Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CSQ7

Protein Details
Accession A0A550CSQ7    Localization Confidence Low Confidence Score 7.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MEDFRRRQRQRAVQESSRASHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 8, nucl 6, cyto_mito 6, mito 4, extr 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039448  Beta_helix  
IPR006626  PbH1  
IPR012334  Pectin_lyas_fold  
IPR011050  Pectin_lyase_fold/virulence  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF13229  Beta_helix  
Amino Acid Sequences MEDFRRRQRQRAVQESSRASGLASRDESDCVSSEPADTVTSRLNQLFKNNGAGYKLQLCPGETYTLTDAIYMTAANQELSTAGYPTDDDRAMLVISGQIVNGTGQTTAVDGSCNACSGAALRNVQINGSRGNMTIVTGGANIEFGGHTNGQLIEYVHSFDPRSWSCLHVAEGGNTCTNITVQNNDIGPAGLDVFQQWADGISVACRNSIVRNNVINNPTDGGIVIFGSPGTQVYNNTIEVYNQTLLGGINLVDFGAFNGDYSGTVVHDNTIYGGFATDDEDDDGQTKGENDDDSIIKIGIAIGPRTWFGNNAYNNISSSGTVTNNKLSGAFTYGIGLTSAKNFTVTGNSFFGNYSFIGARGPNCTDNATPSPGAFVVDQKTAVSSTYQTDFVAISDGDSLTCVLPPDGGDYWPYRSDPTSSDDDEGLSGGAKAGIAIGVIFGVLAVAAAAYFIRRWALQRAANERAYKSSRRSAFLANKNY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.78
3 0.7
4 0.6
5 0.49
6 0.39
7 0.34
8 0.28
9 0.26
10 0.24
11 0.23
12 0.24
13 0.25
14 0.26
15 0.24
16 0.23
17 0.18
18 0.18
19 0.16
20 0.16
21 0.15
22 0.15
23 0.15
24 0.14
25 0.14
26 0.17
27 0.19
28 0.21
29 0.24
30 0.27
31 0.28
32 0.33
33 0.38
34 0.35
35 0.4
36 0.39
37 0.37
38 0.36
39 0.35
40 0.32
41 0.32
42 0.32
43 0.28
44 0.27
45 0.27
46 0.27
47 0.28
48 0.28
49 0.22
50 0.24
51 0.23
52 0.23
53 0.21
54 0.18
55 0.16
56 0.13
57 0.13
58 0.09
59 0.07
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.09
67 0.09
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.09
73 0.13
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.12
78 0.11
79 0.11
80 0.09
81 0.07
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.07
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.08
105 0.13
106 0.15
107 0.15
108 0.16
109 0.19
110 0.2
111 0.2
112 0.22
113 0.19
114 0.16
115 0.17
116 0.17
117 0.14
118 0.16
119 0.15
120 0.13
121 0.11
122 0.1
123 0.08
124 0.07
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.05
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.1
139 0.1
140 0.08
141 0.09
142 0.11
143 0.1
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.17
148 0.17
149 0.19
150 0.18
151 0.2
152 0.21
153 0.22
154 0.23
155 0.21
156 0.21
157 0.21
158 0.21
159 0.21
160 0.19
161 0.17
162 0.16
163 0.11
164 0.11
165 0.1
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.13
170 0.13
171 0.14
172 0.13
173 0.11
174 0.1
175 0.09
176 0.08
177 0.06
178 0.06
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.11
195 0.16
196 0.18
197 0.2
198 0.23
199 0.26
200 0.31
201 0.32
202 0.29
203 0.24
204 0.22
205 0.19
206 0.15
207 0.12
208 0.07
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.04
218 0.05
219 0.05
220 0.08
221 0.1
222 0.1
223 0.11
224 0.11
225 0.1
226 0.1
227 0.12
228 0.1
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.04
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.04
243 0.03
244 0.03
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.05
250 0.04
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.06
258 0.05
259 0.04
260 0.05
261 0.04
262 0.04
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.07
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.1
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.08
291 0.08
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.12
296 0.19
297 0.2
298 0.22
299 0.24
300 0.24
301 0.24
302 0.24
303 0.21
304 0.14
305 0.14
306 0.14
307 0.14
308 0.15
309 0.16
310 0.17
311 0.17
312 0.17
313 0.16
314 0.14
315 0.12
316 0.13
317 0.13
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.1
324 0.07
325 0.09
326 0.09
327 0.08
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.15
332 0.16
333 0.17
334 0.18
335 0.18
336 0.18
337 0.18
338 0.18
339 0.14
340 0.12
341 0.11
342 0.09
343 0.09
344 0.1
345 0.11
346 0.12
347 0.14
348 0.17
349 0.16
350 0.17
351 0.2
352 0.19
353 0.24
354 0.26
355 0.26
356 0.23
357 0.22
358 0.22
359 0.19
360 0.2
361 0.15
362 0.16
363 0.15
364 0.15
365 0.16
366 0.14
367 0.15
368 0.14
369 0.14
370 0.12
371 0.1
372 0.12
373 0.14
374 0.15
375 0.14
376 0.15
377 0.14
378 0.13
379 0.14
380 0.11
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.08
385 0.09
386 0.09
387 0.07
388 0.08
389 0.08
390 0.07
391 0.08
392 0.08
393 0.12
394 0.12
395 0.12
396 0.14
397 0.16
398 0.2
399 0.21
400 0.22
401 0.2
402 0.21
403 0.23
404 0.22
405 0.25
406 0.28
407 0.28
408 0.29
409 0.27
410 0.26
411 0.23
412 0.21
413 0.17
414 0.11
415 0.08
416 0.06
417 0.06
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.02
430 0.02
431 0.02
432 0.02
433 0.02
434 0.02
435 0.02
436 0.03
437 0.04
438 0.04
439 0.05
440 0.07
441 0.09
442 0.12
443 0.19
444 0.27
445 0.32
446 0.4
447 0.47
448 0.52
449 0.57
450 0.58
451 0.53
452 0.54
453 0.55
454 0.54
455 0.53
456 0.55
457 0.55
458 0.55
459 0.57
460 0.59
461 0.63