FuNGI

A0A550CV04

Protein Details

Accession

A0A550CV04

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
827-851	GGDYRPYSKRKPCSFFQQGRCRYGD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
410-448	KTKSGEKRKPTEPPPSKPAPPKKQALAASAKPVAVKRET
472-476	KAKPK
811-825	RGRGRGRGRGGGGGG

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 14, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035441 TFIIS/LEDGF_dom_sf IPR017923 TFIIS_N IPR000571 Znf_CCCH IPR036855 Znf_CCCH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0046872 F:metal ion binding
Pfam	View protein in Pfam PF08711 Med26 PF00642 zf-CCCH
PROSITE	View protein in PROSITE PS51319 TFIIS_N PS50103 ZF_C3H1

Amino Acid Sequences

MDAGAVYNDWLYQQPQVFNQKPTEPEWQRQQQQNASTTEAPAPSTGYPTTDSAAASSSATSPTYIPYNYNYVPHSYTTTAYQAAQWQNQPGAYANSVGQHVTTTHPPPQNPPTQSPMVIDPSLTASNGDLQQYNGYFGQASPSAPTPPTPQQLQLQYQRQQQQPPAHQQQRPPSSQDYNYPGYPPLYPNYLANPLQGHSQSPQPPTVSPSSLQTPSPFAPIGSHQFYNPTPVTATASGSSTISSTATQQPQPSLPPPGPTPEEKRNRFMAALRPLLADTAFTGAQAVNSLMNRIHDYGVDDVDAPTRKTILNAVRDHAGNHYFRAWSENPEAIDVTRDWLKQGYQAKDETVMPLLHLIDRLPFTVQTLAESKMGKIIRKLAKEASSAAIKDMATNIERRWRAMISESEAKTKSGEKRKPTEPPPSKPAPPKKQALAASAKPVAVKRETPSAGASAKAAAGAKVDAGFFSAPKAKPKLPSFKKATTAAPAEVKREVDVGVAQPSSYDPFKETLMSMKKRDSPAATPQPPATPAASVSAKTGKKKKSVTWAPEDKLESVRLIEKAVYDDDESGPHPQHHDLRDFDRGEGAALKHLFEEVIDWFEPVLIDIKDEERYDRGRESVEKEVQEQREATALAALYPDPSLIPESPSEPPTALSDEETEQGMLLMNAGPEIQAEISEHPGDDFAPGPSMGSVAELVGQLAAGNQSFVDPSMSGAQFNAPPGLDLKAAGIDAAATVGALQNLPQDTLQTLLSQLQNTMAVAQAPQPQQPPPPPSYQWGGAPGSGGPPPGDGYGEYDRWNNNGHSEGGYGRGRGRGRGRGGGGGGGGGDYRPYSKRKPCSFFQQGRCRYGDQCDFLHEM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.29
3	0.39
4	0.43
5	0.46
6	0.5
7	0.5
8	0.49
9	0.51
10	0.55
11	0.51
12	0.54
13	0.6
14	0.64
15	0.68
16	0.73
17	0.76
18	0.73
19	0.74
20	0.72
21	0.65
22	0.61
23	0.53
24	0.47
25	0.43
26	0.36
27	0.3
28	0.24
29	0.24
30	0.18
31	0.21
32	0.19
33	0.17
34	0.19
35	0.19
36	0.2
37	0.19
38	0.18
39	0.15
40	0.16
41	0.15
42	0.13
43	0.12
44	0.12
45	0.12
46	0.12
47	0.12
48	0.11
49	0.13
50	0.17
51	0.17
52	0.18
53	0.2
54	0.26
55	0.27
56	0.3
57	0.29
58	0.29
59	0.31
60	0.31
61	0.32
62	0.26
63	0.26
64	0.26
65	0.27
66	0.25
67	0.23
68	0.23
69	0.26
70	0.3
71	0.33
72	0.33
73	0.33
74	0.33
75	0.33
76	0.32
77	0.27
78	0.25
79	0.21
80	0.2
81	0.17
82	0.18
83	0.18
84	0.17
85	0.15
86	0.12
87	0.12
88	0.14
89	0.19
90	0.21
91	0.29
92	0.33
93	0.35
94	0.41
95	0.48
96	0.53
97	0.53
98	0.53
99	0.52
100	0.5
101	0.5
102	0.45
103	0.41
104	0.37
105	0.32
106	0.27
107	0.22
108	0.22
109	0.22
110	0.19
111	0.16
112	0.11
113	0.15
114	0.17
115	0.18
116	0.15
117	0.15
118	0.18
119	0.18
120	0.2
121	0.16
122	0.15
123	0.14
124	0.13
125	0.16
126	0.14
127	0.14
128	0.13
129	0.15
130	0.17
131	0.17
132	0.19
133	0.22
134	0.27
135	0.31
136	0.31
137	0.33
138	0.37
139	0.44
140	0.49
141	0.52
142	0.53
143	0.55
144	0.6
145	0.65
146	0.63
147	0.62
148	0.62
149	0.63
150	0.62
151	0.66
152	0.7
153	0.7
154	0.69
155	0.7
156	0.73
157	0.72
158	0.67
159	0.62
160	0.57
161	0.55
162	0.54
163	0.53
164	0.49
165	0.45
166	0.43
167	0.39
168	0.35
169	0.3
170	0.29
171	0.25
172	0.21
173	0.2
174	0.2
175	0.2
176	0.23
177	0.27
178	0.26
179	0.25
180	0.24
181	0.21
182	0.24
183	0.23
184	0.21
185	0.17
186	0.23
187	0.27
188	0.28
189	0.31
190	0.28
191	0.29
192	0.31
193	0.33
194	0.29
195	0.24
196	0.25
197	0.27
198	0.27
199	0.27
200	0.24
201	0.25
202	0.23
203	0.26
204	0.22
205	0.17
206	0.17
207	0.2
208	0.25
209	0.24
210	0.24
211	0.21
212	0.24
213	0.24
214	0.29
215	0.25
216	0.2
217	0.17
218	0.17
219	0.21
220	0.18
221	0.2
222	0.14
223	0.15
224	0.14
225	0.14
226	0.13
227	0.09
228	0.09
229	0.08
230	0.08
231	0.1
232	0.16
233	0.19
234	0.22
235	0.23
236	0.24
237	0.25
238	0.28
239	0.28
240	0.27
241	0.24
242	0.25
243	0.25
244	0.27
245	0.29
246	0.3
247	0.35
248	0.39
249	0.48
250	0.49
251	0.52
252	0.51
253	0.5
254	0.47
255	0.44
256	0.42
257	0.39
258	0.38
259	0.35
260	0.32
261	0.3
262	0.28
263	0.24
264	0.16
265	0.09
266	0.09
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.07
276	0.08
277	0.08
278	0.09
279	0.11
280	0.12
281	0.12
282	0.1
283	0.12
284	0.12
285	0.12
286	0.11
287	0.1
288	0.09
289	0.12
290	0.13
291	0.12
292	0.11
293	0.12
294	0.11
295	0.12
296	0.18
297	0.2
298	0.27
299	0.28
300	0.29
301	0.31
302	0.31
303	0.31
304	0.28
305	0.26
306	0.19
307	0.18
308	0.18
309	0.16
310	0.16
311	0.21
312	0.19
313	0.19
314	0.22
315	0.23
316	0.21
317	0.22
318	0.22
319	0.16
320	0.17
321	0.12
322	0.12
323	0.12
324	0.12
325	0.12
326	0.12
327	0.13
328	0.17
329	0.24
330	0.25
331	0.25
332	0.26
333	0.26
334	0.27
335	0.27
336	0.22
337	0.17
338	0.13
339	0.11
340	0.11
341	0.11
342	0.09
343	0.09
344	0.08
345	0.07
346	0.08
347	0.09
348	0.08
349	0.08
350	0.09
351	0.11
352	0.1
353	0.11
354	0.12
355	0.13
356	0.15
357	0.15
358	0.14
359	0.17
360	0.19
361	0.18
362	0.17
363	0.25
364	0.28
365	0.29
366	0.32
367	0.3
368	0.32
369	0.32
370	0.32
371	0.26
372	0.22
373	0.2
374	0.18
375	0.16
376	0.13
377	0.12
378	0.11
379	0.11
380	0.1
381	0.11
382	0.11
383	0.16
384	0.17
385	0.17
386	0.19
387	0.17
388	0.17
389	0.19
390	0.21
391	0.18
392	0.25
393	0.25
394	0.27
395	0.27
396	0.26
397	0.24
398	0.27
399	0.3
400	0.32
401	0.38
402	0.41
403	0.47
404	0.52
405	0.59
406	0.6
407	0.63
408	0.61
409	0.61
410	0.61
411	0.59
412	0.6
413	0.61
414	0.65
415	0.63
416	0.6
417	0.59
418	0.54
419	0.56
420	0.53
421	0.49
422	0.44
423	0.36
424	0.34
425	0.31
426	0.3
427	0.24
428	0.23
429	0.2
430	0.16
431	0.17
432	0.15
433	0.2
434	0.2
435	0.2
436	0.2
437	0.2
438	0.19
439	0.17
440	0.16
441	0.09
442	0.09
443	0.09
444	0.08
445	0.06
446	0.06
447	0.05
448	0.05
449	0.05
450	0.05
451	0.04
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.06
456	0.12
457	0.12
458	0.17
459	0.21
460	0.22
461	0.3
462	0.36
463	0.46
464	0.46
465	0.54
466	0.57
467	0.57
468	0.6
469	0.56
470	0.51
471	0.45
472	0.41
473	0.34
474	0.33
475	0.29
476	0.26
477	0.25
478	0.24
479	0.19
480	0.17
481	0.15
482	0.1
483	0.1
484	0.09
485	0.09
486	0.09
487	0.08
488	0.08
489	0.08
490	0.1
491	0.09
492	0.09
493	0.08
494	0.1
495	0.1
496	0.11
497	0.11
498	0.16
499	0.24
500	0.28
501	0.29
502	0.32
503	0.36
504	0.37
505	0.4
506	0.36
507	0.32
508	0.38
509	0.46
510	0.45
511	0.41
512	0.4
513	0.38
514	0.36
515	0.34
516	0.24
517	0.14
518	0.12
519	0.15
520	0.14
521	0.13
522	0.14
523	0.2
524	0.22
525	0.28
526	0.35
527	0.37
528	0.44
529	0.48
530	0.51
531	0.54
532	0.61
533	0.61
534	0.63
535	0.66
536	0.6
537	0.6
538	0.57
539	0.47
540	0.4
541	0.34
542	0.25
543	0.18
544	0.19
545	0.15
546	0.14
547	0.13
548	0.11
549	0.12
550	0.13
551	0.12
552	0.1
553	0.11
554	0.11
555	0.12
556	0.12
557	0.13
558	0.13
559	0.13
560	0.14
561	0.16
562	0.21
563	0.23
564	0.26
565	0.27
566	0.3
567	0.37
568	0.36
569	0.32
570	0.28
571	0.25
572	0.21
573	0.21
574	0.18
575	0.15
576	0.15
577	0.15
578	0.13
579	0.13
580	0.12
581	0.09
582	0.1
583	0.06
584	0.09
585	0.09
586	0.09
587	0.09
588	0.09
589	0.09
590	0.08
591	0.1
592	0.07
593	0.07
594	0.08
595	0.1
596	0.12
597	0.13
598	0.14
599	0.15
600	0.17
601	0.2
602	0.2
603	0.2
604	0.21
605	0.24
606	0.28
607	0.33
608	0.35
609	0.33
610	0.36
611	0.42
612	0.4
613	0.39
614	0.34
615	0.26
616	0.24
617	0.23
618	0.19
619	0.14
620	0.12
621	0.1
622	0.1
623	0.09
624	0.07
625	0.07
626	0.07
627	0.05
628	0.06
629	0.09
630	0.08
631	0.1
632	0.11
633	0.14
634	0.17
635	0.18
636	0.18
637	0.16
638	0.16
639	0.17
640	0.18
641	0.16
642	0.14
643	0.15
644	0.15
645	0.16
646	0.16
647	0.13
648	0.11
649	0.1
650	0.09
651	0.07
652	0.06
653	0.06
654	0.05
655	0.05
656	0.05
657	0.05
658	0.04
659	0.06
660	0.05
661	0.05
662	0.06
663	0.07
664	0.1
665	0.11
666	0.11
667	0.1
668	0.1
669	0.1
670	0.1
671	0.1
672	0.07
673	0.09
674	0.09
675	0.09
676	0.08
677	0.09
678	0.07
679	0.07
680	0.07
681	0.05
682	0.06
683	0.06
684	0.06
685	0.06
686	0.05
687	0.04
688	0.05
689	0.06
690	0.05
691	0.05
692	0.05
693	0.05
694	0.06
695	0.06
696	0.07
697	0.06
698	0.08
699	0.14
700	0.15
701	0.15
702	0.15
703	0.17
704	0.17
705	0.18
706	0.18
707	0.11
708	0.12
709	0.13
710	0.15
711	0.12
712	0.11
713	0.11
714	0.1
715	0.1
716	0.09
717	0.08
718	0.06
719	0.05
720	0.05
721	0.04
722	0.03
723	0.03
724	0.04
725	0.05
726	0.04
727	0.05
728	0.08
729	0.09
730	0.1
731	0.1
732	0.11
733	0.11
734	0.13
735	0.13
736	0.1
737	0.11
738	0.14
739	0.16
740	0.16
741	0.16
742	0.16
743	0.16
744	0.15
745	0.15
746	0.11
747	0.09
748	0.09
749	0.13
750	0.19
751	0.2
752	0.23
753	0.25
754	0.27
755	0.33
756	0.4
757	0.43
758	0.4
759	0.45
760	0.45
761	0.47
762	0.5
763	0.46
764	0.41
765	0.4
766	0.38
767	0.31
768	0.29
769	0.25
770	0.21
771	0.19
772	0.18
773	0.12
774	0.12
775	0.13
776	0.13
777	0.13
778	0.11
779	0.16
780	0.21
781	0.22
782	0.23
783	0.26
784	0.26
785	0.27
786	0.31
787	0.26
788	0.24
789	0.25
790	0.25
791	0.22
792	0.23
793	0.21
794	0.24
795	0.24
796	0.23
797	0.22
798	0.27
799	0.27
800	0.33
801	0.4
802	0.42
803	0.46
804	0.51
805	0.52
806	0.49
807	0.49
808	0.43
809	0.36
810	0.27
811	0.21
812	0.14
813	0.12
814	0.07
815	0.07
816	0.07
817	0.1
818	0.14
819	0.2
820	0.3
821	0.39
822	0.5
823	0.59
824	0.65
825	0.69
826	0.75
827	0.8
828	0.81
829	0.82
830	0.83
831	0.81
832	0.8
833	0.77
834	0.7
835	0.62
836	0.61
837	0.59
838	0.52
839	0.46

A0A550CV04

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer