FuNGI

A0A550CHA6

Protein Details

Accession

A0A550CHA6

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
40-63	PSAIATKLKKQAKKAKVKTPLSFG	Hydrophilic
71-91	GTEFKIRKSNLSQKLKNKAAL	Hydrophilic
436-463	SDRQARRTTRLGRRQRRHVRNTNIQNEE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
48-55	KKQAKKAK
241-249	GKKSRKVEA

Subcellular Location(s)

mito 13, nucl 10, cyto_nucl 7.5, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012890 GCFC2-like
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF15458 NTR2

Amino Acid Sequences

MSLFKKKGTKPALRTRLSEAAPEDSVKTPEDDATMGDESPSAIATKLKKQAKKAKVKTPLSFGAEEQESEGTEFKIRKSNLSQKLKNKAALPSNLDQASITAQSTGPRYDQNYLNELKANTPTSRPSFSADAYDADMAMDVDAPNDIVSVIDVDALDDIAEHAPRIPTETSVKAAKERRERSRKTGTSTSEDYISLSLVHQDSEYQGPHPTSRLMREDDDLGEGDDEFAEFTSAKERIALGKKSRKVEASKRREDMQDLIADAEEEDEETMEWEQEQIRRGGQLPNEAPGKPAKQVYKPAPIPPSVPIPALAPALARLTQQLAQLTASHATTTSSLNAVAKERDEIEEREKEMRDMVERAEAKRAWFDEFREWVESVAGFLDEKYPALERVEEDQLALFKERSGIVAKRRQEEDTDDLVTFLGPAPSSSEEPSSKSDRQARRTTRLGRRQRRHVRNTNIQNEEEGYSTDSSLPEEDASAYDEALQSLKKSRKDVLADVRAEEFRDPGRGRWGSWREQYADTYVGAWGGLGVVSAWEFWVRLEIADWDPVENPLSLDTFKWYKGLYEYARPGSGDVEARDLGPDGDLVSSMITTAVIPRLAKVLEGGALDVYSEKHVRRVIDLVEEVEASIERGSPKLQVLQKAVLGVFARAVAEAEGLLAPYKAQGGSRPFDPEAIPARRRYIARQMKLLKNLLRWRRYMQERYGVGALVERLVEGIILYVAEGGWEVGGADFVEQVVFLACGSRKMD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.76
2	0.73
3	0.72
4	0.63
5	0.58
6	0.49
7	0.44
8	0.41
9	0.38
10	0.34
11	0.28
12	0.28
13	0.25
14	0.24
15	0.2
16	0.2
17	0.2
18	0.17
19	0.15
20	0.18
21	0.18
22	0.16
23	0.15
24	0.13
25	0.12
26	0.12
27	0.12
28	0.08
29	0.07
30	0.12
31	0.16
32	0.24
33	0.33
34	0.42
35	0.47
36	0.57
37	0.67
38	0.73
39	0.8
40	0.81
41	0.82
42	0.84
43	0.88
44	0.83
45	0.8
46	0.77
47	0.7
48	0.63
49	0.53
50	0.48
51	0.41
52	0.35
53	0.29
54	0.22
55	0.17
56	0.17
57	0.18
58	0.12
59	0.16
60	0.17
61	0.18
62	0.26
63	0.26
64	0.32
65	0.4
66	0.49
67	0.55
68	0.65
69	0.71
70	0.72
71	0.81
72	0.81
73	0.76
74	0.7
75	0.67
76	0.65
77	0.62
78	0.6
79	0.53
80	0.53
81	0.48
82	0.44
83	0.36
84	0.29
85	0.25
86	0.19
87	0.16
88	0.11
89	0.11
90	0.14
91	0.16
92	0.17
93	0.17
94	0.19
95	0.23
96	0.27
97	0.32
98	0.33
99	0.37
100	0.37
101	0.37
102	0.37
103	0.34
104	0.32
105	0.3
106	0.3
107	0.26
108	0.27
109	0.32
110	0.32
111	0.35
112	0.34
113	0.34
114	0.33
115	0.33
116	0.34
117	0.29
118	0.26
119	0.24
120	0.22
121	0.18
122	0.14
123	0.13
124	0.09
125	0.08
126	0.07
127	0.05
128	0.05
129	0.05
130	0.05
131	0.05
132	0.05
133	0.05
134	0.04
135	0.04
136	0.05
137	0.05
138	0.05
139	0.05
140	0.05
141	0.05
142	0.05
143	0.05
144	0.04
145	0.05
146	0.06
147	0.06
148	0.06
149	0.07
150	0.08
151	0.09
152	0.12
153	0.12
154	0.14
155	0.18
156	0.2
157	0.22
158	0.25
159	0.27
160	0.3
161	0.36
162	0.41
163	0.47
164	0.54
165	0.62
166	0.69
167	0.73
168	0.74
169	0.79
170	0.76
171	0.73
172	0.73
173	0.67
174	0.63
175	0.61
176	0.54
177	0.44
178	0.39
179	0.32
180	0.24
181	0.19
182	0.13
183	0.09
184	0.11
185	0.09
186	0.1
187	0.09
188	0.09
189	0.11
190	0.13
191	0.14
192	0.12
193	0.14
194	0.15
195	0.16
196	0.17
197	0.19
198	0.19
199	0.23
200	0.27
201	0.27
202	0.28
203	0.29
204	0.29
205	0.26
206	0.25
207	0.2
208	0.16
209	0.13
210	0.11
211	0.09
212	0.07
213	0.06
214	0.05
215	0.04
216	0.04
217	0.04
218	0.05
219	0.09
220	0.09
221	0.09
222	0.1
223	0.11
224	0.17
225	0.24
226	0.3
227	0.35
228	0.43
229	0.49
230	0.52
231	0.55
232	0.53
233	0.54
234	0.59
235	0.61
236	0.63
237	0.65
238	0.65
239	0.65
240	0.61
241	0.56
242	0.49
243	0.41
244	0.32
245	0.25
246	0.22
247	0.18
248	0.16
249	0.13
250	0.1
251	0.06
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.05
258	0.04
259	0.04
260	0.05
261	0.07
262	0.09
263	0.11
264	0.12
265	0.12
266	0.13
267	0.15
268	0.18
269	0.18
270	0.23
271	0.22
272	0.25
273	0.27
274	0.25
275	0.25
276	0.24
277	0.24
278	0.2
279	0.24
280	0.23
281	0.25
282	0.33
283	0.37
284	0.44
285	0.44
286	0.47
287	0.45
288	0.42
289	0.4
290	0.34
291	0.33
292	0.25
293	0.23
294	0.18
295	0.16
296	0.16
297	0.15
298	0.13
299	0.08
300	0.07
301	0.08
302	0.08
303	0.07
304	0.07
305	0.08
306	0.1
307	0.12
308	0.11
309	0.11
310	0.11
311	0.11
312	0.12
313	0.11
314	0.09
315	0.07
316	0.07
317	0.07
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.07
322	0.08
323	0.08
324	0.09
325	0.1
326	0.1
327	0.09
328	0.1
329	0.1
330	0.11
331	0.13
332	0.14
333	0.18
334	0.2
335	0.21
336	0.24
337	0.23
338	0.22
339	0.2
340	0.19
341	0.16
342	0.14
343	0.13
344	0.16
345	0.17
346	0.18
347	0.21
348	0.21
349	0.19
350	0.21
351	0.21
352	0.18
353	0.18
354	0.19
355	0.2
356	0.21
357	0.22
358	0.22
359	0.21
360	0.18
361	0.17
362	0.15
363	0.1
364	0.08
365	0.06
366	0.04
367	0.04
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.06
373	0.07
374	0.07
375	0.08
376	0.08
377	0.11
378	0.13
379	0.12
380	0.12
381	0.11
382	0.11
383	0.11
384	0.11
385	0.08
386	0.06
387	0.07
388	0.07
389	0.08
390	0.11
391	0.14
392	0.2
393	0.27
394	0.31
395	0.34
396	0.36
397	0.35
398	0.34
399	0.35
400	0.34
401	0.3
402	0.28
403	0.23
404	0.21
405	0.2
406	0.18
407	0.14
408	0.08
409	0.06
410	0.04
411	0.04
412	0.06
413	0.08
414	0.09
415	0.1
416	0.13
417	0.13
418	0.16
419	0.2
420	0.24
421	0.23
422	0.28
423	0.36
424	0.4
425	0.47
426	0.54
427	0.57
428	0.57
429	0.64
430	0.68
431	0.69
432	0.73
433	0.76
434	0.78
435	0.79
436	0.84
437	0.87
438	0.88
439	0.88
440	0.87
441	0.85
442	0.85
443	0.86
444	0.84
445	0.77
