FuNGI

A0A550BS28

Protein Details

Accession

A0A550BS28

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
87-112	SYVKGQPIKVEKRKINFWKRAPAPPH	Hydrophilic
1062-1081	LANCSQSRWRRDRIGRMNLH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 11.5, cyto 10.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MDIQIKGLPPFLNDYDVTKLIAQVLHSEAFVPTADESDDEELPSHSPIDKRINFKVKLNRSLAGSVRNDGTGILTVPSDKIGKRFLSYVKGQPIKVEKRKINFWKRAPAPPHIASLLGRTPFVDPEIEETHERIVESLNVGLRVDRVQFGVLFRTRYDKPVSREFSAEWSKEFTTRGVAWLRFEYDHKLIRITLGDSTTEMLGSSIALNFINIQRMALGYQGKPHVVFELLTPPVLERIQFHRHPDDDRKSKLRIGYLDEAHQLVSPYAWQLRIELTDKDFMDLGNVFCDLCKKAGIDNLLLRMVSRGPGNRPVWHKIEASGHKFFERRRIERLCREFAKFPWPVAFQLEALLRNGLITTGEIESSLPGISELCDTYPEHECSRVGDILRKFNIELGKRPATESPASCFSRVMRDFQFPELRITPGHFLCCHIIFTPTRTVLEGPYPVQSNRIIRRYPGYEHHFIRVEFRDEDRLSYRWDRTVDGSHFVRDRVGGILANGFELGGRSFQFLAYSTSALREHSVWFLNEFYHYEAEYPGWVTAQDIRDSIGHFPASSKLLKQPSKYAARLAQAFTATEPSVKIMQHEWEEMPDIGKDPYLFTDGYQIRFLGYKGMVAVDEEMDKDASGIHMRLRPSMRKFDSREEDMREADIEIARHFAYPNNVHQQNLGVGSEEFEKLQQRAVASVERIHDGVDEWKEVLRSNSLGRQFRLPYVLDNLKEMGLSMQSRPGRRPRPGFDSPFFQKIREVARMAILRDIKHNARFEIPDSFKLVGIADEGPAYRAAVKRTSCVQRNEGESPIWLEGNCVITRSPVTHPGDVQRVHAIGKPPEGMLCSFRNLKNLVVLPSVGERSLCSKLSGGDLDGDLYDIIMCEELLYSQQETRTLGRATTVDDICNFIVEYINSDVVGLLSDRLLVIADQSKQGIFDVGCAVDYPKQGIPVDLENGNLPRPLMRQSHITARNDYYRSDKALGRLYRNIQIRDVAPLSNEEATSTPSGVNAITSAIERRGAEYIDETLGFDNDLVQLFKRYAEELRYICTTHTVSNTPGVELIEEEVIVGTILANCSQSRWRRDRIGRMNLHMSQLIHTLLTFNRAVQAWKLSVAQYKDWGAKSFGLITLAYVFECFSILETARDGAAMIST

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.28
3	0.28
4	0.28
5	0.23
6	0.22
7	0.21
8	0.21
9	0.19
10	0.17
11	0.19
12	0.18
13	0.18
14	0.18
15	0.15
16	0.15
17	0.14
18	0.12
19	0.09
20	0.1
21	0.1
22	0.1
23	0.13
24	0.15
25	0.16
26	0.15
27	0.15
28	0.15
29	0.16
30	0.16
31	0.15
32	0.15
33	0.16
34	0.22
35	0.32
36	0.37
37	0.43
38	0.52
39	0.6
40	0.6
41	0.67
42	0.71
43	0.69
44	0.73
45	0.7
46	0.63
47	0.58
48	0.6
49	0.55
50	0.53
51	0.46
52	0.39
53	0.37
54	0.34
55	0.3
56	0.24
57	0.22
58	0.15
59	0.13
60	0.11
61	0.1
62	0.1
63	0.11
64	0.13
65	0.15
66	0.15
67	0.18
68	0.23
69	0.25
70	0.27
71	0.32
72	0.34
73	0.37
74	0.42
75	0.46
76	0.5
77	0.53
78	0.51
79	0.53
80	0.58
81	0.62
82	0.65
83	0.67
84	0.64
85	0.66
86	0.76
87	0.8
88	0.81
89	0.81
90	0.79
91	0.8
92	0.79
93	0.82
94	0.77
95	0.73
96	0.71
97	0.63
98	0.6
99	0.5
100	0.45
101	0.36
102	0.36
103	0.34
104	0.26
105	0.24
106	0.2
107	0.21
108	0.21
109	0.21
110	0.18
111	0.13
112	0.17
113	0.21
114	0.23
115	0.22
116	0.22
117	0.23
118	0.23
119	0.22
120	0.17
121	0.15
122	0.14
123	0.14
124	0.15
125	0.15
126	0.15
127	0.15
128	0.15
129	0.15
130	0.15
131	0.16
132	0.14
133	0.13
134	0.14
135	0.15
136	0.16
137	0.22
138	0.23
139	0.22
140	0.22
141	0.27
142	0.27
143	0.31
144	0.37
145	0.37
146	0.4
147	0.49
148	0.54
149	0.51
150	0.52
151	0.49
152	0.49
153	0.49
154	0.45
155	0.36
156	0.34
157	0.33
158	0.32
159	0.32
160	0.24
161	0.22
162	0.22
163	0.25
164	0.28
165	0.28
166	0.29
167	0.3
168	0.32
169	0.28
170	0.29
171	0.31
172	0.3
173	0.34
174	0.31
175	0.31
176	0.28
177	0.28
178	0.28
179	0.24
180	0.21
181	0.17
182	0.17
183	0.15
184	0.16
185	0.14
186	0.12
187	0.11
188	0.08
189	0.06
190	0.06
191	0.06
192	0.05
193	0.06
194	0.06
195	0.06
196	0.08
197	0.09
198	0.13
199	0.12
200	0.12
201	0.12
202	0.12
203	0.13
204	0.14
205	0.17
206	0.13
207	0.18
208	0.2
209	0.21
210	0.21
211	0.21
212	0.19
213	0.17
214	0.16
215	0.13
216	0.17
217	0.16
218	0.16
219	0.16
220	0.15
221	0.16
222	0.16
223	0.15
224	0.12
225	0.18
226	0.27
227	0.3
228	0.35
229	0.39
230	0.41
231	0.47
232	0.54
233	0.57
234	0.57
235	0.61
236	0.62
237	0.58
238	0.6
239	0.57
240	0.53
241	0.46
242	0.45
243	0.45
244	0.42
245	0.41
246	0.38
247	0.35
248	0.3
249	0.27
250	0.2
251	0.13
252	0.11
253	0.08
254	0.09
255	0.11
256	0.11
257	0.11
258	0.11
259	0.13
260	0.16
261	0.18
262	0.18
263	0.19
264	0.23
265	0.23
266	0.23
267	0.21
268	0.18
269	0.18
270	0.17
271	0.14
272	0.1
273	0.1
274	0.09
275	0.09
276	0.12
277	0.1
278	0.1
279	0.11
280	0.11
281	0.13
282	0.17
283	0.19
284	0.2
285	0.22
286	0.23
287	0.23
288	0.22
289	0.2
290	0.17
291	0.15
292	0.13
293	0.13
294	0.14
295	0.17
296	0.26
297	0.29
298	0.33
299	0.38
300	0.42
301	0.43
302	0.43
303	0.41
304	0.35
305	0.42
306	0.43
307	0.44
308	0.43
309	0.4
310	0.39
311	0.42
312	0.39
313	0.41
314	0.42
315	0.4
316	0.44
317	0.52
318	0.57
319	0.65
320	0.7
321	0.68
322	0.63
323	0.64
324	0.59
325	0.52
326	0.52
327	0.43
328	0.37
329	0.34
330	0.32
331	0.28
332	0.28
333	0.27
334	0.18
335	0.2
336	0.2
337	0.16
338	0.15
339	0.14
340	0.11
341	0.1
342	0.1
343	0.07
344	0.05
345	0.05
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.06
352	0.07
353	0.06
354	0.05
355	0.04
356	0.04
357	0.05
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.08
362	0.08
363	0.11
364	0.16
365	0.18
366	0.17
367	0.19
368	0.19
369	0.19
370	0.22
371	0.22
372	0.18
373	0.22
374	0.24
375	0.29
376	0.3
377	0.29
378	0.26
379	0.27
380	0.32
381	0.27
382	0.3
383	0.3
384	0.33
385	0.33
386	0.34
387	0.32
388	0.31
389	0.32
390	0.29
391	0.26
392	0.29
393	0.3
394	0.29
395	0.28
396	0.24
397	0.3
398	0.3
399	0.3
400	0.25
401	0.29
402	0.3
403	0.34
404	0.38
405	0.3
406	0.33
407	0.3
408	0.28
409	0.24
410	0.24
411	0.23
412	0.19
413	0.2
414	0.16
415	0.17
416	0.18
417	0.18
418	0.18
419	0.14
420	0.16
421	0.15
422	0.17
423	0.2
424	0.18
425	0.18
426	0.18
427	0.18
428	0.16
429	0.18
430	0.17
431	0.13
432	0.14
433	0.15
434	0.15
435	0.16
436	0.18
437	0.22
438	0.26
439	0.31
440	0.29
441	0.29
442	0.34
443	0.35
444	0.35
445	0.37
446	0.37
447	0.39
448	0.4
449	0.42
450	0.4
451	0.36
452	0.38
453	0.32
454	0.29
455	0.25
456	0.24
457	0.27
458	0.25
459	0.27
460	0.25
461	0.24
462	0.25
463	0.28
464	0.28
465	0.25
466	0.26
467	0.25
468	0.24
469	0.29
470	0.26
471	0.27
472	0.26
473	0.25
474	0.24
475	0.23
476	0.21
477	0.15
478	0.14
479	0.1
480	0.1
481	0.08
482	0.07
483	0.08
484	0.08
485	0.07
486	0.06
487	0.05
488	0.04
489	0.05
490	0.05
491	0.04
492	0.05
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.07
497	0.07
498	0.1
499	0.1
500	0.1
501	0.1
502	0.11
503	0.12
504	0.12
505	0.12
506	0.1
507	0.1
508	0.11
509	0.13
510	0.11
511	0.11
512	0.12
513	0.11
514	0.11
515	0.11
516	0.1
517	0.09
518	0.09
519	0.09
520	0.09
521	0.08
522	0.08
523	0.08
524	0.06
525	0.05
526	0.05
527	0.05
528	0.09
529	0.1
530	0.11
531	0.1
532	0.11
533	0.12
534	0.13
535	0.13
536	0.11
537	0.09
538	0.09
539	0.09
540	0.1
541	0.12
542	0.11
543	0.11
544	0.15
545	0.23
546	0.26
547	0.27
548	0.3
549	0.35
550	0.41
551	0.41
552	0.38
553	0.34
554	0.34
555	0.35
556	0.3
557	0.24
558	0.19
559	0.18
560	0.15
561	0.13
562	0.1
563	0.09
564	0.08
565	0.08
566	0.1
567	0.1
568	0.1
569	0.1
570	0.12
571	0.13
572	0.14
573	0.13
574	0.11
575	0.13
576	0.12
577	0.11
578	0.09
579	0.09
580	0.07
581	0.08
582	0.07
583	0.06
584	0.07
585	0.08
586	0.08
587	0.07
588	0.16
589	0.17
590	0.18
591	0.18
592	0.17
593	0.16
594	0.16
595	0.16
596	0.11
597	0.1
598	0.08
599	0.08
600	0.08
601	0.08
602	0.07
603	0.07
604	0.05
605	0.05
606	0.05
607	0.05
608	0.05
609	0.05
610	0.05
611	0.04
612	0.05
613	0.05
614	0.06
615	0.08
616	0.11
617	0.12
618	0.16
619	0.2
620	0.26
621	0.29
622	0.37
623	0.38
624	0.43
625	0.46
626	0.5
627	0.53
628	0.51
629	0.52
630	0.48
631	0.46
632	0.39
633	0.36
634	0.28
635	0.22
636	0.18
637	0.15
638	0.1
639	0.08
640	0.09
641	0.09
642	0.08
643	0.08
644	0.09
645	0.13
646	0.15
647	0.2
648	0.27
649	0.27
650	0.27
651	0.27
652	0.27
653	0.23
654	0.21
655	0.17
656	0.09
657	0.08
658	0.09
659	0.1
660	0.1
661	0.08
662	0.08
663	0.1
664	0.09
665	0.11
666	0.12
667	0.1
668	0.11
669	0.13
670	0.14
671	0.13
672	0.15
673	0.15
674	0.14
675	0.14
676	0.13
677	0.11
678	0.1
679	0.13
680	0.12
681	0.11
682	0.1
683	0.11
684	0.12
685	0.12
686	0.12
687	0.1
688	0.1
689	0.12
690	0.17
691	0.23
692	0.25
693	0.26
694	0.3
695	0.3
696	0.29
697	0.31
698	0.26
699	0.21
700	0.25
701	0.27
702	0.23
703	0.22
704	0.22
705	0.19
706	0.18
707	0.16
708	0.1
709	0.09
710	0.09
711	0.09
712	0.15
713	0.18
714	0.2
715	0.25
716	0.34
717	0.39
718	0.45
719	0.52
720	0.51
721	0.57
722	0.63
723	0.65
724	0.58
725	0.58
726	0.54
727	0.54
728	0.49
729	0.41
730	0.35
731	0.32
732	0.34
733	0.31
734	0.29
735	0.22
736	0.27
737	0.28
738	0.27
739	0.29
740	0.26
741	0.22
742	0.24
743	0.28
744	0.26
745	0.3
746	0.31
747	0.28
748	0.28
749	0.29
750	0.28
751	0.32
752	0.31
753	0.27
754	0.29
755	0.28
756	0.25
757	0.24
758	0.22
759	0.13
760	0.12
761	0.11
762	0.08
763	0.07
764	0.07
765	0.08
766	0.08
767	0.08
768	0.09
769	0.11
770	0.13
771	0.18
772	0.19
773	0.21
774	0.28
775	0.36
776	0.4
777	0.43
778	0.45
779	0.43
780	0.48
781	0.49
782	0.43
783	0.35
784	0.29
785	0.27
786	0.23
787	0.2
788	0.14
789	0.11
790	0.11
791	0.14
792	0.13
793	0.12
794	0.11
795	0.11
796	0.12
797	0.15
798	0.15
799	0.21
800	0.25
801	0.25
802	0.27
803	0.31
804	0.36
805	0.34
806	0.33
807	0.27
808	0.24
809	0.24
810	0.25
811	0.25
812	0.21
813	0.23
814	0.22
815	0.2
816	0.2
817	0.2
818	0.18
819	0.17
820	0.17
821	0.18
822	0.22
823	0.23
824	0.27
825	0.27
826	0.26
827	0.27
828	0.28
829	0.27
830	0.23
831	0.22
832	0.19
833	0.19
834	0.19
835	0.14
836	0.12
837	0.1
838	0.13
839	0.17
840	0.16
841	0.15
842	0.15
843	0.16
844	0.19
845	0.19
846	0.15
847	0.13
848	0.13
849	0.12
850	0.11
851	0.11
852	0.07
853	0.07
854	0.06
855	0.04
856	0.04
857	0.04
858	0.04
859	0.03
860	0.04
861	0.04
862	0.05
863	0.07
864	0.08
865	0.1
866	0.11
867	0.12
868	0.15
869	0.16
870	0.2
871	0.2
872	0.18
873	0.19
874	0.19
875	0.2
876	0.24
877	0.23
878	0.19
879	0.19
880	0.22
881	0.19
882	0.19
883	0.16
884	0.1
885	0.11
886	0.09
887	0.12
888	0.12
889	0.12
890	0.11
891	0.11
892	0.11
893	0.09
894	0.1
895	0.07
896	0.05
897	0.05
898	0.05
899	0.05
900	0.05
901	0.05
902	0.04
903	0.07
904	0.1
905	0.11
906	0.12
907	0.13
908	0.13
909	0.14
910	0.14
911	0.15
912	0.1
913	0.11
914	0.12
915	0.11
916	0.11
917	0.11
918	0.13
919	0.13
920	0.14
921	0.16
922	0.15
923	0.18
924	0.18
925	0.19
926	0.2
927	0.2
928	0.22
929	0.2
930	0.19
931	0.18
932	0.19
933	0.19
934	0.17
935	0.14
936	0.13
937	0.14
938	0.2
939	0.21
940	0.22
941	0.27
942	0.3
943	0.4
944	0.45
945	0.47
946	0.46
947	0.47
948	0.52
949	0.47
950	0.46
951	0.43
952	0.39
953	0.4
954	0.39
955	0.37
956	0.34
957	0.42
958	0.45
959	0.44
960	0.47
961	0.47
962	0.5
963	0.55
964	0.52
965	0.45
966	0.43
967	0.38
968	0.37
969	0.35
970	0.28
971	0.22
972	0.22
973	0.23
974	0.21
975	0.2
976	0.15
977	0.14
978	0.16
979	0.17
980	0.16
981	0.13
982	0.11
983	0.12
984	0.11
985	0.11
986	0.08
987	0.07
988	0.07
989	0.08
990	0.1
991	0.11
992	0.14
993	0.14
994	0.16
995	0.17
996	0.17
997	0.17
998	0.17
999	0.18
1000	0.16
1001	0.16
1002	0.15
1003	0.14
1004	0.13
1005	0.12
1006	0.1
1007	0.09
1008	0.08
1009	0.1
1010	0.1
1011	0.1
1012	0.12
1013	0.12
1014	0.14
1015	0.15
1016	0.16
1017	0.18
1018	0.21
1019	0.27
1020	0.26
1021	0.3
1022	0.31
1023	0.3
1024	0.28
1025	0.29
1026	0.27
1027	0.24
1028	0.27
1029	0.25
1030	0.25
1031	0.31
1032	0.31
1033	0.27
1034	0.27
1035	0.23
1036	0.19
1037	0.17
1038	0.17
1039	0.1
1040	0.09
1041	0.09
1042	0.07
1043	0.07
1044	0.06
1045	0.06
1046	0.04
1047	0.05
1048	0.06
1049	0.07
1050	0.09
1051	0.09
1052	0.12
1053	0.2
1054	0.27
1055	0.36
1056	0.43
1057	0.5
1058	0.59
1059	0.68
1060	0.77
1061	0.79
1062	0.82
1063	0.79
1064	0.79
1065	0.79
1066	0.71
1067	0.65
1068	0.57
1069	0.47
1070	0.39
1071	0.34
1072	0.28
1073	0.2
1074	0.17
1075	0.16
1076	0.14
1077	0.17
1078	0.16
1079	0.14
1080	0.17
1081	0.18
1082	0.2
1083	0.21
1084	0.26
1085	0.23
1086	0.25
1087	0.26
1088	0.25
1089	0.31
1090	0.33
1091	0.32
1092	0.31
1093	0.35
1094	0.39
1095	0.39
1096	0.39
1097	0.35
1098	0.34
1099	0.33
1100	0.31
1101	0.28
1102	0.23
1103	0.21
1104	0.19
1105	0.18
1106	0.17
1107	0.14
1108	0.12
1109	0.11
1110	0.09
1111	0.09
1112	0.08
1113	0.08
1114	0.11
1115	0.12
1116	0.13
1117	0.14
1118	0.15
1119	0.14
1120	0.14
1121	0.13

A0A550BS28

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer