Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CTV3

Protein Details
Accession A0A550CTV3    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-129AERSQPAPSKPRRRNPSTSNQSSPHydrophilic
317-338TGTRARRESRGRRGGRRDRDARBasic
489-512MKLPLRNRHGSSSKRRRRGAGSDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
320-338RARRESRGRRGGRRDRDAR
497-506HGSSSKRRRR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021740  Velvet  
IPR037525  Velvet_dom  
IPR038491  Velvet_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF11754  Velvet  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51821  VELVET  
Amino Acid Sequences MIQKTTEPAATAPPDGPESWGSWVGRKYYSLDVVQHPVRARMCGFGDKDRRPLAPAAVATMVVRRDDNTLVDVDDLDCSFFLVTVDLWSEDGRQEMNLVLHPNAAAERSQPAPSKPRRRNPSTSNQSSPPAPPAPFPSYGPPAPYFPPWSAPAPDRSPSSASAVLPSISTSFGRAPGPSSASPYSPYAQPPFGPPSSSAYGPPSSSSYGPPSSSGYGPPSSTSYGPPSASAYGPPPSYPPFAPYGHPPPSGFGPPPPGFPPPSGFGQTQGFGAHPSPSYADPEVSSPNISTTLSGIPSTRDRDDDRGEASARVETGTGTRARRESRGRRGGRRDRDARDEREGPDGGPDLRDPIEPGQGRRRDRDRDKDDDGDDPTRGTDARSATYTRTLVGPLSANATRLLDEHRKPGIFFLFQDLSVRTEGTFRLRLRLMNVGAPPAPEPGAAGVHTGVSPVLAQAFTAPFTVFSAKRFPGVPDTTALSIAFNQQNMKLPLRNRHGSSSKRRRRGAGSDEDDSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.23
3 0.25
4 0.2
5 0.19
6 0.22
7 0.26
8 0.25
9 0.27
10 0.31
11 0.31
12 0.32
13 0.32
14 0.31
15 0.32
16 0.36
17 0.35
18 0.36
19 0.37
20 0.42
21 0.43
22 0.43
23 0.39
24 0.4
25 0.37
26 0.36
27 0.32
28 0.3
29 0.31
30 0.34
31 0.36
32 0.4
33 0.48
34 0.49
35 0.56
36 0.55
37 0.52
38 0.49
39 0.48
40 0.42
41 0.38
42 0.34
43 0.29
44 0.26
45 0.25
46 0.22
47 0.22
48 0.2
49 0.15
50 0.15
51 0.13
52 0.15
53 0.17
54 0.18
55 0.17
56 0.16
57 0.16
58 0.15
59 0.15
60 0.12
61 0.12
62 0.11
63 0.09
64 0.08
65 0.08
66 0.07
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.08
73 0.08
74 0.09
75 0.09
76 0.1
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.09
81 0.09
82 0.1
83 0.11
84 0.13
85 0.14
86 0.14
87 0.14
88 0.14
89 0.14
90 0.12
91 0.12
92 0.1
93 0.09
94 0.11
95 0.13
96 0.17
97 0.2
98 0.23
99 0.32
100 0.42
101 0.52
102 0.59
103 0.67
104 0.73
105 0.79
106 0.84
107 0.82
108 0.84
109 0.83
110 0.81
111 0.76
112 0.69
113 0.64
114 0.57
115 0.5
116 0.45
117 0.39
118 0.32
119 0.28
120 0.31
121 0.33
122 0.32
123 0.32
124 0.32
125 0.33
126 0.33
127 0.34
128 0.29
129 0.28
130 0.28
131 0.29
132 0.27
133 0.23
134 0.26
135 0.25
136 0.26
137 0.27
138 0.27
139 0.3
140 0.3
141 0.32
142 0.3
143 0.3
144 0.29
145 0.27
146 0.29
147 0.26
148 0.23
149 0.21
150 0.2
151 0.18
152 0.15
153 0.14
154 0.11
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.11
160 0.12
161 0.12
162 0.13
163 0.14
164 0.18
165 0.17
166 0.21
167 0.2
168 0.2
169 0.22
170 0.22
171 0.22
172 0.2
173 0.22
174 0.2
175 0.2
176 0.2
177 0.21
178 0.24
179 0.23
180 0.22
181 0.2
182 0.23
183 0.24
184 0.24
185 0.22
186 0.2
187 0.2
188 0.19
189 0.19
190 0.16
191 0.16
192 0.16
193 0.16
194 0.17
195 0.18
196 0.18
197 0.18
198 0.18
199 0.18
200 0.18
201 0.18
202 0.17
203 0.16
204 0.16
205 0.16
206 0.15
207 0.15
208 0.15
209 0.16
210 0.16
211 0.17
212 0.17
213 0.16
214 0.16
215 0.16
216 0.15
217 0.14
218 0.13
219 0.13
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.14
224 0.16
225 0.15
226 0.15
227 0.17
228 0.18
229 0.19
230 0.22
231 0.26
232 0.28
233 0.29
234 0.27
235 0.24
236 0.25
237 0.26
238 0.22
239 0.16
240 0.2
241 0.19
242 0.21
243 0.22
244 0.21
245 0.2
246 0.21
247 0.22
248 0.17
249 0.19
250 0.2
251 0.18
252 0.18
253 0.18
254 0.18
255 0.16
256 0.14
257 0.11
258 0.09
259 0.1
260 0.09
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.09
265 0.12
266 0.11
267 0.11
268 0.1
269 0.12
270 0.13
271 0.12
272 0.12
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.09
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.13
285 0.16
286 0.16
287 0.18
288 0.19
289 0.24
290 0.27
291 0.26
292 0.25
293 0.23
294 0.23
295 0.21
296 0.2
297 0.16
298 0.12
299 0.11
300 0.09
301 0.07
302 0.07
303 0.1
304 0.13
305 0.14
306 0.16
307 0.2
308 0.22
309 0.28
310 0.37
311 0.44
312 0.5
313 0.6
314 0.65
315 0.7
316 0.79
317 0.83
318 0.82
319 0.82
320 0.8
321 0.74
322 0.77
323 0.75
324 0.69
325 0.66
326 0.61
327 0.53
328 0.49
329 0.45
330 0.34
331 0.29
332 0.26
333 0.19
334 0.16
335 0.14
336 0.12
337 0.12
338 0.12
339 0.12
340 0.12
341 0.19
342 0.2
343 0.24
344 0.31
345 0.37
346 0.4
347 0.46
348 0.52
349 0.54
350 0.62
351 0.69
352 0.67
353 0.67
354 0.7
355 0.67
356 0.62
357 0.55
358 0.51
359 0.42
360 0.35
361 0.28
362 0.22
363 0.18
364 0.17
365 0.14
366 0.13
367 0.13
368 0.15
369 0.17
370 0.18
371 0.19
372 0.24
373 0.23
374 0.2
375 0.19
376 0.17
377 0.15
378 0.16
379 0.15
380 0.11
381 0.15
382 0.15
383 0.15
384 0.15
385 0.15
386 0.14
387 0.14
388 0.19
389 0.23
390 0.25
391 0.29
392 0.34
393 0.34
394 0.34
395 0.37
396 0.35
397 0.29
398 0.27
399 0.28
400 0.25
401 0.24
402 0.26
403 0.23
404 0.21
405 0.19
406 0.19
407 0.12
408 0.13
409 0.14
410 0.18
411 0.24
412 0.23
413 0.28
414 0.29
415 0.31
416 0.32
417 0.38
418 0.34
419 0.32
420 0.32
421 0.3
422 0.29
423 0.28
424 0.25
425 0.2
426 0.19
427 0.13
428 0.13
429 0.11
430 0.12
431 0.11
432 0.11
433 0.1
434 0.1
435 0.1
436 0.1
437 0.08
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.07
442 0.06
443 0.06
444 0.08
445 0.09
446 0.09
447 0.1
448 0.1
449 0.09
450 0.12
451 0.17
452 0.16
453 0.17
454 0.24
455 0.24
456 0.26
457 0.27
458 0.28
459 0.32
460 0.35
461 0.34
462 0.3
463 0.32
464 0.31
465 0.31
466 0.28
467 0.2
468 0.17
469 0.22
470 0.22
471 0.2
472 0.21
473 0.23
474 0.31
475 0.34
476 0.38
477 0.36
478 0.41
479 0.49
480 0.56
481 0.61
482 0.57
483 0.62
484 0.66
485 0.7
486 0.75
487 0.77
488 0.79
489 0.81
490 0.83
491 0.81
492 0.8
493 0.8
494 0.78
495 0.78
496 0.74