Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CJM0

Protein Details
Accession A0A550CJM0    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
425-461VATASGRKKKKQVKAPLERERVSKTERKRREVPDFVSHydrophilic
475-499DGPAALTKREKRRAKQAKKTEEGETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
430-454GRKKKKQVKAPLERERVSKTERKRR
482-493KREKRRAKQAKK
543-555GVGKGKKGKKAGR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001623  DnaJ_domain  
IPR018253  DnaJ_domain_CS  
IPR036869  J_dom_sf  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00226  DnaJ  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00636  DNAJ_1  
PS50076  DNAJ_2  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
CDD cd06257  DnaJ  
Amino Acid Sequences MGAQGSKSQSGAGADADAVDYYELLEVDENATQDEIKKSFRKLALIHHPDKNPDDPEGATKRFAALQQAYEVLSDEQERAWYDSHKASLAPEPDAETVFDDIRKGAPPSKARDRGLTVRHLARFFDTTSWSGFDDDDGNSFYTIYRNLFTRLAAEEAMFEPDITHPSFGYSTTPWVAPKASGTEDARSFYTAWINFSTAKDFAWRDAWDLREAPDRRIRRLMEKENKKSRDDGRRDYNDTIRQLAKFLRKRDPRYKIYQTAQANAPTAKTGSAATTRTADAAAAYVEQEWQKVGNGDTHADLEWAFAEGEDPEEWECVACGKSFRSEAAWDSHERSRKHMVQVERLRMEMEAEDEALQFEEGDLEAEEVGEVGEEAQQEIPDGELEHDVADAPPRTPSPTPSADGHAEEGPASPPPEGNEAAEEVATASGRKKKKQVKAPLERERVSKTERKRREVPDFVSGETPLQSDGEANGDGPAALTKREKRRAKQAKKTEEGETGTMQTKCNVCEETFSSKTKLFAHISLTGHALATPEAGGGKAATGVGKGKKGKKAGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.12
4 0.09
5 0.08
6 0.07
7 0.06
8 0.06
9 0.07
10 0.06
11 0.06
12 0.07
13 0.07
14 0.09
15 0.11
16 0.1
17 0.1
18 0.11
19 0.11
20 0.13
21 0.18
22 0.19
23 0.24
24 0.29
25 0.32
26 0.4
27 0.43
28 0.46
29 0.45
30 0.52
31 0.56
32 0.61
33 0.64
34 0.63
35 0.63
36 0.62
37 0.63
38 0.59
39 0.5
40 0.43
41 0.39
42 0.33
43 0.38
44 0.4
45 0.37
46 0.33
47 0.31
48 0.29
49 0.3
50 0.3
51 0.29
52 0.26
53 0.25
54 0.26
55 0.27
56 0.25
57 0.23
58 0.23
59 0.15
60 0.14
61 0.13
62 0.11
63 0.1
64 0.12
65 0.13
66 0.14
67 0.15
68 0.16
69 0.19
70 0.22
71 0.24
72 0.23
73 0.22
74 0.22
75 0.27
76 0.27
77 0.25
78 0.22
79 0.23
80 0.23
81 0.23
82 0.21
83 0.16
84 0.16
85 0.15
86 0.15
87 0.12
88 0.12
89 0.13
90 0.15
91 0.16
92 0.2
93 0.26
94 0.32
95 0.4
96 0.5
97 0.56
98 0.56
99 0.59
100 0.6
101 0.6
102 0.59
103 0.58
104 0.53
105 0.51
106 0.53
107 0.49
108 0.43
109 0.38
110 0.35
111 0.3
112 0.26
113 0.23
114 0.2
115 0.2
116 0.21
117 0.19
118 0.17
119 0.16
120 0.14
121 0.13
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.1
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.13
134 0.16
135 0.16
136 0.16
137 0.17
138 0.16
139 0.16
140 0.15
141 0.14
142 0.12
143 0.12
144 0.14
145 0.12
146 0.1
147 0.09
148 0.09
149 0.12
150 0.11
151 0.11
152 0.09
153 0.1
154 0.11
155 0.11
156 0.13
157 0.11
158 0.13
159 0.14
160 0.15
161 0.14
162 0.15
163 0.15
164 0.13
165 0.14
166 0.14
167 0.14
168 0.18
169 0.19
170 0.22
171 0.22
172 0.23
173 0.23
174 0.21
175 0.2
176 0.16
177 0.19
178 0.16
179 0.17
180 0.17
181 0.18
182 0.18
183 0.18
184 0.2
185 0.15
186 0.14
187 0.16
188 0.15
189 0.15
190 0.17
191 0.17
192 0.17
193 0.2
194 0.22
195 0.2
196 0.2
197 0.2
198 0.26
199 0.27
200 0.28
201 0.33
202 0.34
203 0.36
204 0.42
205 0.42
206 0.42
207 0.49
208 0.55
209 0.58
210 0.66
211 0.72
212 0.76
213 0.78
214 0.7
215 0.67
216 0.65
217 0.65
218 0.62
219 0.6
220 0.6
221 0.62
222 0.65
223 0.62
224 0.6
225 0.54
226 0.48
227 0.44
228 0.37
229 0.31
230 0.28
231 0.29
232 0.32
233 0.32
234 0.36
235 0.43
236 0.49
237 0.57
238 0.65
239 0.69
240 0.66
241 0.69
242 0.72
243 0.69
244 0.64
245 0.64
246 0.55
247 0.5
248 0.46
249 0.39
250 0.33
251 0.25
252 0.22
253 0.15
254 0.14
255 0.1
256 0.08
257 0.07
258 0.07
259 0.1
260 0.1
261 0.11
262 0.12
263 0.12
264 0.12
265 0.11
266 0.1
267 0.07
268 0.06
269 0.05
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.05
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.09
282 0.1
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.11
287 0.1
288 0.1
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.04
294 0.05
295 0.04
296 0.06
297 0.05
298 0.06
299 0.05
300 0.06
301 0.06
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.07
309 0.1
310 0.11
311 0.11
312 0.12
313 0.13
314 0.14
315 0.17
316 0.19
317 0.18
318 0.21
319 0.26
320 0.3
321 0.3
322 0.32
323 0.37
324 0.39
325 0.43
326 0.45
327 0.45
328 0.49
329 0.55
330 0.58
331 0.51
332 0.47
333 0.41
334 0.35
335 0.31
336 0.21
337 0.15
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.07
344 0.07
345 0.05
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.03
357 0.03
358 0.02
359 0.03
360 0.04
361 0.04
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.05
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.07
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.1
381 0.11
382 0.15
383 0.16
384 0.19
385 0.22
386 0.25
387 0.28
388 0.28
389 0.32
390 0.3
391 0.3
392 0.29
393 0.24
394 0.2
395 0.17
396 0.16
397 0.12
398 0.12
399 0.11
400 0.09
401 0.09
402 0.11
403 0.14
404 0.14
405 0.14
406 0.14
407 0.14
408 0.14
409 0.13
410 0.12
411 0.08
412 0.08
413 0.07
414 0.07
415 0.1
416 0.17
417 0.22
418 0.27
419 0.37
420 0.46
421 0.55
422 0.65
423 0.72
424 0.76
425 0.83
426 0.88
427 0.89
428 0.88
429 0.82
430 0.75
431 0.69
432 0.63
433 0.58
434 0.55
435 0.55
436 0.57
437 0.64
438 0.67
439 0.72
440 0.76
441 0.8
442 0.81
443 0.75
444 0.73
445 0.66
446 0.59
447 0.52
448 0.44
449 0.34
450 0.26
451 0.22
452 0.13
453 0.11
454 0.1
455 0.09
456 0.09
457 0.1
458 0.09
459 0.09
460 0.09
461 0.09
462 0.08
463 0.08
464 0.1
465 0.08
466 0.1
467 0.17
468 0.25
469 0.35
470 0.46
471 0.55
472 0.59
473 0.7
474 0.79
475 0.84
476 0.87
477 0.87
478 0.88
479 0.87
480 0.84
481 0.77
482 0.73
483 0.65
484 0.57
485 0.48
486 0.41
487 0.39
488 0.36
489 0.31
490 0.29
491 0.28
492 0.26
493 0.28
494 0.28
495 0.22
496 0.26
497 0.3
498 0.35
499 0.37
500 0.38
501 0.38
502 0.37
503 0.4
504 0.38
505 0.4
506 0.35
507 0.33
508 0.36
509 0.39
510 0.39
511 0.37
512 0.36
513 0.29
514 0.25
515 0.23
516 0.18
517 0.12
518 0.11
519 0.09
520 0.08
521 0.08
522 0.08
523 0.08
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.07
529 0.09
530 0.15
531 0.19
532 0.26
533 0.34
534 0.41
535 0.48