446	0.67
447	0.57
448	0.49
449	0.4
450	0.3
451	0.21
452	0.14
453	0.11
454	0.11
455	0.11
456	0.09
457	0.09
458	0.09
459	0.09
460	0.07
461	0.07
462	0.07
463	0.06
464	0.08
465	0.08
466	0.07
467	0.08
468	0.08
469	0.08
470	0.08
471	0.08
472	0.07
473	0.14
474	0.19
475	0.22
476	0.25
477	0.28
478	0.34
479	0.38
480	0.44
481	0.47
482	0.49
483	0.47
484	0.45
485	0.44
486	0.38
487	0.34
488	0.28
489	0.19
490	0.12
491	0.18
492	0.18
493	0.17
494	0.25
495	0.25
496	0.26
497	0.35
498	0.39
499	0.39
500	0.43
501	0.45
502	0.4
503	0.41
504	0.41
505	0.34
506	0.3
507	0.24
508	0.19
509	0.15
510	0.12
511	0.1
512	0.08
513	0.05
514	0.04
515	0.03
516	0.03
517	0.02
518	0.03
519	0.03
520	0.03
521	0.03
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.06
526	0.06
527	0.07
528	0.07
529	0.1
530	0.11
531	0.14
532	0.14
533	0.13
534	0.13
535	0.14
536	0.14
537	0.12
538	0.11
539	0.09
540	0.1
541	0.1
542	0.1
543	0.13
544	0.14
545	0.14
546	0.15
547	0.14
548	0.15
549	0.17
550	0.23
551	0.22
552	0.28
553	0.32
554	0.33
555	0.34
556	0.33
557	0.31
558	0.25
559	0.24
560	0.2
561	0.16
562	0.16
563	0.15
564	0.15
565	0.15
566	0.15
567	0.12
568	0.09
569	0.09
570	0.06
571	0.06
572	0.06
573	0.06
574	0.05
575	0.05
576	0.05
577	0.05
578	0.04
579	0.04
580	0.06
581	0.07
582	0.09
583	0.09
584	0.1
585	0.12
586	0.12
587	0.12
588	0.12
589	0.11
590	0.11
591	0.11
592	0.11
593	0.08
594	0.08
595	0.08
596	0.08
597	0.08
598	0.09
599	0.12
600	0.12
601	0.17
602	0.2
603	0.21
604	0.24
605	0.26
606	0.25
607	0.27
608	0.28
609	0.24
610	0.22
611	0.21
612	0.18
613	0.15
614	0.13
615	0.08
616	0.07
617	0.08
618	0.08
619	0.09
620	0.1
621	0.12
622	0.14
623	0.21
624	0.25
625	0.29
626	0.33
627	0.35
628	0.35
629	0.35
630	0.33
631	0.29
632	0.25
633	0.19
634	0.15
635	0.13
636	0.12
637	0.09
638	0.1
639	0.07
640	0.06
641	0.06
642	0.06
643	0.06
644	0.06
645	0.06
646	0.06
647	0.06
648	0.06
649	0.08
650	0.07
651	0.08
652	0.14
653	0.19
654	0.23
655	0.25
656	0.31
657	0.3
658	0.31
659	0.31
660	0.31
661	0.34
662	0.39
663	0.41
664	0.38
665	0.43
666	0.46
667	0.48
668	0.48
669	0.51
670	0.53
671	0.55
672	0.61
673	0.66
674	0.68
675	0.73
676	0.74
677	0.69
678	0.67
679	0.71
680	0.71
681	0.68
682	0.64
683	0.63
684	0.65
685	0.69
686	0.68
687	0.66
688	0.66
689	0.62
690	0.62
691	0.58
692	0.48
693	0.38
694	0.33
695	0.26
696	0.17
697	0.15
698	0.1
699	0.09
700	0.09
701	0.08
702	0.05
703	0.05
704	0.04
705	0.04
706	0.04
707	0.04
708	0.04
709	0.04
710	0.04
711	0.04
712	0.04
713	0.04
714	0.04
715	0.04
716	0.05
717	0.05
718	0.05
719	0.05
720	0.05
721	0.05
722	0.05
723	0.05
724	0.05
725	0.05
726	0.05
727	0.09
728	0.1

A0A550CHA6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer