FuNGI

C5DCL6

Protein Details

Accession

C5DCL6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1171-1192	CYPVDKSTRKPIKDPNHPIIKR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12, cyto_nucl 9.5, extr 7, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025574 Nucleoporin_FG_rpt IPR037665 Nucleoporin_S59-like IPR007230 Nup98_auto-Pept-S59_dom IPR036903 Nup98_auto-Pept-S59_dom_sf
Gene Ontology	GO:0031965 C:nuclear membrane GO:0044613 C:nuclear pore central transport channel GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0006606 P:protein import into nucleus
KEGG	lth:KLTH0B04070g -
Pfam	View protein in Pfam PF04096 Nucleoporin2 PF13634 Nucleoporin_FG
PROSITE	View protein in PROSITE PS51434 NUP_C

Amino Acid Sequences

MFGSTGTAFGNSGSTPFGSAATPATTGASPFGSAAPNPTPAFGAAQPSNAASGFGGFGAANSNPSAGGTGLFGMSNNSNSSSSTTGAAAPFGQATSAPANGPSLFGSAVPTGAPNTSVPGAAQGPGTAIKPFSTYTEKDATTGSNNVFQSISCMPEYRAYSFEELRYQDYQANRRFPTGPVGSAGVASPFGAQTSSPFAQNNSTNTNAFGMVGNNNNNNNNNTTGGLFGQNNTGAAGTSAFGQPAGGSLFGANNAANNSPFGLNKPASSGGLFGQPSNTAAPGGSGLFGQSNNTAQGSGGLFGQNNNTGTTGSSMFGATNNAPGQQPGGLFGQPSTNTGGGLFGQNNNANANNSPFGQSNTNTGGGLFGQNPNNGAANSPFGQNNQAQAGGGLFGNKSAPSGGLFGQNNNTSGGGLFGQANNTNNSPFGQNNNAGGGLFGQNNSGNTGGGLFGQNNNNNNTTGGGLFGQNNNNNNNAGGGLFGQNNNNATGGGLFGQNTANNSTFGQNSGSAPFGQSQQQGSSLFGNKPAGSGGLFGQNNTASTGFGQNNSSAGGGLFGQNNNNNSTGNTGGLFGQNNTNTGSGLFGQNNSQQQQQQQPAGGLFGQNTQQNQGGLFGQNNANTGGGLFGQNNQQQQQQPSGGLFGAKPATGATGGGLFGQNNNQQPPATGGLFGQNNNANQPSTSGGLFGNKPAGSTGGGLFGQNNTAGNTGTTGGGLFGQNNSTAANNSSGGGLFGAKPATNTGGGLFGNKPAGAPTTGGGLFGSKPAGTATGTTGGGLFGAKPAGAATGGLFGNTNGTNNTNATGTQPGVSGGLFGNQQNQQQAAPGSQPSLQQTGANPYGTNELFSRVLIPDSITQPTKPSATKLNADFKKKASLSGAYRLAPKPLFAPRSASTSPVARLGSTTTSQSNGRVLSVASSTDSLGREIVPANTGSSSIFTNESDELILSSNDTLFNPDKKSFKNLIINRKKMEDTVDSKEDDQVLRITFKADGDSTSNEGVQGGAKTESTKIETPLYDDVQGTPLRQGSRIDAPFKNSVSTPLAKTPLKSSNLASSSATSTTINEKPSGVIGDDISFMDDGYYISPSLETLSSMTLLQLRKVSGLTIGRRDYGKIDFLEPVDLSNISLPALCGQLVVFEPKTCTVCPNASMQPAEGEGLNVRARISTSGCYPVDKSTRKPIKDPNHPIIKRHINRLKSISDTKFDSYDPQTGTWVFTVDSPV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.11
3	0.11
4	0.12
5	0.11
6	0.12
7	0.13
8	0.13
9	0.13
10	0.12
11	0.14
12	0.13
13	0.13
14	0.14
15	0.13
16	0.11
17	0.12
18	0.13
19	0.13
20	0.13
21	0.18
22	0.19
23	0.23
24	0.23
25	0.23
26	0.23
27	0.22
28	0.25
29	0.21
30	0.26
31	0.21
32	0.23
33	0.23
34	0.22
35	0.23
36	0.19
37	0.18
38	0.11
39	0.11
40	0.09
41	0.08
42	0.09
43	0.07
44	0.07
45	0.1
46	0.1
47	0.1
48	0.1
49	0.11
50	0.1
51	0.1
52	0.11
53	0.08
54	0.08
55	0.08
56	0.08
57	0.08
58	0.08
59	0.08
60	0.1
61	0.12
62	0.13
63	0.14
64	0.16
65	0.16
66	0.17
67	0.2
68	0.19
69	0.19
70	0.19
71	0.18
72	0.18
73	0.18
74	0.18
75	0.14
76	0.13
77	0.12
78	0.11
79	0.1
80	0.08
81	0.1
82	0.12
83	0.12
84	0.12
85	0.12
86	0.14
87	0.14
88	0.15
89	0.13
90	0.12
91	0.11
92	0.11
93	0.13
94	0.11
95	0.12
96	0.11
97	0.11
98	0.1
99	0.1
100	0.12
101	0.09
102	0.12
103	0.13
104	0.13
105	0.12
106	0.15
107	0.15
108	0.15
109	0.15
110	0.11
111	0.12
112	0.13
113	0.14
114	0.12
115	0.11
116	0.11
117	0.13
118	0.14
119	0.17
120	0.22
121	0.23
122	0.27
123	0.32
124	0.32
125	0.31
126	0.32
127	0.29
128	0.27
129	0.29
130	0.26
131	0.26
132	0.26
133	0.26
134	0.25
135	0.22
136	0.23
137	0.2
138	0.22
139	0.16
140	0.18
141	0.18
142	0.24
143	0.27
144	0.25
145	0.25
146	0.25
147	0.28
148	0.29
149	0.31
150	0.3
151	0.29
152	0.31
153	0.31
154	0.3
155	0.29
156	0.34
157	0.4
158	0.42
159	0.48
160	0.45
161	0.47
162	0.47
163	0.44
164	0.47
165	0.41
166	0.34
167	0.29
168	0.29
169	0.25
170	0.24
171	0.22
172	0.14
173	0.11
174	0.1
175	0.08
176	0.06
177	0.06
178	0.06
179	0.06
180	0.07
181	0.15
182	0.15
183	0.17
184	0.18
185	0.19
186	0.24
187	0.29
188	0.31
189	0.28
190	0.3
191	0.29
192	0.29
193	0.29
194	0.23
195	0.2
196	0.17
197	0.14
198	0.14
199	0.18
200	0.2
201	0.23
202	0.26
203	0.29
204	0.31
205	0.31
206	0.31
207	0.28
208	0.26
209	0.23
210	0.21
211	0.18
212	0.17
213	0.18
214	0.16
215	0.14
216	0.16
217	0.15
218	0.15
219	0.14
220	0.12
221	0.09
222	0.09
223	0.08
224	0.06
225	0.07
226	0.07
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.06
231	0.07
232	0.08
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.07
237	0.07
238	0.08
239	0.07
240	0.07
241	0.09
242	0.1
243	0.1
244	0.1
245	0.11
246	0.11
247	0.12
248	0.13
249	0.18
250	0.18
251	0.18
252	0.21
253	0.2
254	0.2
255	0.2
256	0.19
257	0.14
258	0.18
259	0.18
260	0.15
261	0.15
262	0.14
263	0.15
264	0.15
265	0.14
266	0.09
267	0.08
268	0.09
269	0.08
270	0.08
271	0.07
272	0.06
273	0.06
274	0.07
275	0.07
276	0.08
277	0.09
278	0.1
279	0.1
280	0.11
281	0.1
282	0.09
283	0.12
284	0.11
285	0.1
286	0.1
287	0.1
288	0.09
289	0.1
290	0.12
291	0.13
292	0.13
293	0.13
294	0.13
295	0.12
296	0.13
297	0.14
298	0.13
299	0.1
300	0.1
301	0.1
302	0.09
303	0.1
304	0.12
305	0.1
306	0.13
307	0.13
308	0.13
309	0.13
310	0.13
311	0.14
312	0.13
313	0.12
314	0.11
315	0.12
316	0.11
317	0.11
318	0.11
319	0.15
320	0.13
321	0.15
322	0.15
323	0.14
324	0.13
325	0.13
326	0.14
327	0.1
328	0.12
329	0.12
330	0.1
331	0.14
332	0.15
333	0.16
334	0.16
335	0.17
336	0.16
337	0.16
338	0.17
339	0.15
340	0.14
341	0.16
342	0.15
343	0.16
344	0.19
345	0.18
346	0.2
347	0.21
348	0.21
349	0.19
350	0.18
351	0.16
352	0.13
353	0.14
354	0.12
355	0.12
356	0.14
357	0.14
358	0.15
359	0.16
360	0.16
361	0.15
362	0.14
363	0.12
364	0.13
365	0.13
366	0.14
367	0.14
368	0.13
369	0.17
370	0.17
371	0.18
372	0.16
373	0.15
374	0.13
375	0.12
376	0.12
377	0.09
378	0.08
379	0.07
380	0.05
381	0.05
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.06
387	0.06
388	0.08
389	0.09
390	0.15
391	0.15
392	0.16
393	0.2
394	0.2
395	0.2
396	0.19
397	0.19
398	0.12
399	0.12
400	0.12
401	0.08
402	0.07
403	0.07
404	0.07
405	0.09
406	0.1
407	0.12
408	0.13
409	0.13
410	0.13
411	0.13
412	0.13
413	0.14
414	0.13
415	0.15
416	0.17
417	0.18
418	0.19
419	0.19
420	0.18
421	0.16
422	0.15
423	0.13
424	0.1
425	0.08
426	0.08
427	0.08
428	0.09
429	0.09
430	0.1
431	0.09
432	0.08
433	0.07
434	0.07
435	0.06
436	0.06
437	0.07
438	0.06
439	0.09
440	0.13
441	0.16
442	0.18
443	0.21
444	0.21
445	0.21
446	0.21
447	0.19
448	0.15
449	0.12
450	0.1
451	0.09
452	0.08
453	0.09
454	0.11
455	0.15
456	0.17
457	0.2
458	0.2
459	0.21
460	0.2
461	0.19
462	0.17
463	0.12
464	0.09
465	0.07
466	0.07
467	0.07
468	0.08
469	0.08
470	0.09
471	0.1
472	0.11
473	0.11
474	0.1
475	0.08
476	0.08
477	0.07
478	0.06
479	0.06
480	0.06
481	0.05
482	0.06
483	0.06
484	0.07
485	0.08
486	0.1
487	0.1
488	0.1
489	0.11
490	0.12
491	0.12
492	0.12
493	0.12
494	0.11
495	0.11
496	0.11
497	0.11
498	0.1
499	0.1
500	0.1
501	0.1
502	0.12
503	0.13
504	0.13
505	0.13
506	0.15
507	0.15
508	0.15
509	0.16
510	0.16
511	0.15
512	0.16
513	0.17
514	0.15
515	0.14
516	0.13
517	0.11
518	0.08
519	0.09
520	0.08
521	0.13
522	0.13
523	0.12
524	0.14
525	0.13
526	0.13
527	0.14
528	0.13
529	0.06
530	0.07
531	0.12
532	0.11
533	0.12
534	0.13
535	0.12
536	0.12
537	0.12
538	0.11
539	0.07
540	0.06
541	0.06
542	0.05
543	0.06
544	0.07
545	0.07
546	0.09
547	0.11
548	0.12
549	0.13
550	0.13
551	0.12
552	0.12
553	0.13
554	0.12
555	0.1
556	0.09
557	0.08
558	0.08
559	0.09
560	0.09
561	0.08
562	0.11
563	0.1
564	0.11
565	0.11
566	0.11
567	0.1
568	0.1
569	0.1
570	0.07
571	0.09
572	0.08
573	0.08
574	0.09
575	0.12
576	0.15
577	0.15
578	0.17
579	0.16
580	0.19
581	0.25
582	0.26
583	0.24
584	0.22
585	0.22
586	0.2
587	0.19
588	0.16
589	0.1
590	0.07
591	0.07
592	0.09
593	0.09
594	0.1
595	0.11
596	0.11
597	0.11
598	0.11
599	0.11
600	0.09
601	0.09
602	0.09
603	0.09
604	0.09
605	0.1
606	0.1
607	0.1
608	0.09
609	0.08
610	0.08
611	0.06
612	0.05
613	0.05
614	0.05
615	0.06
616	0.1
617	0.12
618	0.13
619	0.14
620	0.17
621	0.19
622	0.21
623	0.22
624	0.19
625	0.17
626	0.16
627	0.16
628	0.12
629	0.11
630	0.09
631	0.08
632	0.07
633	0.07
634	0.07
635	0.06
636	0.06
637	0.06
638	0.06
639	0.04
640	0.04
641	0.05
642	0.05
643	0.05
644	0.05
645	0.05
646	0.08
647	0.11
648	0.12
649	0.13
650	0.13
651	0.13
652	0.14
653	0.16
654	0.16
655	0.13
656	0.11
657	0.11
658	0.14
659	0.15
660	0.15
661	0.15
662	0.15
663	0.15
664	0.16
665	0.16
666	0.12
667	0.11
668	0.12
669	0.11
670	0.1
671	0.1
672	0.09
673	0.09
674	0.11
675	0.11
676	0.11
677	0.13
678	0.11
679	0.11
680	0.1
681	0.11
682	0.09
683	0.1
684	0.1
685	0.08
686	0.09
687	0.08
688	0.08
689	0.08
690	0.08
691	0.07
692	0.07
693	0.06
694	0.06
695	0.06
696	0.06
697	0.07
698	0.07
699	0.07
700	0.06
701	0.05
702	0.05
703	0.06
704	0.06
705	0.05
706	0.05
707	0.06
708	0.06
709	0.06
710	0.06
711	0.06
712	0.06
713	0.07
714	0.08
715	0.08
716	0.08
717	0.08
718	0.08
719	0.08
720	0.07
721	0.07
722	0.05
723	0.06
724	0.06
725	0.06
726	0.06
727	0.07
728	0.08
729	0.08
730	0.08
731	0.07
732	0.09
733	0.09
734	0.1
735	0.1
736	0.09
737	0.1
738	0.1
739	0.09
740	0.08
741	0.09
742	0.08
743	0.08
744	0.07
745	0.1
746	0.1
747	0.1
748	0.09
749	0.09
750	0.08
751	0.08
752	0.09
753	0.06
754	0.06
755	0.06
756	0.07
757	0.06
758	0.07
759	0.08
760	0.1
761	0.1
762	0.1
763	0.1
764	0.09
765	0.09
766	0.08
767	0.06
768	0.04
769	0.04
770	0.04
771	0.04
772	0.04
773	0.04
774	0.04
775	0.04
776	0.04
777	0.07
778	0.07
779	0.07
780	0.07
781	0.07
782	0.09
783	0.09
784	0.1
785	0.07
786	0.09
787	0.1
788	0.1
789	0.11
790	0.09
791	0.09
792	0.1
793	0.11
794	0.11
795	0.1
796	0.1
797	0.09
798	0.09
799	0.09
800	0.08
801	0.06
802	0.07
803	0.08
804	0.08
805	0.12
806	0.14
807	0.16
808	0.16
809	0.17
810	0.15
811	0.16
812	0.17
813	0.14
814	0.13
815	0.12
816	0.12
817	0.13
818	0.15
819	0.15
820	0.17
821	0.16
822	0.16
823	0.16
824	0.21
825	0.22
826	0.21
827	0.18
828	0.17
829	0.21
830	0.2
831	0.2
832	0.14
833	0.15
834	0.15
835	0.15
836	0.15
837	0.11
838	0.12
839	0.11
840	0.12
841	0.12
842	0.14
843	0.17
844	0.17
845	0.16
846	0.18
847	0.2
848	0.21
849	0.19
850	0.2
851	0.24
852	0.27
853	0.32
854	0.36
855	0.44
856	0.47
857	0.52
858	0.53
859	0.47
860	0.52
861	0.47
862	0.43
863	0.36
864	0.37
865	0.35
866	0.4
867	0.42
868	0.34
869	0.39
870	0.37
871	0.38
872	0.31
873	0.28
874	0.24
875	0.28
876	0.29
877	0.25
878	0.31
879	0.28
880	0.35
881	0.35
882	0.33
883	0.27
884	0.27
885	0.28
886	0.26
887	0.25
888	0.17
889	0.18
890	0.18
891	0.19
892	0.17
893	0.18
894	0.15
895	0.17
896	0.18
897	0.18
898	0.19
899	0.17
900	0.16
901	0.14
902	0.13
903	0.12
904	0.12
905	0.11
906	0.09
907	0.1
908	0.1
909	0.12
910	0.12
911	0.11
912	0.11
913	0.11
914	0.11
915	0.11
916	0.12
917	0.1
918	0.1
919	0.1
920	0.1
921	0.1
922	0.09
923	0.09
924	0.09
925	0.09
926	0.1
927	0.1
928	0.12
929	0.12
930	0.12
931	0.11
932	0.11
933	0.1
934	0.1
935	0.09
936	0.07
937	0.07
938	0.07
939	0.08
940	0.08
941	0.12
942	0.14
943	0.18
944	0.22
945	0.26
946	0.31
947	0.32
948	0.4
949	0.4
950	0.44
951	0.5
952	0.53
953	0.6
954	0.66
955	0.71
956	0.66
957	0.66
958	0.59
959	0.5
960	0.48
961	0.44
962	0.39
963	0.4
964	0.41
965	0.38
966	0.38
967	0.38
968	0.36
969	0.28
970	0.24
971	0.2
972	0.18
973	0.18
974	0.17
975	0.16
976	0.15
977	0.15
978	0.16
979	0.14
980	0.14
981	0.16
982	0.18
983	0.2
984	0.2
985	0.19
986	0.16
987	0.16
988	0.14
989	0.13
990	0.11
991	0.1
992	0.09
993	0.1
994	0.11
995	0.13
996	0.15
997	0.18
998	0.19
999	0.2
1000	0.23
1001	0.23
1002	0.26
1003	0.29
1004	0.28
1005	0.25
1006	0.24
1007	0.22
1008	0.22
1009	0.22
1010	0.19
1011	0.17
1012	0.19
1013	0.19
1014	0.2
1015	0.21
1016	0.22
1017	0.3
1018	0.34
1019	0.38
1020	0.36
1021	0.4
1022	0.44
1023	0.43
1024	0.4
1025	0.32
1026	0.31
1027	0.31
1028	0.32
1029	0.3
1030	0.3
1031	0.36
1032	0.35
1033	0.36
1034	0.38
1035	0.41
1036	0.41
1037	0.4
1038	0.37
1039	0.4
1040	0.4
1041	0.4
1042	0.35
1043	0.29
1044	0.28
1045	0.27
1046	0.25
1047	0.17
1048	0.17
1049	0.21
1050	0.23
1051	0.23
1052	0.22
1053	0.22
1054	0.21
1055	0.22
1056	0.22
1057	0.17
1058	0.15
1059	0.13
1060	0.13
1061	0.14
1062	0.13
1063	0.12
1064	0.1
1065	0.09
1066	0.08
1067	0.07
1068	0.07
1069	0.07
1070	0.08
1071	0.07
1072	0.07
1073	0.07
1074	0.07
1075	0.09
1076	0.09
1077	0.09
1078	0.09
1079	0.1
1080	0.1
1081	0.1
1082	0.11
1083	0.14
1084	0.15
1085	0.17
1086	0.18
1087	0.18
1088	0.18
1089	0.19
1090	0.18
1091	0.19
1092	0.26
1093	0.28
1094	0.33
1095	0.35
1096	0.36
1097	0.37
1098	0.38
1099	0.35
1100	0.32
1101	0.32
1102	0.26
1103	0.26
1104	0.26
1105	0.26
1106	0.28
1107	0.25
1108	0.22
1109	0.19
1110	0.17
1111	0.15
1112	0.14
1113	0.13
1114	0.1
1115	0.1
1116	0.1
1117	0.09
1118	0.1
1119	0.1
1120	0.08
1121	0.08
1122	0.1
1123	0.11
1124	0.15
1125	0.15
1126	0.15
1127	0.18
1128	0.21
1129	0.24
1130	0.23
1131	0.24
1132	0.24
1133	0.26
1134	0.27
1135	0.31
1136	0.33
1137	0.34
1138	0.35
1139	0.33
1140	0.29
1141	0.27
1142	0.26
1143	0.2
1144	0.16
1145	0.13
1146	0.16
1147	0.16
1148	0.15
1149	0.14
1150	0.14
1151	0.15
1152	0.17
1153	0.19
1154	0.18
1155	0.2
1156	0.27
1157	0.28
1158	0.3
1159	0.3
1160	0.35
1161	0.42
1162	0.44
1163	0.46
1164	0.5
1165	0.59
1166	0.61
1167	0.66
1168	0.69
1169	0.7
1170	0.76
1171	0.8
1172	0.79
1173	0.81
1174	0.79
1175	0.75
1176	0.75
1177	0.75
1178	0.7
1179	0.71
1180	0.7
1181	0.64
1182	0.7
1183	0.72
1184	0.67
1185	0.63
1186	0.67
1187	0.61
1188	0.57
1189	0.57
1190	0.52
1191	0.48
1192	0.44
1193	0.42
1194	0.38
1195	0.39
1196	0.36
1197	0.33
1198	0.33
1199	0.31
1200	0.33
1201	0.27
1202	0.23
1203	0.17

C5DCL6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer