Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CBV6

Protein Details
Accession A0A550CBV6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-43HEEKDRESRHHDKGRKSTKTKDLSHVPCKFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
101-125KNKKAAQQAAGGGGRESGGRRGKRE
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045072  MKRN-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0000209  P:protein polyubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF14608  zf-CCCH_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MPSADRLESSASQHEEKDRESRHHDKGRKSTKTKDLSHVPCKFYKVGGCTAGSSCPFSHAAVDPSAQKDTCAWFIKGNCKFGHKCALAHILPGQSMAMDRKNKKAAQQAAGGGGRESGGRRGKREGAGVSGRSNSLLSGGSTAPTRASTSGRPPISTMSLKVSPSAPAPAIKNTDFASFTEALDESAELPAAPARQQSQSSPTHEAGNPITAQASPTSSIPVASPRRQARTTPPPADLGPIGSPPRQSGMATSPRRPNGFTSSPSRDAGSSAQATSSPFSAPHNQTAFYDDWQGQGIAASLGSGMAMAMGAGGNGAVSRSVGWNNMDDEGGYNQRTIRGRPTNMPNGGDEDLEEFIPSSLTDLLTPEERSRRMSRTNSGQTSTGTPSQHQPLPSREAPSGAGHRYSRSVPAPSLLADVRSIWAENPPAPDATKQSIIPPHSAGLASSPNTHLGVPGSFTHGSLVDDTKQQLGRGVRNVSSPIYGAAHLSSAGNPARSPFDLTQYSQGATNAQTESYLRNGPQHPQNIQAQPSAQQENFVMSPSTRALQAHAPGQSLPQGLAAGYSRIHALPPPLPLASPSGSTTFGAASGSPGVGANTFGSFSGNMSDWAASTPPPGISGAGVSMKGGVPGSQTGGSTLDQMFSRLSPLSQPAAAGADDDDLFSMDNMDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.37
3 0.39
4 0.44
5 0.43
6 0.46
7 0.52
8 0.58
9 0.62
10 0.69
11 0.73
12 0.74
13 0.8
14 0.83
15 0.85
16 0.84
17 0.83
18 0.83
19 0.85
20 0.81
21 0.79
22 0.79
23 0.78
24 0.81
25 0.79
26 0.74
27 0.68
28 0.67
29 0.59
30 0.53
31 0.49
32 0.44
33 0.42
34 0.41
35 0.38
36 0.35
37 0.35
38 0.35
39 0.31
40 0.29
41 0.23
42 0.23
43 0.23
44 0.21
45 0.23
46 0.21
47 0.22
48 0.21
49 0.23
50 0.23
51 0.25
52 0.28
53 0.25
54 0.23
55 0.23
56 0.24
57 0.3
58 0.31
59 0.29
60 0.31
61 0.36
62 0.46
63 0.49
64 0.51
65 0.46
66 0.49
67 0.5
68 0.5
69 0.55
70 0.47
71 0.42
72 0.42
73 0.48
74 0.4
75 0.4
76 0.39
77 0.3
78 0.27
79 0.26
80 0.21
81 0.12
82 0.14
83 0.16
84 0.19
85 0.27
86 0.3
87 0.37
88 0.45
89 0.47
90 0.52
91 0.58
92 0.59
93 0.55
94 0.57
95 0.51
96 0.5
97 0.49
98 0.43
99 0.33
100 0.25
101 0.2
102 0.16
103 0.15
104 0.17
105 0.23
106 0.26
107 0.3
108 0.35
109 0.41
110 0.43
111 0.47
112 0.41
113 0.4
114 0.42
115 0.41
116 0.37
117 0.33
118 0.3
119 0.26
120 0.24
121 0.17
122 0.13
123 0.11
124 0.09
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.12
133 0.12
134 0.15
135 0.18
136 0.25
137 0.33
138 0.34
139 0.34
140 0.33
141 0.34
142 0.37
143 0.35
144 0.29
145 0.26
146 0.28
147 0.28
148 0.28
149 0.26
150 0.22
151 0.21
152 0.22
153 0.17
154 0.17
155 0.19
156 0.21
157 0.25
158 0.24
159 0.25
160 0.24
161 0.25
162 0.23
163 0.21
164 0.22
165 0.19
166 0.18
167 0.18
168 0.16
169 0.14
170 0.13
171 0.13
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.11
182 0.14
183 0.16
184 0.17
185 0.22
186 0.27
187 0.31
188 0.35
189 0.33
190 0.34
191 0.34
192 0.35
193 0.29
194 0.27
195 0.22
196 0.17
197 0.16
198 0.12
199 0.12
200 0.1
201 0.1
202 0.08
203 0.09
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.17
209 0.22
210 0.25
211 0.32
212 0.35
213 0.41
214 0.43
215 0.45
216 0.46
217 0.51
218 0.57
219 0.53
220 0.49
221 0.46
222 0.44
223 0.44
224 0.34
225 0.26
226 0.17
227 0.16
228 0.16
229 0.15
230 0.16
231 0.14
232 0.16
233 0.15
234 0.14
235 0.13
236 0.18
237 0.27
238 0.3
239 0.35
240 0.4
241 0.42
242 0.44
243 0.43
244 0.39
245 0.37
246 0.37
247 0.36
248 0.37
249 0.4
250 0.41
251 0.41
252 0.38
253 0.3
254 0.28
255 0.25
256 0.22
257 0.16
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.13
262 0.12
263 0.12
264 0.08
265 0.08
266 0.1
267 0.17
268 0.19
269 0.24
270 0.25
271 0.25
272 0.25
273 0.28
274 0.26
275 0.19
276 0.2
277 0.15
278 0.14
279 0.14
280 0.14
281 0.1
282 0.09
283 0.08
284 0.05
285 0.04
286 0.04
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.02
291 0.02
292 0.02
293 0.02
294 0.02
295 0.02
296 0.02
297 0.02
298 0.02
299 0.02
300 0.02
301 0.02
302 0.02
303 0.02
304 0.02
305 0.03
306 0.04
307 0.05
308 0.06
309 0.07
310 0.08
311 0.09
312 0.1
313 0.09
314 0.08
315 0.09
316 0.09
317 0.1
318 0.09
319 0.09
320 0.08
321 0.13
322 0.14
323 0.14
324 0.21
325 0.25
326 0.27
327 0.33
328 0.39
329 0.42
330 0.43
331 0.43
332 0.35
333 0.33
334 0.31
335 0.25
336 0.19
337 0.13
338 0.11
339 0.1
340 0.09
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.06
350 0.07
351 0.08
352 0.09
353 0.11
354 0.14
355 0.15
356 0.19
357 0.22
358 0.26
359 0.31
360 0.35
361 0.38
362 0.44
363 0.51
364 0.49
365 0.47
366 0.44
367 0.38
368 0.36
369 0.34
370 0.29
371 0.21
372 0.2
373 0.21
374 0.24
375 0.25
376 0.25
377 0.26
378 0.25
379 0.31
380 0.33
381 0.32
382 0.29
383 0.27
384 0.27
385 0.26
386 0.26
387 0.21
388 0.22
389 0.2
390 0.2
391 0.21
392 0.21
393 0.22
394 0.2
395 0.21
396 0.18
397 0.19
398 0.18
399 0.17
400 0.18
401 0.14
402 0.12
403 0.1
404 0.1
405 0.1
406 0.09
407 0.09
408 0.07
409 0.09
410 0.1
411 0.11
412 0.13
413 0.14
414 0.14
415 0.15
416 0.16
417 0.17
418 0.19
419 0.19
420 0.17
421 0.2
422 0.24
423 0.25
424 0.26
425 0.23
426 0.21
427 0.19
428 0.19
429 0.15
430 0.12
431 0.13
432 0.12
433 0.12
434 0.13
435 0.13
436 0.14
437 0.14
438 0.12
439 0.11
440 0.1
441 0.11
442 0.1
443 0.14
444 0.13
445 0.13
446 0.14
447 0.13
448 0.13
449 0.13
450 0.14
451 0.11
452 0.13
453 0.14
454 0.17
455 0.17
456 0.16
457 0.2
458 0.22
459 0.24
460 0.28
461 0.31
462 0.28
463 0.29
464 0.31
465 0.27
466 0.24
467 0.2
468 0.16
469 0.14
470 0.13
471 0.11
472 0.1
473 0.09
474 0.09
475 0.09
476 0.08
477 0.1
478 0.12
479 0.12
480 0.11
481 0.13
482 0.16
483 0.16
484 0.21
485 0.18
486 0.23
487 0.25
488 0.27
489 0.31
490 0.29
491 0.28
492 0.24
493 0.23
494 0.19
495 0.17
496 0.18
497 0.14
498 0.12
499 0.12
500 0.12
501 0.14
502 0.15
503 0.17
504 0.15
505 0.21
506 0.23
507 0.28
508 0.35
509 0.4
510 0.38
511 0.4
512 0.47
513 0.45
514 0.45
515 0.41
516 0.35
517 0.33
518 0.36
519 0.36
520 0.29
521 0.26
522 0.24
523 0.25
524 0.24
525 0.21
526 0.17
527 0.12
528 0.15
529 0.15
530 0.15
531 0.13
532 0.13
533 0.15
534 0.18
535 0.21
536 0.23
537 0.24
538 0.24
539 0.22
540 0.23
541 0.24
542 0.2
543 0.17
544 0.13
545 0.12
546 0.1
547 0.12
548 0.11
549 0.09
550 0.09
551 0.09
552 0.1
553 0.1
554 0.11
555 0.11
556 0.15
557 0.16
558 0.19
559 0.21
560 0.2
561 0.2
562 0.2
563 0.23
564 0.2
565 0.19
566 0.18
567 0.18
568 0.19
569 0.19
570 0.19
571 0.15
572 0.13
573 0.12
574 0.1
575 0.1
576 0.09
577 0.09
578 0.08
579 0.08
580 0.08
581 0.08
582 0.09
583 0.08
584 0.08
585 0.09
586 0.08
587 0.09
588 0.09
589 0.09
590 0.11
591 0.11
592 0.11
593 0.12
594 0.12
595 0.11
596 0.13
597 0.13
598 0.11
599 0.11
600 0.12
601 0.11
602 0.12
603 0.12
604 0.11
605 0.11
606 0.11
607 0.13
608 0.13
609 0.13
610 0.11
611 0.12
612 0.12
613 0.12
614 0.12
615 0.1
616 0.1
617 0.11
618 0.14
619 0.14
620 0.14
621 0.14
622 0.16
623 0.16
624 0.17
625 0.16
626 0.16
627 0.15
628 0.16
629 0.16
630 0.14
631 0.17
632 0.14
633 0.15
634 0.16
635 0.2
636 0.22
637 0.21
638 0.21
639 0.19
640 0.21
641 0.2
642 0.17
643 0.13
644 0.12
645 0.11
646 0.12
647 0.11
648 0.09
649 0.09
650 0.08