FuNGI

A0A550CLI8

Protein Details

Accession

A0A550CLI8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
50-85	GDATDPSSSRRRKRKSISTKHTQPKRKKTASEAAPI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
59-77	RRRKRKSISTKHTQPKRKK
763-780	RGRGRGGRGRGDDRGRGR

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003618 TFIIS_cen_dom IPR036575 TFIIS_cen_dom_sf
Gene Ontology	GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF07500 TFIIS_M
PROSITE	View protein in PROSITE PS51321 TFIIS_CENTRAL
CDD	cd21538 SPOC_TFIIS

Amino Acid Sequences

MRLAQRKALDPVSEDEETQSNGSSQDEFVVEAPRPKGRKLAIVSDDEDSGDATDPSSSRRRKRKSISTKHTQPKRKKTASEAAPITSVDDDPFRKFTLGKFTTIFSDIFLRYPRVDDVEKPSDALTPEETEVIRADAARYAEDLERCMSEKYVEADGRTGAKYKDRFRMLTVNLSKRDREFVHKRIVAREVTPDMLAVMSSMELADAATQQSIRNAERAALDHSTLRVTIAAGPRTKMTHKGFEEVENQEQQYGSRDEQYGSRDESRHVEDGARESHTPRTPGTPRVEWGAPPRMPSTAPSSMPSPKTEHPPRPPLFMHISTDYPMPGAEPELNLADLINIDETGDEPMTPALPTPSADAPMGYMSNSPVVASASPVSLSARRRSESVNAEAEATFDLNTLWSAPKEDTNDGGVASMDHAFQESEMPMDVDHGNEHEGADADFDMLFNDADGTAPPPPPPPVCWNSRKRPSISTWRTLFPADTLRIDGRVPVDKSGDYLLQSRMNPTRELVGVAFAPTTAEHEASFRALRSSDREEPPWTGLPWGQRPKEHHPGRELYIIPFCIELMDDLKLPRVRTRDYLIGIYVLARGKLQPPPAPQPVAAPAPHHTLSRPMSAAPFPPTPTPHMYGTPPPPAPPMHAAAAPVLPNIEPAALAAEVASLTPEQIQAMLQTLQGTALIPQATPPPPSMPMNMPAWGAPPPPGGYPSRDGYPPHEGFSPHEGYPPREGYPPRDGFPPHDGAYRGGPPPFDRPPYGGDGYGHMRGRGRGGRGRGDDRGRGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.29
3	0.26
4	0.26
5	0.24
6	0.2
7	0.15
8	0.14
9	0.16
10	0.15
11	0.13
12	0.13
13	0.13
14	0.13
15	0.14
16	0.17
17	0.17
18	0.21
19	0.24
20	0.29
21	0.31
22	0.32
23	0.38
24	0.38
25	0.45
26	0.45
27	0.52
28	0.5
29	0.52
30	0.53
31	0.47
32	0.44
33	0.36
34	0.3
35	0.21
36	0.16
37	0.12
38	0.1
39	0.08
40	0.1
41	0.1
42	0.15
43	0.24
44	0.32
45	0.41
46	0.52
47	0.6
48	0.69
49	0.79
50	0.85
51	0.88
52	0.9
53	0.91
54	0.91
55	0.93
56	0.93
57	0.92
58	0.91
59	0.91
60	0.91
61	0.92
62	0.9
63	0.85
64	0.84
65	0.84
66	0.81
67	0.8
68	0.71
69	0.62
70	0.55
71	0.48
72	0.41
73	0.32
74	0.24
75	0.16
76	0.17
77	0.18
78	0.19
79	0.22
80	0.22
81	0.22
82	0.22
83	0.24
84	0.31
85	0.31
86	0.31
87	0.3
88	0.3
89	0.32
90	0.33
91	0.3
92	0.2
93	0.23
94	0.2
95	0.21
96	0.22
97	0.22
98	0.21
99	0.23
100	0.23
101	0.23
102	0.25
103	0.27
104	0.33
105	0.36
106	0.35
107	0.34
108	0.33
109	0.3
110	0.29
111	0.27
112	0.2
113	0.17
114	0.18
115	0.19
116	0.18
117	0.16
118	0.16
119	0.15
120	0.13
121	0.1
122	0.1
123	0.11
124	0.12
125	0.12
126	0.12
127	0.13
128	0.16
129	0.17
130	0.18
131	0.16
132	0.17
133	0.18
134	0.18
135	0.16
136	0.14
137	0.16
138	0.17
139	0.22
140	0.22
141	0.21
142	0.22
143	0.23
144	0.24
145	0.22
146	0.22
147	0.17
148	0.24
149	0.3
150	0.35
151	0.42
152	0.45
153	0.46
154	0.47
155	0.55
156	0.5
157	0.54
158	0.55
159	0.54
160	0.55
161	0.57
162	0.54
163	0.47
164	0.5
165	0.42
166	0.44
167	0.45
168	0.45
169	0.52
170	0.54
171	0.54
172	0.53
173	0.55
174	0.47
175	0.4
176	0.39
177	0.31
178	0.29
179	0.27
180	0.22
181	0.17
182	0.15
183	0.13
184	0.08
185	0.05
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.03
190	0.03
191	0.03
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.05
196	0.06
197	0.06
198	0.09
199	0.12
200	0.13
201	0.14
202	0.14
203	0.16
204	0.17
205	0.18
206	0.19
207	0.17
208	0.17
209	0.16
210	0.17
211	0.16
212	0.14
213	0.13
214	0.09
215	0.08
216	0.12
217	0.16
218	0.2
219	0.2
220	0.21
221	0.22
222	0.25
223	0.26
224	0.3
225	0.3
226	0.34
227	0.35
228	0.38
229	0.38
230	0.39
231	0.43
232	0.38
233	0.37
234	0.3
235	0.28
236	0.25
237	0.23
238	0.2
239	0.19
240	0.18
241	0.15
242	0.16
243	0.17
244	0.17
245	0.2
246	0.22
247	0.21
248	0.22
249	0.25
250	0.22
251	0.23
252	0.26
253	0.27
254	0.26
255	0.24
256	0.22
257	0.19
258	0.22
259	0.22
260	0.21
261	0.18
262	0.18
263	0.24
264	0.24
265	0.25
266	0.22
267	0.28
268	0.29
269	0.35
270	0.39
271	0.35
272	0.33
273	0.36
274	0.36
275	0.3
276	0.33
277	0.34
278	0.29
279	0.29
280	0.29
281	0.26
282	0.25
283	0.25
284	0.26
285	0.23
286	0.23
287	0.22
288	0.25
289	0.28
290	0.3
291	0.3
292	0.28
293	0.26
294	0.35
295	0.41
296	0.47
297	0.49
298	0.57
299	0.57
300	0.57
301	0.55
302	0.5
303	0.48
304	0.42
305	0.38
306	0.29
307	0.29
308	0.24
309	0.24
310	0.19
311	0.13
312	0.11
313	0.08
314	0.06
315	0.07
316	0.06
317	0.06
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.06
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.04
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.04
331	0.05
332	0.05
333	0.04
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.06
342	0.08
343	0.08
344	0.09
345	0.09
346	0.09
347	0.09
348	0.09
349	0.09
350	0.07
351	0.07
352	0.06
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.05
357	0.06
358	0.05
359	0.06
360	0.06
361	0.05
362	0.05
363	0.06
364	0.06
365	0.1
366	0.12
367	0.17
368	0.19
369	0.2
370	0.21
371	0.23
372	0.28
373	0.29
374	0.3
375	0.27
376	0.24
377	0.24
378	0.23
379	0.21
380	0.16
381	0.11
382	0.07
383	0.05
384	0.05
385	0.04
386	0.04
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.06
391	0.07
392	0.09
393	0.12
394	0.13
395	0.13
396	0.14
397	0.14
398	0.12
399	0.12
400	0.09
401	0.07
402	0.07
403	0.06
404	0.05
405	0.04
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.06
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.07
416	0.07
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.07
421	0.07
422	0.07
423	0.05
424	0.06
425	0.05
426	0.06
427	0.05
428	0.05
429	0.04
430	0.04
431	0.04
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.04
436	0.03
437	0.04
438	0.04
439	0.05
440	0.06
441	0.07
442	0.08
443	0.09
444	0.12
445	0.12
446	0.15
447	0.2
448	0.23
449	0.29
450	0.38
451	0.45
452	0.53
453	0.61
454	0.63
455	0.6
456	0.61
457	0.61
458	0.63
459	0.61
460	0.59
461	0.53
462	0.49
463	0.47
464	0.43
465	0.37
466	0.27
467	0.26
468	0.19
469	0.17
470	0.18
471	0.17
472	0.17
473	0.17
474	0.16
475	0.13
476	0.18
477	0.18
478	0.17
479	0.18
480	0.17
481	0.18
482	0.18
483	0.17
484	0.13
485	0.14
486	0.15
487	0.18
488	0.18
489	0.21
490	0.25
491	0.26
492	0.25
493	0.23
494	0.23
495	0.2
496	0.21
497	0.17
498	0.13
499	0.11
500	0.11
501	0.1
502	0.07
503	0.07
504	0.06
505	0.08
506	0.08
507	0.08
508	0.08
509	0.09
510	0.1
511	0.11
512	0.12
513	0.1
514	0.1
515	0.1
516	0.12
517	0.16
518	0.23
519	0.29
520	0.31
521	0.34
522	0.35
523	0.37
524	0.39
525	0.37
526	0.3
527	0.24
528	0.23
529	0.26
530	0.32
531	0.38
532	0.37
533	0.39
534	0.45
535	0.52
536	0.6
537	0.61
538	0.57
539	0.54
540	0.56
541	0.55
542	0.54
543	0.47
544	0.39
545	0.36
546	0.31
547	0.26
548	0.21
549	0.17
550	0.12
551	0.11
552	0.09
553	0.07
554	0.08
555	0.09
556	0.09
557	0.15
558	0.17
559	0.18
560	0.22
561	0.25
562	0.27
563	0.3
564	0.35
565	0.35
566	0.35
567	0.35
568	0.31
569	0.28
570	0.24
571	0.21
572	0.18
573	0.13
574	0.11
575	0.1
576	0.1
577	0.13
578	0.17
579	0.21
580	0.24
581	0.29
582	0.36
583	0.41
584	0.42
585	0.39
586	0.38
587	0.38
588	0.36
589	0.31
590	0.26
591	0.23
592	0.27
593	0.28
594	0.26
595	0.22
596	0.26
597	0.28
598	0.29
599	0.27
600	0.22
601	0.24
602	0.25
603	0.28
604	0.25
605	0.25
606	0.24
607	0.26
608	0.28
609	0.3
610	0.33
611	0.34
612	0.31
613	0.32
614	0.33
615	0.36
616	0.39
617	0.42
618	0.38
619	0.35
620	0.36
621	0.34
622	0.34
623	0.31
624	0.29
625	0.24
626	0.24
627	0.23
628	0.22
629	0.23
630	0.19
631	0.15
632	0.12
633	0.1
634	0.1
635	0.1
636	0.08
637	0.06
638	0.06
639	0.08
640	0.07
641	0.07
642	0.06
643	0.06
644	0.06
645	0.06
646	0.06
647	0.04
648	0.05
649	0.06
650	0.06
651	0.06
652	0.06
653	0.07
654	0.07
655	0.1
656	0.1
657	0.1
658	0.1
659	0.1
660	0.1
661	0.1
662	0.1
663	0.07
664	0.1
665	0.1
666	0.09
667	0.1
668	0.16
669	0.18
670	0.19
671	0.2
672	0.2
673	0.24
674	0.26
675	0.29
676	0.27
677	0.3
678	0.31
679	0.3
680	0.28
681	0.24
682	0.23
683	0.22
684	0.19
685	0.17
686	0.17
687	0.17
688	0.18
689	0.21
690	0.22
691	0.24
692	0.28
693	0.29
694	0.3
695	0.31
696	0.32
697	0.34
698	0.42
699	0.39
700	0.37
701	0.36
702	0.34
703	0.36
704	0.4
705	0.39
706	0.29
707	0.33
708	0.34
709	0.34
710	0.4
711	0.4
712	0.35
713	0.38
714	0.4
715	0.41
716	0.49
717	0.49
718	0.44
719	0.46
720	0.46
721	0.45
722	0.48
723	0.48
724	0.39
725	0.39
726	0.39
727	0.35
728	0.39
729	0.38
730	0.35
731	0.31
732	0.31
733	0.3
734	0.36
735	0.41
736	0.41
737	0.38
738	0.38
739	0.41
740	0.45
741	0.45
742	0.39
743	0.33
744	0.33
745	0.34
746	0.39
747	0.35
748	0.31
749	0.31
750	0.3
751	0.37
752	0.38
753	0.41
754	0.41
755	0.46
756	0.53
757	0.58
758	0.62
759	0.63
760	0.63

A0A550CLI8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer