FuNGI

A0A550CTP1

Protein Details

Accession

A0A550CTP1

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
177-196	QEEHRRRYPDWRFKPQQIAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
204-212	PRPRKGRIK
329-358	SRRGRGRSVELGGPSRPAARLPESPRREKR
384-392	PRKKQDKGK

Subcellular Location(s)

nucl 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009071 HMG_box_dom IPR036910 HMG_box_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00505 HMG_box
PROSITE	View protein in PROSITE PS50118 HMG_BOX_2
CDD	cd01389 HMG-box_ROX1-like

Amino Acid Sequences

MSEDRVGPTDESQDAAGAPYNVQVPYKEYEEEGAADEDDDGPPPLVEPTSSMTFTFNTDMTPYEGGLQQTPRFPHPSPVVSGASLAQFSTHEVTPLYTDDAFVGGGRTNRRRAQDPDYIPRAPNAFILFRASFVRTYTLEGGAGGKKDRLGKLVGEAWRALPAHERAEWEAKAILAQEEHRRRYPDWRFKPQQIAAGLGQPSGPRPRKGRIKDGGGGNYDKGEGSSKGKQASALSETTDTEDTASSSASVAEVSGPQIVLDQIDTGSPSVEHISITGSSPISARDEEAPGRSRLSTQIPSLLSPPQEETGGRLRSRSLATKTRSQSTASRRGRGRSVELGGPSRPAARLPESPRREKRSAMVAELLAPGQHSGGRGRNTDVSPPRKKQDKGKGREQSTSGGIFRHVPATPVEQHEHLQSDSAQGPPSTPESAFSSPILAEAKATTGPSQAFGAAPQGSLNIRFYHDPRSVANRQAKPQKGPSEMPPTRAGALQHFGAPSQISGRDHGRVGADLAYAKSPDASPYFAPADMQRLPAPPVAPHTPVMSPATTAASPFTSPATSLASPHARPAAGFERHGMGIVPLTEMFKRSSSAPPMDKGPSPSIVQIPDFIARREEEEESDDAGGSSGSTTPQNVVRPTPPGSSGISVPFGVGKVGQPGVGWSISGSMFTAATSEASSLGTRPTHGRRDTISLPIQRASPVEHQQYTYTPSVEPALLQHPQPTITSQTSSFTSTYQDLPQTAQTSNESQVDVPSQQNWAPLTTEGMGYECSDWQARPLYLRRRRPQLTLAQPYHHTEDTSGIQWTRETGRQGVLAAIEAPQIHNKWSSGYDEAAFAETADWTTQASPELPLMSLPVPHQHANEQQQQQPVEFPATYGTSSEWSYADWTPQEPAPPAYSPAMYTPQQTTWPQQSSWNQQPVYYPQHYLHPSPYTQSQQSPYSQPQSSQYSPYAQAQHSPYTHSQQSPYAQPGHLSIHPEHSPYAQPQHLSAQISPLASPAMKGFSPPEQTGGGPWPGTGGDLSGPVTGVHGAMAEPAQQWASYRTSGWGDPPAEERR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.15
3	0.15
4	0.12
5	0.11
6	0.12
7	0.15
8	0.15
9	0.16
10	0.16
11	0.17
12	0.21
13	0.24
14	0.23
15	0.21
16	0.22
17	0.23
18	0.23
19	0.21
20	0.19
21	0.16
22	0.15
23	0.15
24	0.13
25	0.12
26	0.12
27	0.11
28	0.1
29	0.09
30	0.1
31	0.11
32	0.1
33	0.1
34	0.11
35	0.15
36	0.19
37	0.2
38	0.2
39	0.2
40	0.2
41	0.23
42	0.23
43	0.18
44	0.15
45	0.15
46	0.16
47	0.18
48	0.18
49	0.16
50	0.15
51	0.18
52	0.19
53	0.22
54	0.25
55	0.25
56	0.29
57	0.32
58	0.35
59	0.38
60	0.38
61	0.42
62	0.44
63	0.45
64	0.44
65	0.46
66	0.44
67	0.38
68	0.38
69	0.3
70	0.25
71	0.21
72	0.16
73	0.12
74	0.1
75	0.12
76	0.15
77	0.13
78	0.13
79	0.13
80	0.14
81	0.15
82	0.17
83	0.17
84	0.14
85	0.14
86	0.13
87	0.13
88	0.12
89	0.11
90	0.1
91	0.1
92	0.14
93	0.21
94	0.27
95	0.34
96	0.39
97	0.44
98	0.5
99	0.54
100	0.57
101	0.6
102	0.62
103	0.65
104	0.65
105	0.63
106	0.57
107	0.54
108	0.48
109	0.39
110	0.34
111	0.28
112	0.23
113	0.21
114	0.27
115	0.23
116	0.23
117	0.25
118	0.23
119	0.21
120	0.2
121	0.23
122	0.18
123	0.23
124	0.23
125	0.22
126	0.2
127	0.19
128	0.21
129	0.2
130	0.21
131	0.18
