Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DG84

Protein Details
Accession C5DG84    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
135-157STRPNPKESSKKASKTRKVQSLTHydrophilic
367-386LKKQQRNMRRWEKLERERHGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
121-152APKANAPRKAVVRPSTRPNPKESSKKASKTRK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG lth:KLTH0D03168g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MGKSSAISFAVREIPHIIPIDEESARQLCEQILSEYGEDPQAIAEKFMDILGPEDASLNFVLQFTEKLSHEESEKASKSALSPKPSTKNDTFASRSGRQGVNKPESAELRKSEEPSGVPAAPKANAPRKAVVRPSTRPNPKESSKKASKTRKVQSLTEIDDILKALELEQTESDPTKYACNCQGTRHPLFEVAPNCLSCGKIICLREGLNLNHCTFCHTEFLSAEERAQIIEVLNQEKQDLESSKPVAALEKPKKPKGYKITSGAGTNLFSEQDKLFDRVEKERQRELKRAEVLEGIDKEQSKAMHSQNGEDNADPELKVAQERLEKLLHFQDTSAQRTKIIDNASDFSMSNDGSVWGSAQDRALLLKKQQRNMRRWEKLERERHGGRDKVVMDLSIGKDGKVTMTEARRAPKTAHAFDEENVEDISDEEDLQDLQEITELKSTLMDEKKRIDKDLESNVWDPEKDKKQFQKPVYVNNESEISPEKGKPEKDGTRDRGWKNRVQISQGDENSLEQNILAVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.27
3 0.28
4 0.25
5 0.19
6 0.21
7 0.24
8 0.2
9 0.19
10 0.19
11 0.19
12 0.2
13 0.19
14 0.19
15 0.15
16 0.17
17 0.18
18 0.16
19 0.17
20 0.18
21 0.19
22 0.18
23 0.18
24 0.17
25 0.15
26 0.13
27 0.11
28 0.14
29 0.13
30 0.13
31 0.13
32 0.12
33 0.12
34 0.12
35 0.12
36 0.07
37 0.09
38 0.09
39 0.09
40 0.09
41 0.1
42 0.09
43 0.11
44 0.11
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.1
51 0.1
52 0.15
53 0.15
54 0.18
55 0.2
56 0.21
57 0.22
58 0.25
59 0.27
60 0.31
61 0.32
62 0.29
63 0.27
64 0.27
65 0.28
66 0.34
67 0.37
68 0.35
69 0.39
70 0.46
71 0.55
72 0.59
73 0.63
74 0.56
75 0.57
76 0.54
77 0.56
78 0.52
79 0.48
80 0.51
81 0.46
82 0.46
83 0.45
84 0.46
85 0.43
86 0.46
87 0.51
88 0.5
89 0.49
90 0.48
91 0.46
92 0.47
93 0.48
94 0.46
95 0.39
96 0.39
97 0.4
98 0.41
99 0.38
100 0.35
101 0.31
102 0.3
103 0.31
104 0.26
105 0.23
106 0.22
107 0.22
108 0.2
109 0.22
110 0.26
111 0.3
112 0.36
113 0.39
114 0.43
115 0.46
116 0.51
117 0.56
118 0.56
119 0.55
120 0.54
121 0.6
122 0.64
123 0.69
124 0.65
125 0.64
126 0.64
127 0.64
128 0.69
129 0.67
130 0.66
131 0.67
132 0.73
133 0.76
134 0.79
135 0.81
136 0.8
137 0.83
138 0.82
139 0.77
140 0.71
141 0.68
142 0.64
143 0.59
144 0.5
145 0.42
146 0.33
147 0.28
148 0.26
149 0.18
150 0.12
151 0.07
152 0.06
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.09
158 0.1
159 0.11
160 0.11
161 0.1
162 0.11
163 0.14
164 0.15
165 0.18
166 0.22
167 0.28
168 0.29
169 0.32
170 0.4
171 0.43
172 0.45
173 0.43
174 0.38
175 0.33
176 0.33
177 0.34
178 0.28
179 0.24
180 0.23
181 0.21
182 0.21
183 0.19
184 0.18
185 0.13
186 0.13
187 0.11
188 0.14
189 0.15
190 0.15
191 0.17
192 0.17
193 0.2
194 0.22
195 0.21
196 0.23
197 0.25
198 0.25
199 0.24
200 0.23
201 0.23
202 0.2
203 0.2
204 0.17
205 0.15
206 0.15
207 0.14
208 0.17
209 0.17
210 0.16
211 0.15
212 0.13
213 0.12
214 0.11
215 0.11
216 0.08
217 0.05
218 0.07
219 0.09
220 0.1
221 0.11
222 0.11
223 0.11
224 0.1
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.14
230 0.15
231 0.16
232 0.16
233 0.15
234 0.14
235 0.15
236 0.23
237 0.26
238 0.33
239 0.39
240 0.42
241 0.49
242 0.5
243 0.56
244 0.56
245 0.57
246 0.55
247 0.55
248 0.55
249 0.49
250 0.48
251 0.4
252 0.32
253 0.24
254 0.18
255 0.13
256 0.09
257 0.08
258 0.09
259 0.08
260 0.1
261 0.1
262 0.12
263 0.13
264 0.15
265 0.18
266 0.21
267 0.31
268 0.35
269 0.38
270 0.43
271 0.51
272 0.53
273 0.58
274 0.56
275 0.55
276 0.52
277 0.49
278 0.43
279 0.36
280 0.32
281 0.28
282 0.26
283 0.19
284 0.16
285 0.16
286 0.15
287 0.15
288 0.15
289 0.12
290 0.17
291 0.18
292 0.21
293 0.21
294 0.23
295 0.25
296 0.28
297 0.28
298 0.22
299 0.21
300 0.17
301 0.18
302 0.15
303 0.11
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.1
309 0.13
310 0.14
311 0.17
312 0.18
313 0.18
314 0.2
315 0.24
316 0.22
317 0.19
318 0.17
319 0.21
320 0.24
321 0.29
322 0.31
323 0.26
324 0.26
325 0.28
326 0.29
327 0.26
328 0.24
329 0.22
330 0.19
331 0.21
332 0.21
333 0.2
334 0.19
335 0.16
336 0.15
337 0.13
338 0.1
339 0.09
340 0.08
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.1
351 0.12
352 0.14
353 0.19
354 0.27
355 0.33
356 0.39
357 0.46
358 0.53
359 0.57
360 0.66
361 0.71
362 0.71
363 0.71
364 0.74
365 0.77
366 0.79
367 0.81
368 0.76
369 0.73
370 0.68
371 0.7
372 0.68
373 0.6
374 0.52
375 0.49
376 0.44
377 0.39
378 0.36
379 0.28
380 0.22
381 0.23
382 0.22
383 0.21
384 0.2
385 0.17
386 0.17
387 0.17
388 0.17
389 0.14
390 0.15
391 0.15
392 0.19
393 0.25
394 0.28
395 0.34
396 0.35
397 0.36
398 0.36
399 0.39
400 0.43
401 0.42
402 0.42
403 0.41
404 0.41
405 0.39
406 0.43
407 0.35
408 0.28
409 0.24
410 0.2
411 0.15
412 0.13
413 0.14
414 0.07
415 0.07
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.07
421 0.07
422 0.06
423 0.09
424 0.1
425 0.1
426 0.14
427 0.14
428 0.12
429 0.13
430 0.15
431 0.2
432 0.26
433 0.29
434 0.31
435 0.38
436 0.46
437 0.48
438 0.5
439 0.47
440 0.45
441 0.49
442 0.55
443 0.52
444 0.48
445 0.47
446 0.47
447 0.45
448 0.39
449 0.33
450 0.33
451 0.38
452 0.38
453 0.46
454 0.52
455 0.61
456 0.7
457 0.73
458 0.74
459 0.7
460 0.76
461 0.75
462 0.72
463 0.62
464 0.56
465 0.53
466 0.42
467 0.39
468 0.34
469 0.29
470 0.26
471 0.27
472 0.3
473 0.35
474 0.36
475 0.4
476 0.45
477 0.5
478 0.54
479 0.63
480 0.64
481 0.68
482 0.76
483 0.77
484 0.77
485 0.75
486 0.74
487 0.72
488 0.74
489 0.69
490 0.64
491 0.62
492 0.59
493 0.63
494 0.57
495 0.51
496 0.43
497 0.4
498 0.36
499 0.31
500 0.24
501 0.14