Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DD44

Protein Details
Accession C5DD44    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MSGKKPRSQNQLYRRRKVQDARNIRTEAHydrophilic
73-114SSTRVFQSLPRKLRRRTASHNVKRIPKRLRNRALREMQKSDQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
82-107PRKLRRRTASHNVKRIPKRLRNRALR
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 10.5, cyto_nucl 7.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
IPR027266  TrmE/GcvT_dom1  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
KEGG lth:KLTH0B08162g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MSGKKPRSQNQLYRRRKVQDARNIRTEALKSGAQASQELSESGGMMRVPEFMASREFEVKQLQVAMHKSKSASSTRVFQSLPRKLRRRTASHNVKRIPKRLRNRALREMQKSDQAVTRGTEKPSRQRRSGLTAKQLYKARMTVKLLRLAARSKSMKLALPAQVTGSQTKLRQRIRALQKTLRAEAKPGTAQLRNNQMGSYDCTGIGKLAPRPVGRIKYMKRQRVFTWLPTHVWNAKRSHMLKRWGYQMPWSPTQKCFKLTHRIGGNTAASDGALCCDSSYMGTMIVASADTEALRLLAHQLTNKRATLPKYRVSGHWFEGLIYDENAEAVGPGEILWISSNKLLLRLHPAIYSRVFEQISLANSEKKFVIQDCRFSIGSITLSGGKSLNALSQVLRSTTASKSYNQFKTVAYVTDTNVLPQRTVFAFEAIDPRHLSNPRALPKANINANDVLKLQAEYPREEIAEVLEKLCNPDKREMSYKNQQTLKQLAYRRRMLLESTARTNAIPHDSKEDPFIPIAIFKRPKQESWVVLLPWFWLLPLWYQLNRVSRVYHMGLRQLQQLSFEQRRLYFPDDYPFTQAGYDENSTFKRLSQEALWKRKPAGKRVNFDKISGIHTENPVRFPGEIGDPFSCDWRLLQVLRNGIDFLRTRDQGPIRMYDPKRTSQFDELNMRKLMYVNDIIDLYSDVQDKKLTPSALPISIFTKSVKGANSGCPQYGNSPRMQIVTTPLQVAAVSCVLQEQGHPKDFARVYAIPAQDMDYWLSIVNIKARSNGKRDHDTAQPTPGVQDLIGFVTSGTFHLGDGRGACTAFIAAQEACKSPNEYVLIRNVGTNVYRVAKWEQIAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.84
3 0.83
4 0.82
5 0.82
6 0.81
7 0.82
8 0.8
9 0.8
10 0.76
11 0.68
12 0.64
13 0.56
14 0.48
15 0.41
16 0.35
17 0.28
18 0.29
19 0.3
20 0.24
21 0.24
22 0.22
23 0.2
24 0.19
25 0.18
26 0.15
27 0.13
28 0.13
29 0.12
30 0.12
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.1
35 0.1
36 0.11
37 0.12
38 0.12
39 0.15
40 0.16
41 0.2
42 0.23
43 0.24
44 0.24
45 0.27
46 0.26
47 0.25
48 0.26
49 0.23
50 0.24
51 0.3
52 0.34
53 0.32
54 0.34
55 0.33
56 0.33
57 0.38
58 0.37
59 0.37
60 0.34
61 0.4
62 0.41
63 0.45
64 0.42
65 0.43
66 0.48
67 0.52
68 0.58
69 0.61
70 0.66
71 0.68
72 0.77
73 0.8
74 0.79
75 0.78
76 0.8
77 0.81
78 0.82
79 0.86
80 0.84
81 0.85
82 0.84
83 0.84
84 0.84
85 0.82
86 0.83
87 0.84
88 0.87
89 0.88
90 0.88
91 0.89
92 0.89
93 0.88
94 0.85
95 0.81
96 0.73
97 0.7
98 0.62
99 0.55
100 0.49
101 0.41
102 0.35
103 0.3
104 0.33
105 0.3
106 0.33
107 0.37
108 0.39
109 0.47
110 0.56
111 0.62
112 0.61
113 0.64
114 0.65
115 0.67
116 0.71
117 0.68
118 0.68
119 0.69
120 0.67
121 0.67
122 0.66
123 0.6
124 0.54
125 0.51
126 0.45
127 0.43
128 0.46
129 0.47
130 0.47
131 0.52
132 0.5
133 0.49
134 0.48
135 0.46
136 0.43
137 0.43
138 0.41
139 0.35
140 0.38
141 0.38
142 0.37
143 0.35
144 0.39
145 0.35
146 0.35
147 0.33
148 0.3
149 0.3
150 0.29
151 0.27
152 0.23
153 0.21
154 0.23
155 0.3
156 0.37
157 0.39
158 0.44
159 0.48
160 0.56
161 0.63
162 0.69
163 0.69
164 0.67
165 0.7
166 0.69
167 0.69
168 0.65
169 0.55
170 0.48
171 0.43
172 0.41
173 0.35
174 0.33
175 0.32
176 0.3
177 0.33
178 0.35
179 0.42
180 0.39
181 0.38
182 0.35
183 0.31
184 0.29
185 0.3
186 0.28
187 0.19
188 0.17
189 0.17
190 0.17
191 0.16
192 0.16
193 0.15
194 0.15
195 0.18
196 0.23
197 0.23
198 0.28
199 0.34
200 0.37
201 0.38
202 0.45
203 0.45
204 0.52
205 0.61
206 0.66
207 0.63
208 0.63
209 0.61
210 0.61
211 0.61
212 0.57
213 0.56
214 0.49
215 0.47
216 0.44
217 0.46
218 0.42
219 0.42
220 0.4
221 0.35
222 0.36
223 0.42
224 0.43
225 0.48
226 0.5
227 0.55
228 0.55
229 0.57
230 0.6
231 0.56
232 0.53
233 0.5
234 0.51
235 0.48
236 0.49
237 0.5
238 0.46
239 0.48
240 0.54
241 0.51
242 0.47
243 0.47
244 0.46
245 0.51
246 0.51
247 0.53
248 0.51
249 0.5
250 0.47
251 0.46
252 0.4
253 0.29
254 0.26
255 0.19
256 0.13
257 0.11
258 0.09
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.04
275 0.03
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.06
284 0.07
285 0.08
286 0.12
287 0.15
288 0.2
289 0.23
290 0.23
291 0.24
292 0.27
293 0.3
294 0.37
295 0.39
296 0.41
297 0.42
298 0.44
299 0.44
300 0.46
301 0.45
302 0.38
303 0.35
304 0.29
305 0.25
306 0.24
307 0.23
308 0.18
309 0.14
310 0.12
311 0.08
312 0.08
313 0.07
314 0.06
315 0.04
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.05
326 0.06
327 0.08
328 0.08
329 0.11
330 0.11
331 0.12
332 0.19
333 0.2
334 0.2
335 0.21
336 0.22
337 0.21
338 0.22
339 0.22
340 0.16
341 0.18
342 0.17
343 0.15
344 0.15
345 0.14
346 0.14
347 0.16
348 0.16
349 0.16
350 0.16
351 0.18
352 0.16
353 0.15
354 0.15
355 0.14
356 0.23
357 0.21
358 0.25
359 0.26
360 0.3
361 0.29
362 0.28
363 0.26
364 0.18
365 0.16
366 0.12
367 0.11
368 0.1
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.08
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.11
385 0.11
386 0.16
387 0.16
388 0.17
389 0.22
390 0.29
391 0.31
392 0.3
393 0.31
394 0.26
395 0.28
396 0.27
397 0.23
398 0.17
399 0.15
400 0.14
401 0.17
402 0.16
403 0.14
404 0.16
405 0.16
406 0.14
407 0.12
408 0.14
409 0.1
410 0.13
411 0.12
412 0.1
413 0.1
414 0.1
415 0.15
416 0.14
417 0.15
418 0.13
419 0.13
420 0.17
421 0.18
422 0.18
423 0.19
424 0.25
425 0.28
426 0.3
427 0.3
428 0.27
429 0.31
430 0.36
431 0.35
432 0.3
433 0.28
434 0.28
435 0.28
436 0.27
437 0.22
438 0.17
439 0.14
440 0.12
441 0.11
442 0.11
443 0.13
444 0.13
445 0.15
446 0.15
447 0.14
448 0.14
449 0.13
450 0.11
451 0.13
452 0.12
453 0.1
454 0.1
455 0.1
456 0.13
457 0.18
458 0.2
459 0.18
460 0.24
461 0.26
462 0.29
463 0.36
464 0.38
465 0.41
466 0.47
467 0.5
468 0.51
469 0.54
470 0.52
471 0.49
472 0.49
473 0.45
474 0.42
475 0.42
476 0.43
477 0.45
478 0.47
479 0.44
480 0.41
481 0.39
482 0.34
483 0.35
484 0.35
485 0.3
486 0.3
487 0.29
488 0.27
489 0.26
490 0.26
491 0.2
492 0.2
493 0.19
494 0.16
495 0.21
496 0.22
497 0.23
498 0.25
499 0.25
500 0.2
501 0.18
502 0.18
503 0.12
504 0.14
505 0.15
506 0.19
507 0.23
508 0.23
509 0.32
510 0.33
511 0.34
512 0.37
513 0.41
514 0.36
515 0.38
516 0.4
517 0.31
518 0.3
519 0.29
520 0.23
521 0.18
522 0.15
523 0.09
524 0.05
525 0.06
526 0.06
527 0.1
528 0.12
529 0.12
530 0.15
531 0.19
532 0.24
533 0.26
534 0.26
535 0.24
536 0.22
537 0.26
538 0.27
539 0.26
540 0.23
541 0.26
542 0.28
543 0.29
544 0.32
545 0.29
546 0.27
547 0.25
548 0.26
549 0.28
550 0.28
551 0.28
552 0.26
553 0.26
554 0.28
555 0.3
556 0.32
557 0.28
558 0.26
559 0.31
560 0.32
561 0.32
562 0.34
563 0.3
564 0.26
565 0.22
566 0.21
567 0.15
568 0.15
569 0.16
570 0.12
571 0.14
572 0.15
573 0.17
574 0.17
575 0.17
576 0.18
577 0.17
578 0.19
579 0.21
580 0.3
581 0.38
582 0.48
583 0.5
584 0.48
585 0.51
586 0.55
587 0.56
588 0.55
589 0.57
590 0.56
591 0.6
592 0.66
593 0.73
594 0.68
595 0.64
596 0.58
597 0.49
598 0.43
599 0.37
600 0.32
601 0.24
602 0.27
603 0.32
604 0.29
605 0.29
606 0.27
607 0.25
608 0.22
609 0.2
610 0.18
611 0.18
612 0.18
613 0.2
614 0.19
615 0.19
616 0.19
617 0.21
618 0.19
619 0.14
620 0.13
621 0.12
622 0.15
623 0.15
624 0.2
625 0.22
626 0.26
627 0.27
628 0.28
629 0.25
630 0.22
631 0.25
632 0.21
633 0.22
634 0.25
635 0.25
636 0.25
637 0.32
638 0.34
639 0.36
640 0.37
641 0.36
642 0.32
643 0.41
644 0.42
645 0.44
646 0.46
647 0.47
648 0.5
649 0.5
650 0.53
651 0.51
652 0.54
653 0.51
654 0.57
655 0.53
656 0.53
657 0.5
658 0.45
659 0.37
660 0.33
661 0.28
662 0.22
663 0.23
664 0.18
665 0.18
666 0.18
667 0.17
668 0.16
669 0.16
670 0.13
671 0.11
672 0.13
673 0.12
674 0.13
675 0.15
676 0.16
677 0.19
678 0.23
679 0.22
680 0.2
681 0.27
682 0.3
683 0.31
684 0.31
685 0.28
686 0.25
687 0.25
688 0.26
689 0.2
690 0.19
691 0.17
692 0.19
693 0.19
694 0.21
695 0.23
696 0.3
697 0.36
698 0.36
699 0.35
700 0.33
701 0.33
702 0.36
703 0.42
704 0.37
705 0.31
706 0.33
707 0.34
708 0.34
709 0.33
710 0.27
711 0.25
712 0.28
713 0.27
714 0.24
715 0.23
716 0.21
717 0.2
718 0.2
719 0.16
720 0.1
721 0.09
722 0.08
723 0.08
724 0.09
725 0.09
726 0.11
727 0.16
728 0.21
729 0.24
730 0.26
731 0.26
732 0.34
733 0.35
734 0.34
735 0.33
736 0.28
737 0.3
738 0.35
739 0.35
740 0.27
741 0.27
742 0.28
743 0.22
744 0.23
745 0.2
746 0.14
747 0.13
748 0.13
749 0.13
750 0.12
751 0.13
752 0.17
753 0.19
754 0.19
755 0.25
756 0.33
757 0.39
758 0.44
759 0.5
760 0.52
761 0.57
762 0.6
763 0.58
764 0.58
765 0.6
766 0.56
767 0.54
768 0.48
769 0.4
770 0.37
771 0.34
772 0.27
773 0.19
774 0.17
775 0.12
776 0.12
777 0.12
778 0.11
779 0.09
780 0.09
781 0.1
782 0.09
783 0.1
784 0.08
785 0.08
786 0.12
787 0.13
788 0.15
789 0.16
790 0.17
791 0.16
792 0.16
793 0.15
794 0.12
795 0.12
796 0.1
797 0.09
798 0.11
799 0.09
800 0.13
801 0.15
802 0.16
803 0.17
804 0.19
805 0.22
806 0.2
807 0.25
808 0.27
809 0.26
810 0.29
811 0.34
812 0.36
813 0.33
814 0.33
815 0.28
816 0.27
817 0.27
818 0.25
819 0.22
820 0.22
821 0.22
822 0.24
823 0.28
824 0.3