FuNGI

A0A550CN32

Protein Details

Accession

A0A550CN32

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
148-171	LPEVGNLTRKKRRREERAYVVPDS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
157-161	KKRRR

Subcellular Location(s)

mito 14.5, cyto_mito 10.5, cyto 5.5, nucl 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003107 HAT IPR010491 PRP1_N IPR045075 Syf1-like IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf IPR019734 TPR_repeat
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF06424 PRP1_N PF13432 TPR_16

Amino Acid Sequences

MASNKPNKLAFLSMPAPASYVAGLGRGASGFTTRSDIGPAREGPSAEVIAEAQARRGEEQEVDPEQFQDPDNEFGLFAGTTYEADDEEADRIYEKVDDAMDARRRARRCAQEQIEMAKHRAERPKIQQQFADLKRGLSAVTDSEWENLPEVGNLTRKKRRREERAYVVPDSVIVGDRGKNEFENALDPRQNEVCFDTAADPGAMTNFIEIGQARDKILSLKLDQISGTATTSGSSTSIDPKGYLTSLDSVIIKSDAEIGDIKRARMLFDSLVKSNPKHAPGWIAAACLEEHAGRMVAARKLIKQGCEMCPKSEDVWLEAARLHNNDDAKVILANAVQHVGQSVKIWLAAADLEHDVKAKKRVLRKALEHIPNSVRLWKETVSLETSASDARILLARAVEVIPLSVELWLALARLEPVERAKAVLNKARKAVPTSHEIWIAAARLWEQVASGQPEAEKLSQYVLVDKTIASAVGALRQHQVLLTREQWLKEAEKCESEGAVRTCEAIVKATVAMDIEEEDQLDTWESDIDGAEARGRVGTARAILAYALKVYPNVKHLWIRAAELEKAHGTRESLDNILSRAVQHCPQTEVLWLMGAKEKWLAGDVPAAREVLERAFIANPESEQIWLAAVKLEAENGEVDVAKQLLIRARDVAGTQRIWMKSAVFERQHGDFDAALQTVSAALKKYPKYAKLYMVQGQIHASQKRYAAARQAYAAGLKAVPKEPALWILASRLEELDNKSIKARALLEKARMVNPGVDTLWAEAVGVEERSSGANQAKATLARALQECPSSGLLWSMAIWSEARPARKARSVDAVKKTNDDSLVLCSIARLFWSERKIEKAREWFGRAVARDEHDYGDIWGWWLKFEREHGTEEHRELVRAKCAQTDPHHGPVWQSIAKDDGNRGKHTKEILELVANALQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.29
3	0.26
4	0.22
5	0.21
6	0.14
7	0.12
8	0.1
9	0.09
10	0.09
11	0.08
12	0.09
13	0.08
14	0.08
15	0.07
16	0.09
17	0.09
18	0.11
19	0.15
20	0.15
21	0.16
22	0.2
23	0.23
24	0.25
25	0.29
26	0.3
27	0.29
28	0.31
29	0.31
30	0.27
31	0.28
32	0.25
33	0.19
34	0.17
35	0.14
36	0.14
37	0.17
38	0.16
39	0.15
40	0.16
41	0.18
42	0.18
43	0.2
44	0.2
45	0.19
46	0.22
47	0.26
48	0.28
49	0.29
50	0.28
51	0.28
52	0.27
53	0.25
54	0.23
55	0.22
56	0.2
57	0.21
58	0.22
59	0.21
60	0.19
61	0.18
62	0.18
63	0.13
64	0.1
65	0.08
66	0.08
67	0.07
68	0.08
69	0.09
70	0.08
71	0.08
72	0.09
73	0.09
74	0.1
75	0.1
76	0.09
77	0.1
78	0.09
79	0.1
80	0.1
81	0.09
82	0.1
83	0.1
84	0.11
85	0.12
86	0.2
87	0.26
88	0.3
89	0.34
90	0.4
91	0.42
92	0.48
93	0.56
94	0.58
95	0.58
96	0.65
97	0.66
98	0.67
99	0.69
100	0.69
101	0.67
102	0.59
103	0.53
104	0.47
105	0.44
106	0.43
107	0.48
108	0.47
109	0.49
110	0.56
111	0.65
112	0.68
113	0.69
114	0.64
115	0.62
116	0.66
117	0.59
118	0.59
119	0.48
120	0.41
121	0.38
122	0.36
123	0.29
124	0.2
125	0.19
126	0.11
127	0.12
128	0.13
129	0.13
130	0.14
131	0.15
132	0.14
133	0.14
134	0.13
135	0.12
136	0.11
137	0.12
138	0.13
139	0.19
140	0.23
141	0.31
142	0.4
143	0.47
144	0.56
145	0.65
146	0.73
147	0.77
148	0.83
149	0.85
150	0.86
151	0.9
152	0.86
153	0.77
154	0.67
155	0.56
156	0.45
157	0.35
158	0.25
159	0.16
160	0.1
161	0.1
162	0.12
163	0.15
164	0.16
165	0.17
166	0.17
167	0.17
168	0.18
169	0.17
170	0.2
171	0.21
172	0.24
173	0.26
174	0.26
175	0.29
176	0.31
177	0.3
178	0.25
179	0.25
180	0.21
181	0.18
182	0.18
183	0.16
184	0.13
185	0.14
186	0.12
187	0.1
188	0.08
189	0.09
190	0.08
191	0.06
192	0.06
193	0.05
194	0.05
195	0.06
196	0.06
197	0.09
198	0.12
199	0.13
200	0.14
201	0.14
202	0.14
203	0.15
204	0.18
205	0.18
206	0.16
207	0.22
208	0.22
209	0.23
210	0.22
211	0.2
212	0.19
213	0.17
214	0.16
215	0.09
216	0.09
217	0.08
218	0.08
219	0.08
220	0.07
221	0.07
222	0.08
223	0.12
224	0.14
225	0.15
226	0.15
227	0.15
228	0.16
229	0.16
230	0.15
231	0.12
232	0.12
233	0.12
234	0.13
235	0.13
236	0.11
237	0.12
238	0.12
239	0.1
240	0.08
241	0.1
242	0.09
243	0.1
244	0.12
245	0.11
246	0.19
247	0.21
248	0.21
249	0.2
250	0.21
251	0.2
252	0.2
253	0.22
254	0.17
255	0.22
256	0.26
257	0.24
258	0.28
259	0.3
260	0.28
261	0.33
262	0.34
263	0.31
264	0.28
265	0.28
266	0.29
267	0.27
268	0.33
269	0.26
270	0.22
271	0.19
272	0.19
273	0.17
274	0.13
275	0.12
276	0.07
277	0.06
278	0.06
279	0.06
280	0.05
281	0.08
282	0.11
283	0.12
284	0.15
285	0.16
286	0.17
287	0.25
288	0.27
289	0.27
290	0.29
291	0.33
292	0.36
293	0.44
294	0.44
295	0.38
296	0.38
297	0.38
298	0.34
299	0.32
300	0.26
301	0.18
302	0.21
303	0.19
304	0.18
305	0.18
306	0.18
307	0.17
308	0.17
309	0.17
310	0.15
311	0.16
312	0.15
313	0.15
314	0.13
315	0.12
316	0.11
317	0.09
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.07
323	0.06
324	0.06
325	0.07
326	0.06
327	0.06
328	0.06
329	0.07
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.05
336	0.05
337	0.06
338	0.06
339	0.07
340	0.07
341	0.08
342	0.08
343	0.11
344	0.16
345	0.19
346	0.23
347	0.31
348	0.39
349	0.46
350	0.53
351	0.56
352	0.59
353	0.64
354	0.66
355	0.59
356	0.55
357	0.49
358	0.45
359	0.41
360	0.36
361	0.27
362	0.21
363	0.22
364	0.19
365	0.2
366	0.17
367	0.18
368	0.16
369	0.17
370	0.16
371	0.14
372	0.14
373	0.11
374	0.1
375	0.08
376	0.06
377	0.05
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.07
385	0.06
386	0.05
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.04
396	0.04
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.04
401	0.04
402	0.05
403	0.06
404	0.07
405	0.07
406	0.08
407	0.1
408	0.14
409	0.17
410	0.22
411	0.26
412	0.27
413	0.29
414	0.31
415	0.3
416	0.29
417	0.3
418	0.27
419	0.27
420	0.28
421	0.28
422	0.26
423	0.24
424	0.22
425	0.18
426	0.16
427	0.11
428	0.08
429	0.07
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.05
434	0.05
435	0.07
436	0.09
437	0.08
438	0.08
439	0.08
440	0.09
441	0.11
442	0.1
443	0.09
444	0.07
445	0.08
446	0.09
447	0.09
448	0.11
449	0.1
450	0.1
451	0.1
452	0.09
453	0.09
454	0.08
455	0.07
456	0.05
457	0.05
458	0.05
459	0.08
460	0.09
461	0.09
462	0.1
463	0.1
464	0.1
465	0.09
466	0.13
467	0.11
468	0.14
469	0.14
470	0.18
471	0.2
472	0.2
473	0.21
474	0.2
475	0.2
476	0.21
477	0.22
478	0.18
479	0.18
480	0.19
481	0.18
482	0.16
483	0.14
484	0.15
485	0.14
486	0.13
487	0.12
488	0.12
489	0.11
490	0.12
491	0.12
492	0.08
493	0.07
494	0.07
495	0.07
496	0.06
497	0.06
498	0.05
499	0.05
500	0.04
501	0.05
502	0.05
503	0.05
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.05
508	0.06
509	0.05
510	0.04
511	0.04
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.04
516	0.04
517	0.04
518	0.05
519	0.05
520	0.05
521	0.05
522	0.05
523	0.05
524	0.06
525	0.06
526	0.06
527	0.06
528	0.06
529	0.06
530	0.07
531	0.07
532	0.06
533	0.06
534	0.05
535	0.05
536	0.06
537	0.08
538	0.09
539	0.11
540	0.13
541	0.15
542	0.18
543	0.19
544	0.22
545	0.22
546	0.21
547	0.22
548	0.23
549	0.21
550	0.19
551	0.2
552	0.16
553	0.16
554	0.15
555	0.13
556	0.11
557	0.12
558	0.14
559	0.14
560	0.13
561	0.14
562	0.14
563	0.13
564	0.14
565	0.12
566	0.1
567	0.1
568	0.12
569	0.14
570	0.16
571	0.17
572	0.18
573	0.19
574	0.19
575	0.19
576	0.17
577	0.14
578	0.13
579	0.11
580	0.1
581	0.12
582	0.12
583	0.11
584	0.11
585	0.11
586	0.1
587	0.11
588	0.1
589	0.07
590	0.13
591	0.13
592	0.14
593	0.14
594	0.14
595	0.13
596	0.13
597	0.13
598	0.08
599	0.09
600	0.08
601	0.08
602	0.09
603	0.09
604	0.1
605	0.1
606	0.09
607	0.09
608	0.09
609	0.09
610	0.08
611	0.08
612	0.07
613	0.07
614	0.07
615	0.07
616	0.06
617	0.07
618	0.06
619	0.07
620	0.06
621	0.07
622	0.07
623	0.06
624	0.06
625	0.05
626	0.06
627	0.06
628	0.06
629	0.06
630	0.06
631	0.07
632	0.11
633	0.12
634	0.13
635	0.13
636	0.14
637	0.14
638	0.15
639	0.18
640	0.18
641	0.17
642	0.18
643	0.22
644	0.22
645	0.23
646	0.23
647	0.19
648	0.2
649	0.24
650	0.3
651	0.26
652	0.28
653	0.29
654	0.3
655	0.31
656	0.27
657	0.24
658	0.16
659	0.16
660	0.16
661	0.13
662	0.11
663	0.09
664	0.08
665	0.07
666	0.08
667	0.08
668	0.07
669	0.09
670	0.15
671	0.17
672	0.25
673	0.3
674	0.36
675	0.42
676	0.46
677	0.51
678	0.5
679	0.55
680	0.53
681	0.53
682	0.47
683	0.41
684	0.38
685	0.36
686	0.36
687	0.32
688	0.29
689	0.25
690	0.26
691	0.29
692	0.29
693	0.28
694	0.3
695	0.32
696	0.31
697	0.3
698	0.3
699	0.27
700	0.25
701	0.23
702	0.15
703	0.13
704	0.13
705	0.14
706	0.14
707	0.14
708	0.14
709	0.15
710	0.15
711	0.17
712	0.17
713	0.15
714	0.14
715	0.14
716	0.16
717	0.16
718	0.15
719	0.13
720	0.13
721	0.15
722	0.19
723	0.24
724	0.24
725	0.24
726	0.25
727	0.27
728	0.26
729	0.27
730	0.28
731	0.27
732	0.34
733	0.37
734	0.4
735	0.43
736	0.46
737	0.44
738	0.41
739	0.35
740	0.3
741	0.27
742	0.25
743	0.19
744	0.17
745	0.16
746	0.15
747	0.14
748	0.11
749	0.09
750	0.07
751	0.08
752	0.08
753	0.08
754	0.07
755	0.06
756	0.07
757	0.08
758	0.09
759	0.11
760	0.13
761	0.16
762	0.16
763	0.18
764	0.2
765	0.2
766	0.21
767	0.21
768	0.19
769	0.2
770	0.21
771	0.21
772	0.22
773	0.22
774	0.21
775	0.2
776	0.21
777	0.17
778	0.16
779	0.15
780	0.13
781	0.12
782	0.11
783	0.09
784	0.08
785	0.08
786	0.09
787	0.08
788	0.15
789	0.18
790	0.21
791	0.25
792	0.29
793	0.35
794	0.42
795	0.44
796	0.41
797	0.48
798	0.54
799	0.59
800	0.63
801	0.64
802	0.59
803	0.6
804	0.58
805	0.52
806	0.44
807	0.36
808	0.28
809	0.25
810	0.25
811	0.22
812	0.19
813	0.16
814	0.15
815	0.14
816	0.13
817	0.11
818	0.14
819	0.19
820	0.25
821	0.3
822	0.32
823	0.41
824	0.47
825	0.49
826	0.54
827	0.58
828	0.61
829	0.63
830	0.65
831	0.58
832	0.57
833	0.58
834	0.51
835	0.46
836	0.43
837	0.38
838	0.38
839	0.37
840	0.34
841	0.28
842	0.27
843	0.24
844	0.21
845	0.18
846	0.15
847	0.17
848	0.15
849	0.16
850	0.18
851	0.19
852	0.2
853	0.25
854	0.32
855	0.31
856	0.35
857	0.37
858	0.42
859	0.45
860	0.44
861	0.46
862	0.39
863	0.39
864	0.39
865	0.39
866	0.39
867	0.38
868	0.38
869	0.38
870	0.4
871	0.46
872	0.48
873	0.54
874	0.52
875	0.54
876	0.55
877	0.48
878	0.48
879	0.45
880	0.46
881	0.39
882	0.33
883	0.27
884	0.29
885	0.31
886	0.32
887	0.34
888	0.36
889	0.38
890	0.44
891	0.47
892	0.45
893	0.48
894	0.49
895	0.45
896	0.42
897	0.41
898	0.38
899	0.37
900	0.35

A0A550CN32

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer