FuNGI

A0A550CKX5

Protein Details

Accession

A0A550CKX5

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
680-703	PVQRQMRRASRRCRSIRRRCSSCI	Hydrophilic
720-739	GEWRRHRRRVGLSRNCNSRR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
723-727	RRHRR

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20

Amino Acid Sequences

MTVDYNRTRFVDGLLERNKDQPPSFKIHLHAEHWNLNNGSKFLYNNQVASLLDDIREHRIPADFLGLFTESGVPFYDGCLIVELIDYRVGAAKKETITVGGSSAAGPSVIKPTASTSSANGSTSASTTAPAITRAVLFPTPETLYTDVCLLGARYGARWTDMDALEAESRILLATAPPLCLDPDPHLTRAVNAVMKVSTPSTPTSLKRKASAALDAEDARARRSKMMQFMNPRGTLRAGGGHRLFDALQRVRSGRMEEERPSQHAGPSQQAHTTSVLAPGDPRNAPYAGQQGAYAGQQTADQSGAAGLAAAINSAHSHNAQVSHNAQISQATQNAHNASLAAQAAHNAAQMLPPAHTPPSVNGRATPSAMNGRQTPGMMNGQANGMMNGQANGLMNGQLVNGRHTPGIVNGRQTPGLVNGRQTPVAVNGRQTPGMVNGRQTPGLVNGRTTPHAPTPPPPMPTATQQFLHQQRTAGVNGSPQPHPAHLPAHGQQQHGQQQQPPGQLIGHPQPQGNALGLQLTEGHSPGQQQHFSPPQRFAASPPTQHSPLQAFAGSPPQRFSGSPPMQNSPQMQAAEARAAQQTHQRQIVAAHNSSWSPLSSNSSRPCSSSSVRALRAPRLASGPTAAQSATTPPQSQPQSQPQPSQPQPALQPAPSTQQQQQNALSALYKHPSWSVLPEPVQRQMRRASRRCRSIRRRCSSCIMGLRRWRRILWGGEGGGEWRRHRRRVGLSRNCNSRRVREVWRMEAWHSSSSSNSSSSNNRVLDEGKRAWDEEPGSFSSHCPDSKSLSYSPDSSQHPIHNLGSNPSLPQPTPHPPTQHQAAQQQPVPQPGQPHAQPQQFTQAQAAYFRHQYMQMYQRGGAPVVWAMPGAHYMAAPGRGAGPPGQAPPQAQAGQLPPAGQLTQAQAAQAAQAAQAVQAAAQAQAQAQAQAQAGRGAGQPVQPQPGQAQQAAQLQAQFQQPQPGPGQLPPGAVRLPPGTQLPPGAQRLPPGAVPPGAQRMMVPPPTDPVLLAALDATFEPVPIAFQSEPYLVQCPDHKAEKCTVCDVDYVHLNRLSRLLAKNPNLRCPPPPQVLSRELQAAVTGLKEEGNGGSHPQAIQKYTMAASVAVQRPPWEAAQLMREDVSAILSNRAASHLEAQDPISALADANAVVDVRRPWSKGHFRRAKALQALGSLSEAAAAARAGLAYEPASVELKNLLDEIERAEGERHQPLLELTPNGEA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.42
3	0.42
4	0.47
5	0.49
6	0.45
7	0.46
8	0.45
9	0.44
10	0.48
11	0.51
12	0.5
13	0.51
14	0.54
15	0.56
16	0.52
17	0.54
18	0.51
19	0.54
20	0.52
21	0.54
22	0.46
23	0.45
24	0.44
25	0.37
26	0.33
27	0.28
28	0.28
29	0.25
30	0.33
31	0.32
32	0.29
33	0.3
34	0.29
35	0.27
36	0.27
37	0.26
38	0.17
39	0.16
40	0.17
41	0.18
42	0.22
43	0.23
44	0.21
45	0.21
46	0.23
47	0.23
48	0.23
49	0.28
50	0.21
51	0.2
52	0.22
53	0.21
54	0.18
55	0.18
56	0.2
57	0.13
58	0.13
59	0.15
60	0.13
61	0.12
62	0.13
63	0.16
64	0.14
65	0.14
66	0.15
67	0.14
68	0.13
69	0.14
70	0.14
71	0.11
72	0.11
73	0.1
74	0.09
75	0.14
76	0.14
77	0.14
78	0.16
79	0.2
80	0.2
81	0.23
82	0.23
83	0.19
84	0.21
85	0.2
86	0.19
87	0.15
88	0.14
89	0.12
90	0.12
91	0.1
92	0.08
93	0.08
94	0.08
95	0.12
96	0.12
97	0.12
98	0.12
99	0.17
100	0.21
101	0.23
102	0.23
103	0.2
104	0.26
105	0.28
106	0.28
107	0.24
108	0.21
109	0.2
110	0.19
111	0.19
