FuNGI

A0A550C8L2

Protein Details

Accession

A0A550C8L2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
286-307	MDKQNERDLRKRKPRASVDWPW	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
258-300	KARVRHGKKRDTLEERLEKGNAKAKREAMDKQNERDLRKRKPR

Subcellular Location(s)

cyto 7.5, extr 6, cyto_nucl 6, mito 5, nucl 3.5, E.R. 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR011048 Haem_d1_sf IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MKVVTTFHAPSSVISSVKCKLVPGDVEHLIVAKMTRLEVFSIQEDGLRAECDLDVWGSICSVKAVRRLTEDCSRLVVMLDHPQPELLFMDYKGAKLTLATAVELSTSNALQRPAEFCMDFFVSEEGSRIVASAYAGKLKVICLEDGLPTQLGFDASAYENNILALCFLPGVEKSIAILHTDAAQRVRLVARDLDVEEYEISAKPSLELPPVALNNSYFRRPDSDPTFLLPVPEQTQFRGGVLIVGGKRLLLYERADDKARVRHGKKRDTLEERLEKGNAKAKREAMDKQNERDLRKRKPRASVDWPWSAVAVCEAVSDTSFLIGDAYGRLAIVHLDLRDIAPCLVLVPLGTTSPPKSITHLSGSKVYIGSHFGDAQLIDVNIATVDGSPVPILKGLPTVRPDELDGVGPPTTFSDPTQDLPDLAKANKGKIIQTSGSYVSVDQTYTNIAPIEDAVLVDIDGSGQPQIVTCSGGYGAGRLHVVRNGADFQVLANAGDASAAHVSGIWPLKNMYDDVEHSHFMMDTPDGTQLFHIDSSSAQPTFTYESPADAGFLSERTLAVGNVRTAPSYGDSPVVVQVTTKVVHACEYKMELVGYCGLMGDDKTDTPTAACVAESQIFVAYPGGTLSYLMIEAQGEEYKLKLVARLPLRVGSEIAAISAIPPEPKHGKIPKQSSRIAVAYWDTRAIDIFRLKKSGNTIIAECIHTTDPLPALVRDLTVQHFRPKDGERHPPYLFAALADGTVVTYALRDGVTGDRKIVSLGDTPVSLTVYSGADGESAVFAAGQHAAVWSWEKQRLHHAAVLFRDVSAVAPLHTSHFKNALLLTGPAGLTIGCVREVDKMHIRTVPLDGYTPAGIAHDAKNKVFGVVASYTPPEPVGTDAEPMISSAFILFDDSTLQELQRHTYPEGTIPTAITLVPNDGSEETYFCVATYDPSAAQSGRRDASNSNRAPPNSGKIYLLGIARTSLSGAAGAQITVRVEREVISYVMQLTTVKGIIAAAVESAVIFFRPEIVNISSSSWALHKVGEWNHNFVVRTLAAKDDHLAIGDQMHSISIVKVSLSSNETAKLELISSDYSPLFPSSLELGENKSVITANVDLNLCAFSSTTPSLSGREVLERDGAFHLGEYVNKFIRGSLMPTETANARLRPSYVFFTSVGRIGVIMDIHGDPRLFTDLERNMAYVFRGVGVEHGPHEDHSKHRAPKNSTRGSDAEKSARGFVDGDFIEQLLLHPQDNDKIRRILGGANEFEVIHYSVDQIRYQLESLQSLH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.25
3	0.25
4	0.29
5	0.29
6	0.24
7	0.24
8	0.29
9	0.32
10	0.33
11	0.37
12	0.35
13	0.35
14	0.33
15	0.32
16	0.25
17	0.21
18	0.16
19	0.12
20	0.11
21	0.11
22	0.13
23	0.13
24	0.16
25	0.17
26	0.2
27	0.2
28	0.21
29	0.2
30	0.2
31	0.19
32	0.18
33	0.17
34	0.14
35	0.13
36	0.11
37	0.11
38	0.1
39	0.11
40	0.1
41	0.09
42	0.09
43	0.09
44	0.09
45	0.09
46	0.09
47	0.1
48	0.12
49	0.15
50	0.22
51	0.27
52	0.29
53	0.36
54	0.39
55	0.43
56	0.49
57	0.48
58	0.42
59	0.41
60	0.39
61	0.32
62	0.3
63	0.26
64	0.19
65	0.25
66	0.28
67	0.25
68	0.25
69	0.25
70	0.24
71	0.24
72	0.22
73	0.16
74	0.14
75	0.13
76	0.2
77	0.2
78	0.2
79	0.2
80	0.19
81	0.17
82	0.15
83	0.17
84	0.14
85	0.15
86	0.15
87	0.14
88	0.13
89	0.14
90	0.14
91	0.13
92	0.1
93	0.1
94	0.11
95	0.13
96	0.15
97	0.15
98	0.17
99	0.19
100	0.2
101	0.24
102	0.23
103	0.2
104	0.24
105	0.24
106	0.22
107	0.2
108	0.18
109	0.15
110	0.14
111	0.16
112	0.11
113	0.1
114	0.1
115	0.09
116	0.08
117	0.07
118	0.08
119	0.11
120	0.12
121	0.15
122	0.15
123	0.16
124	0.17
125	0.16
126	0.21
127	0.19
128	0.18
129	0.16
130	0.17
131	0.19
132	0.19
133	0.21
134	0.16
135	0.14
136	0.14
137	0.12
138	0.11
139	0.09
140	0.08
141	0.09
142	0.1
143	0.12
144	0.13
145	0.13
146	0.12
147	0.12
148	0.12
149	0.1
150	0.09
151	0.08
152	0.06
153	0.06
154	0.05
155	0.07
156	0.07
157	0.11
158	0.11
159	0.11
160	0.11
161	0.14
162	0.15
163	0.14
164	0.15
165	0.11
166	0.15
167	0.17
168	0.18
169	0.17
170	0.18
171	0.17
172	0.19
173	0.2
174	0.17
175	0.19
176	0.18
177	0.18
178	0.2
179	0.21
180	0.21
181	0.19
182	0.19
183	0.16
184	0.14
185	0.14
186	0.12
187	0.13
188	0.11
189	0.11
190	0.1
191	0.13
192	0.14
193	0.16
194	0.15
195	0.16
196	0.2
197	0.21
198	0.22
199	0.2
200	0.19
201	0.22
202	0.26
203	0.27
204	0.23
205	0.24
206	0.28
207	0.3
208	0.38
209	0.38
210	0.4
211	0.38
212	0.4
213	0.43
214	0.37
215	0.36
216	0.28
217	0.25
218	0.22
219	0.25
220	0.23
221	0.2
222	0.24
223	0.22
224	0.22
225	0.19
226	0.16
227	0.13
228	0.12
229	0.15
230	0.12
231	0.12
232	0.12
233	0.11
234	0.11
235	0.1
236	0.12
237	0.1
238	0.12
239	0.18
240	0.22
241	0.25
242	0.28
243	0.29
244	0.32
245	0.36
246	0.42
247	0.46
248	0.47
249	0.52
250	0.6
251	0.68
252	0.71
253	0.73
254	0.74
255	0.72
256	0.74
257	0.75
258	0.73
259	0.67
260	0.62
261	0.56
262	0.47
263	0.44
264	0.44
265	0.39
266	0.35
267	0.37
268	0.38
269	0.42
270	0.44
271	0.47
272	0.48
273	0.55
274	0.56
275	0.55
276	0.6
277	0.59
278	0.59
279	0.62
280	0.62
281	0.62
282	0.68
283	0.74
284	0.72
285	0.77
286	0.81
287	0.81
288	0.81
289	0.8
290	0.76
291	0.71
292	0.65
293	0.55
294	0.47
295	0.38
296	0.28
297	0.19
298	0.13
299	0.07
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.07
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.06
320	0.07
321	0.07
322	0.08
323	0.08
324	0.09
325	0.09
326	0.1
327	0.09
328	0.07
329	0.07
330	0.07
331	0.06
332	0.06
333	0.05
334	0.05
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.08
339	0.09
340	0.11
341	0.14
342	0.14
343	0.17
344	0.21
345	0.23
346	0.28
347	0.31
348	0.31
349	0.32
350	0.32
351	0.3
352	0.27
353	0.25
354	0.19
355	0.18
356	0.17
357	0.14
358	0.14
359	0.12
360	0.12
361	0.12
362	0.11
363	0.1
364	0.08
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.05
369	0.05
370	0.04
371	0.03
372	0.04
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.05
377	0.05
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.11
382	0.12
383	0.16
384	0.18
385	0.21
386	0.21
387	0.22
388	0.22
389	0.19
390	0.19
391	0.16
392	0.14
393	0.13
394	0.13
395	0.11
396	0.11
397	0.1
398	0.11
399	0.11
400	0.11
401	0.13
402	0.15
403	0.17
404	0.19
405	0.18
406	0.17
407	0.17
408	0.2
409	0.17
410	0.16
411	0.2
412	0.18
413	0.19
414	0.22
415	0.22
416	0.21
417	0.22
418	0.26
419	0.22
420	0.22
421	0.24
422	0.21
423	0.21
424	0.19
425	0.16
426	0.13
427	0.12
428	0.11
429	0.08
430	0.07
431	0.09
432	0.09
433	0.09
434	0.08
435	0.08
436	0.07
437	0.07
438	0.08
439	0.06
440	0.06
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.04
445	0.04
446	0.03
447	0.03
448	0.04
449	0.03
450	0.04
451	0.04
452	0.04
453	0.05
454	0.05
455	0.06
456	0.06
457	0.07
458	0.06
459	0.07
460	0.07
461	0.07
462	0.06
463	0.06
464	0.07
465	0.07
466	0.08
467	0.08
468	0.1
469	0.09
470	0.11
471	0.12
472	0.11
473	0.11
474	0.1
475	0.08
476	0.09
477	0.09
478	0.07
479	0.06
480	0.06
481	0.05
482	0.05
483	0.05
484	0.04
485	0.04
486	0.04
487	0.04
488	0.04
489	0.04
490	0.08
491	0.1
492	0.08
493	0.09
494	0.09
495	0.1
496	0.11
497	0.11
498	0.09
499	0.09
500	0.1
501	0.14
502	0.16
503	0.16
504	0.15
505	0.15
506	0.14
507	0.12
508	0.12
509	0.08
510	0.06
511	0.06
512	0.08
513	0.08
514	0.08
515	0.08
516	0.08
517	0.08
518	0.08
519	0.07
520	0.05
521	0.06
522	0.08
523	0.1
524	0.1
525	0.09
526	0.09
527	0.1
528	0.13
529	0.13
530	0.14
531	0.12
532	0.13
533	0.14
534	0.14
535	0.13
536	0.09
537	0.1
538	0.06
539	0.07
540	0.06
541	0.06
542	0.06
543	0.06
544	0.06
545	0.06
546	0.07
547	0.09
548	0.09
549	0.1
550	0.11
551	0.1
552	0.1
553	0.1
554	0.1
555	0.1
556	0.1
557	0.09
558	0.09
559	0.09
560	0.1
561	0.1
562	0.08
563	0.07
564	0.07
565	0.08
566	0.09
567	0.09
568	0.08
569	0.07
570	0.1
571	0.11
572	0.11
573	0.1
574	0.11
575	0.11
576	0.11
577	0.11
578	0.09
579	0.08
580	0.09
581	0.08
582	0.05
583	0.05
584	0.04
585	0.05
586	0.04
587	0.05
588	0.05
589	0.05
590	0.06
591	0.06
592	0.07
593	0.06
594	0.07
595	0.07
596	0.06
597	0.06
598	0.05
599	0.06
600	0.08
601	0.08
602	0.07
603	0.07
604	0.06
605	0.07
606	0.07
607	0.05
608	0.04
609	0.04
610	0.04
611	0.04
612	0.04
613	0.04
614	0.03
615	0.03
616	0.03
617	0.03
618	0.03
619	0.03
620	0.04
621	0.04
622	0.04
623	0.05
624	0.05
625	0.05
626	0.06
627	0.06
628	0.07
629	0.08
630	0.14
631	0.16
632	0.18
633	0.18
634	0.2
635	0.21
636	0.2
637	0.19
638	0.14
639	0.12
640	0.1
641	0.09
642	0.06
643	0.05
644	0.05
645	0.05
646	0.05
647	0.04
648	0.04
649	0.08
650	0.11
651	0.12
652	0.19
653	0.25
654	0.32
655	0.39
656	0.49
657	0.54
658	0.57
659	0.59
660	0.54
661	0.52
662	0.46
663	0.37
664	0.29
665	0.23
666	0.18
667	0.15
668	0.14
669	0.1
670	0.09
671	0.1
672	0.09
673	0.1
674	0.13
675	0.17
676	0.17
677	0.2
678	0.2
679	0.21
680	0.24
681	0.27
682	0.26
683	0.24
684	0.23
685	0.23
686	0.25
687	0.23
688	0.19
689	0.16
690	0.13
691	0.11
692	0.11
693	0.09
694	0.08
695	0.09
696	0.09
697	0.08
698	0.09
699	0.09
700	0.08
701	0.08
702	0.09
703	0.1
704	0.14
705	0.15
706	0.19
707	0.2
708	0.21
709	0.24
710	0.26
711	0.32
712	0.34
713	0.43
714	0.43
715	0.48
716	0.48
717	0.45
718	0.43
719	0.37
720	0.3
721	0.2
722	0.15
723	0.09
724	0.08
725	0.06
726	0.05
727	0.04
728	0.03
729	0.03
730	0.02
731	0.02
732	0.03
733	0.03
734	0.03
735	0.03
736	0.05
737	0.09
738	0.13
739	0.13
740	0.14
741	0.14
742	0.14
743	0.14
744	0.14
745	0.11
746	0.1
747	0.11
748	0.1
749	0.1
750	0.1
751	0.1
752	0.1
753	0.08
754	0.06
755	0.06
756	0.06
757	0.06
758	0.06
759	0.06
760	0.05
761	0.05
762	0.05
763	0.04
764	0.04
765	0.03
766	0.03
767	0.03
768	0.04
769	0.04
770	0.04
771	0.04
772	0.04
773	0.04
774	0.05
775	0.07
776	0.08
777	0.12
778	0.17
779	0.18
780	0.19
781	0.27
782	0.32
783	0.33
784	0.33
785	0.31
786	0.3
787	0.31
788	0.32
789	0.24
790	0.19
791	0.16
792	0.14
793	0.12
794	0.09
795	0.08
796	0.06
797	0.06
798	0.07
799	0.09
800	0.13
801	0.13
802	0.14
803	0.17
804	0.16
805	0.17
806	0.17
807	0.16
808	0.13
809	0.13
810	0.12
811	0.1
812	0.09
813	0.08
814	0.08
815	0.06
816	0.06
817	0.06
818	0.06
819	0.05
820	0.05
821	0.06
822	0.1
823	0.12
824	0.16
825	0.23
826	0.24
827	0.26
828	0.28
829	0.28
830	0.25
831	0.25
832	0.22
833	0.15
834	0.14
835	0.13
836	0.12
837	0.12
838	0.11
839	0.09
840	0.08
841	0.07
842	0.08
843	0.11
844	0.16
845	0.18
846	0.18
847	0.21
848	0.21
849	0.21
850	0.19
851	0.16
852	0.13
853	0.13
854	0.14
855	0.12
856	0.13
857	0.13
858	0.13
859	0.13
860	0.09
861	0.08
862	0.09
863	0.11
864	0.11
865	0.12
866	0.11
867	0.12
868	0.11
869	0.11
870	0.09
871	0.06
872	0.05
873	0.04
874	0.05
875	0.04
876	0.05
877	0.05
878	0.05
879	0.06
880	0.07
881	0.08
882	0.08
883	0.09
884	0.1
885	0.11
886	0.14
887	0.16
888	0.19
889	0.18
890	0.2
891	0.2
892	0.21
893	0.23
894	0.22
895	0.19
896	0.16
897	0.16
898	0.14
899	0.13
900	0.1
901	0.08
902	0.08
903	0.08
904	0.07
905	0.08
906	0.08
907	0.1
908	0.1
909	0.1
910	0.1
911	0.1
912	0.1
913	0.08
914	0.09
915	0.07
916	0.08
917	0.09
918	0.1
919	0.09
920	0.1
921	0.12
922	0.11
923	0.14
924	0.16
925	0.19
926	0.19
927	0.2
928	0.2
929	0.23
930	0.32
931	0.39
932	0.38
933	0.4
934	0.44
935	0.44
936	0.47
937	0.47
938	0.44
939	0.39
940	0.38
941	0.32
942	0.28
943	0.29
944	0.26
945	0.24
946	0.18
947	0.13
948	0.13
949	0.12
950	0.11
951	0.1
952	0.07
953	0.06
954	0.06
955	0.06
956	0.06
957	0.06
958	0.06
959	0.06
960	0.07
961	0.07
962	0.08
963	0.08
964	0.07
965	0.08
966	0.08
967	0.1
968	0.11
969	0.11
970	0.11
971	0.11
972	0.12
973	0.11
974	0.11
975	0.1
976	0.08
977	0.09
978	0.08
979	0.07
980	0.07
981	0.06
982	0.06
983	0.06
984	0.06
985	0.04
986	0.04
987	0.04
988	0.04
989	0.04
990	0.04
991	0.04
992	0.04
993	0.04
994	0.07
995	0.07
996	0.08
997	0.12
998	0.14
999	0.15
1000	0.16
1001	0.18
1002	0.17
1003	0.16
1004	0.16
1005	0.13
1006	0.14
1007	0.13
1008	0.13
1009	0.12
1010	0.17
1011	0.23
1012	0.3
1013	0.32
1014	0.34
1015	0.35
1016	0.38
1017	0.37
1018	0.31
1019	0.3
1020	0.22
1021	0.22
1022	0.18
1023	0.2
1024	0.18
1025	0.18
1026	0.19
1027	0.16
1028	0.16
1029	0.14
1030	0.14
1031	0.11
1032	0.11
1033	0.11
1034	0.1
1035	0.08
1036	0.08
1037	0.07
1038	0.07
1039	0.08
1040	0.07
1041	0.07
1042	0.06
1043	0.08
1044	0.09
1045	0.12
1046	0.14
1047	0.15
1048	0.16
1049	0.18
1050	0.19
1051	0.18
1052	0.17
1053	0.15
1054	0.13
1055	0.11
1056	0.12
1057	0.11
1058	0.11
1059	0.13
1060	0.13
1061	0.13
1062	0.14
1063	0.14
1064	0.12
1065	0.11
1066	0.12
1067	0.12
1068	0.12
1069	0.13
1070	0.13
1071	0.16
1072	0.17
1073	0.17
1074	0.15
1075	0.14
1076	0.13
1077	0.12
1078	0.14
1079	0.13
1080	0.12
1081	0.16
1082	0.16
1083	0.15
1084	0.16
1085	0.16
1086	0.13
1087	0.11
1088	0.1
1089	0.06
1090	0.11
1091	0.13
1092	0.13
1093	0.15
1094	0.16
1095	0.18
1096	0.19
1097	0.21
1098	0.18
1099	0.22
1100	0.22
1101	0.21
1102	0.25
1103	0.23
1104	0.24
1105	0.23
1106	0.22
1107	0.17
1108	0.16
1109	0.16
1110	0.12
1111	0.15
1112	0.15
1113	0.17
1114	0.18
1115	0.19
1116	0.19
1117	0.17
1118	0.2
1119	0.19
1120	0.21
1121	0.22
1122	0.23
1123	0.24
1124	0.24
1125	0.26
1126	0.23
1127	0.28
1128	0.28
1129	0.25
1130	0.24
1131	0.25
1132	0.26
1133	0.27
1134	0.3
1135	0.3
1136	0.27
1137	0.28
1138	0.26
1139	0.28
1140	0.29
1141	0.28
1142	0.24
1143	0.18
1144	0.16
1145	0.14
1146	0.14
1147	0.11
1148	0.09
1149	0.09
1150	0.09
1151	0.1
1152	0.12
1153	0.11
1154	0.1
1155	0.12
1156	0.15
1157	0.13
1158	0.13
1159	0.21
1160	0.23
1161	0.27
1162	0.28
1163	0.26
1164	0.24
1165	0.24
1166	0.25
1167	0.17
1168	0.14
1169	0.11
1170	0.11
1171	0.1
1172	0.12
1173	0.14
1174	0.14
1175	0.14
1176	0.16
1177	0.16
1178	0.17
1179	0.22
1180	0.23
1181	0.26
1182	0.32
1183	0.4
1184	0.46
1185	0.52
1186	0.6
1187	0.63
1188	0.71
1189	0.77
1190	0.79
1191	0.73
1192	0.7
1193	0.68
1194	0.66
1195	0.64
1196	0.6
1197	0.56
1198	0.5
1199	0.49
1200	0.46
1201	0.42
1202	0.36
1203	0.3
1204	0.24
1205	0.25
1206	0.21
1207	0.2
1208	0.18
1209	0.17
1210	0.16
1211	0.15
1212	0.15
1213	0.14
1214	0.15
1215	0.13
1216	0.15
1217	0.17
1218	0.24
1219	0.32
1220	0.36
1221	0.36
1222	0.38
1223	0.39
1224	0.39
1225	0.39
1226	0.36
1227	0.37
1228	0.39
1229	0.35
1230	0.33
1231	0.33
1232	0.31
1233	0.29
1234	0.27
1235	0.2
1236	0.14
1237	0.12
1238	0.13
1239	0.16
1240	0.19
1241	0.19
1242	0.18
1243	0.19
1244	0.2
1245	0.21
1246	0.23
1247	0.21

A0A550C8L2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer