Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550C2M1

Protein Details
Accession A0A550C2M1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-63ATPKKRKAGHAAPTPNKRRVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-62KKRKAGHAAPTPNKRR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003615  HNH_nuc  
Pfam View protein in Pfam  
PF13391  HNH_2  
Amino Acid Sequences MSSPTSAYMDRSPTPSTRAMPADLPSTSPSPSDAGDPTYESGTATPKKRKAGHAAPTPNKRRVAASSVETTRKRAVDAEVKRRDRSSTKNYRTRCVVSRATDKMTLLEYAHVLPAATRSAELDQLEWCWGMSYRTLNVDSRRNIHPLRSSMHKWFDITNDKKAVGWFWLPTDIRLLAEMHEFYVTMQNVESSEPGCRRDIDSVSTVVSTIDLDSCLSPFIVLCTGSDLSISARRFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.36
3 0.35
4 0.35
5 0.36
6 0.34
7 0.33
8 0.34
9 0.33
10 0.28
11 0.28
12 0.25
13 0.24
14 0.22
15 0.19
16 0.18
17 0.16
18 0.16
19 0.17
20 0.15
21 0.16
22 0.16
23 0.18
24 0.17
25 0.17
26 0.16
27 0.13
28 0.13
29 0.18
30 0.23
31 0.28
32 0.36
33 0.4
34 0.48
35 0.53
36 0.59
37 0.62
38 0.65
39 0.68
40 0.69
41 0.74
42 0.75
43 0.8
44 0.8
45 0.77
46 0.7
47 0.61
48 0.54
49 0.48
50 0.44
51 0.38
52 0.35
53 0.35
54 0.36
55 0.42
56 0.4
57 0.39
58 0.38
59 0.34
60 0.31
61 0.26
62 0.27
63 0.3
64 0.37
65 0.45
66 0.51
67 0.54
68 0.55
69 0.54
70 0.53
71 0.49
72 0.49
73 0.49
74 0.51
75 0.57
76 0.63
77 0.64
78 0.65
79 0.64
80 0.61
81 0.54
82 0.5
83 0.46
84 0.42
85 0.47
86 0.45
87 0.43
88 0.4
89 0.35
90 0.29
91 0.25
92 0.21
93 0.14
94 0.12
95 0.09
96 0.08
97 0.08
98 0.07
99 0.06
100 0.05
101 0.06
102 0.06
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.06
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.08
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.07
119 0.08
120 0.09
121 0.11
122 0.13
123 0.16
124 0.19
125 0.25
126 0.26
127 0.28
128 0.29
129 0.32
130 0.31
131 0.32
132 0.34
133 0.31
134 0.32
135 0.34
136 0.36
137 0.37
138 0.41
139 0.38
140 0.33
141 0.32
142 0.34
143 0.38
144 0.38
145 0.38
146 0.35
147 0.34
148 0.34
149 0.33
150 0.28
151 0.21
152 0.19
153 0.15
154 0.13
155 0.2
156 0.19
157 0.19
158 0.21
159 0.18
160 0.17
161 0.17
162 0.16
163 0.11
164 0.13
165 0.13
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.09
170 0.15
171 0.14
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.13
177 0.13
178 0.08
179 0.13
180 0.15
181 0.18
182 0.19
183 0.2
184 0.22
185 0.26
186 0.28
187 0.26
188 0.27
189 0.26
190 0.25
191 0.24
192 0.21
193 0.16
194 0.14
195 0.1
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.09
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.14
211 0.14
212 0.14
213 0.14
214 0.13
215 0.14
216 0.21