Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CYN6

Protein Details
Accession A0A550CYN6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
115-142QAEAKTAKNRAKRQKKKERTKKGGVGADBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-155RKRKAIEEQAEAKTAKNRAKRQKKKERTKKGGVGADGEGKADAPLKKRR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009548  Prkrip1  
Gene Ontology GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06658  DUF1168  
Amino Acid Sequences MAGEPSSFTAETIPPVNRHALSATEKQRAQLDRLLKDPAKPAYVPQAPQEKTIRPAREMMKNVQGSSAGAGSGEFHVYKASRRREYERLKLLEEQNRKETETAEFERKRKAIEEQAEAKTAKNRAKRQKKKERTKKGGVGADGEGKADAPLKKRRLVNGQALVFKRPGEEDSDDDAMDDQPAPELALPESLPAEEVPEVPRVAEENRLTIHEDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.23
3 0.28
4 0.25
5 0.26
6 0.25
7 0.25
8 0.28
9 0.35
10 0.39
11 0.42
12 0.42
13 0.43
14 0.48
15 0.46
16 0.43
17 0.41
18 0.42
19 0.37
20 0.39
21 0.45
22 0.39
23 0.4
24 0.42
25 0.39
26 0.35
27 0.32
28 0.31
29 0.34
30 0.37
31 0.35
32 0.35
33 0.41
34 0.39
35 0.44
36 0.46
37 0.39
38 0.41
39 0.47
40 0.44
41 0.37
42 0.42
43 0.42
44 0.46
45 0.47
46 0.45
47 0.46
48 0.45
49 0.43
50 0.37
51 0.33
52 0.24
53 0.21
54 0.17
55 0.08
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.07
61 0.06
62 0.06
63 0.08
64 0.08
65 0.13
66 0.21
67 0.28
68 0.33
69 0.38
70 0.44
71 0.52
72 0.6
73 0.64
74 0.64
75 0.59
76 0.55
77 0.56
78 0.56
79 0.54
80 0.52
81 0.46
82 0.43
83 0.41
84 0.39
85 0.34
86 0.3
87 0.24
88 0.24
89 0.24
90 0.28
91 0.3
92 0.31
93 0.35
94 0.34
95 0.32
96 0.28
97 0.29
98 0.28
99 0.28
100 0.33
101 0.34
102 0.35
103 0.37
104 0.35
105 0.32
106 0.28
107 0.29
108 0.29
109 0.31
110 0.39
111 0.47
112 0.59
113 0.68
114 0.76
115 0.83
116 0.88
117 0.92
118 0.94
119 0.94
120 0.92
121 0.91
122 0.88
123 0.84
124 0.78
125 0.67
126 0.59
127 0.49
128 0.43
129 0.33
130 0.26
131 0.18
132 0.13
133 0.12
134 0.14
135 0.15
136 0.17
137 0.25
138 0.29
139 0.35
140 0.38
141 0.44
142 0.49
143 0.53
144 0.57
145 0.56
146 0.56
147 0.57
148 0.55
149 0.51
150 0.43
151 0.37
152 0.28
153 0.22
154 0.19
155 0.18
156 0.19
157 0.21
158 0.25
159 0.27
160 0.26
161 0.24
162 0.24
163 0.19
164 0.17
165 0.13
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.11
181 0.1
182 0.11
183 0.12
184 0.14
185 0.15
186 0.14
187 0.15
188 0.15
189 0.16
190 0.22
191 0.22
192 0.23
193 0.24
194 0.26