Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CX21

Protein Details
Accession A0A550CX21    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-59AHTAVAAKRRAKKNQVKEVVFHydrophilic
199-242KPKTSADKTKRAAKPKKIKYETNAARRAQTTKQRARRTEKAELAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
73-90KRKVARTDAARKKAMDKE
192-256VKPKPASKPKTSADKTKRAAKPKKIKYETNAARRAQTTKQRARRTEKAELAGGKRAHKNKSAKRR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.166, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019186  Nucleolar_protein_12  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF09805  Nop25  
Amino Acid Sequences MHVIVTTRAGELCDRCDQALVSLPPSLSMSSNLARLTRAHTAVAAKRRAKKNQVKEVVFDEDARREFLTGFHKRKVARTDAARKKAMDKEKQQRQESRREQRQILREQAVENAANVEAAYGALINGEGADADVPALGPSGRARGKQREEFEDEETLATVTVVEDFDPDTLIHGTPDEEQERRPSTSATSAPVKPKPASKPKTSADKTKRAAKPKKIKYETNAARRAQTTKQRARRTEKAELAGGKRAHKNKSAKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.25
3 0.26
4 0.25
5 0.23
6 0.29
7 0.26
8 0.22
9 0.23
10 0.22
11 0.21
12 0.22
13 0.21
14 0.14
15 0.15
16 0.17
17 0.17
18 0.2
19 0.2
20 0.2
21 0.2
22 0.2
23 0.23
24 0.24
25 0.24
26 0.21
27 0.22
28 0.28
29 0.33
30 0.4
31 0.44
32 0.45
33 0.52
34 0.6
35 0.67
36 0.72
37 0.75
38 0.78
39 0.8
40 0.84
41 0.77
42 0.71
43 0.67
44 0.62
45 0.52
46 0.44
47 0.35
48 0.3
49 0.28
50 0.27
51 0.23
52 0.17
53 0.17
54 0.19
55 0.25
56 0.31
57 0.34
58 0.36
59 0.4
60 0.41
61 0.47
62 0.49
63 0.47
64 0.44
65 0.49
66 0.56
67 0.62
68 0.67
69 0.64
70 0.59
71 0.58
72 0.59
73 0.59
74 0.56
75 0.57
76 0.6
77 0.67
78 0.75
79 0.76
80 0.77
81 0.72
82 0.75
83 0.75
84 0.75
85 0.75
86 0.71
87 0.7
88 0.68
89 0.71
90 0.66
91 0.62
92 0.54
93 0.46
94 0.41
95 0.37
96 0.32
97 0.24
98 0.18
99 0.13
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.06
104 0.04
105 0.03
106 0.03
107 0.02
108 0.02
109 0.02
110 0.02
111 0.02
112 0.02
113 0.02
114 0.02
115 0.02
116 0.02
117 0.02
118 0.02
119 0.02
120 0.02
121 0.02
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.04
126 0.09
127 0.1
128 0.14
129 0.18
130 0.26
131 0.33
132 0.39
133 0.42
134 0.43
135 0.47
136 0.46
137 0.44
138 0.37
139 0.31
140 0.25
141 0.22
142 0.16
143 0.11
144 0.08
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.05
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.12
163 0.13
164 0.13
165 0.14
166 0.2
167 0.23
168 0.24
169 0.24
170 0.21
171 0.21
172 0.26
173 0.27
174 0.25
175 0.27
176 0.3
177 0.35
178 0.38
179 0.4
180 0.36
181 0.41
182 0.47
183 0.52
184 0.55
185 0.56
186 0.61
187 0.62
188 0.71
189 0.69
190 0.7
191 0.68
192 0.72
193 0.7
194 0.73
195 0.74
196 0.73
197 0.79
198 0.79
199 0.81
200 0.81
201 0.87
202 0.84
203 0.84
204 0.79
205 0.8
206 0.79
207 0.78
208 0.75
209 0.66
210 0.63
211 0.59
212 0.58
213 0.55
214 0.56
215 0.56
216 0.59
217 0.67
218 0.73
219 0.79
220 0.84
221 0.85
222 0.83
223 0.82
224 0.79
225 0.73
226 0.69
227 0.66
228 0.61
229 0.59
230 0.54
231 0.51
232 0.53
233 0.55
234 0.54
235 0.57
236 0.64