FuNGI

A0A550CIM1

Protein Details

Accession

A0A550CIM1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-24	ATTARPIKPGKKGPEPAKRAPAW	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-21	PIKPGKKGPEPAKRA

Subcellular Location(s)

mito 14.5, cyto_mito 10.333, nucl 6.5, cyto_nucl 6.333, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045117 ATXN2-like IPR009604 LsmAD_domain
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF06741 LsmAD

Amino Acid Sequences

MATTARPIKPGKKGPEPAKRAPAWTGARTFSPSSTPRPPSAAPTAAQPAATNGTAKPEDGVLRPLTGLIGTTITLQTKTGAHYEGVVMSTSGEGDTTGVTLKDAKDITQPGAPLKDQQFVASTNIDKWSSGPALVPGPQDSFRTDTDISAKKGLPRERELQAWQPSGADASGGAIGGKGDDLTFGPGASTNTSWDQFATNEKLFGVKTDFDENIYTTKLDRSHPNFKEREREAQRIANEIQGTTSSNPHINEERNLADDSGVNEEDRYGAVVRGPGAYVPPGARRGDPAPAAKVEVPKVSVNGPDGKAAQPASPAPAASKPAAEAAFREFVQGEKQRLTLKRQAIVKSEMDKKMAELVKFSQSFKLNKPMPDDLVNILAKDEEKQKAIREKATKDAAAANARSIGPSSTATQTAAPGVPRSVLPPPSNKLKASVASPKAAAAPPATTGNQKTAATKPAADKPRLSASGKPLVSMVIQPIPAFKGQKARPVSQQPPASTAQVPMSPNGNNKLNVNASSFKPTTKASPSPSPSTTTSSTPNGVATKPKPEAPNPFFGARPLRKLPAVHLKDDFNPFKHGKVVDARDAAPAWPYTGKRFMLMFPMPQQQQQQQQQPAQQQQPSPHMVQPVPPPMPPPPYEDDPTQQQQQAQARGYVYAYPPYGYPGQMMQPMMAGMPPPGPPGAYMPGPYMQPIPYPPGMPPNMMYPPGMQMPPQGYMQPPPHPGAYPQPPNGAGPRQSMPATPIPPHAHPSYYHQSPQLAHAVPYPMMMPPPPHQGYEGPNAPPVQMGGHA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.78
2	0.83
3	0.84
4	0.82
5	0.82
6	0.76
7	0.7
8	0.63
9	0.62
10	0.58
11	0.55
12	0.51
13	0.44
14	0.44
15	0.45
16	0.43
17	0.35
18	0.36
19	0.34
20	0.37
21	0.44
22	0.47
23	0.45
24	0.49
25	0.49
26	0.48
27	0.52
28	0.48
29	0.39
30	0.39
31	0.42
32	0.38
33	0.36
34	0.3
35	0.25
36	0.25
37	0.25
38	0.21
39	0.15
40	0.21
41	0.21
42	0.21
43	0.19
44	0.19
45	0.21
46	0.21
47	0.26
48	0.2
49	0.21
50	0.21
51	0.2
52	0.17
53	0.14
54	0.12
55	0.09
56	0.08
57	0.07
58	0.09
59	0.11
60	0.12
61	0.12
62	0.12
63	0.13
64	0.14
65	0.16
66	0.17
67	0.17
68	0.16
69	0.16
70	0.17
71	0.17
72	0.16
73	0.14
74	0.11
75	0.1
76	0.1
77	0.09
78	0.07
79	0.06
80	0.05
81	0.05
82	0.05
83	0.05
84	0.07
85	0.06
86	0.07
87	0.1
88	0.1
89	0.15
90	0.15
91	0.16
92	0.21
93	0.24
94	0.26
95	0.26
96	0.26
97	0.25
98	0.28
99	0.27
100	0.29
101	0.29
102	0.32
103	0.29
104	0.29
105	0.28
106	0.26
107	0.28
108	0.24
109	0.23
110	0.2
111	0.23
112	0.22
113	0.2
114	0.19
115	0.21
116	0.19
117	0.18
118	0.17
119	0.16
120	0.18
121	0.2
122	0.21
123	0.18
124	0.2
125	0.21
126	0.21
127	0.21
128	0.22
129	0.2
130	0.24
131	0.23
132	0.22
133	0.28
134	0.32
135	0.32
136	0.33
137	0.34
138	0.34
139	0.41
140	0.45
141	0.45
142	0.45
143	0.48
144	0.47
145	0.5
146	0.49
147	0.5
148	0.51
149	0.46
150	0.4
151	0.34
152	0.31
153	0.27
154	0.23
155	0.14
156	0.07
157	0.06
158	0.06
159	0.06
160	0.05
161	0.05
162	0.05
163	0.05
164	0.05
165	0.04
166	0.03
167	0.04
168	0.05
169	0.07
170	0.07
171	0.07
172	0.08
173	0.09
174	0.1
175	0.11
176	0.11
177	0.11
178	0.14
179	0.15
180	0.15
181	0.14
182	0.15
183	0.14
184	0.18
185	0.22
186	0.19
187	0.19
188	0.19
189	0.2
190	0.19
191	0.2
192	0.18
193	0.13
194	0.15
195	0.19
196	0.19
197	0.19
198	0.2
199	0.19
200	0.17
201	0.17
202	0.15
203	0.12
204	0.15
205	0.16
206	0.18
207	0.27
208	0.32
209	0.42
210	0.47
211	0.55
212	0.56
213	0.57
214	0.64
215	0.58
216	0.61
217	0.58
218	0.59
219	0.54
220	0.55
221	0.52
222	0.47
223	0.45
224	0.38
225	0.31
226	0.25
227	0.21
228	0.16
229	0.18
230	0.14
231	0.15
232	0.13
233	0.15
234	0.16
235	0.19
236	0.22
237	0.23
238	0.24
239	0.25
240	0.24
241	0.24
242	0.24
243	0.2
244	0.17
245	0.15
246	0.14
247	0.14
248	0.14
249	0.11
250	0.11
251	0.1
252	0.1
253	0.09
254	0.09
255	0.06
256	0.06
257	0.07
258	0.08
259	0.09
260	0.09
261	0.09
262	0.08
263	0.08
264	0.08
265	0.08
266	0.09
267	0.11
268	0.14
269	0.15
270	0.15
271	0.17
272	0.19
273	0.21
274	0.24
275	0.23
276	0.22
277	0.22
278	0.23
279	0.22
280	0.23
281	0.21
282	0.18
283	0.19
284	0.17
285	0.17
286	0.16
287	0.16
288	0.15
289	0.18
290	0.18
291	0.17
292	0.18
293	0.17
294	0.18
295	0.17
296	0.16
297	0.13
298	0.12
299	0.13
300	0.12
301	0.12
302	0.11
303	0.12
304	0.14
305	0.13
306	0.13
307	0.11
308	0.13
309	0.14
310	0.12
311	0.11
312	0.12
313	0.14
314	0.13
315	0.14
316	0.11
317	0.11
318	0.18
319	0.21
320	0.2
321	0.19
322	0.21
323	0.26
324	0.29
325	0.34
326	0.35
327	0.34
328	0.37
329	0.41
330	0.42
331	0.4
332	0.42
333	0.39
334	0.37
335	0.41
336	0.37
337	0.34
338	0.31
339	0.27
340	0.3
341	0.3
342	0.24
343	0.19
344	0.2
345	0.25
346	0.27
347	0.27
348	0.24
349	0.26
350	0.29
351	0.3
352	0.37
353	0.33
354	0.34
355	0.39
356	0.36
357	0.33
358	0.33
359	0.31
360	0.23
361	0.24
362	0.21
363	0.17
364	0.15
365	0.13
366	0.11
367	0.11
368	0.14
369	0.11
370	0.13
371	0.14
372	0.18
373	0.25
374	0.28
375	0.33
376	0.34
377	0.35
378	0.39
379	0.41
380	0.37
381	0.31
382	0.31
383	0.27
384	0.24
385	0.22
386	0.16
387	0.15
388	0.15
389	0.14
390	0.12
391	0.09
392	0.07
393	0.09
394	0.1
395	0.1
396	0.1
397	0.11
398	0.11
399	0.11
400	0.11
401	0.1
402	0.09
403	0.08
404	0.08
405	0.08
406	0.08
407	0.09
408	0.11
409	0.15
410	0.16
411	0.2
412	0.22
413	0.29
414	0.32
415	0.3
416	0.3
417	0.28
418	0.28
419	0.28
420	0.33
421	0.28
422	0.27
423	0.26
424	0.24
425	0.23
426	0.22
427	0.19
428	0.12
429	0.1
430	0.1
431	0.12
432	0.12
433	0.12
434	0.13
435	0.14
436	0.17
437	0.17
438	0.18
439	0.18
440	0.21
441	0.2
442	0.22
443	0.23
444	0.28
445	0.33
446	0.32
447	0.3
448	0.3
449	0.35
450	0.36
451	0.34
452	0.3
453	0.3
454	0.37
455	0.36
456	0.33
457	0.27
458	0.24
459	0.23
460	0.2
461	0.16
462	0.1
463	0.1
464	0.1
465	0.1
466	0.11
467	0.12
468	0.13
469	0.13
470	0.2
471	0.21
472	0.29
473	0.33
474	0.35
475	0.4
476	0.48
477	0.51
478	0.49
479	0.53
480	0.45
481	0.45
482	0.44
483	0.39
484	0.31
485	0.28
486	0.22
487	0.21
488	0.2
489	0.17
490	0.18
491	0.17
492	0.19
493	0.23
494	0.24
495	0.22
496	0.22
497	0.25
498	0.24
499	0.24
500	0.24
501	0.23
502	0.21
503	0.26
504	0.26
505	0.22
506	0.23
507	0.22
508	0.24
509	0.27
510	0.31
511	0.3
512	0.38
513	0.42
514	0.45
515	0.46
516	0.45
517	0.41
518	0.41
519	0.38
520	0.32
521	0.31
522	0.28
523	0.28
524	0.25
525	0.24
526	0.21
527	0.2
528	0.24
529	0.22
530	0.27
531	0.27
532	0.31
533	0.33
534	0.36
535	0.45
536	0.43
537	0.48
538	0.44
539	0.44
540	0.4
541	0.39
542	0.44
543	0.36
544	0.39
545	0.35
546	0.34
547	0.36
548	0.36
549	0.39
550	0.41
551	0.41
552	0.38
553	0.38
554	0.37
555	0.39
556	0.46
557	0.43
558	0.34
559	0.37
560	0.35
561	0.33
562	0.35
563	0.31
564	0.28
565	0.33
566	0.35
567	0.34
568	0.36
569	0.35
570	0.32
571	0.33
572	0.28
573	0.22
574	0.18
575	0.14
576	0.16
577	0.16
578	0.19
579	0.24
580	0.24
581	0.24
582	0.25
583	0.24
584	0.28
585	0.28
586	0.27
587	0.26
588	0.32
589	0.31
590	0.33
591	0.37
592	0.34
593	0.42
594	0.47
595	0.51
596	0.51
597	0.54
598	0.56
599	0.6
600	0.63
601	0.59
602	0.56
603	0.51
604	0.49
605	0.51
606	0.49
607	0.45
608	0.39
609	0.37
610	0.34
611	0.35
612	0.37
613	0.39
614	0.36
615	0.33
616	0.34
617	0.33
618	0.38
619	0.35
620	0.34
621	0.33
622	0.36
623	0.39
624	0.39
625	0.4
626	0.41
627	0.45
628	0.43
629	0.39
630	0.36
631	0.39
632	0.43
633	0.45
634	0.39
635	0.37
636	0.33
637	0.32
638	0.32
639	0.28
640	0.23
641	0.2
642	0.19
643	0.17
644	0.16
645	0.19
646	0.2
647	0.17
648	0.17
649	0.15
650	0.18
651	0.21
652	0.21
653	0.17
654	0.16
655	0.15
656	0.14
657	0.12
658	0.09
659	0.07
660	0.09
661	0.09
662	0.1
663	0.1
664	0.1
665	0.11
666	0.14
667	0.17
668	0.17
669	0.17
670	0.18
671	0.2
672	0.21
673	0.21
674	0.19
675	0.16
676	0.17
677	0.18
678	0.21
679	0.21
680	0.22
681	0.22
682	0.28
683	0.29
684	0.29
685	0.28
686	0.28
687	0.3
688	0.3
689	0.29
690	0.22
691	0.24
692	0.26
693	0.26
694	0.2
695	0.21
696	0.22
697	0.24
698	0.24
699	0.22
700	0.2
701	0.26
702	0.31
703	0.34
704	0.35
705	0.35
706	0.36
707	0.35
708	0.37
709	0.39
710	0.44
711	0.46
712	0.45
713	0.46
714	0.46
715	0.47
716	0.5
717	0.47
718	0.4
719	0.37
720	0.37
721	0.36
722	0.36
723	0.34
724	0.34
725	0.34
726	0.35
727	0.32
728	0.38
729	0.39
730	0.41
731	0.45
732	0.42
733	0.37
734	0.36
735	0.42
736	0.43
737	0.43
738	0.44
739	0.42
740	0.44
741	0.42
742	0.45
743	0.44
744	0.37
745	0.32
746	0.32
747	0.32
748	0.28
749	0.28
750	0.24
751	0.17
752	0.18
753	0.19
754	0.19
755	0.2
756	0.3
757	0.31
758	0.31
759	0.33
760	0.35
761	0.39
762	0.43
763	0.45
764	0.37
765	0.39
766	0.38
767	0.36
768	0.32
769	0.27

A0A550CIM1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer