Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550C1F0

Protein Details
Accession A0A550C1F0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
235-256EWDKRVKAGKVKEERRKKLEGKBasic
315-339SKDAQPSPQKRARTRLRDPDPDWEFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
238-264KRVKAGKVKEERRKKLEGKTKASGEKR
Subcellular Location(s) mito_nucl 9.666, nucl 9.5, cyto_mito 9.333, mito 8.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036265  HIT-like_sf  
IPR032566  Znf-C2HE  
Pfam View protein in Pfam  
PF11969  DcpS_C  
PF16278  zf-C2HE  
Amino Acid Sequences MMMEGGGKAGTRPWIRGLRHIYIFYALERNVSLDHLALLRPQGPSQLPASILFSHSDHNLVIYDAFPKSIFHFLILPRVKAPHTAAELSSLRVLLKGDRQRAKDVVDRLRLDAEELKKEIEAEMLKRYGCKWDIWCGFHAVQSMEHMHLHVLSADLVSEKMKHKKHYNSFHPKRGFFLHLNDVLDWFEAEPSFYSNVTKLSPSKYEPLLKEPLACFDCDAEMKNMPTLKSHLKEEWDKRVKAGKVKEERRKKLEGKTKASGEKRLESDANKSESSADSKKQLGGEGERLEEGAGDENNKHTTGNKRPSAEPVAESKDAQPSPQKRARTRLRDPDPDWEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.38
3 0.47
4 0.52
5 0.52
6 0.54
7 0.53
8 0.47
9 0.42
10 0.41
11 0.34
12 0.32
13 0.25
14 0.21
15 0.2
16 0.2
17 0.17
18 0.17
19 0.15
20 0.1
21 0.12
22 0.11
23 0.11
24 0.11
25 0.13
26 0.14
27 0.15
28 0.15
29 0.19
30 0.19
31 0.21
32 0.22
33 0.22
34 0.2
35 0.2
36 0.23
37 0.19
38 0.19
39 0.19
40 0.17
41 0.17
42 0.17
43 0.17
44 0.13
45 0.13
46 0.12
47 0.11
48 0.1
49 0.09
50 0.11
51 0.1
52 0.11
53 0.1
54 0.1
55 0.13
56 0.17
57 0.16
58 0.15
59 0.19
60 0.19
61 0.29
62 0.3
63 0.29
64 0.26
65 0.28
66 0.27
67 0.27
68 0.29
69 0.24
70 0.26
71 0.26
72 0.25
73 0.28
74 0.28
75 0.25
76 0.24
77 0.18
78 0.15
79 0.14
80 0.14
81 0.11
82 0.18
83 0.24
84 0.32
85 0.38
86 0.41
87 0.44
88 0.46
89 0.48
90 0.45
91 0.46
92 0.45
93 0.46
94 0.45
95 0.42
96 0.41
97 0.37
98 0.33
99 0.31
100 0.26
101 0.22
102 0.22
103 0.21
104 0.19
105 0.2
106 0.18
107 0.15
108 0.14
109 0.12
110 0.15
111 0.16
112 0.16
113 0.17
114 0.17
115 0.19
116 0.19
117 0.2
118 0.19
119 0.27
120 0.32
121 0.33
122 0.33
123 0.33
124 0.31
125 0.29
126 0.28
127 0.2
128 0.15
129 0.15
130 0.15
131 0.12
132 0.11
133 0.1
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.06
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.07
146 0.1
147 0.18
148 0.21
149 0.27
150 0.34
151 0.43
152 0.52
153 0.6
154 0.67
155 0.71
156 0.75
157 0.79
158 0.76
159 0.67
160 0.61
161 0.54
162 0.48
163 0.39
164 0.36
165 0.31
166 0.28
167 0.29
168 0.26
169 0.23
170 0.18
171 0.16
172 0.13
173 0.08
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.09
184 0.1
185 0.12
186 0.12
187 0.14
188 0.17
189 0.19
190 0.22
191 0.25
192 0.3
193 0.3
194 0.33
195 0.35
196 0.32
197 0.33
198 0.3
199 0.31
200 0.26
201 0.24
202 0.2
203 0.15
204 0.16
205 0.14
206 0.15
207 0.11
208 0.12
209 0.13
210 0.15
211 0.17
212 0.16
213 0.17
214 0.19
215 0.24
216 0.25
217 0.28
218 0.28
219 0.32
220 0.4
221 0.45
222 0.52
223 0.53
224 0.5
225 0.5
226 0.56
227 0.54
228 0.53
229 0.54
230 0.53
231 0.56
232 0.66
233 0.73
234 0.75
235 0.8
236 0.78
237 0.8
238 0.77
239 0.76
240 0.76
241 0.76
242 0.73
243 0.71
244 0.72
245 0.72
246 0.69
247 0.67
248 0.62
249 0.58
250 0.53
251 0.51
252 0.47
253 0.41
254 0.44
255 0.42
256 0.41
257 0.35
258 0.33
259 0.3
260 0.28
261 0.33
262 0.3
263 0.27
264 0.27
265 0.28
266 0.31
267 0.3
268 0.31
269 0.28
270 0.28
271 0.32
272 0.3
273 0.29
274 0.27
275 0.26
276 0.23
277 0.19
278 0.15
279 0.12
280 0.11
281 0.11
282 0.12
283 0.14
284 0.17
285 0.17
286 0.16
287 0.18
288 0.27
289 0.35
290 0.45
291 0.49
292 0.51
293 0.53
294 0.6
295 0.61
296 0.55
297 0.48
298 0.44
299 0.44
300 0.42
301 0.41
302 0.36
303 0.39
304 0.36
305 0.36
306 0.39
307 0.38
308 0.47
309 0.52
310 0.59
311 0.58
312 0.68
313 0.76
314 0.76
315 0.81
316 0.82
317 0.85
318 0.86
319 0.82