Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DD33

Protein Details
Accession C5DD33    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
484-515ATPSNPRPKVPNSSKPRPKKRRQSDLSPLSTGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
490-505RPKVPNSSKPRPKKRR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029005  LIM-bd/SEUSS  
KEGG lth:KLTH0B07920g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01803  LIM_bind  
Amino Acid Sequences MNSQQPHQGSQHMYGYQAPLRKQVPNFTPGVNMGQMMMGPQVNAHMGQQQPELGLHPTARQGHVQYSGAQISVPQPRKQQQQVQPQSQSNDLSNSTSAIPSPFATSMPTPTGPASAPPMNMHVGAPVSGAAQMPGATRSAGPVSATASTANHISGPGLTPASPQVGAMPSNQFYPVASAYQPVSKRHIASNMIPYPIRKYLSNMAILRLHEIINLVNVSTDRVDDFGYWQRFTNDLFTPYGILRYSTQGGEETRQFEFTTPIIPLICNSLGSVGIVRLEMIPQQLRAQVLSNGTIFFDCPRCTTTFYYPDGSYMTNFSQVKGIFDSNLKIEWVEISSYSFVPGIEWSSLERLISSEPVCHEIFKDLSNSRKKPESTEDPKNQEPARNQDPKVPDNFSAITKLRSQFGVFHNISSFGIQESFMRALQVSDAISYLKNLKVYQKVHNLQSPLTSLESFVASSQAEKASSMAPGAPFKYGNSSSPAATPSNPRPKVPNSSKPRPKKRRQSDLSPLSTGDRGLQGFGQI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.36
3 0.34
4 0.35
5 0.32
6 0.34
7 0.37
8 0.42
9 0.43
10 0.48
11 0.49
12 0.48
13 0.49
14 0.43
15 0.43
16 0.38
17 0.38
18 0.29
19 0.24
20 0.19
21 0.17
22 0.15
23 0.12
24 0.12
25 0.09
26 0.08
27 0.08
28 0.09
29 0.1
30 0.1
31 0.11
32 0.14
33 0.15
34 0.18
35 0.19
36 0.18
37 0.18
38 0.18
39 0.2
40 0.16
41 0.17
42 0.16
43 0.16
44 0.21
45 0.24
46 0.25
47 0.27
48 0.27
49 0.29
50 0.32
51 0.32
52 0.27
53 0.28
54 0.27
55 0.23
56 0.21
57 0.18
58 0.19
59 0.28
60 0.31
61 0.31
62 0.38
63 0.46
64 0.55
65 0.62
66 0.67
67 0.66
68 0.72
69 0.78
70 0.79
71 0.8
72 0.75
73 0.7
74 0.63
75 0.56
76 0.46
77 0.4
78 0.32
79 0.27
80 0.22
81 0.21
82 0.19
83 0.16
84 0.15
85 0.13
86 0.13
87 0.11
88 0.14
89 0.13
90 0.12
91 0.15
92 0.15
93 0.17
94 0.2
95 0.2
96 0.18
97 0.18
98 0.19
99 0.17
100 0.17
101 0.2
102 0.18
103 0.19
104 0.19
105 0.21
106 0.2
107 0.21
108 0.19
109 0.15
110 0.13
111 0.11
112 0.11
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.1
131 0.11
132 0.11
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.1
148 0.11
149 0.11
150 0.09
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.12
155 0.14
156 0.13
157 0.14
158 0.14
159 0.12
160 0.11
161 0.13
162 0.12
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.11
167 0.17
168 0.19
169 0.19
170 0.23
171 0.25
172 0.26
173 0.27
174 0.32
175 0.3
176 0.31
177 0.38
178 0.35
179 0.35
180 0.34
181 0.32
182 0.31
183 0.31
184 0.29
185 0.2
186 0.22
187 0.26
188 0.29
189 0.35
190 0.31
191 0.3
192 0.31
193 0.31
194 0.28
195 0.23
196 0.19
197 0.13
198 0.13
199 0.1
200 0.09
201 0.08
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.06
210 0.07
211 0.06
212 0.09
213 0.16
214 0.18
215 0.18
216 0.19
217 0.19
218 0.2
219 0.2
220 0.21
221 0.15
222 0.15
223 0.15
224 0.15
225 0.15
226 0.14
227 0.15
228 0.11
229 0.1
230 0.09
231 0.11
232 0.12
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.12
237 0.13
238 0.14
239 0.14
240 0.13
241 0.14
242 0.14
243 0.13
244 0.14
245 0.12
246 0.11
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.11
274 0.11
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.1
280 0.11
281 0.1
282 0.09
283 0.08
284 0.1
285 0.09
286 0.1
287 0.12
288 0.14
289 0.17
290 0.21
291 0.25
292 0.27
293 0.29
294 0.32
295 0.29
296 0.29
297 0.27
298 0.24
299 0.18
300 0.16
301 0.14
302 0.17
303 0.17
304 0.16
305 0.19
306 0.18
307 0.19
308 0.19
309 0.19
310 0.13
311 0.14
312 0.15
313 0.12
314 0.13
315 0.11
316 0.09
317 0.09
318 0.08
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.09
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.09
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.1
335 0.1
336 0.09
337 0.09
338 0.08
339 0.09
340 0.11
341 0.11
342 0.11
343 0.12
344 0.16
345 0.16
346 0.16
347 0.15
348 0.16
349 0.16
350 0.15
351 0.2
352 0.19
353 0.27
354 0.36
355 0.38
356 0.39
357 0.45
358 0.45
359 0.45
360 0.51
361 0.53
362 0.52
363 0.6
364 0.65
365 0.64
366 0.66
367 0.66
368 0.6
369 0.55
370 0.52
371 0.49
372 0.5
373 0.52
374 0.5
375 0.51
376 0.54
377 0.52
378 0.52
379 0.48
380 0.4
381 0.36
382 0.37
383 0.31
384 0.32
385 0.29
386 0.26
387 0.28
388 0.28
389 0.26
390 0.25
391 0.25
392 0.25
393 0.27
394 0.34
395 0.29
396 0.29
397 0.28
398 0.28
399 0.27
400 0.22
401 0.19
402 0.1
403 0.1
404 0.09
405 0.09
406 0.11
407 0.13
408 0.12
409 0.12
410 0.12
411 0.11
412 0.12
413 0.13
414 0.09
415 0.08
416 0.09
417 0.09
418 0.09
419 0.1
420 0.13
421 0.13
422 0.16
423 0.17
424 0.23
425 0.31
426 0.35
427 0.42
428 0.49
429 0.53
430 0.57
431 0.6
432 0.56
433 0.48
434 0.47
435 0.4
436 0.32
437 0.28
438 0.23
439 0.18
440 0.17
441 0.17
442 0.14
443 0.12
444 0.12
445 0.1
446 0.1
447 0.12
448 0.13
449 0.12
450 0.12
451 0.13
452 0.12
453 0.13
454 0.13
455 0.13
456 0.14
457 0.17
458 0.18
459 0.19
460 0.19
461 0.19
462 0.26
463 0.26
464 0.25
465 0.27
466 0.28
467 0.27
468 0.28
469 0.31
470 0.25
471 0.26
472 0.31
473 0.36
474 0.45
475 0.47
476 0.47
477 0.51
478 0.56
479 0.64
480 0.66
481 0.66
482 0.65
483 0.74
484 0.82
485 0.87
486 0.91
487 0.91
488 0.93
489 0.94
490 0.95
491 0.95
492 0.93
493 0.92
494 0.92
495 0.91
496 0.86
497 0.77
498 0.67
499 0.59
500 0.52
501 0.42
502 0.33
503 0.27
504 0.21
505 0.2