Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CLX1

Protein Details
Accession A0A550CLX1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
174-202LKGQPSTSKEPPRKKPKGPKGPNPLSMKKBasic
255-279GEAGQAGGRKRKRKRKTGGAAGGVEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
182-225KEPPRKKPKGPKGPNPLSMKKKKTAETAPKEKRTEAKAGDKRKR
261-272GGRKRKRKRKTG
Subcellular Location(s) mito 18.5, cyto_mito 11, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
CDD cd09865  PIN_ScUtp23p-like  
Amino Acid Sequences MRQKRAKSYRKLMSLYHINFGFRQPYQVLVDADMCTTAIDNKMELHKQLESVLQGDVKPMITQCCIHALYLQGKVAQPAVDLAKTFERRKCNHREPIDSDECLTAVVGPTNKHRYAIATQSQPLRVKLRAIPAVPIVHIKRAVMILEPPSDNTLREKERMVATSLKPSAQDATLKGQPSTSKEPPRKKPKGPKGPNPLSMKKKKTAETAPKEKRTEAKAGDKRKRNEGDEQDGEGEGGNAGGTGHAAVDIVTGEGEAGQAGGRKRKRKRKTGGAAGGVEGTVTEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.62
3 0.58
4 0.5
5 0.43
6 0.41
7 0.41
8 0.37
9 0.27
10 0.29
11 0.23
12 0.25
13 0.27
14 0.3
15 0.28
16 0.24
17 0.26
18 0.22
19 0.21
20 0.17
21 0.14
22 0.1
23 0.1
24 0.09
25 0.1
26 0.1
27 0.11
28 0.13
29 0.19
30 0.21
31 0.22
32 0.23
33 0.21
34 0.21
35 0.22
36 0.22
37 0.18
38 0.17
39 0.17
40 0.15
41 0.14
42 0.15
43 0.14
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.13
48 0.13
49 0.14
50 0.14
51 0.18
52 0.18
53 0.18
54 0.18
55 0.19
56 0.21
57 0.23
58 0.23
59 0.19
60 0.19
61 0.2
62 0.19
63 0.16
64 0.12
65 0.11
66 0.12
67 0.11
68 0.11
69 0.12
70 0.18
71 0.23
72 0.27
73 0.3
74 0.37
75 0.4
76 0.48
77 0.57
78 0.59
79 0.64
80 0.66
81 0.68
82 0.66
83 0.71
84 0.67
85 0.57
86 0.48
87 0.39
88 0.32
89 0.25
90 0.19
91 0.1
92 0.06
93 0.07
94 0.08
95 0.09
96 0.14
97 0.2
98 0.2
99 0.21
100 0.21
101 0.22
102 0.24
103 0.3
104 0.3
105 0.27
106 0.29
107 0.31
108 0.35
109 0.33
110 0.33
111 0.29
112 0.25
113 0.24
114 0.25
115 0.28
116 0.27
117 0.26
118 0.25
119 0.24
120 0.23
121 0.21
122 0.22
123 0.17
124 0.15
125 0.15
126 0.14
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.08
131 0.09
132 0.09
133 0.1
134 0.11
135 0.1
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.13
140 0.16
141 0.16
142 0.17
143 0.18
144 0.19
145 0.21
146 0.22
147 0.22
148 0.22
149 0.21
150 0.26
151 0.26
152 0.24
153 0.22
154 0.21
155 0.2
156 0.16
157 0.17
158 0.12
159 0.16
160 0.19
161 0.2
162 0.19
163 0.19
164 0.2
165 0.24
166 0.3
167 0.33
168 0.39
169 0.47
170 0.57
171 0.66
172 0.75
173 0.78
174 0.81
175 0.84
176 0.86
177 0.88
178 0.89
179 0.88
180 0.88
181 0.87
182 0.86
183 0.82
184 0.8
185 0.79
186 0.78
187 0.74
188 0.7
189 0.68
190 0.64
191 0.64
192 0.66
193 0.67
194 0.67
195 0.73
196 0.75
197 0.77
198 0.75
199 0.71
200 0.67
201 0.6
202 0.58
203 0.53
204 0.55
205 0.55
206 0.63
207 0.69
208 0.72
209 0.71
210 0.74
211 0.74
212 0.67
213 0.69
214 0.66
215 0.66
216 0.6
217 0.59
218 0.5
219 0.43
220 0.38
221 0.28
222 0.2
223 0.11
224 0.08
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.03
244 0.03
245 0.04
246 0.08
247 0.11
248 0.21
249 0.28
250 0.38
251 0.49
252 0.6
253 0.7
254 0.78
255 0.85
256 0.87
257 0.91
258 0.92
259 0.91
260 0.88
261 0.79
262 0.69
263 0.59
264 0.47
265 0.36