FuNGI

A0A550BTB0

Protein Details

Accession

A0A550BTB0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
229-251	GKVVFPLKIKPKKENRSGKGPIT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
238-242	KPKKE

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MPFYSRDDRLPADGDKFYYENTIPSQTYDGSISDLLEPPSSLGSSTAVSQFSDSTNRRGVKIPALESPSPLAKKRKQEDGPDEEPEMLWRSAKTVKVEEDSPTLASTVNDNVVVLAWAPRVQHMVDKYDLSIGVQWEITRLLSTNHITYNDLTPEKLSALRGPNADAAQRAARILLNVPEQAESDDTAFAQEKSLLSPWAELDTEIETLKLDPDAGLGNSTVKPGWYGGKVVFPLKIKPKKENRSGKGPITGYQIVLDHATLSSSTRFARKSGSAAFIRVKIAMDILRSNASMMIDLFLKPFVLWDRVFRAFFAKDDNVFLFCTNETMDESGMLRTIDNGRQSLLEFVEFHNPLREGDKQLLCKWASRMALGLSNSVPGPRIDPRDIFETPDIVSTDGTNSDLTDGCGLCNKTLPMMIYHQLALEGVPAAIQFRLGGMKGLLLQQPQSTISDRPQVTYRPSQLKIRGQPEHPSHLTIDLLRTSRMRTSVSISAEVIRNLEDNGVPRRALADLFRARITEVMEGLTDWEGSNAMLKLWATLERLGGVHNQRRAIEAGGEARARGLGGGFDRPNADEDGDDNEPDESGFDPGLQQRSRAWDPDEESGCPSGLEETMISLLASGFTPNNSSICRAKLQAIYLSRARILTSRIKFTVPQSASAFVVPDPCGVLGPNEIHIKASRPALKMEDGLEADIVVGDVLITRNPCKVPSDVRKVRAVDHPELAGYVDVIVVSAHPSAQRLLELLAGGKLDSSFTLTLSNYSRVIISSGDYDGDTCIVIWDQQIVAPFKNSDIKYATPPAGMLQRQFTRDNTTVDKFIQTHNAVQDNERKVAEIQRYLLSNLRDMTQLGMYSSFHENAIITYGYSNPRTVRLAHMFNTLMDSAKTGYSLTRAAWQDDFHKHFHKVGPKYRELASTRRRKKLEHPSDEYVTRSERSPYHRNSKEIMDYFVNVAKEEYDKLCIQMDEKFKALHFGDYENGIPPDKDLAQPWFAAEERAITCPSLAKDLRAIAAHVNRVYDERKAVQTDKRIEERQDQLRALSKKFASGPPLEAMQVIFDEAQIRRLAASYAYVHDWKKKRTFANSIGGDGWSRFPWDVAFRELCHIKAQCAVGHSQTVTMFFFNHLRMVKT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.32
3	0.3
4	0.27
5	0.28
6	0.25
7	0.23
8	0.24
9	0.28
10	0.25
11	0.26
12	0.28
13	0.24
14	0.25
15	0.24
16	0.2
17	0.18
18	0.18
19	0.17
20	0.17
21	0.19
22	0.18
23	0.17
24	0.17
25	0.15
26	0.16
27	0.15
28	0.12
29	0.11
30	0.11
31	0.11
32	0.13
33	0.16
34	0.15
35	0.15
36	0.16
37	0.16
38	0.17
39	0.25
40	0.26
41	0.28
42	0.35
43	0.37
44	0.38
45	0.42
46	0.43
47	0.43
48	0.47
49	0.45
50	0.44
51	0.49
52	0.47
53	0.44
54	0.44
55	0.43
56	0.4
57	0.43
58	0.46
59	0.47
60	0.56
61	0.61
62	0.68
63	0.68
64	0.74
65	0.78
66	0.77
67	0.75
68	0.69
69	0.64
70	0.54
71	0.46
72	0.38
73	0.33
74	0.25
75	0.21
76	0.16
77	0.19
78	0.23
79	0.27
80	0.3
81	0.31
82	0.35
83	0.38
84	0.4
85	0.39
86	0.38
87	0.35
88	0.31
89	0.26
90	0.22
91	0.18
92	0.17
93	0.15
94	0.14
95	0.14
96	0.13
97	0.12
98	0.12
99	0.11
100	0.11
101	0.09
102	0.09
103	0.08
104	0.1
105	0.1
106	0.12
107	0.14
108	0.14
109	0.19
110	0.21
111	0.24
112	0.25
113	0.26
114	0.25
115	0.25
116	0.24
117	0.2
118	0.2
119	0.16
120	0.15
121	0.14
122	0.13
123	0.12
124	0.13
125	0.13
126	0.1
127	0.1
128	0.1
129	0.15
130	0.18
131	0.19
132	0.21
133	0.22
134	0.24
135	0.25
136	0.28
137	0.28
138	0.27
139	0.24
140	0.22
141	0.22
142	0.22
143	0.22
144	0.19
145	0.19
146	0.24
147	0.28
148	0.28
149	0.29
150	0.31
151	0.3
152	0.3
153	0.25
154	0.23
155	0.21
156	0.21
157	0.18
158	0.16
159	0.15
160	0.15
161	0.16
162	0.17
163	0.18
164	0.18
165	0.19
166	0.18
167	0.18
168	0.18
169	0.17
170	0.14
171	0.12
172	0.11
173	0.1
174	0.12
175	0.12
176	0.11
177	0.11
178	0.12
179	0.11
180	0.14
181	0.15
182	0.15
183	0.14
184	0.15
185	0.15
186	0.15
187	0.15
188	0.13
189	0.13
190	0.13
191	0.13
192	0.12
193	0.11
194	0.09
195	0.09
196	0.1
197	0.09
198	0.07
199	0.06
200	0.07
201	0.09
202	0.08
203	0.09
204	0.09
205	0.11
206	0.11
207	0.12
208	0.11
209	0.1
210	0.1
211	0.11
212	0.14
213	0.13
214	0.15
215	0.16
216	0.2
217	0.22
218	0.22
219	0.25
220	0.23
221	0.29
222	0.37
223	0.44
224	0.44
225	0.52
226	0.62
227	0.68
228	0.76
229	0.8
230	0.76
231	0.78
232	0.8
233	0.74
234	0.71
235	0.63
236	0.55
237	0.52
238	0.47
239	0.37
240	0.31
241	0.27
242	0.2
243	0.19
244	0.16
245	0.09
246	0.08
247	0.08
248	0.07
249	0.08
250	0.08
251	0.09
252	0.11
253	0.15
254	0.16
255	0.17
256	0.22
257	0.22
258	0.26
259	0.28
260	0.33
261	0.3
262	0.33
263	0.35
264	0.32
265	0.31
266	0.27
267	0.23
268	0.17
269	0.17
270	0.15
271	0.14
272	0.13
273	0.13
274	0.14
275	0.14
276	0.14
277	0.13
278	0.12
279	0.1
280	0.09
281	0.09
282	0.08
283	0.09
284	0.09
285	0.08
286	0.08
287	0.07
288	0.08
289	0.1
290	0.13
291	0.13
292	0.16
293	0.22
294	0.25
295	0.26
296	0.25
297	0.27
298	0.23
299	0.23
300	0.26
301	0.24
302	0.21
303	0.23
304	0.23
305	0.2
306	0.2
307	0.19
308	0.15
309	0.12
310	0.12
311	0.1
312	0.09
313	0.09
314	0.09
315	0.09
316	0.09
317	0.09
318	0.09
319	0.09
320	0.08
321	0.07
322	0.09
323	0.12
324	0.14
325	0.16
326	0.16
327	0.16
328	0.16
329	0.17
330	0.17
331	0.14
332	0.12
333	0.11
334	0.12
335	0.18
336	0.18
337	0.18
338	0.19
339	0.19
340	0.19
341	0.21
342	0.23
343	0.19
344	0.25
345	0.29
346	0.29
347	0.3
348	0.36
349	0.33
350	0.33
351	0.32
352	0.31
353	0.27
354	0.24
355	0.23
356	0.18
357	0.22
358	0.2
359	0.19
360	0.14
361	0.14
362	0.14
363	0.13
364	0.12
365	0.08
366	0.11
367	0.14
368	0.19
369	0.21
370	0.22
371	0.24
372	0.29
373	0.29
374	0.29
375	0.25
376	0.21
377	0.19
378	0.2
379	0.18
380	0.12
381	0.12
382	0.09
383	0.1
384	0.09
385	0.09
386	0.07
387	0.07
388	0.07
389	0.08
390	0.08
391	0.09
392	0.08
393	0.08
394	0.12
395	0.12
396	0.11
397	0.13
398	0.13
399	0.11
400	0.13
401	0.13
402	0.11
403	0.14
404	0.15
405	0.14
406	0.14
407	0.14
408	0.12
409	0.12
410	0.1
411	0.07
412	0.05
413	0.04
414	0.04
415	0.04
416	0.04
417	0.04
418	0.04
419	0.04
420	0.04
421	0.05
422	0.05
423	0.06
424	0.05
425	0.06
426	0.07
427	0.09
428	0.1
429	0.1
430	0.11
431	0.1
432	0.11
433	0.12
434	0.13
435	0.12
436	0.12
437	0.14
438	0.21
439	0.21
440	0.22
441	0.23
442	0.24
443	0.27
444	0.31
445	0.35
446	0.34
447	0.36
448	0.4
449	0.44
450	0.5
451	0.52
452	0.53
453	0.52
454	0.47
455	0.53
456	0.51
457	0.51
458	0.44
459	0.39
460	0.32
461	0.28
462	0.27
463	0.19
464	0.17
465	0.13
466	0.13
467	0.12
468	0.13
469	0.13
470	0.14
471	0.15
472	0.15
473	0.14
474	0.18
475	0.21
476	0.22
477	0.22
478	0.21
479	0.21
480	0.21
481	0.2
482	0.15
483	0.11
484	0.09
485	0.08
486	0.09
487	0.07
488	0.09
489	0.12
490	0.13
491	0.13
492	0.12
493	0.13
494	0.13
495	0.13
496	0.11
497	0.16
498	0.17
499	0.19
500	0.19
501	0.19
502	0.18
503	0.19
504	0.19
505	0.12
506	0.09
507	0.08
508	0.08
509	0.07
510	0.08
511	0.07
512	0.06
513	0.05
514	0.05
515	0.04
516	0.04
517	0.06
518	0.05
519	0.05
520	0.05
521	0.05
522	0.06
523	0.06
524	0.08
525	0.07
526	0.08
527	0.08
528	0.08
529	0.08
530	0.09
531	0.12
532	0.16
533	0.19
534	0.2
535	0.22
536	0.21
537	0.23
538	0.23
539	0.19
540	0.15
541	0.12
542	0.11
543	0.12
544	0.12
545	0.1
546	0.09
547	0.08
548	0.08
549	0.06
550	0.05
551	0.04
552	0.04
553	0.08
554	0.08
555	0.09
556	0.09
557	0.1
558	0.11
559	0.11
560	0.1
561	0.07
562	0.08
563	0.11
564	0.11
565	0.11
566	0.1
567	0.09
568	0.09
569	0.08
570	0.08
571	0.04
572	0.05
573	0.05
574	0.04
575	0.06
576	0.08
577	0.13
578	0.13
579	0.13
580	0.14
581	0.2
582	0.21
583	0.22
584	0.22
585	0.2
586	0.23
587	0.28
588	0.29
589	0.23
590	0.23
591	0.21
592	0.19
593	0.16
594	0.13
595	0.08
596	0.06
597	0.06
598	0.05
599	0.04
600	0.05
601	0.05
602	0.04
603	0.04
604	0.04
605	0.04
606	0.04
607	0.04
608	0.04
609	0.04
610	0.06
611	0.06
612	0.08
613	0.08
614	0.11
615	0.12
616	0.14
617	0.16
618	0.15
619	0.18
620	0.19
621	0.2
622	0.23
623	0.23
624	0.24
625	0.24
626	0.24
627	0.21
628	0.19
629	0.18
630	0.14
631	0.17
632	0.22
633	0.23
634	0.26
635	0.26
636	0.27
637	0.28
638	0.29
639	0.34
640	0.26
641	0.28
642	0.25
643	0.25
644	0.25
645	0.23
646	0.22
647	0.12
648	0.14
649	0.1
650	0.09
651	0.08
652	0.07
653	0.07
654	0.07
655	0.07
656	0.07
657	0.07
658	0.1
659	0.11
660	0.11
661	0.12
662	0.12
663	0.14
664	0.15
665	0.2
666	0.22
667	0.22
668	0.24
669	0.25
670	0.26
671	0.25
672	0.24
673	0.21
674	0.16
675	0.15
676	0.13
677	0.1
678	0.09
679	0.07
680	0.06
681	0.03
682	0.02
683	0.02
684	0.03
685	0.03
686	0.04
687	0.05
688	0.06
689	0.09
690	0.09
691	0.11
692	0.13
693	0.16
694	0.24
695	0.32
696	0.42
697	0.46
698	0.49
699	0.54
700	0.53
701	0.53
702	0.51
703	0.48
704	0.4
705	0.36
706	0.32
707	0.27
708	0.26
709	0.22
710	0.15
711	0.09
712	0.06
713	0.04
714	0.04
715	0.04
716	0.03
717	0.03
718	0.04
719	0.04
720	0.05
721	0.05
722	0.06
723	0.07
724	0.07
725	0.07
726	0.07
727	0.07
728	0.08
729	0.08
730	0.07
731	0.07
732	0.07
733	0.06
734	0.06
735	0.05
736	0.05
737	0.05
738	0.07
739	0.07
740	0.07
741	0.09
742	0.09
743	0.12
744	0.14
745	0.16
746	0.14
747	0.14
748	0.14
749	0.12
750	0.13
751	0.11
752	0.09
753	0.09
754	0.09
755	0.09
756	0.09
757	0.09
758	0.08
759	0.08
760	0.07
761	0.05
762	0.05
763	0.05
764	0.05
765	0.05
766	0.06
767	0.05
768	0.07
769	0.11
770	0.12
771	0.12
772	0.13
773	0.13
774	0.15
775	0.22
776	0.21
777	0.21
778	0.22
779	0.24
780	0.27
781	0.3
782	0.3
783	0.22
784	0.22
785	0.21
786	0.24
787	0.23
788	0.2
789	0.22
790	0.25
791	0.28
792	0.3
793	0.29
794	0.31
795	0.33
796	0.35
797	0.34
798	0.34
799	0.32
800	0.31
801	0.33
802	0.26
803	0.25
804	0.29
805	0.25
806	0.26
807	0.27
808	0.31
809	0.29
810	0.31
811	0.37
812	0.33
813	0.34
814	0.31
815	0.28
816	0.25
817	0.3
818	0.32
819	0.27
820	0.26
821	0.26
822	0.27
823	0.27
824	0.3
825	0.25
826	0.23
827	0.21
828	0.19
829	0.17
830	0.16
831	0.17
832	0.14
833	0.13
834	0.11
835	0.11
836	0.1
837	0.13
838	0.15
839	0.14
840	0.12
841	0.13
842	0.12
843	0.11
844	0.13
845	0.11
846	0.08
847	0.08
848	0.11
849	0.14
850	0.15
851	0.17
852	0.16
853	0.19
854	0.21
855	0.21
856	0.26
857	0.29
858	0.32
859	0.31
860	0.35
861	0.32
862	0.31
863	0.32
864	0.25
865	0.19
866	0.15
867	0.14
868	0.11
869	0.11
870	0.11
871	0.08
872	0.09
873	0.1
874	0.11
875	0.11
876	0.17
877	0.19
878	0.21
879	0.22
880	0.23
881	0.27
882	0.34
883	0.37
884	0.34
885	0.37
886	0.36
887	0.39
888	0.43
889	0.46
890	0.47
891	0.53
892	0.57
893	0.57
894	0.58
895	0.57
896	0.59
897	0.53
898	0.54
899	0.55
900	0.58
901	0.63
902	0.69
903	0.69
904	0.66
905	0.72
906	0.74
907	0.75
908	0.74
909	0.72
910	0.7
911	0.72
912	0.69
913	0.61
914	0.52
915	0.44
916	0.35
917	0.29
918	0.26
919	0.26
920	0.32
921	0.4
922	0.46
923	0.53
924	0.58
925	0.6
926	0.6
927	0.6
928	0.62
929	0.54
930	0.5
931	0.41
932	0.36
933	0.35
934	0.35
935	0.29
936	0.2
937	0.19
938	0.16
939	0.15
940	0.17
941	0.16
942	0.17
943	0.17
944	0.18
945	0.2
946	0.2
947	0.19
948	0.23
949	0.28
950	0.27
951	0.28
952	0.27
953	0.25
954	0.31
955	0.3
956	0.28
957	0.23
958	0.22
959	0.22
960	0.23
961	0.24
962	0.21
963	0.21
964	0.18
965	0.17
966	0.15
967	0.18
968	0.17
969	0.18
970	0.18
971	0.21
972	0.22
973	0.23
974	0.22
975	0.21
976	0.2
977	0.19
978	0.16
979	0.17
980	0.16
981	0.19
982	0.19
983	0.16
984	0.16
985	0.19
986	0.2
987	0.23
988	0.22
989	0.22
990	0.24
991	0.26
992	0.28
993	0.25
994	0.25
995	0.24
996	0.28
997	0.31
998	0.29
999	0.28
1000	0.26
1001	0.29
1002	0.3
1003	0.26
1004	0.26
1005	0.26
1006	0.29
1007	0.34
1008	0.38
1009	0.41
1010	0.48
1011	0.53
1012	0.56
1013	0.6
1014	0.6
1015	0.6
1016	0.63
1017	0.65
1018	0.64
1019	0.62
1020	0.56
1021	0.51
1022	0.55
1023	0.55
1024	0.49
1025	0.48
1026	0.41
1027	0.39
1028	0.42
1029	0.43
1030	0.4
1031	0.39
1032	0.4
1033	0.35
1034	0.36
1035	0.31
1036	0.27
1037	0.23
1038	0.18
1039	0.15
1040	0.12
1041	0.09
1042	0.08
1043	0.12
1044	0.12
1045	0.15
1046	0.15
1047	0.15
1048	0.14
1049	0.15
1050	0.15
1051	0.12
1052	0.16
1053	0.15
1054	0.17
1055	0.21
1056	0.25
1057	0.28
1058	0.36
1059	0.43
1060	0.48
1061	0.54
1062	0.59
1063	0.63
1064	0.67
1065	0.74
1066	0.73
1067	0.76
1068	0.7
1069	0.64
1070	0.57
1071	0.5
1072	0.42
1073	0.34
1074	0.29
1075	0.19
1076	0.19
1077	0.16
1078	0.16
1079	0.18
1080	0.22
1081	0.24
1082	0.28
1083	0.3
1084	0.29
1085	0.36
1086	0.38
1087	0.36
1088	0.38
1089	0.36
1090	0.31
1091	0.34
1092	0.35
1093	0.3
1094	0.3
1095	0.32
1096	0.27
1097	0.3
1098	0.28
1099	0.25
1100	0.23
1101	0.23
1102	0.22
1103	0.2
1104	0.18
1105	0.17
1106	0.2
1107	0.19
1108	0.24

A0A550BTB0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer