FuNGI

A0A550C1M6

Protein Details

Accession

A0A550C1M6

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-22	MPGRAPRSARTRDKPPTSRSSL	Hydrophilic
391-413	KATAALSKRPRGRPRKNTTPAAA	Hydrophilic
450-475	SKTVTAPLKRPRGRPRKDAIPKRSLY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
342-354	PAASKRRGRPRKI
391-406	KATAALSKRPRGRPRK
456-471	PLKRPRGRPRKDAIPK

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017956 AT_hook_DNA-bd_motif IPR000305 GIY-YIG_endonuc IPR035901 GIY-YIG_endonuc_sf IPR000116 HMGA IPR000637 HMGI/Y_DNA-bd_CS IPR027520 Slx1 IPR013083 Znf_RING/FYVE/PHD
Gene Ontology	GO:0000785 C:chromatin GO:0033557 C:Slx1-Slx4 complex GO:0017108 F:5'-flap endonuclease activity GO:0003677 F:DNA binding GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006281 P:DNA repair GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF02178 AT_hook PF01541 GIY-YIG
PROSITE	View protein in PROSITE PS50164 GIY_YIG PS00354 HMGI_Y PS51257 PROKAR_LIPOPROTEIN
CDD	cd10455 GIY-YIG_SLX1

Amino Acid Sequences

MPGRAPRSARTRDKPPTSRSSLHTHVYPSFYACYLLKSIQTPTSKATYIGSTPNPPRRISVHIRVGELTQGAWKTKHRRPWVMQLIVYGFPSKLAALQFEWAWQHPQLSRHLRDPSGQRLVATGHKNKGMKNNIQTLLMMISSHPYSLWPLHVKIFTAEAEKCWTALIKAPAYRALPLGLTTTVELEGVDGRSGQRGSGRTGPIDVADTQFTSAYLAKNTAVAALPTKPSCGVCGERITEYSSEPLSTTLCPHNRCTSTSHLLCLSQDWLAAQQDNTGLLPRGGQCRSCKSYVLYGDIIRGCYRRAAGRAIAVEDDEEEHVLDDADDSAISGSDDGESPVRPAASKRRGRPRKIAEGGRSDDGELFDFNVSGSSDEEHALSRIVKPRLTGKATAALSKRPRGRPRKNTTPAAAICGHSSEGEAFDFNVSGSSDEDRATAPVTKSKAPVASKTVTAPLKRPRGRPRKDAIPKRSLYMQAALPEETGGEAFDFDGISDCTSDDVPLTTIARSPLQHGASRSTTGKQGKDTIGDANMLSVKSPPRTAAPAKYIEISD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.84
2	0.82
3	0.82
4	0.8
5	0.77
6	0.71
7	0.69
8	0.65
9	0.6
10	0.56
11	0.51
12	0.47
13	0.45
14	0.41
15	0.35
16	0.32
17	0.27
18	0.27
19	0.23
20	0.22
21	0.21
22	0.22
23	0.22
24	0.22
25	0.26
26	0.3
27	0.33
28	0.32
29	0.33
30	0.36
31	0.34
32	0.32
33	0.31
34	0.27
35	0.26
36	0.31
37	0.31
38	0.34
39	0.42
40	0.51
41	0.52
42	0.5
43	0.51
44	0.48
45	0.52
46	0.53
47	0.54
48	0.54
49	0.54
50	0.55
51	0.52
52	0.49
53	0.43
54	0.34
55	0.25
56	0.19
57	0.18
58	0.18
59	0.2
60	0.27
61	0.34
62	0.4
63	0.5
64	0.55
65	0.63
66	0.67
67	0.76
68	0.78
69	0.75
70	0.69
71	0.63
72	0.57
73	0.48
74	0.42
75	0.32
76	0.22
77	0.16
78	0.15
79	0.12
80	0.11
81	0.11
82	0.12
83	0.12
84	0.14
85	0.14
86	0.16
87	0.18
88	0.16
89	0.19
90	0.17
91	0.2
92	0.21
93	0.25
94	0.32
95	0.39
96	0.41
97	0.45
98	0.49
99	0.47
100	0.5
101	0.52
102	0.52
103	0.5
104	0.47
105	0.4
106	0.36
107	0.37
108	0.38
109	0.4
110	0.37
111	0.34
112	0.39
113	0.41
114	0.43
115	0.5
116	0.51
117	0.51
118	0.52
119	0.57
120	0.53
121	0.51
122	0.48
123	0.39
124	0.32
125	0.24
126	0.18
127	0.09
128	0.1
129	0.09
130	0.09
131	0.08
132	0.07
133	0.1
134	0.11
135	0.16
136	0.17
137	0.18
138	0.22
139	0.23
140	0.23
141	0.21
142	0.22
143	0.18
144	0.19
145	0.18
146	0.15
147	0.19
148	0.18
149	0.17
150	0.16
151	0.15
152	0.11
153	0.16
154	0.2
155	0.2
156	0.21
157	0.22
158	0.26
159	0.27
160	0.27
161	0.22
162	0.18
163	0.14
164	0.13
165	0.14
166	0.1
167	0.1
168	0.09
169	0.09
170	0.08
171	0.08
172	0.07
173	0.06
174	0.07
175	0.07
176	0.06
177	0.06
178	0.06
179	0.09
180	0.09
181	0.09
182	0.12
183	0.13
184	0.17
185	0.22
186	0.24
187	0.22
188	0.23
189	0.22
190	0.19
191	0.19
192	0.16
193	0.11
194	0.1
195	0.1
196	0.1
197	0.09
198	0.09
199	0.08
200	0.09
201	0.09
202	0.09
203	0.1
204	0.09
205	0.1
206	0.1
207	0.09
208	0.08
209	0.07
210	0.08
211	0.09
212	0.11
213	0.1
214	0.11
215	0.11
216	0.11
217	0.12
218	0.14
219	0.14
220	0.15
221	0.18
222	0.19
223	0.19
224	0.19
225	0.2
226	0.17
227	0.16
228	0.14
229	0.12
230	0.1
231	0.1
232	0.1
233	0.09
234	0.09
235	0.11
236	0.15
237	0.2
238	0.22
239	0.24
240	0.3
241	0.31
242	0.32
243	0.33
244	0.33
245	0.36
246	0.34
247	0.33
248	0.27
249	0.26
250	0.25
251	0.22
252	0.17
253	0.09
254	0.08
255	0.07
256	0.08
257	0.08
258	0.08
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.07
264	0.06
265	0.06
266	0.06
267	0.07
268	0.08
269	0.12
270	0.13
271	0.16
272	0.18
273	0.24
274	0.28
275	0.28
276	0.28
277	0.25
278	0.3
279	0.29
280	0.3
281	0.25
282	0.21
283	0.23
284	0.22
285	0.22
286	0.17
287	0.16
288	0.12
289	0.12
290	0.13
291	0.12
292	0.14
293	0.15
294	0.15
295	0.18
296	0.18
297	0.17
298	0.16
299	0.14
300	0.12
301	0.09
302	0.09
303	0.06
304	0.06
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.03
314	0.03
315	0.03
316	0.03
317	0.03
318	0.03
319	0.03
320	0.04
321	0.04
322	0.05
323	0.06
324	0.06
325	0.07
326	0.07
327	0.08
328	0.08
329	0.11
330	0.2
331	0.29
332	0.37
333	0.44
334	0.55
335	0.64
336	0.7
337	0.78
338	0.76
339	0.77
340	0.77
341	0.76
342	0.71
343	0.68
344	0.65
345	0.57
346	0.49
347	0.38
348	0.32
349	0.25
350	0.2
351	0.13
352	0.1
353	0.09
354	0.08
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.06
359	0.07
360	0.07
361	0.07
362	0.08
363	0.09
364	0.08
365	0.08
366	0.09
367	0.09
368	0.13
369	0.19
370	0.21
371	0.22
372	0.23
373	0.29
374	0.35
375	0.38
376	0.36
377	0.31
378	0.36
379	0.36
380	0.4
381	0.35
382	0.36
383	0.38
384	0.43
385	0.49
386	0.5
387	0.6
388	0.65
389	0.75
390	0.78
391	0.83
392	0.87
393	0.87
394	0.85
395	0.78
396	0.76
397	0.66
398	0.6
399	0.52
400	0.41
401	0.33
402	0.27
403	0.24
404	0.15
405	0.15
406	0.1
407	0.09
408	0.09
409	0.09
410	0.08
411	0.08
412	0.08
413	0.07
414	0.08
415	0.07
416	0.07
417	0.08
418	0.09
419	0.1
420	0.1
421	0.11
422	0.1
423	0.11
424	0.12
425	0.15
426	0.15
427	0.2
428	0.22
429	0.25
430	0.26
431	0.29
432	0.34
433	0.33
434	0.36
435	0.37
436	0.36
437	0.35
438	0.35
439	0.39
440	0.37
441	0.36
442	0.39
443	0.42
444	0.51
445	0.55
446	0.63
447	0.67
448	0.72
449	0.78
450	0.81
451	0.8
452	0.8
453	0.85
454	0.86
455	0.84
456	0.83
457	0.77
458	0.71
459	0.69
460	0.62
461	0.54
462	0.47
463	0.41
464	0.35
465	0.35
466	0.32
467	0.26
468	0.22
469	0.19
470	0.15
471	0.12
472	0.08
473	0.06
474	0.05
475	0.05
476	0.06
477	0.05
478	0.05
479	0.07
480	0.07
481	0.08
482	0.08
483	0.08
484	0.09
485	0.1
486	0.1
487	0.08
488	0.09
489	0.09
490	0.11
491	0.12
492	0.12
493	0.13
494	0.16
495	0.19
496	0.18
497	0.21
498	0.27
499	0.29
500	0.33
501	0.33
502	0.37
503	0.36
504	0.4
505	0.39
506	0.34
507	0.39
508	0.41
509	0.43
510	0.41
511	0.44
512	0.43
513	0.44
514	0.43
515	0.39
516	0.34
517	0.32
518	0.27
519	0.23
520	0.23
521	0.19
522	0.18
523	0.18
524	0.21
525	0.23
526	0.25
527	0.25
528	0.27
529	0.35
530	0.4
531	0.45
532	0.47
533	0.48
534	0.49

A0A550C1M6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer