Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DJG3

Protein Details
Accession C5DJG3    Localization Confidence High Confidence Score 18.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-78PSNQVAKRPNHNTTRAKRKRRKGKGPWASWSSSHydrophilic
366-393AIYAFSMKPKYRRNPKKRFEGHKCAGYGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-70TTRAKRKRRKGKG
375-383KYRRNPKKR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 6, mito 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR032847  PRPF17  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG lth:KLTH0F16192g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MPLVEGYSSDSDSSSHSHAESNKLPKAVKDQENNDSISVDLTQLEPSNQVAKRPNHNTTRAKRKRRKGKGPWASWSSSEESEEEPGPEVASEAEKESGILLEDEEFQLSRDEKTLSSESTRFYGDSVTDYQGRSFLHPPIEVDIDFTKPELSFRCYLPKKMIHSYRGHHNGTTTIKMLPKSGHLFLSGGNDNKVKLWDVYHKRELLRDYCGHSKAVRDVSFSGSGTSFLSVSYDQHMKIWNTETGDIEHRYKFPAVPNCAEFSPANSNELIVGLSNSEVRHYDLRVAHKDGLVQVYDHHLSSIIALKYFPDGSKFISSSEDKSMRIWDNQVNIPIKQISDTAQYSMPFIDIHPEHHYFATQSMDNAIYAFSMKPKYRRNPKKRFEGHKCAGYGIGFGFSPDGQYLASGDTKGRVYIWDWKTTRLLKHFEVPGKKAVITVAWAPQETSKMLCAGNGGRIFLYD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.17
4 0.21
5 0.24
6 0.31
7 0.36
8 0.41
9 0.43
10 0.46
11 0.46
12 0.44
13 0.51
14 0.54
15 0.55
16 0.56
17 0.58
18 0.61
19 0.64
20 0.62
21 0.53
22 0.44
23 0.35
24 0.27
25 0.21
26 0.14
27 0.11
28 0.1
29 0.11
30 0.11
31 0.12
32 0.12
33 0.13
34 0.21
35 0.21
36 0.26
37 0.32
38 0.38
39 0.48
40 0.55
41 0.62
42 0.62
43 0.71
44 0.76
45 0.77
46 0.82
47 0.83
48 0.86
49 0.88
50 0.9
51 0.92
52 0.93
53 0.94
54 0.94
55 0.94
56 0.94
57 0.92
58 0.9
59 0.85
60 0.76
61 0.66
62 0.59
63 0.52
64 0.42
65 0.36
66 0.28
67 0.23
68 0.23
69 0.22
70 0.19
71 0.16
72 0.15
73 0.14
74 0.12
75 0.11
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.09
85 0.08
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.08
93 0.08
94 0.11
95 0.11
96 0.11
97 0.12
98 0.13
99 0.13
100 0.18
101 0.2
102 0.2
103 0.23
104 0.24
105 0.24
106 0.24
107 0.25
108 0.2
109 0.18
110 0.17
111 0.13
112 0.14
113 0.16
114 0.16
115 0.18
116 0.18
117 0.18
118 0.19
119 0.19
120 0.2
121 0.19
122 0.2
123 0.21
124 0.21
125 0.22
126 0.22
127 0.23
128 0.19
129 0.19
130 0.17
131 0.15
132 0.15
133 0.14
134 0.13
135 0.1
136 0.13
137 0.13
138 0.16
139 0.17
140 0.18
141 0.29
142 0.3
143 0.33
144 0.38
145 0.41
146 0.42
147 0.48
148 0.54
149 0.5
150 0.53
151 0.54
152 0.58
153 0.6
154 0.56
155 0.47
156 0.41
157 0.39
158 0.37
159 0.35
160 0.26
161 0.21
162 0.22
163 0.22
164 0.23
165 0.18
166 0.2
167 0.22
168 0.22
169 0.2
170 0.18
171 0.18
172 0.18
173 0.22
174 0.19
175 0.16
176 0.17
177 0.16
178 0.16
179 0.16
180 0.16
181 0.12
182 0.1
183 0.12
184 0.2
185 0.27
186 0.34
187 0.38
188 0.4
189 0.39
190 0.42
191 0.43
192 0.36
193 0.34
194 0.3
195 0.3
196 0.32
197 0.32
198 0.3
199 0.27
200 0.26
201 0.25
202 0.29
203 0.25
204 0.21
205 0.21
206 0.23
207 0.24
208 0.22
209 0.19
210 0.13
211 0.13
212 0.11
213 0.1
214 0.07
215 0.06
216 0.07
217 0.06
218 0.07
219 0.09
220 0.1
221 0.09
222 0.11
223 0.14
224 0.13
225 0.15
226 0.17
227 0.16
228 0.16
229 0.17
230 0.16
231 0.15
232 0.18
233 0.18
234 0.18
235 0.18
236 0.17
237 0.18
238 0.18
239 0.17
240 0.21
241 0.26
242 0.28
243 0.29
244 0.3
245 0.3
246 0.29
247 0.3
248 0.24
249 0.19
250 0.22
251 0.2
252 0.2
253 0.17
254 0.17
255 0.15
256 0.15
257 0.12
258 0.05
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.09
267 0.11
268 0.11
269 0.16
270 0.19
271 0.25
272 0.28
273 0.31
274 0.31
275 0.3
276 0.3
277 0.26
278 0.24
279 0.18
280 0.14
281 0.11
282 0.14
283 0.14
284 0.13
285 0.11
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.16
290 0.12
291 0.12
292 0.12
293 0.12
294 0.14
295 0.15
296 0.14
297 0.11
298 0.11
299 0.14
300 0.18
301 0.18
302 0.17
303 0.21
304 0.23
305 0.23
306 0.29
307 0.28
308 0.25
309 0.26
310 0.31
311 0.29
312 0.29
313 0.3
314 0.26
315 0.29
316 0.3
317 0.36
318 0.33
319 0.3
320 0.3
321 0.27
322 0.24
323 0.2
324 0.19
325 0.14
326 0.17
327 0.18
328 0.18
329 0.19
330 0.19
331 0.19
332 0.18
333 0.17
334 0.11
335 0.1
336 0.15
337 0.14
338 0.17
339 0.21
340 0.23
341 0.24
342 0.24
343 0.25
344 0.19
345 0.2
346 0.21
347 0.16
348 0.14
349 0.14
350 0.15
351 0.14
352 0.13
353 0.12
354 0.08
355 0.09
356 0.09
357 0.11
358 0.17
359 0.21
360 0.29
361 0.38
362 0.49
363 0.59
364 0.7
365 0.77
366 0.82
367 0.88
368 0.91
369 0.92
370 0.92
371 0.91
372 0.91
373 0.87
374 0.83
375 0.74
376 0.64
377 0.56
378 0.45
379 0.35
380 0.25
381 0.19
382 0.12
383 0.11
384 0.11
385 0.09
386 0.1
387 0.09
388 0.09
389 0.07
390 0.08
391 0.08
392 0.1
393 0.11
394 0.1
395 0.11
396 0.13
397 0.14
398 0.15
399 0.14
400 0.14
401 0.16
402 0.25
403 0.29
404 0.36
405 0.36
406 0.4
407 0.47
408 0.51
409 0.55
410 0.52
411 0.55
412 0.48
413 0.55
414 0.59
415 0.61
416 0.62
417 0.58
418 0.57
419 0.54
420 0.5
421 0.43
422 0.36
423 0.29
424 0.25
425 0.25
426 0.24
427 0.24
428 0.24
429 0.24
430 0.25
431 0.26
432 0.24
433 0.23
434 0.19
435 0.19
436 0.19
437 0.18
438 0.2
439 0.2
440 0.26
441 0.26
442 0.25