132	0.16
133	0.19
134	0.24
135	0.25
136	0.25
137	0.25
138	0.24
139	0.28
140	0.33
141	0.33
142	0.3
143	0.29
144	0.27
145	0.29
146	0.27
147	0.23
148	0.22
149	0.22
150	0.24
151	0.25
152	0.27
153	0.27
154	0.33
155	0.32
156	0.27
157	0.25
158	0.21
159	0.2
160	0.19
161	0.16
162	0.11
163	0.15
164	0.24
165	0.31
166	0.36
167	0.4
168	0.43
169	0.44
170	0.53
171	0.61
172	0.62
173	0.63
174	0.69
175	0.73
176	0.75
177	0.83
178	0.75
179	0.71
180	0.61
181	0.55
182	0.45
183	0.43
184	0.37
185	0.27
186	0.24
187	0.18
188	0.2
189	0.26
190	0.3
191	0.3
192	0.35
193	0.44
194	0.54
195	0.6
196	0.67
197	0.66
198	0.68
199	0.69
200	0.71
201	0.66
202	0.6
203	0.55
204	0.45
205	0.37
206	0.3
207	0.23
208	0.18
209	0.15
210	0.14
211	0.17
212	0.23
213	0.26
214	0.28
215	0.28
216	0.3
217	0.28
218	0.3
219	0.28
220	0.23
221	0.21
222	0.2
223	0.2
224	0.21
225	0.2
226	0.15
227	0.13
228	0.12
229	0.11
230	0.1
231	0.09
232	0.07
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.06
241	0.07
242	0.06
243	0.06
244	0.07
245	0.07
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.05
250	0.05
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.08
257	0.08
258	0.07
259	0.07
260	0.09
261	0.09
262	0.1
263	0.11
264	0.1
265	0.1
266	0.1
267	0.11
268	0.12
269	0.12
270	0.12
271	0.13
272	0.16
273	0.17
274	0.21
275	0.23
276	0.21
277	0.22
278	0.21
279	0.2
280	0.21
281	0.25
282	0.24
283	0.22
284	0.27
285	0.26
286	0.27
287	0.27
288	0.26
289	0.21
290	0.2
291	0.2
292	0.16
293	0.16
294	0.15
295	0.17
296	0.22
297	0.26
298	0.25
299	0.24
300	0.24
301	0.26
302	0.3
303	0.32
304	0.3
305	0.34
306	0.38
307	0.46
308	0.49
309	0.5
310	0.49
311	0.45
312	0.47
313	0.47
314	0.54
315	0.5
316	0.54
317	0.53
318	0.55
319	0.57
320	0.53
321	0.49
322	0.44
323	0.42
324	0.37
325	0.36
326	0.35
327	0.3
328	0.28
329	0.23
330	0.19
331	0.16
332	0.14
333	0.15
334	0.17
335	0.24
336	0.3
337	0.39
338	0.44
339	0.54
340	0.61
341	0.66
342	0.64
343	0.59
344	0.56
345	0.55
346	0.51
347	0.44
348	0.38
349	0.3
350	0.29
351	0.27
352	0.23
353	0.13
354	0.11
355	0.08
356	0.06
357	0.07
358	0.06
359	0.09
360	0.14
361	0.17
362	0.18
363	0.2
364	0.25
365	0.25
366	0.32
367	0.37
368	0.42
369	0.47
370	0.5
371	0.55
372	0.58
373	0.61
374	0.63
375	0.66
376	0.67
377	0.66
378	0.73
379	0.75
380	0.7
381	0.71
382	0.63
383	0.55
384	0.47
385	0.42
386	0.32
387	0.23
388	0.21
389	0.18
390	0.16
391	0.16
392	0.13
393	0.12
394	0.12
395	0.16
396	0.18
397	0.2
398	0.21
399	0.2
400	0.2
401	0.21
402	0.21
403	0.17
404	0.15
405	0.12
406	0.13
407	0.13
408	0.13
409	0.12
410	0.11
411	0.11
412	0.11
413	0.14
414	0.12
415	0.11
416	0.12
417	0.16
418	0.18
419	0.19
420	0.17
421	0.16
422	0.14
423	0.16
424	0.15
425	0.09
426	0.08
427	0.07
428	0.08
429	0.08
430	0.08
431	0.07
432	0.08
433	0.08
434	0.09
435	0.09
436	0.08
437	0.08
438	0.08
439	0.1
440	0.08
441	0.08
442	0.07
443	0.08
444	0.08
445	0.09
446	0.1
447	0.08
448	0.09
449	0.11
450	0.13
451	0.19
452	0.2
453	0.21
454	0.22
455	0.29
456	0.3
457	0.36
458	0.43
459	0.4
460	0.44
461	0.51
462	0.53
463	0.49
464	0.53
465	0.52
466	0.48
467	0.46
468	0.46
469	0.48
470	0.46
471	0.45
472	0.4
473	0.35
474	0.31
475	0.31
476	0.25
477	0.16
478	0.17
479	0.14
480	0.13
481	0.12
482	0.11
483	0.1
484	0.09
485	0.07
486	0.07
487	0.09
488	0.08
489	0.1
490	0.12
491	0.13
492	0.13
493	0.14
494	0.13
495	0.11
496	0.11
497	0.1
498	0.08
499	0.07
500	0.08
501	0.07
502	0.07
503	0.06
504	0.06
505	0.06
506	0.07
507	0.08
508	0.09
509	0.09
510	0.11
511	0.12
512	0.12
513	0.12
514	0.11
515	0.14
516	0.13
517	0.15
518	0.12
519	0.13
520	0.14
521	0.15
522	0.15
523	0.11
524	0.15
525	0.16
526	0.16
527	0.16
528	0.16
529	0.15
530	0.16
531	0.17
532	0.13
533	0.11
534	0.1
535	0.11
536	0.09
537	0.09
538	0.08
539	0.07
540	0.07
541	0.07
542	0.08
543	0.06
544	0.06
545	0.07
546	0.1
547	0.1
548	0.1
549	0.14
550	0.16
551	0.16
552	0.17
553	0.18
554	0.14
555	0.14
556	0.17
557	0.21
558	0.19
559	0.19
560	0.19
561	0.2
562	0.2
563	0.2
564	0.15
565	0.08
566	0.07
567	0.07
568	0.07
569	0.05
570	0.06
571	0.06
572	0.08
573	0.09
574	0.09
575	0.09
576	0.11
577	0.15
578	0.18
579	0.23
580	0.24
581	0.24
582	0.27
583	0.29
584	0.28
585	0.27
586	0.25
587	0.22
588	0.21
589	0.21
590	0.19
591	0.18
592	0.17
593	0.15
594	0.14
595	0.16
596	0.15
597	0.14
598	0.14
599	0.13
600	0.15
601	0.16
602	0.16
603	0.13
604	0.15
605	0.16
606	0.15
607	0.15
608	0.13
609	0.1
610	0.09
611	0.08
612	0.05
613	0.04
614	0.04
615	0.05
616	0.05
617	0.05
618	0.07
619	0.1
620	0.13
621	0.14
622	0.16
623	0.17
624	0.2
625	0.23
626	0.23
627	0.21
628	0.2
629	0.2
630	0.19
631	0.19
632	0.16
633	0.15
634	0.13
635	0.12
636	0.11
637	0.09
638	0.08
639	0.07
640	0.06
641	0.07
642	0.07
643	0.07
644	0.07
645	0.07
646	0.09
647	0.08
648	0.08
649	0.06
650	0.07
651	0.07
652	0.07
653	0.07
654	0.05
655	0.05
656	0.05
657	0.06
658	0.04
659	0.05
660	0.05
661	0.05
662	0.05
663	0.06
664	0.06
665	0.06
666	0.08
667	0.08
668	0.09
669	0.14
670	0.19
671	0.26
672	0.28
673	0.3
674	0.3
675	0.36
676	0.37
677	0.38
678	0.39
679	0.35
680	0.35
681	0.34
682	0.32
683	0.27
684	0.25
685	0.23
686	0.23
687	0.26
688	0.29
689	0.29
690	0.29
691	0.3
692	0.3
693	0.31
694	0.26
695	0.21
696	0.16
697	0.16
698	0.16
699	0.15
700	0.14
701	0.11
702	0.13
703	0.14
704	0.14
705	0.15
706	0.15
707	0.16
708	0.16
709	0.16
710	0.17
711	0.17
712	0.19
713	0.17
714	0.18
715	0.19
716	0.21
717	0.19
718	0.15
719	0.16
720	0.16
721	0.18
722	0.18
723	0.18
724	0.16
725	0.17
726	0.2
727	0.2
728	0.18
729	0.18
730	0.18
731	0.19
732	0.2
733	0.2
734	0.18
735	0.16
736	0.16
737	0.17
738	0.17
739	0.15
740	0.13
741	0.14
742	0.14
743	0.17
744	0.17
745	0.16
746	0.15
747	0.14
748	0.16
749	0.14
750	0.14
751	0.11
752	0.11
753	0.1
754	0.1
755	0.1
756	0.08
757	0.09
758	0.1
759	0.1
760	0.12
761	0.15
762	0.15
763	0.19
764	0.27
765	0.37
766	0.45
767	0.56
768	0.61
769	0.67
770	0.7
771	0.69
772	0.69
773	0.68
774	0.69
775	0.68
776	0.64
777	0.58
778	0.57
779	0.55
780	0.52
781	0.43
782	0.33
783	0.23
784	0.24
785	0.23
786	0.22
787	0.2
788	0.16
789	0.16
790	0.15
791	0.17
792	0.17
793	0.19
794	0.2
795	0.2
796	0.21
797	0.22
798	0.22
799	0.21
800	0.17
801	0.14
802	0.11
803	0.1
804	0.09
805	0.08
806	0.09
807	0.11
808	0.12
809	0.13
810	0.14
811	0.14
812	0.15
813	0.17
814	0.2
815	0.18
816	0.19
817	0.18
818	0.18
819	0.18
820	0.17
821	0.15
822	0.12
823	0.1
824	0.08
825	0.08
826	0.07
827	0.07
828	0.06
829	0.07
830	0.07
831	0.08
832	0.09
833	0.09
834	0.1
835	0.11
836	0.1
837	0.1
838	0.11
839	0.11
840	0.11
841	0.11
842	0.15
843	0.18
844	0.2
845	0.22
846	0.24
847	0.31
848	0.36
849	0.45
850	0.45
851	0.45
852	0.49
853	0.49
854	0.45
855	0.39
856	0.34
857	0.28
858	0.23
859	0.19
860	0.16
861	0.17
862	0.16
863	0.15
864	0.14
865	0.13
866	0.14
867	0.15
868	0.12
869	0.11
870	0.14
871	0.15
872	0.17
873	0.16
874	0.16
875	0.18
876	0.19
877	0.21
878	0.2
879	0.21
880	0.22
881	0.22
882	0.23
883	0.23
884	0.22
885	0.2
886	0.22
887	0.24
888	0.22
889	0.23
890	0.24
891	0.24
892	0.29
893	0.3
894	0.33
895	0.36
896	0.39
897	0.37
898	0.42
899	0.47
900	0.52
901	0.58
902	0.6
903	0.52
904	0.5
905	0.53
906	0.51
907	0.52
908	0.46
909	0.4
910	0.33
911	0.41
912	0.43
913	0.42
914	0.41
915	0.37
916	0.35
917	0.36
918	0.41
919	0.39
920	0.39
921	0.42
922	0.41
923	0.41
924	0.44
925	0.46
926	0.46
927	0.47
928	0.45
929	0.42
930	0.44
931	0.47
932	0.46
933	0.44
934	0.4
935	0.38
936	0.39
937	0.43
938	0.43
939	0.35
940	0.39
941	0.38
942	0.42
943	0.38
944	0.41
945	0.39
946	0.4
947	0.45
948	0.42
949	0.41
950	0.4
951	0.43
952	0.43
953	0.44
954	0.41
955	0.36
956	0.34
957	0.34
958	0.34
959	0.32
960	0.31
961	0.28
962	0.31
963	0.32
964	0.33
965	0.31
966	0.28
967	0.3
968	0.3
969	0.36
970	0.32
971	0.32
972	0.32
973	0.37
974	0.38
975	0.37
976	0.33
977	0.3
978	0.29
979	0.29
980	0.27
981	0.22
982	0.19
983	0.16
984	0.16
985	0.13
986	0.15
987	0.14
988	0.15
989	0.18
990	0.22
991	0.29
992	0.29
993	0.3
994	0.28
995	0.28
996	0.3
997	0.31
998	0.27
999	0.21
1000	0.2
1001	0.18
1002	0.17
1003	0.17
1004	0.14
1005	0.11
1006	0.08
1007	0.1
1008	0.11
1009	0.1
1010	0.11
1011	0.1
1012	0.11
1013	0.1
1014	0.09
1015	0.08
1016	0.07
1017	0.06
1018	0.07
1019	0.08
1020	0.09
1021	0.09
1022	0.1
1023	0.11
1024	0.11
1025	0.12
1026	0.15
1027	0.18
1028	0.18
1029	0.18
1030	0.21
1031	0.24
1032	0.25
1033	0.28
1034	0.32
1035	0.29
1036	0.3

A0A550CTP1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer