Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550C5S8

Protein Details
Accession A0A550C5S8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
438-458TAMVEYMKKRKGKKTMGKRKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
445-458KKRKGKKTMGKRKR
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 9, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR023780  Chromo_domain  
IPR040684  HMUDK_hel  
Pfam View protein in Pfam  
PF18723  aGPT-Pplase1  
PF00385  Chromo  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50013  CHROMO_2  
CDD cd00024  CD_CSD  
Amino Acid Sequences MSSSPLTSANSSALTSPESSPEPNGSSLSKNSTLSKACSRIQHASRRDRITQTPLPPFFDVDGMQLKPTPQFNMLWYWLAERQEIYVRRQQGLPREEWTNDPIMRDFRFCNAYRVLDRESQFLIREVIQKGKQTPVEIAFRVLLYDIFTRQSTYELLQQHIGKLQWKTYNRERYSEVLRSHKGSLYTAAFQKTSSSDAATKNRPRYEAHLDDLERFMSDKLPRRIAKATHSVEVYEYFLWQRSYAHFKSYQVTVNFTYTPLLNFNANDFVVPGPGARKGLTRMFGTSLASACAKDPTAEMRALLWLTRTQQEHFERCGLEFKLLNGDRPLEVPDIEHAVCELDKYLRGGARKVYKVAEGGARLPPPVLPEAWKQKARRESNVREAWPNLVKEKSWDLEEIVGDKVEDGVTWVRVKWVGFPESKNTWERASHIRHDSRTAMVEYMKKRKGKKTMGKRKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.17
4 0.19
5 0.2
6 0.21
7 0.23
8 0.26
9 0.26
10 0.25
11 0.27
12 0.25
13 0.27
14 0.29
15 0.32
16 0.32
17 0.32
18 0.34
19 0.38
20 0.39
21 0.41
22 0.45
23 0.45
24 0.45
25 0.49
26 0.52
27 0.56
28 0.6
29 0.65
30 0.66
31 0.7
32 0.75
33 0.75
34 0.74
35 0.71
36 0.69
37 0.68
38 0.66
39 0.64
40 0.65
41 0.61
42 0.59
43 0.54
44 0.5
45 0.42
46 0.36
47 0.28
48 0.22
49 0.24
50 0.2
51 0.2
52 0.19
53 0.19
54 0.21
55 0.23
56 0.22
57 0.2
58 0.21
59 0.22
60 0.27
61 0.28
62 0.26
63 0.24
64 0.25
65 0.26
66 0.26
67 0.25
68 0.19
69 0.19
70 0.25
71 0.28
72 0.3
73 0.32
74 0.35
75 0.36
76 0.39
77 0.41
78 0.43
79 0.45
80 0.42
81 0.39
82 0.4
83 0.39
84 0.38
85 0.36
86 0.33
87 0.29
88 0.28
89 0.27
90 0.27
91 0.27
92 0.28
93 0.26
94 0.23
95 0.29
96 0.28
97 0.3
98 0.3
99 0.33
100 0.32
101 0.35
102 0.35
103 0.35
104 0.35
105 0.33
106 0.32
107 0.29
108 0.27
109 0.24
110 0.22
111 0.18
112 0.23
113 0.22
114 0.26
115 0.27
116 0.3
117 0.31
118 0.35
119 0.35
120 0.31
121 0.32
122 0.3
123 0.32
124 0.29
125 0.28
126 0.23
127 0.21
128 0.19
129 0.16
130 0.12
131 0.09
132 0.1
133 0.09
134 0.11
135 0.11
136 0.12
137 0.12
138 0.13
139 0.12
140 0.12
141 0.17
142 0.17
143 0.19
144 0.22
145 0.22
146 0.21
147 0.23
148 0.22
149 0.21
150 0.2
151 0.24
152 0.27
153 0.3
154 0.36
155 0.43
156 0.53
157 0.5
158 0.52
159 0.5
160 0.47
161 0.5
162 0.5
163 0.44
164 0.41
165 0.41
166 0.4
167 0.39
168 0.37
169 0.32
170 0.26
171 0.25
172 0.21
173 0.21
174 0.21
175 0.21
176 0.19
177 0.18
178 0.18
179 0.16
180 0.16
181 0.13
182 0.12
183 0.14
184 0.19
185 0.25
186 0.32
187 0.37
188 0.41
189 0.43
190 0.43
191 0.41
192 0.42
193 0.46
194 0.41
195 0.37
196 0.36
197 0.34
198 0.33
199 0.32
200 0.26
201 0.17
202 0.14
203 0.12
204 0.11
205 0.15
206 0.22
207 0.25
208 0.32
209 0.33
210 0.36
211 0.4
212 0.38
213 0.39
214 0.4
215 0.39
216 0.34
217 0.33
218 0.3
219 0.26
220 0.25
221 0.21
222 0.12
223 0.1
224 0.08
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.18
231 0.18
232 0.21
233 0.22
234 0.23
235 0.25
236 0.26
237 0.29
238 0.22
239 0.25
240 0.22
241 0.22
242 0.21
243 0.19
244 0.18
245 0.12
246 0.12
247 0.11
248 0.11
249 0.1
250 0.09
251 0.1
252 0.12
253 0.11
254 0.1
255 0.09
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.07
262 0.08
263 0.08
264 0.09
265 0.12
266 0.16
267 0.18
268 0.18
269 0.19
270 0.2
271 0.2
272 0.2
273 0.18
274 0.15
275 0.13
276 0.12
277 0.11
278 0.1
279 0.1
280 0.09
281 0.08
282 0.09
283 0.11
284 0.13
285 0.13
286 0.13
287 0.12
288 0.13
289 0.13
290 0.13
291 0.11
292 0.1
293 0.12
294 0.16
295 0.18
296 0.17
297 0.26
298 0.32
299 0.34
300 0.35
301 0.36
302 0.32
303 0.31
304 0.36
305 0.28
306 0.25
307 0.21
308 0.19
309 0.26
310 0.26
311 0.27
312 0.23
313 0.24
314 0.21
315 0.21
316 0.23
317 0.14
318 0.14
319 0.13
320 0.13
321 0.15
322 0.14
323 0.13
324 0.11
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.1
329 0.08
330 0.09
331 0.1
332 0.13
333 0.15
334 0.17
335 0.19
336 0.25
337 0.32
338 0.34
339 0.35
340 0.34
341 0.33
342 0.32
343 0.33
344 0.3
345 0.23
346 0.23
347 0.25
348 0.24
349 0.22
350 0.21
351 0.19
352 0.17
353 0.17
354 0.16
355 0.15
356 0.22
357 0.32
358 0.39
359 0.46
360 0.46
361 0.52
362 0.62
363 0.65
364 0.67
365 0.68
366 0.69
367 0.73
368 0.78
369 0.73
370 0.67
371 0.62
372 0.58
373 0.54
374 0.48
375 0.41
376 0.35
377 0.32
378 0.32
379 0.36
380 0.32
381 0.28
382 0.27
383 0.24
384 0.25
385 0.26
386 0.23
387 0.19
388 0.16
389 0.14
390 0.13
391 0.12
392 0.09
393 0.07
394 0.09
395 0.1
396 0.13
397 0.14
398 0.14
399 0.16
400 0.18
401 0.19
402 0.23
403 0.27
404 0.3
405 0.33
406 0.36
407 0.41
408 0.44
409 0.49
410 0.46
411 0.42
412 0.4
413 0.38
414 0.39
415 0.41
416 0.44
417 0.47
418 0.53
419 0.58
420 0.57
421 0.6
422 0.59
423 0.53
424 0.5
425 0.44
426 0.36
427 0.34
428 0.38
429 0.41
430 0.49
431 0.52
432 0.54
433 0.6
434 0.67
435 0.73
436 0.77
437 0.8
438 0.81