112	0.13
113	0.12
114	0.12
115	0.13
116	0.13
117	0.13
118	0.13
119	0.12
120	0.13
121	0.13
122	0.16
123	0.15
124	0.16
125	0.15
126	0.19
127	0.19
128	0.19
129	0.21
130	0.19
131	0.19
132	0.18
133	0.18
134	0.14
135	0.13
136	0.13
137	0.1
138	0.08
139	0.1
140	0.09
141	0.1
142	0.12
143	0.13
144	0.14
145	0.14
146	0.16
147	0.21
148	0.2
149	0.21
150	0.19
151	0.21
152	0.2
153	0.2
154	0.17
155	0.1
156	0.1
157	0.08
158	0.08
159	0.05
160	0.05
161	0.1
162	0.11
163	0.11
164	0.12
165	0.12
166	0.14
167	0.14
168	0.16
169	0.16
170	0.24
171	0.27
172	0.27
173	0.3
174	0.29
175	0.3
176	0.31
177	0.3
178	0.24
179	0.21
180	0.21
181	0.18
182	0.18
183	0.19
184	0.17
185	0.14
186	0.14
187	0.16
188	0.18
189	0.23
190	0.27
191	0.36
192	0.42
193	0.44
194	0.46
195	0.47
196	0.48
197	0.46
198	0.47
199	0.4
200	0.34
201	0.34
202	0.31
203	0.29
204	0.27
205	0.25
206	0.21
207	0.22
208	0.21
209	0.22
210	0.28
211	0.32
212	0.38
213	0.46
214	0.51
215	0.56
216	0.63
217	0.66
218	0.62
219	0.57
220	0.5
221	0.44
222	0.37
223	0.29
224	0.28
225	0.23
226	0.27
227	0.27
228	0.26
229	0.25
230	0.25
231	0.24
232	0.2
233	0.27
234	0.23
235	0.24
236	0.26
237	0.27
238	0.28
239	0.3
240	0.3
241	0.28
242	0.31
243	0.33
244	0.34
245	0.41
246	0.42
247	0.42
248	0.44
249	0.39
250	0.35
251	0.35
252	0.34
253	0.33
254	0.33
255	0.32
256	0.3
257	0.31
258	0.3
259	0.27
260	0.26
261	0.19
262	0.2
263	0.18
264	0.15
265	0.16
266	0.17
267	0.2
268	0.18
269	0.19
270	0.18
271	0.18
272	0.19
273	0.2
274	0.23
275	0.2
276	0.2
277	0.19
278	0.16
279	0.17
280	0.17
281	0.14
282	0.08
283	0.07
284	0.08
285	0.09
286	0.09
287	0.08
288	0.07
289	0.06
290	0.06
291	0.06
292	0.05
293	0.04
294	0.03
295	0.03
296	0.03
297	0.03
298	0.03
299	0.03
300	0.04
301	0.05
302	0.06
303	0.06
304	0.07
305	0.09
306	0.12
307	0.13
308	0.17
309	0.18
310	0.21
311	0.22
312	0.21
313	0.2
314	0.18
315	0.19
316	0.18
317	0.19
318	0.16
319	0.16
320	0.2
321	0.21
322	0.19
323	0.17
324	0.15
325	0.12
326	0.13
327	0.13
328	0.09
329	0.08
330	0.08
331	0.09
332	0.09
333	0.09
334	0.07
335	0.06
336	0.07
337	0.08
338	0.08
339	0.08
340	0.09
341	0.1
342	0.11
343	0.12
344	0.12
345	0.14
346	0.21
347	0.24
348	0.24
349	0.25
350	0.28
351	0.29
352	0.3
353	0.27
354	0.22
355	0.25
356	0.26
357	0.27
358	0.23
359	0.24
360	0.23
361	0.23
362	0.21
363	0.17
364	0.18
365	0.17
366	0.16
367	0.14
368	0.13
369	0.14
370	0.13
371	0.11
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.07
386	0.08
387	0.1
388	0.11
389	0.12
390	0.12
391	0.12
392	0.12
393	0.15
394	0.22
395	0.2
396	0.23
397	0.24
398	0.26
399	0.26
400	0.25
401	0.21
402	0.2
403	0.23
404	0.21
405	0.21
406	0.23
407	0.25
408	0.25
409	0.24
410	0.19
411	0.2
412	0.24
413	0.22
414	0.21
415	0.23
416	0.24
417	0.24
418	0.24
419	0.19
420	0.19
421	0.23
422	0.22
423	0.2
424	0.22
425	0.24
426	0.24
427	0.23
428	0.18
429	0.19
430	0.23
431	0.22
432	0.19
433	0.2
434	0.22
435	0.23
436	0.23
437	0.2
438	0.19
439	0.23
440	0.23
441	0.24
442	0.31
443	0.33
444	0.34
445	0.32
446	0.31
447	0.29
448	0.34
449	0.35
450	0.29
451	0.25
452	0.25
453	0.32
454	0.35
455	0.37
456	0.32
457	0.28
458	0.28
459	0.29
460	0.29
461	0.22
462	0.17
463	0.16
464	0.18
465	0.21
466	0.19
467	0.19
468	0.19
469	0.19
470	0.2
471	0.19
472	0.17
473	0.17
474	0.21
475	0.21
476	0.28
477	0.31
478	0.3
479	0.31
480	0.36
481	0.42
482	0.41
483	0.4
484	0.34
485	0.36
486	0.4
487	0.38
488	0.32
489	0.25
490	0.22
491	0.21
492	0.22
493	0.21
494	0.21
495	0.2
496	0.2
497	0.2
498	0.21
499	0.21
500	0.17
501	0.13
502	0.08
503	0.07
504	0.07
505	0.07
506	0.06
507	0.07
508	0.06
509	0.06
510	0.07
511	0.07
512	0.08
513	0.11
514	0.14
515	0.14
516	0.15
517	0.19
518	0.27
519	0.3
520	0.32
521	0.31
522	0.3
523	0.31
524	0.31
525	0.28
526	0.29
527	0.29
528	0.3
529	0.3
530	0.31
531	0.31
532	0.31
533	0.31
534	0.23
535	0.21
536	0.19
537	0.16
538	0.13
539	0.11
540	0.2
541	0.2
542	0.19
543	0.19
544	0.19
545	0.2
546	0.2
547	0.23
548	0.25
549	0.27
550	0.31
551	0.32
552	0.34
553	0.34
554	0.37
555	0.34
556	0.25
557	0.25
558	0.21
559	0.19
560	0.17
561	0.16
562	0.15
563	0.14
564	0.13
565	0.1
566	0.1
567	0.11
568	0.16
569	0.19
570	0.21
571	0.22
572	0.21
573	0.2
574	0.23
575	0.28
576	0.25
577	0.22
578	0.19
579	0.18
580	0.18
581	0.18
582	0.16
583	0.1
584	0.07
585	0.08
586	0.12
587	0.13
588	0.18
589	0.21
590	0.25
591	0.26
592	0.26
593	0.27
594	0.27
595	0.27
596	0.27
597	0.31
598	0.31
599	0.32
600	0.35
601	0.35
602	0.33
603	0.35
604	0.3
605	0.24
606	0.21
607	0.2
608	0.17
609	0.16
610	0.13
611	0.1
612	0.1
613	0.09
614	0.07
615	0.07
616	0.09
617	0.1
618	0.1
619	0.11
620	0.11
621	0.17
622	0.2
623	0.22
624	0.25
625	0.33
626	0.4
627	0.41
628	0.45
629	0.42
630	0.48
631	0.47
632	0.48
633	0.39
634	0.33
635	0.32
636	0.34
637	0.32
638	0.23
639	0.23
640	0.19
641	0.22
642	0.22
643	0.23
644	0.23
645	0.28
646	0.29
647	0.31
648	0.31
649	0.29
650	0.27
651	0.24
652	0.2
653	0.14
654	0.14
655	0.12
656	0.11
657	0.09
658	0.09
659	0.1
660	0.1
661	0.13
662	0.14
663	0.16
664	0.18
665	0.21
666	0.23
667	0.28
668	0.35
669	0.32
670	0.32
671	0.36
672	0.43
673	0.49
674	0.56
675	0.59
676	0.6
677	0.7
678	0.76
679	0.79
680	0.82
681	0.83
682	0.86
683	0.86
684	0.83
685	0.77
686	0.75
687	0.67
688	0.62
689	0.59
690	0.53
691	0.49
692	0.52
693	0.54
694	0.54
695	0.53
696	0.47
697	0.42
698	0.43
699	0.4
700	0.35
701	0.32
702	0.27
703	0.25
704	0.25
705	0.22
706	0.2
707	0.19
708	0.17
709	0.23
710	0.28
711	0.31
712	0.34
713	0.4
714	0.47
715	0.56
716	0.66
717	0.67
718	0.71
719	0.75
720	0.82
721	0.77
722	0.74
723	0.66
724	0.6
725	0.56
726	0.51
727	0.52
728	0.51
729	0.54
730	0.52
731	0.52
732	0.49
733	0.44
734	0.42
735	0.37
736	0.29
737	0.25
738	0.2
739	0.17
740	0.18
741	0.18
742	0.15
743	0.15
744	0.15
745	0.18
746	0.21
747	0.27
748	0.25
749	0.24
750	0.24
751	0.25
752	0.25
753	0.27
754	0.25
755	0.21
756	0.21
757	0.22
758	0.21
759	0.22
760	0.21
761	0.16
762	0.18
763	0.17
764	0.18
765	0.17
766	0.17
767	0.17
768	0.18
769	0.18
770	0.17
771	0.17
772	0.2
773	0.23
774	0.26
775	0.25
776	0.25
777	0.27
778	0.26
779	0.26
780	0.27
781	0.28
782	0.27
783	0.28
784	0.26
785	0.27
786	0.28
787	0.28
788	0.26
789	0.24
790	0.23
791	0.23
792	0.21
793	0.2
794	0.19
795	0.19
796	0.15
797	0.16
798	0.19
799	0.25
800	0.29
801	0.32
802	0.35
803	0.37
804	0.42
805	0.45
806	0.44
807	0.41
808	0.43
809	0.44
810	0.43
811	0.43
812	0.44
813	0.4
814	0.4
815	0.37
816	0.31
817	0.29
818	0.27
819	0.3
820	0.26
821	0.31
822	0.34
823	0.36
824	0.36
825	0.34
826	0.41
827	0.36
828	0.35
829	0.3
830	0.25
831	0.21
832	0.24
833	0.25
834	0.19
835	0.19
836	0.19
837	0.19
838	0.19
839	0.19
840	0.22
841	0.28
842	0.29
843	0.29
844	0.29
845	0.3
846	0.3
847	0.29
848	0.22
849	0.16
850	0.12
851	0.1
852	0.1
853	0.07
854	0.06
855	0.06
856	0.07
857	0.07
858	0.06
859	0.06
860	0.06
861	0.07
862	0.09
863	0.08
864	0.08
865	0.09
866	0.09
867	0.1
868	0.1
869	0.11
870	0.11
871	0.13
872	0.16
873	0.16
874	0.16
875	0.17
876	0.21
877	0.2
878	0.19
879	0.19
880	0.18
881	0.2
882	0.19
883	0.18
884	0.13
885	0.13
886	0.13
887	0.11
888	0.11
889	0.1
890	0.13
891	0.12
892	0.12
893	0.11
894	0.11
895	0.11
896	0.1
897	0.08
898	0.05
899	0.06
900	0.06
901	0.05
902	0.06
903	0.05
904	0.05
905	0.05
906	0.06
907	0.05
908	0.06
909	0.06
910	0.06
911	0.08
912	0.09
913	0.09
914	0.09
915	0.11
916	0.11
917	0.12
918	0.13
919	0.12
920	0.12
921	0.12
922	0.13
923	0.12
924	0.12
925	0.14
926	0.17
927	0.18
928	0.23
929	0.21
930	0.22
931	0.22
932	0.27
933	0.27
934	0.23
935	0.22
936	0.22
937	0.27
938	0.28
939	0.26
940	0.22
941	0.19
942	0.23
943	0.25
944	0.23
945	0.19
946	0.25
947	0.24
948	0.27
949	0.28
950	0.28
951	0.26
952	0.26
953	0.31
954	0.24
955	0.26
956	0.24
957	0.25
958	0.22
959	0.2
960	0.21
961	0.18
962	0.17
963	0.17
964	0.19
965	0.18
966	0.18
967	0.2
968	0.21
969	0.24
970	0.27
971	0.28
972	0.26
973	0.26
974	0.28
975	0.28
976	0.26
977	0.22
978	0.21
979	0.19
980	0.19
981	0.2
982	0.23
983	0.22
984	0.21
985	0.19
986	0.2
987	0.26
988	0.28
989	0.26
990	0.2
991	0.23
992	0.25
993	0.25
994	0.21
995	0.16
996	0.15
997	0.13
998	0.13
999	0.1
1000	0.08
1001	0.08
1002	0.08
1003	0.08
1004	0.06
1005	0.06
1006	0.07
1007	0.06
1008	0.07
1009	0.07
1010	0.12
1011	0.09
1012	0.1
1013	0.13
1014	0.14
1015	0.15
1016	0.16
1017	0.2
1018	0.16
1019	0.18
1020	0.2
1021	0.24
1022	0.27
1023	0.35
1024	0.35
1025	0.35
1026	0.43
1027	0.47
1028	0.47
1029	0.46
1030	0.43
1031	0.36
1032	0.35
1033	0.33
1034	0.28
1035	0.29
1036	0.28
1037	0.27
1038	0.29
1039	0.28
1040	0.27
1041	0.27
1042	0.26
1043	0.25
1044	0.26
1045	0.3
1046	0.36
1047	0.44
1048	0.52
1049	0.54
1050	0.61
1051	0.62
1052	0.61
1053	0.58
1054	0.57
1055	0.57
1056	0.57
1057	0.58
1058	0.53
1059	0.54
1060	0.56
1061	0.53
1062	0.47
1063	0.42
1064	0.35
1065	0.3
1066	0.25
1067	0.19
1068	0.15
1069	0.13
1070	0.11
1071	0.08
1072	0.08
1073	0.08
1074	0.08
1075	0.08
1076	0.1
1077	0.1
1078	0.12
1079	0.13
1080	0.15
1081	0.15
1082	0.19
1083	0.21
1084	0.21
1085	0.22
1086	0.21
1087	0.22
1088	0.21
1089	0.21
1090	0.17
1091	0.15
1092	0.15
1093	0.21
1094	0.24
1095	0.24
1096	0.24
1097	0.23
1098	0.25
1099	0.27
1100	0.27
1101	0.2
1102	0.17
1103	0.19
1104	0.24
1105	0.25
1106	0.24
1107	0.21
1108	0.2
1109	0.19
1110	0.18
1111	0.17
1112	0.15
1113	0.14
1114	0.15
1115	0.15
1116	0.16
1117	0.16
1118	0.17
1119	0.16
1120	0.14
1121	0.2
1122	0.2
1123	0.21
1124	0.22
1125	0.23
1126	0.23
1127	0.23
1128	0.21
1129	0.16
1130	0.13
1131	0.11
1132	0.1
1133	0.1
1134	0.08
1135	0.07
1136	0.07
1137	0.06
1138	0.06
1139	0.09
1140	0.1
1141	0.15
1142	0.19
1143	0.2
1144	0.23
1145	0.33
1146	0.45
1147	0.51
1148	0.61
1149	0.66
1150	0.66
1151	0.75
1152	0.78
1153	0.76
1154	0.71
1155	0.67
1156	0.58
1157	0.51
1158	0.48
1159	0.39
1160	0.34
1161	0.24
1162	0.18
1163	0.13
1164	0.11
1165	0.08
1166	0.07
1167	0.06
1168	0.05
1169	0.05
1170	0.05
1171	0.05
1172	0.05
1173	0.07
1174	0.06
1175	0.07
1176	0.08
1177	0.1
1178	0.11
1179	0.11
1180	0.12
1181	0.13
1182	0.13
1183	0.13
1184	0.13
1185	0.12
1186	0.12
1187	0.13
1188	0.15
1189	0.16
1190	0.15
1191	0.16
1192	0.17
1193	0.21
1194	0.24
1195	0.28
1196	0.27
1197	0.23
1198	0.24
1199	0.24
1200	0.29
1201	0.29
1202	0.26

A0A550CKX5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer