Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DCM5

Protein Details
Accession C5DCM5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-36EYDSRSSYRRDTRGPRRFDRBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG lth:KLTH0B04312g  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12232  RRM3_U2AF65  
Amino Acid Sequences MSNSREKSRFSAGPAGEYDSRSSYRRDTRGPRRFDRGDMGGTDGGRSRYGGRSSRNFENRSRYQGGGRYRQEPRYGDSRKPEDVDWSAVVSISQRRRMRETQWDMAPKGFEKVPAERAKLSGLFPLPGQPQDLDRSKLEGIVSSGVLTRRTRILFEDPTESNMSKTKYNQILILTSVGSSPAEMNQLAEYVKEFVKLVDETQELKEHKILQENRLYLRFSSEEITTIALSCQKFIERKTGSKFIWQRPGECVEKKEPVDPICAGSVIALQELGDCTEEGLQSDLNQSGVETNWLKLISLGKTNEFTGTALIDPKANVDELSHYKWIRPNDCKLRQDFTEITFQQLPHLVARKDHAESRVIVLLNCVDPMDLKNDEFVKEIRDSMTSSKTMTALGEIESVKIPQPGADYRTSFESIEESVGKIYVKFKEQESAKAAMSQLSGVSFNDRTVLCAYYSERDYNMDVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.45
3 0.39
4 0.37
5 0.34
6 0.29
7 0.31
8 0.28
9 0.31
10 0.34
11 0.4
12 0.46
13 0.53
14 0.59
15 0.68
16 0.75
17 0.81
18 0.79
19 0.79
20 0.76
21 0.71
22 0.68
23 0.61
24 0.56
25 0.48
26 0.45
27 0.38
28 0.34
29 0.31
30 0.26
31 0.23
32 0.19
33 0.19
34 0.18
35 0.22
36 0.29
37 0.34
38 0.38
39 0.46
40 0.52
41 0.61
42 0.67
43 0.65
44 0.65
45 0.68
46 0.66
47 0.65
48 0.63
49 0.55
50 0.52
51 0.54
52 0.56
53 0.57
54 0.56
55 0.55
56 0.57
57 0.61
58 0.62
59 0.58
60 0.54
61 0.54
62 0.55
63 0.53
64 0.56
65 0.56
66 0.54
67 0.54
68 0.5
69 0.46
70 0.44
71 0.41
72 0.32
73 0.28
74 0.23
75 0.21
76 0.2
77 0.16
78 0.21
79 0.22
80 0.3
81 0.33
82 0.37
83 0.44
84 0.49
85 0.53
86 0.57
87 0.6
88 0.58
89 0.62
90 0.64
91 0.58
92 0.55
93 0.5
94 0.4
95 0.34
96 0.28
97 0.24
98 0.22
99 0.25
100 0.31
101 0.35
102 0.38
103 0.35
104 0.36
105 0.35
106 0.33
107 0.3
108 0.26
109 0.21
110 0.19
111 0.18
112 0.21
113 0.2
114 0.19
115 0.2
116 0.16
117 0.17
118 0.22
119 0.26
120 0.24
121 0.23
122 0.26
123 0.24
124 0.26
125 0.23
126 0.18
127 0.16
128 0.14
129 0.14
130 0.1
131 0.12
132 0.12
133 0.15
134 0.14
135 0.15
136 0.18
137 0.18
138 0.19
139 0.21
140 0.26
141 0.27
142 0.29
143 0.32
144 0.28
145 0.31
146 0.33
147 0.29
148 0.23
149 0.23
150 0.23
151 0.21
152 0.22
153 0.27
154 0.29
155 0.3
156 0.31
157 0.29
158 0.28
159 0.26
160 0.25
161 0.17
162 0.12
163 0.11
164 0.09
165 0.07
166 0.06
167 0.06
168 0.05
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.07
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.11
186 0.12
187 0.13
188 0.14
189 0.2
190 0.18
191 0.18
192 0.2
193 0.19
194 0.19
195 0.26
196 0.27
197 0.27
198 0.32
199 0.33
200 0.33
201 0.33
202 0.32
203 0.24
204 0.24
205 0.2
206 0.15
207 0.15
208 0.13
209 0.12
210 0.12
211 0.12
212 0.09
213 0.09
214 0.08
215 0.1
216 0.1
217 0.09
218 0.09
219 0.11
220 0.13
221 0.14
222 0.23
223 0.22
224 0.26
225 0.31
226 0.37
227 0.36
228 0.42
229 0.48
230 0.45
231 0.52
232 0.48
233 0.45
234 0.42
235 0.46
236 0.42
237 0.37
238 0.35
239 0.29
240 0.34
241 0.33
242 0.32
243 0.31
244 0.27
245 0.28
246 0.25
247 0.22
248 0.17
249 0.16
250 0.13
251 0.1
252 0.1
253 0.07
254 0.06
255 0.05
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.05
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.1
277 0.09
278 0.09
279 0.11
280 0.11
281 0.11
282 0.12
283 0.15
284 0.13
285 0.17
286 0.18
287 0.18
288 0.2
289 0.2
290 0.19
291 0.17
292 0.15
293 0.1
294 0.1
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.09
303 0.08
304 0.07
305 0.12
306 0.15
307 0.19
308 0.23
309 0.22
310 0.25
311 0.29
312 0.35
313 0.39
314 0.41
315 0.47
316 0.54
317 0.63
318 0.66
319 0.65
320 0.63
321 0.56
322 0.56
323 0.48
324 0.4
325 0.41
326 0.35
327 0.36
328 0.34
329 0.32
330 0.28
331 0.29
332 0.27
333 0.22
334 0.28
335 0.24
336 0.23
337 0.26
338 0.28
339 0.27
340 0.3
341 0.28
342 0.25
343 0.25
344 0.27
345 0.29
346 0.25
347 0.22
348 0.2
349 0.19
350 0.17
351 0.16
352 0.13
353 0.08
354 0.08
355 0.1
356 0.13
357 0.13
358 0.12
359 0.16
360 0.18
361 0.19
362 0.2
363 0.19
364 0.19
365 0.19
366 0.2
367 0.17
368 0.17
369 0.19
370 0.21
371 0.25
372 0.21
373 0.21
374 0.22
375 0.21
376 0.2
377 0.19
378 0.16
379 0.12
380 0.12
381 0.15
382 0.13
383 0.14
384 0.14
385 0.14
386 0.14
387 0.15
388 0.14
389 0.11
390 0.16
391 0.19
392 0.22
393 0.27
394 0.27
395 0.28
396 0.32
397 0.33
398 0.29
399 0.25
400 0.23
401 0.19
402 0.21
403 0.2
404 0.15
405 0.14
406 0.15
407 0.15
408 0.14
409 0.18
410 0.19
411 0.24
412 0.26
413 0.27
414 0.35
415 0.36
416 0.42
417 0.42
418 0.42
419 0.37
420 0.38
421 0.36
422 0.3
423 0.28
424 0.22
425 0.17
426 0.15
427 0.15
428 0.13
429 0.17
430 0.15
431 0.15
432 0.19
433 0.18
434 0.19
435 0.2
436 0.21
437 0.17
438 0.2
439 0.23
440 0.24
441 0.28
442 0.28
443 0.27
444 0.28