FuNGI

A0A550CZ35

Protein Details

Accession

A0A550CZ35

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
262-286	RELSPKSRRRLQKRLYMRRKRAEKT	Basic
302-326	PAKARPPPKKTGPPRKRGRRGSAAE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
266-285	PKSRRRLQKRLYMRRKRAEK
298-322	KVGRPAKARPPPKKTGPPRKRGRRG
484-491	PRPGKRKR

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 11, cyto 7.5, pero 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039601 Rrn5 IPR001005 SANT/Myb
Gene Ontology	GO:0000500 C:RNA polymerase I upstream activating factor complex GO:0042790 P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I
CDD	cd00167 SANT

Amino Acid Sequences

MSGESSAQEAENDFRIFLTQYRQHLKDIRAHFAGQTLDGADSEGQNEGGDETDDDNILEPGCGMQAATVTEDSKEEAVDQDPWTASEKDALFHGLAVHSRLRPDLIASRIQTKTIPEVCAFLEALENAASHHPLPDRRRDTLLPAMEVTDSWITWEERQAAHLLLAEPEWEAYAQDAQRQSILTAHPEDAPDSPRTPLLAQWKAQDALRALDKHRLRAMARILRHGEASAEDGSPPATSVPDDANLDPVVRGRSQSSTPSTRELSPKSRRRLQKRLYMRRKRAEKTGTEAVQDEGLLKVGRPAKARPPPKKTGPPRKRGRRGSAAEDADATQRNGDGSEEGEDEGNDEGDDGEEEAGKGDYAHPHKGGLTAPYKARRLLQEAGITPAVLAEHKLDMFDGIGVARFLEHARDDGTAISISRNTLALLYDILYDIVTEIVRRAIVSREQEVNLKAGNKAWRVKNPDGILPKNVEHALEMMGAGAPPRPGKRKRSADNEEDDGDNWGDEQEDGDGDEASASDTQVTSDAQDAKDAQEAQFDLAEDIYPAFFRLPSAYAEKHGDILPDDMDEEALERELDEEDELDAEDCVAQETYEENLWLSMQEQPAIN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.17
3	0.18
4	0.19
5	0.25
6	0.26
7	0.34
8	0.43
9	0.44
10	0.49
11	0.55
12	0.57
13	0.57
14	0.56
15	0.55
16	0.5
17	0.49
18	0.43
19	0.4
20	0.37
21	0.28
22	0.24
23	0.18
24	0.15
25	0.14
26	0.15
27	0.12
28	0.11
29	0.11
30	0.1
31	0.09
32	0.09
33	0.09
34	0.08
35	0.08
36	0.08
37	0.08
38	0.09
39	0.1
40	0.1
41	0.1
42	0.1
43	0.1
44	0.1
45	0.08
46	0.07
47	0.06
48	0.06
49	0.06
50	0.05
51	0.05
52	0.06
53	0.07
54	0.09
55	0.1
56	0.1
57	0.11
58	0.12
59	0.13
60	0.12
61	0.11
62	0.1
63	0.11
64	0.12
65	0.15
66	0.15
67	0.17
68	0.16
69	0.17
70	0.21
71	0.2
72	0.18
73	0.21
74	0.21
75	0.18
76	0.19
77	0.2
78	0.16
79	0.16
80	0.16
81	0.12
82	0.13
83	0.15
84	0.17
85	0.17
86	0.18
87	0.18
88	0.18
89	0.17
90	0.19
91	0.23
92	0.23
93	0.28
94	0.28
95	0.35
96	0.34
97	0.35
98	0.33
99	0.29
100	0.34
101	0.32
102	0.33
103	0.26
104	0.27
105	0.26
106	0.27
107	0.25
108	0.16
109	0.14
110	0.11
111	0.11
112	0.1
113	0.09
114	0.08
115	0.09
116	0.1
117	0.09
118	0.12
119	0.15
120	0.22
121	0.27
122	0.36
123	0.41
124	0.43
125	0.48
126	0.47
127	0.49
128	0.5
129	0.48
130	0.39
131	0.34
132	0.31
133	0.26
134	0.24
135	0.21
136	0.13
137	0.1
138	0.1
139	0.12
140	0.12
141	0.13
142	0.17
143	0.17
144	0.16
145	0.18
146	0.18
147	0.16
148	0.15
149	0.16
150	0.13
151	0.11
152	0.1
153	0.1
154	0.08
155	0.08
156	0.07
157	0.06
158	0.05
159	0.05
160	0.09
161	0.09
162	0.14
163	0.15
164	0.15
165	0.16
166	0.16
167	0.15
168	0.15
169	0.15
170	0.15
171	0.16
172	0.16
173	0.17
174	0.17
175	0.18
176	0.16
177	0.18
178	0.17
179	0.16
180	0.16
181	0.16
182	0.17
183	0.16
184	0.18
185	0.24
186	0.27
187	0.27
188	0.29
189	0.31
190	0.31
191	0.31
192	0.29
193	0.21
194	0.19
195	0.22
196	0.22
197	0.21
198	0.28
199	0.29
200	0.29
201	0.31
202	0.32
203	0.28
204	0.32
205	0.39
206	0.37
207	0.37
208	0.4
209	0.39
210	0.36
211	0.36
212	0.3
213	0.22
214	0.16
215	0.17
216	0.12
217	0.1
218	0.09
219	0.09
220	0.09
221	0.08
222	0.08
223	0.06
224	0.05
225	0.05
226	0.06
227	0.07
228	0.08
229	0.1
230	0.1
231	0.12
232	0.11
233	0.11
234	0.1
235	0.11
236	0.11
237	0.1
238	0.1
239	0.1
240	0.12
241	0.14
242	0.18
243	0.22
244	0.25
245	0.27
246	0.29
247	0.3
248	0.31
249	0.34
250	0.34
251	0.39
252	0.44
253	0.51
254	0.54
255	0.6
256	0.66
257	0.71
258	0.77
259	0.75
260	0.74
261	0.77
262	0.81
263	0.84
264	0.86
265	0.86
266	0.85
267	0.86
268	0.79
269	0.77
270	0.72
271	0.63
272	0.59
273	0.58
274	0.49
275	0.41
276	0.39
277	0.3
278	0.24
279	0.21
280	0.15
281	0.07
282	0.07
283	0.06
284	0.05
285	0.09
286	0.12
287	0.15
288	0.16
289	0.19
290	0.27
291	0.35
292	0.45
293	0.49
294	0.54
295	0.58
296	0.64
297	0.72
298	0.74
299	0.77
300	0.77
301	0.79
302	0.82
303	0.86
304	0.89
305	0.87
306	0.84
307	0.82
308	0.77
309	0.73
310	0.7
311	0.6
312	0.5
313	0.42
314	0.35
315	0.27
316	0.24
317	0.17
318	0.09
319	0.08
320	0.08
321	0.07
322	0.07
323	0.06
324	0.05
325	0.07
326	0.07
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.07
331	0.07
332	0.06
333	0.05
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.05
347	0.11
348	0.14
349	0.16
350	0.16
351	0.17
352	0.17
353	0.19
354	0.18
355	0.18
356	0.18
357	0.18
358	0.23
359	0.28
360	0.29
361	0.29
362	0.31
363	0.28
364	0.31
365	0.31
366	0.3
367	0.29
368	0.28
369	0.3
370	0.27
371	0.24
372	0.18
373	0.16
374	0.12
375	0.07
376	0.07
377	0.05
378	0.06
379	0.06
380	0.07
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.05
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.05
392	0.05
393	0.06
394	0.07
395	0.07
396	0.08
397	0.09
398	0.09
399	0.09
400	0.1
401	0.09
402	0.09
403	0.09
404	0.08
405	0.08
406	0.08
407	0.08
408	0.07
409	0.07
410	0.08
411	0.07
412	0.07
413	0.07
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.06
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.06
425	0.06
426	0.06
427	0.07
428	0.1
429	0.15
430	0.19
431	0.22
432	0.25
433	0.26
434	0.29
435	0.29
436	0.28
437	0.25
438	0.23
439	0.19
440	0.2
441	0.25
442	0.27
443	0.34
444	0.38
445	0.43
446	0.5
447	0.53
448	0.56
449	0.52
450	0.54
451	0.54
452	0.51
453	0.47
454	0.42
455	0.39
456	0.35
457	0.33
458	0.26
459	0.2
460	0.18
461	0.15
462	0.12
463	0.11
464	0.08
465	0.07
466	0.07
467	0.07
468	0.07
469	0.08
470	0.11
471	0.16
472	0.25
473	0.32
474	0.41
475	0.52
476	0.61
477	0.68
478	0.75
479	0.79
480	0.78
481	0.77
482	0.73
483	0.64
484	0.55
485	0.47
486	0.39
487	0.3
488	0.22
489	0.15
490	0.11
491	0.09
492	0.08
493	0.08
494	0.06
495	0.06
496	0.06
497	0.07
498	0.07
499	0.06
500	0.06
501	0.06
502	0.06
503	0.07
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.07
508	0.08
509	0.08
510	0.08
511	0.12
512	0.15
513	0.15
514	0.17
515	0.18
516	0.18
517	0.23
518	0.23
519	0.19
520	0.2
521	0.2
522	0.19
523	0.2
524	0.19
525	0.14
526	0.13
527	0.13
528	0.09
529	0.09
530	0.08
531	0.07
532	0.07
533	0.08
534	0.07
535	0.08
536	0.1
537	0.11
538	0.15
539	0.21
540	0.22
541	0.25
542	0.3
543	0.3
544	0.3
545	0.29
546	0.27
547	0.22
548	0.22
549	0.19
550	0.15
551	0.14
552	0.12
553	0.11
554	0.09
555	0.09
556	0.08
557	0.08
558	0.07
559	0.07
560	0.08
561	0.08
562	0.09
563	0.08
564	0.08
565	0.08
566	0.09
567	0.09
568	0.09
569	0.08
570	0.07
571	0.07
572	0.07
573	0.08
574	0.08
575	0.07
576	0.07
577	0.08
578	0.11
579	0.11
580	0.12
581	0.1
582	0.11
583	0.11
584	0.11
585	0.11
586	0.14
587	0.14

A0A550CZ35

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer