Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DH84

Protein Details
Accession C5DH84    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-32CTKTLKFKTSLARKVRHQRPNCKLGMQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 17.5, mito_nucl 10.5, cyto_pero 4, cyto 3.5, pero 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002372  PQQ_repeat  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
KEGG lth:KLTH0E02134g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13360  PQQ_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MLNHICTKTLKFKTSLARKVRHQRPNCKLGMQFECLKNVPEDLVSSLLVSDRTPHINVTAWDGTVSLYDYNANELVVRMKHTDPLLCSAWLEHGSKKYAGSVAGEVLEVDMESGKFHLVSDAAELGISAMRCSENDVLAGSWDGSLQALDTRSGKAWFTVRHENRKVLALDCAGNTVVVATTGGKVTIYDLRNMHNPKLQESGLKFQTRDIKLMPSGGGYVQSSLDGRVAVEYFGQDSSRFAFRCHRMNLSDTQFVFPVNALCFNRSDELLYTGGSDGRVFSWNLTTRKKSEELPKFEDSVLKLGCNDDVFCVATGDDSFKTLATIQDADVQPGKIYYTKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.69
3 0.68
4 0.68
5 0.73
6 0.81
7 0.85
8 0.85
9 0.84
10 0.86
11 0.86
12 0.88
13 0.81
14 0.76
15 0.7
16 0.68
17 0.64
18 0.58
19 0.56
20 0.48
21 0.5
22 0.45
23 0.42
24 0.35
25 0.3
26 0.25
27 0.18
28 0.18
29 0.14
30 0.15
31 0.13
32 0.12
33 0.11
34 0.11
35 0.11
36 0.1
37 0.11
38 0.12
39 0.15
40 0.16
41 0.17
42 0.17
43 0.2
44 0.21
45 0.25
46 0.23
47 0.2
48 0.19
49 0.19
50 0.17
51 0.14
52 0.15
53 0.08
54 0.07
55 0.08
56 0.09
57 0.11
58 0.11
59 0.1
60 0.09
61 0.09
62 0.13
63 0.12
64 0.14
65 0.15
66 0.16
67 0.19
68 0.21
69 0.23
70 0.21
71 0.25
72 0.25
73 0.22
74 0.21
75 0.18
76 0.19
77 0.2
78 0.2
79 0.18
80 0.19
81 0.22
82 0.22
83 0.22
84 0.21
85 0.19
86 0.18
87 0.17
88 0.15
89 0.13
90 0.12
91 0.11
92 0.1
93 0.08
94 0.07
95 0.05
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.06
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.09
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.07
138 0.08
139 0.09
140 0.1
141 0.1
142 0.11
143 0.13
144 0.15
145 0.2
146 0.3
147 0.34
148 0.43
149 0.45
150 0.46
151 0.44
152 0.45
153 0.41
154 0.31
155 0.27
156 0.19
157 0.17
158 0.15
159 0.14
160 0.1
161 0.09
162 0.08
163 0.06
164 0.04
165 0.03
166 0.04
167 0.03
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.06
174 0.12
175 0.12
176 0.15
177 0.16
178 0.18
179 0.25
180 0.27
181 0.28
182 0.24
183 0.24
184 0.23
185 0.26
186 0.25
187 0.23
188 0.23
189 0.27
190 0.3
191 0.31
192 0.29
193 0.29
194 0.38
195 0.35
196 0.34
197 0.29
198 0.27
199 0.25
200 0.26
201 0.23
202 0.14
203 0.13
204 0.11
205 0.12
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.1
226 0.14
227 0.14
228 0.15
229 0.23
230 0.27
231 0.35
232 0.38
233 0.4
234 0.38
235 0.41
236 0.47
237 0.44
238 0.45
239 0.38
240 0.36
241 0.31
242 0.29
243 0.26
244 0.19
245 0.16
246 0.11
247 0.16
248 0.16
249 0.17
250 0.18
251 0.2
252 0.21
253 0.19
254 0.19
255 0.15
256 0.17
257 0.16
258 0.15
259 0.14
260 0.13
261 0.13
262 0.12
263 0.1
264 0.08
265 0.09
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.18
270 0.25
271 0.31
272 0.37
273 0.41
274 0.41
275 0.47
276 0.49
277 0.48
278 0.52
279 0.56
280 0.57
281 0.59
282 0.6
283 0.56
284 0.54
285 0.52
286 0.43
287 0.39
288 0.32
289 0.26
290 0.23
291 0.22
292 0.23
293 0.2
294 0.19
295 0.14
296 0.15
297 0.15
298 0.15
299 0.14
300 0.12
301 0.12
302 0.12
303 0.14
304 0.12
305 0.12
306 0.12
307 0.11
308 0.13
309 0.13
310 0.14
311 0.15
312 0.16
313 0.15
314 0.23
315 0.24
316 0.26
317 0.28
318 0.27
319 0.23
320 0.22
321 0.24