Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550C3K6

Protein Details
Accession A0A550C3K6    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
464-484EDETKPKKSERKPPVQPKANGBasic
1046-1071EDSDDDKPKKKKVNGTAKKPVPNGKSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
468-498KPKKSERKPPVQPKANGSPAKNKTVAGKVLR
1052-1075KPKKKKVNGTAKKPVPNGKSKGRR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029149  Creatin/AminoP/Spt16_NTD  
IPR036005  Creatinase/aminopeptidase-like  
IPR029148  FACT-Spt16_Nlobe  
IPR013953  FACT_Spt16  
IPR000994  Pept_M24  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR013719  RTT106/SPT16-like_middle_dom  
IPR040258  Spt16  
Gene Ontology GO:0035101  C:FACT complex  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF14826  FACT-Spt16_Nlob  
PF00557  Peptidase_M24  
PF08512  Rtt106  
PF08644  SPT16  
Amino Acid Sequences MPVELNKKLFNSHLRRLLDAWNDANPNNEYSTIAGVDAILLMAGDGEDDNFTKGMSFQQWLLVYEFPSTLIFFEKDKVTFLCSASKAKILSQLEKNAPVPIEILAQPKPKDPPNDSLSKFVERFASKERVGTLLKEQPSGKLIAEWNKALEGAASKPELVDISHTISAVLSTKDAEEMKAVTTAAALTSTLLRYHVATKLEMILDKEAKISHEAFASQIETRLGSGEGDNAKGPDMKVWNKGKGIQDVDFGLVDFCYPPVVISKSSSSGYDIRFSAVSTNDNIAHNGVLLVAFALRYRGYAANVGRTWIVDPTPEQEAQYNLLLSLQTELLSKIGDGVVAKDVYQHALDYVRDKSPDLEKHFVKNIGFSMGIELRDATFLLSSKNNRTIHSSMVFNLALGFTDLTDKNGRSKPPLIIVWKLGTNTRRYALQLADTIKVDGSRSVLLTDALRSAKDVLLFLNAEEDETKPKKSERKPPVQPKANGSPAKNKTVAGKVLRNQRRAKQEEDQSHLQRFIDHQRELHQKIQDEGLERYTDGAGGKKNEDKTWKKFQSYKGELALPPDVERLRVFVDRKAQTVILPINGFAVPFHINTIKNVSKNDEGDLTYLRINFQTPGQLAGKKEDTPFENPDATFVRSVSFRSPDGARFDNLQKQITDLKKEANKREQQRKQLADVIDQDKLVEIKGRRPIRTSDMFVRPALDGKRLPGDVEIHQNGVRFVSAIGQRIDILFNNVKHLFFQPCDHELLVIIHFHLKAPIMVGKRKATDIQFFREATDVQFDETGNRKRKHRYGDEDEIEQEQQERKRRQTLNKEVKGFAEKIADAAAASIEDTFELDIPFRELSFEGVPFRSGVRLQPTTECLVHLTDPPFLVVTLSEIEIASLERVQYGLKQFDLVFIFHDYTKTPLHINSISTSQIDDVKNWLDSVDIPMSEGPVNLNWGQIMKHINEDPHEFFLQGGWVFLGGPEGAQADGSSGEDDTESEFEEESAFEESDSASASDFSEDASASEASGSFSGSDVSDEGDDWDELERKAAKSDKKRLEQAAEDSDDDKPKKKKVNGTAKKPVPNGKSKGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.57
3 0.57
4 0.58
5 0.54
6 0.5
7 0.44
8 0.41
9 0.42
10 0.39
11 0.41
12 0.35
13 0.31
14 0.27
15 0.25
16 0.21
17 0.19
18 0.21
19 0.16
20 0.15
21 0.12
22 0.1
23 0.1
24 0.09
25 0.07
26 0.04
27 0.03
28 0.03
29 0.03
30 0.03
31 0.03
32 0.03
33 0.04
34 0.06
35 0.06
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.09
41 0.13
42 0.16
43 0.17
44 0.16
45 0.22
46 0.24
47 0.26
48 0.27
49 0.24
50 0.22
51 0.22
52 0.21
53 0.16
54 0.15
55 0.14
56 0.12
57 0.14
58 0.14
59 0.14
60 0.18
61 0.2
62 0.2
63 0.23
64 0.23
65 0.23
66 0.25
67 0.26
68 0.3
69 0.29
70 0.33
71 0.32
72 0.35
73 0.32
74 0.31
75 0.38
76 0.35
77 0.4
78 0.42
79 0.48
80 0.49
81 0.53
82 0.52
83 0.47
84 0.42
85 0.35
86 0.29
87 0.21
88 0.21
89 0.18
90 0.21
91 0.23
92 0.29
93 0.3
94 0.33
95 0.38
96 0.4
97 0.46
98 0.48
99 0.51
100 0.51
101 0.59
102 0.57
103 0.58
104 0.56
105 0.55
106 0.5
107 0.44
108 0.45
109 0.37
110 0.38
111 0.38
112 0.42
113 0.35
114 0.37
115 0.37
116 0.34
117 0.35
118 0.34
119 0.34
120 0.34
121 0.35
122 0.37
123 0.36
124 0.33
125 0.34
126 0.33
127 0.27
128 0.23
129 0.26
130 0.3
131 0.34
132 0.32
133 0.31
134 0.29
135 0.29
136 0.24
137 0.21
138 0.15
139 0.12
140 0.15
141 0.15
142 0.14
143 0.14
144 0.15
145 0.14
146 0.12
147 0.13
148 0.12
149 0.16
150 0.17
151 0.17
152 0.16
153 0.15
154 0.16
155 0.15
156 0.13
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.12
161 0.13
162 0.13
163 0.12
164 0.12
165 0.13
166 0.14
167 0.13
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.08
172 0.07
173 0.06
174 0.05
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.1
180 0.11
181 0.14
182 0.17
183 0.18
184 0.17
185 0.18
186 0.2
187 0.21
188 0.21
189 0.2
190 0.21
191 0.2
192 0.2
193 0.2
194 0.18
195 0.18
196 0.2
197 0.19
198 0.16
199 0.15
200 0.15
201 0.15
202 0.15
203 0.16
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.11
209 0.12
210 0.11
211 0.09
212 0.09
213 0.13
214 0.13
215 0.14
216 0.15
217 0.14
218 0.15
219 0.16
220 0.16
221 0.15
222 0.21
223 0.23
224 0.32
225 0.37
226 0.41
227 0.41
228 0.47
229 0.47
230 0.48
231 0.48
232 0.4
233 0.36
234 0.32
235 0.31
236 0.25
237 0.21
238 0.14
239 0.1
240 0.09
241 0.07
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.09
247 0.11
248 0.12
249 0.15
250 0.17
251 0.19
252 0.2
253 0.2
254 0.2
255 0.22
256 0.23
257 0.24
258 0.22
259 0.2
260 0.2
261 0.2
262 0.19
263 0.16
264 0.16
265 0.14
266 0.16
267 0.17
268 0.18
269 0.18
270 0.16
271 0.14
272 0.13
273 0.11
274 0.08
275 0.06
276 0.05
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.08
285 0.09
286 0.11
287 0.16
288 0.17
289 0.23
290 0.23
291 0.24
292 0.22
293 0.21
294 0.2
295 0.16
296 0.15
297 0.09
298 0.1
299 0.12
300 0.15
301 0.15
302 0.15
303 0.15
304 0.16
305 0.17
306 0.17
307 0.14
308 0.11
309 0.11
310 0.1
311 0.09
312 0.09
313 0.07
314 0.06
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.1
330 0.11
331 0.11
332 0.1
333 0.08
334 0.1
335 0.11
336 0.12
337 0.15
338 0.15
339 0.16
340 0.16
341 0.18
342 0.24
343 0.3
344 0.34
345 0.38
346 0.38
347 0.41
348 0.45
349 0.45
350 0.38
351 0.33
352 0.27
353 0.22
354 0.2
355 0.16
356 0.16
357 0.14
358 0.14
359 0.13
360 0.12
361 0.1
362 0.1
363 0.1
364 0.07
365 0.06
366 0.06
367 0.08
368 0.12
369 0.14
370 0.18
371 0.27
372 0.28
373 0.28
374 0.35
375 0.34
376 0.35
377 0.34
378 0.31
379 0.24
380 0.26
381 0.25
382 0.18
383 0.17
384 0.12
385 0.09
386 0.09
387 0.08
388 0.04
389 0.08
390 0.08
391 0.1
392 0.13
393 0.13
394 0.19
395 0.23
396 0.24
397 0.25
398 0.28
399 0.28
400 0.3
401 0.34
402 0.32
403 0.3
404 0.31
405 0.28
406 0.26
407 0.25
408 0.24
409 0.23
410 0.22
411 0.22
412 0.21
413 0.21
414 0.21
415 0.23
416 0.2
417 0.19
418 0.2
419 0.19
420 0.2
421 0.19
422 0.18
423 0.15
424 0.15
425 0.13
426 0.09
427 0.09
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.09
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.1
440 0.1
441 0.1
442 0.1
443 0.08
444 0.09
445 0.1
446 0.09
447 0.09
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.13
453 0.14
454 0.15
455 0.15
456 0.19
457 0.28
458 0.35
459 0.45
460 0.48
461 0.58
462 0.67
463 0.77
464 0.83
465 0.83
466 0.79
467 0.74
468 0.72
469 0.7
470 0.63
471 0.55
472 0.54
473 0.49
474 0.5
475 0.45
476 0.38
477 0.33
478 0.33
479 0.36
480 0.3
481 0.32
482 0.32
483 0.42
484 0.47
485 0.51
486 0.52
487 0.53
488 0.59
489 0.58
490 0.58
491 0.55
492 0.57
493 0.55
494 0.56
495 0.56
496 0.5
497 0.47
498 0.43
499 0.35
500 0.28
501 0.25
502 0.27
503 0.26
504 0.24
505 0.23
506 0.29
507 0.36
508 0.39
509 0.41
510 0.36
511 0.3
512 0.31
513 0.32
514 0.27
515 0.22
516 0.2
517 0.16
518 0.14
519 0.13
520 0.13
521 0.11
522 0.1
523 0.08
524 0.09
525 0.09
526 0.1
527 0.12
528 0.15
529 0.17
530 0.19
531 0.27
532 0.31
533 0.36
534 0.46
535 0.49
536 0.49
537 0.54
538 0.59
539 0.61
540 0.6
541 0.57
542 0.48
543 0.46
544 0.42
545 0.39
546 0.33
547 0.22
548 0.17
549 0.16
550 0.14
551 0.12
552 0.12
553 0.1
554 0.11
555 0.15
556 0.16
557 0.16
558 0.25
559 0.25
560 0.26
561 0.26
562 0.24
563 0.21
564 0.23
565 0.21
566 0.14
567 0.13
568 0.12
569 0.12
570 0.11
571 0.11
572 0.07
573 0.09
574 0.08
575 0.08
576 0.09
577 0.11
578 0.11
579 0.12
580 0.19
581 0.2
582 0.2
583 0.21
584 0.24
585 0.24
586 0.24
587 0.25
588 0.2
589 0.18
590 0.17
591 0.17
592 0.15
593 0.13
594 0.12
595 0.11
596 0.1
597 0.1
598 0.1
599 0.09
600 0.11
601 0.1
602 0.14
603 0.15
604 0.17
605 0.17
606 0.2
607 0.22
608 0.2
609 0.21
610 0.2
611 0.21
612 0.23
613 0.25
614 0.24
615 0.25
616 0.22
617 0.24
618 0.24
619 0.22
620 0.18
621 0.15
622 0.14
623 0.12
624 0.14
625 0.14
626 0.14
627 0.13
628 0.15
629 0.16
630 0.18
631 0.23
632 0.23
633 0.21
634 0.22
635 0.25
636 0.29
637 0.3
638 0.28
639 0.23
640 0.24
641 0.3
642 0.3
643 0.3
644 0.25
645 0.29
646 0.33
647 0.4
648 0.45
649 0.48
650 0.53
651 0.58
652 0.68
653 0.7
654 0.74
655 0.77
656 0.72
657 0.67
658 0.64
659 0.56
660 0.49
661 0.47
662 0.4
663 0.32
664 0.28
665 0.24
666 0.19
667 0.18
668 0.14
669 0.13
670 0.12
671 0.16
672 0.25
673 0.3
674 0.31
675 0.34
676 0.37
677 0.39
678 0.43
679 0.43
680 0.42
681 0.43
682 0.43
683 0.41
684 0.39
685 0.32
686 0.31
687 0.28
688 0.24
689 0.18
690 0.18
691 0.22
692 0.2
693 0.2
694 0.18
695 0.19
696 0.17
697 0.24
698 0.23
699 0.21
700 0.22
701 0.22
702 0.2
703 0.18
704 0.16
705 0.08
706 0.08
707 0.11
708 0.12
709 0.15
710 0.15
711 0.15
712 0.16
713 0.16
714 0.17
715 0.12
716 0.15
717 0.16
718 0.16
719 0.21
720 0.21
721 0.21
722 0.21
723 0.24
724 0.22
725 0.19
726 0.22
727 0.21
728 0.23
729 0.25
730 0.23
731 0.2
732 0.18
733 0.18
734 0.16
735 0.12
736 0.1
737 0.1
738 0.1
739 0.1
740 0.1
741 0.09
742 0.08
743 0.1
744 0.14
745 0.16
746 0.2
747 0.25
748 0.27
749 0.28
750 0.3
751 0.33
752 0.32
753 0.36
754 0.36
755 0.38
756 0.39
757 0.38
758 0.37
759 0.34
760 0.31
761 0.23
762 0.24
763 0.18
764 0.14
765 0.15
766 0.14
767 0.16
768 0.23
769 0.3
770 0.35
771 0.39
772 0.44
773 0.51
774 0.58
775 0.65
776 0.67
777 0.69
778 0.69
779 0.75
780 0.72
781 0.66
782 0.61
783 0.53
784 0.43
785 0.33
786 0.27
787 0.22
788 0.24
789 0.31
790 0.36
791 0.39
792 0.48
793 0.56
794 0.64
795 0.7
796 0.75
797 0.77
798 0.79
799 0.78
800 0.7
801 0.65
802 0.6
803 0.5
804 0.41
805 0.33
806 0.25
807 0.21
808 0.2
809 0.17
810 0.12
811 0.11
812 0.08
813 0.05
814 0.05
815 0.04
816 0.04
817 0.04
818 0.04
819 0.04
820 0.05
821 0.05
822 0.06
823 0.06
824 0.08
825 0.09
826 0.08
827 0.1
828 0.09
829 0.12
830 0.13
831 0.14
832 0.15
833 0.15
834 0.16
835 0.15
836 0.15
837 0.14
838 0.14
839 0.16
840 0.21
841 0.24
842 0.25
843 0.28
844 0.3
845 0.32
846 0.32
847 0.28
848 0.22
849 0.21
850 0.2
851 0.22
852 0.2
853 0.18
854 0.18
855 0.18
856 0.17
857 0.15
858 0.14
859 0.09
860 0.09
861 0.08
862 0.09
863 0.09
864 0.08
865 0.08
866 0.08
867 0.08
868 0.07
869 0.07
870 0.07
871 0.06
872 0.07
873 0.07
874 0.11
875 0.15
876 0.17
877 0.16
878 0.18
879 0.18
880 0.22
881 0.24
882 0.2
883 0.17
884 0.17
885 0.19
886 0.17
887 0.18
888 0.14
889 0.16
890 0.18
891 0.17
892 0.17
893 0.17
894 0.22
895 0.23
896 0.25
897 0.24
898 0.24
899 0.24
900 0.23
901 0.22
902 0.17
903 0.21
904 0.2
905 0.19
906 0.2
907 0.2
908 0.21
909 0.2
910 0.18
911 0.13
912 0.13
913 0.17
914 0.16
915 0.14
916 0.14
917 0.15
918 0.16
919 0.16
920 0.15
921 0.12
922 0.1
923 0.14
924 0.13
925 0.14
926 0.12
927 0.13
928 0.13
929 0.15
930 0.19
931 0.16
932 0.21
933 0.23
934 0.25
935 0.27
936 0.33
937 0.32
938 0.33
939 0.32
940 0.27
941 0.25
942 0.23
943 0.23
944 0.17
945 0.14
946 0.09
947 0.09
948 0.09
949 0.09
950 0.09
951 0.06
952 0.06
953 0.06
954 0.06
955 0.06
956 0.06
957 0.06
958 0.06
959 0.06
960 0.07
961 0.07
962 0.07
963 0.07
964 0.07
965 0.08
966 0.09
967 0.09
968 0.1
969 0.1
970 0.1
971 0.1
972 0.11
973 0.1
974 0.1
975 0.12
976 0.1
977 0.09
978 0.09
979 0.1
980 0.09
981 0.11
982 0.09
983 0.07
984 0.08
985 0.08
986 0.09
987 0.09
988 0.09
989 0.09
990 0.09
991 0.08
992 0.11
993 0.1
994 0.09
995 0.1
996 0.09
997 0.1
998 0.1
999 0.1
1000 0.08
1001 0.08
1002 0.09
1003 0.08
1004 0.09
1005 0.08
1006 0.1
1007 0.09
1008 0.1
1009 0.11
1010 0.12
1011 0.12
1012 0.11
1013 0.14
1014 0.15
1015 0.15
1016 0.2
1017 0.22
1018 0.21
1019 0.27
1020 0.34
1021 0.4
1022 0.48
1023 0.59
1024 0.65
1025 0.7
1026 0.77
1027 0.78
1028 0.78
1029 0.75
1030 0.71
1031 0.68
1032 0.61
1033 0.54
1034 0.48
1035 0.45
1036 0.46
1037 0.42
1038 0.43
1039 0.42
1040 0.47
1041 0.55
1042 0.62
1043 0.68
1044 0.71
1045 0.8
1046 0.82
1047 0.86
1048 0.88
1049 0.87
1050 0.87
1051 0.84
1052 0.82
1053 0.79
1054 0.78
1055 0.76