Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DIR1

Protein Details
Accession C5DIR1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
151-172SDITRRIRRLRVRNQTPRENRSHydrophilic
296-317IATQKKTIRKSQTMKNLRQESRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031401  She1  
Gene Ontology GO:0015630  C:microtubule cytoskeleton  
GO:0008017  F:microtubule binding  
KEGG lth:KLTH0E14498g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17077  Msap1  
Amino Acid Sequences MAGMECTPVSDAGMEYHDQVIDNLGVSKRLGNSVLSELDLRATDKASSLGPRFEDAQPHTAACDRFEIMHQTEFGAMQSIGSHYAAHKYPVAETSGISQGATDEGGSAGEDEIPGTPKRAPEQNLQSSNKRLRDRNGKSRESDSFVFSPVSDITRRIRRLRVRNQTPRENRSNVNRVRNTPLSGVPPPKISFDRQQATFAKPTFTSINRETRPGAIFSKLKKPDSKPNKFAPPSTPSPAPPLPQLSSRSAELLRAKDSTKIKDKATKNSPSTAHNSVFQRLYEQTTISRSNSSNTIATQKKTIRKSQTMKNLRQESRQDTSPTPTPVTSSVTRSKSSYTLSTRDKSNEKIPRSTSTSMSRPVWR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.14
4 0.14
5 0.14
6 0.13
7 0.14
8 0.12
9 0.12
10 0.14
11 0.13
12 0.14
13 0.14
14 0.17
15 0.16
16 0.18
17 0.19
18 0.16
19 0.19
20 0.22
21 0.22
22 0.2
23 0.2
24 0.17
25 0.17
26 0.17
27 0.15
28 0.12
29 0.13
30 0.12
31 0.12
32 0.13
33 0.14
34 0.19
35 0.21
36 0.23
37 0.23
38 0.25
39 0.28
40 0.29
41 0.33
42 0.31
43 0.33
44 0.31
45 0.3
46 0.29
47 0.3
48 0.28
49 0.23
50 0.22
51 0.18
52 0.17
53 0.19
54 0.24
55 0.22
56 0.23
57 0.22
58 0.2
59 0.2
60 0.19
61 0.17
62 0.13
63 0.1
64 0.08
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.1
70 0.08
71 0.13
72 0.13
73 0.15
74 0.16
75 0.16
76 0.17
77 0.18
78 0.2
79 0.16
80 0.15
81 0.17
82 0.17
83 0.17
84 0.15
85 0.13
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.07
90 0.04
91 0.04
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.05
100 0.08
101 0.08
102 0.1
103 0.11
104 0.13
105 0.16
106 0.22
107 0.25
108 0.31
109 0.4
110 0.47
111 0.54
112 0.56
113 0.57
114 0.59
115 0.62
116 0.61
117 0.57
118 0.52
119 0.52
120 0.59
121 0.64
122 0.67
123 0.69
124 0.66
125 0.64
126 0.65
127 0.6
128 0.54
129 0.47
130 0.4
131 0.32
132 0.28
133 0.25
134 0.2
135 0.19
136 0.14
137 0.14
138 0.11
139 0.12
140 0.16
141 0.23
142 0.28
143 0.3
144 0.38
145 0.45
146 0.54
147 0.62
148 0.68
149 0.72
150 0.78
151 0.81
152 0.83
153 0.82
154 0.79
155 0.75
156 0.67
157 0.6
158 0.58
159 0.6
160 0.56
161 0.58
162 0.54
163 0.51
164 0.53
165 0.51
166 0.45
167 0.38
168 0.33
169 0.28
170 0.28
171 0.28
172 0.23
173 0.23
174 0.22
175 0.23
176 0.23
177 0.23
178 0.25
179 0.3
180 0.33
181 0.31
182 0.36
183 0.35
184 0.37
185 0.37
186 0.32
187 0.26
188 0.22
189 0.24
190 0.22
191 0.21
192 0.24
193 0.24
194 0.32
195 0.31
196 0.33
197 0.32
198 0.32
199 0.31
200 0.28
201 0.25
202 0.21
203 0.24
204 0.25
205 0.33
206 0.36
207 0.38
208 0.42
209 0.45
210 0.51
211 0.59
212 0.65
213 0.62
214 0.65
215 0.71
216 0.67
217 0.65
218 0.61
219 0.56
220 0.52
221 0.5
222 0.45
223 0.35
224 0.4
225 0.39
226 0.34
227 0.31
228 0.3
229 0.27
230 0.29
231 0.32
232 0.29
233 0.29
234 0.28
235 0.28
236 0.24
237 0.27
238 0.27
239 0.25
240 0.24
241 0.23
242 0.23
243 0.28
244 0.32
245 0.34
246 0.39
247 0.41
248 0.43
249 0.5
250 0.55
251 0.58
252 0.62
253 0.65
254 0.59
255 0.61
256 0.59
257 0.55
258 0.56
259 0.51
260 0.44
261 0.41
262 0.4
263 0.37
264 0.37
265 0.32
266 0.3
267 0.26
268 0.28
269 0.24
270 0.22
271 0.21
272 0.24
273 0.27
274 0.25
275 0.27
276 0.23
277 0.25
278 0.26
279 0.27
280 0.24
281 0.23
282 0.3
283 0.3
284 0.31
285 0.36
286 0.4
287 0.46
288 0.5
289 0.58
290 0.58
291 0.64
292 0.7
293 0.72
294 0.76
295 0.78
296 0.8
297 0.82
298 0.82
299 0.76
300 0.77
301 0.75
302 0.71
303 0.67
304 0.64
305 0.58
306 0.51
307 0.53
308 0.51
309 0.48
310 0.43
311 0.38
312 0.35
313 0.33
314 0.36
315 0.32
316 0.32
317 0.37
318 0.38
319 0.4
320 0.39
321 0.4
322 0.38
323 0.39
324 0.42
325 0.39
326 0.44
327 0.49
328 0.51
329 0.53
330 0.56
331 0.57
332 0.55
333 0.59
334 0.6
335 0.58
336 0.62
337 0.61
338 0.61
339 0.63
340 0.61
341 0.57
342 0.56
343 0.56
344 0.55