.07
477	0.1
478	0.1
479	0.11
480	0.12
481	0.16
482	0.17
483	0.2
484	0.26
485	0.28
486	0.36
487	0.41
488	0.45
489	0.47
490	0.51
491	0.56
492	0.53
493	0.54
494	0.49
495	0.47
496	0.45
497	0.45
498	0.43
499	0.39
500	0.4
501	0.39
502	0.4
503	0.42
504	0.43
505	0.38
506	0.35
507	0.31
508	0.28
509	0.24
510	0.22
511	0.19
512	0.15
513	0.15
514	0.17
515	0.18
516	0.17
517	0.19
518	0.19
519	0.21
520	0.22
521	0.22
522	0.21
523	0.22
524	0.25
525	0.22
526	0.21
527	0.17
528	0.25
529	0.28
530	0.3
531	0.35
532	0.38
533	0.47
534	0.57
535	0.66
536	0.65
537	0.71
538	0.79
539	0.79
540	0.81
541	0.75
542	0.71
543	0.63
544	0.6

A0A550BY67

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer