Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CCW0

Protein Details
Accession A0A550CCW0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
277-300RQSSRFDGDRRRDRERSRSPRRRYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
237-261REKRKASAPPPAAAPGGGPPRGGER
285-300DRRRDRERSRSPRRRY
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 12.5, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004882  Luc7-rel  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006376  P:mRNA splice site selection  
Pfam View protein in Pfam  
PF03194  LUC7  
Amino Acid Sequences MGRLAEMQRKLLEQMMGPEAMGTANANLTWKDEKVCRNFLCGTCPHTLFTNTKMDLGACPKSHTERLKTEFLEARKQDPSDPIFNRFQMEYESNIFAFVDECDRRIRAAHRRLEKTPEENAKTTNLMREIAEIELAIQGGTEKIESLGEQGKVDESMQEMAAIEALKNEKADKERELQQLTDTSGASGHQKLRVCDVCGAYLSVLDSDRRLADHFGGKMHLGYHELRKMLQTFKEEREKRKASAPPPAAAPGGGPPRGGERDYRRDEYRDRDRGYDRQSSRFDGDRRRDRERSRSPRRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.22
4 0.21
5 0.19
6 0.15
7 0.13
8 0.12
9 0.08
10 0.06
11 0.06
12 0.07
13 0.08
14 0.08
15 0.12
16 0.15
17 0.15
18 0.19
19 0.25
20 0.33
21 0.38
22 0.47
23 0.45
24 0.47
25 0.52
26 0.49
27 0.49
28 0.44
29 0.42
30 0.38
31 0.38
32 0.34
33 0.31
34 0.34
35 0.3
36 0.31
37 0.35
38 0.3
39 0.3
40 0.29
41 0.27
42 0.26
43 0.29
44 0.3
45 0.22
46 0.24
47 0.26
48 0.31
49 0.37
50 0.4
51 0.42
52 0.45
53 0.49
54 0.53
55 0.51
56 0.52
57 0.5
58 0.47
59 0.5
60 0.42
61 0.41
62 0.39
63 0.39
64 0.36
65 0.36
66 0.37
67 0.36
68 0.37
69 0.38
70 0.38
71 0.38
72 0.37
73 0.32
74 0.28
75 0.24
76 0.23
77 0.2
78 0.2
79 0.2
80 0.18
81 0.18
82 0.17
83 0.13
84 0.12
85 0.09
86 0.12
87 0.11
88 0.12
89 0.14
90 0.15
91 0.15
92 0.17
93 0.24
94 0.28
95 0.36
96 0.43
97 0.5
98 0.55
99 0.57
100 0.62
101 0.59
102 0.53
103 0.52
104 0.52
105 0.47
106 0.43
107 0.41
108 0.36
109 0.34
110 0.31
111 0.26
112 0.19
113 0.16
114 0.15
115 0.15
116 0.14
117 0.12
118 0.11
119 0.08
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.04
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.04
133 0.05
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.08
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.09
157 0.12
158 0.14
159 0.16
160 0.2
161 0.27
162 0.32
163 0.33
164 0.31
165 0.3
166 0.29
167 0.28
168 0.25
169 0.17
170 0.11
171 0.1
172 0.1
173 0.11
174 0.12
175 0.13
176 0.16
177 0.18
178 0.19
179 0.25
180 0.27
181 0.27
182 0.28
183 0.27
184 0.24
185 0.22
186 0.22
187 0.15
188 0.13
189 0.11
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.1
198 0.11
199 0.13
200 0.17
201 0.17
202 0.17
203 0.18
204 0.18
205 0.17
206 0.16
207 0.14
208 0.12
209 0.14
210 0.19
211 0.21
212 0.21
213 0.21
214 0.24
215 0.26
216 0.28
217 0.29
218 0.3
219 0.32
220 0.38
221 0.49
222 0.51
223 0.56
224 0.62
225 0.62
226 0.58
227 0.61
228 0.62
229 0.56
230 0.61
231 0.58
232 0.5
233 0.48
234 0.48
235 0.4
236 0.32
237 0.28
238 0.23
239 0.24
240 0.23
241 0.2
242 0.18
243 0.23
244 0.26
245 0.27
246 0.29
247 0.32
248 0.42
249 0.49
250 0.54
251 0.53
252 0.56
253 0.61
254 0.63
255 0.65
256 0.64
257 0.6
258 0.61
259 0.63
260 0.65
261 0.66
262 0.66
263 0.6
264 0.59
265 0.59
266 0.58
267 0.57
268 0.57
269 0.57
270 0.57
271 0.64
272 0.66
273 0.68
274 0.72
275 0.76
276 0.77
277 0.81
278 0.82
279 0.82
280 0.84