Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550C5L2

Protein Details
Accession A0A550C5L2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-35MSSKEKKSYEKKSYEKKKNKTRAQRHANNQLQPIYHydrophilic
542-562VESRWPYRKDVSRKYHETRDMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-22KSYEKKSYEKKKNKTR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001810  F-box_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF12937  F-box-like  
Amino Acid Sequences MSSKEKKSYEKKSYEKKKNKTRAQRHANNQLQPIYRLPNEILEIIFVLSRPLALERPVPGTADFYFSYMRASGVLDYARLLGRVSQRWRDVTRGCPALWSHIYIHAGVFPVFGRYEQRHYEMALQLSKDYPLTISIAVGKDGCMPILRGPLFAPHIPRIRALYIDMTSSFAMSQRVLPLFPEVDTPLLEIIHIDFGCSAPVAAMYLGSLAIDYAQDIPGVAGGGPRQHKRLTRDAPLLHEVLLEGLGMDNPHMMETGASDTYAVQHLGPAGVHWENLTRLRLPDMPVSAASLVKVIARATRLTELRCAIHEEMYPEDLIELMDEEDSFSDPEDERSGERHDTDTRQGRTPGNAGLGLHVFPDLEILHIVTWALDPGIYDSDVEDEYGFPTNMELLLNALICPALTQLSITRQADELFLHMLDEYSAGLGDESQCRPGAFKLHPPLRAFLQRSRCTVRGLHLSGLSIVQQELLNIMQLCPDVRTLTLTDAVRQMSPGFWRALRQRERGGRHIYMPALRVLNVENRRESNARSGFSNMDVLDTVESRWPYRKDVSRKYHETRDMILVRVMHHPEPVRAPKNARGTPQHVLEARMRERLRMVQSRKDIMLGITELERGPPVGSDEDYEDFDDYDVVLDLDYWY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.91
2 0.92
3 0.92
4 0.93
5 0.93
6 0.94
7 0.94
8 0.94
9 0.94
10 0.94
11 0.94
12 0.92
13 0.93
14 0.9
15 0.86
16 0.8
17 0.76
18 0.68
19 0.61
20 0.55
21 0.5
22 0.43
23 0.4
24 0.35
25 0.32
26 0.31
27 0.29
28 0.25
29 0.19
30 0.18
31 0.15
32 0.14
33 0.1
34 0.09
35 0.07
36 0.07
37 0.08
38 0.1
39 0.11
40 0.13
41 0.16
42 0.18
43 0.23
44 0.24
45 0.24
46 0.22
47 0.24
48 0.22
49 0.23
50 0.21
51 0.18
52 0.19
53 0.17
54 0.19
55 0.16
56 0.15
57 0.11
58 0.12
59 0.11
60 0.13
61 0.13
62 0.11
63 0.12
64 0.13
65 0.13
66 0.12
67 0.12
68 0.14
69 0.2
70 0.27
71 0.33
72 0.39
73 0.43
74 0.49
75 0.52
76 0.54
77 0.52
78 0.51
79 0.53
80 0.49
81 0.45
82 0.42
83 0.4
84 0.4
85 0.37
86 0.34
87 0.28
88 0.28
89 0.3
90 0.26
91 0.25
92 0.19
93 0.19
94 0.15
95 0.14
96 0.1
97 0.11
98 0.11
99 0.11
100 0.15
101 0.17
102 0.23
103 0.26
104 0.3
105 0.29
106 0.3
107 0.35
108 0.33
109 0.34
110 0.32
111 0.28
112 0.26
113 0.25
114 0.24
115 0.19
116 0.15
117 0.12
118 0.1
119 0.11
120 0.1
121 0.1
122 0.13
123 0.13
124 0.14
125 0.13
126 0.13
127 0.14
128 0.14
129 0.13
130 0.1
131 0.11
132 0.12
133 0.2
134 0.19
135 0.17
136 0.17
137 0.21
138 0.24
139 0.25
140 0.27
141 0.26
142 0.31
143 0.31
144 0.33
145 0.32
146 0.3
147 0.29
148 0.26
149 0.24
150 0.19
151 0.2
152 0.18
153 0.17
154 0.16
155 0.15
156 0.13
157 0.1
158 0.11
159 0.1
160 0.11
161 0.13
162 0.14
163 0.13
164 0.14
165 0.15
166 0.15
167 0.14
168 0.15
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.1
174 0.09
175 0.08
176 0.07
177 0.06
178 0.09
179 0.09
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.08
185 0.07
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.03
192 0.04
193 0.04
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.04
209 0.05
210 0.1
211 0.14
212 0.16
213 0.19
214 0.23
215 0.28
216 0.33
217 0.43
218 0.44
219 0.47
220 0.52
221 0.51
222 0.51
223 0.49
224 0.44
225 0.34
226 0.27
227 0.2
228 0.13
229 0.12
230 0.07
231 0.04
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.08
250 0.08
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.05
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.09
263 0.12
264 0.13
265 0.11
266 0.11
267 0.14
268 0.16
269 0.17
270 0.18
271 0.17
272 0.17
273 0.16
274 0.16
275 0.14
276 0.12
277 0.1
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.13
288 0.15
289 0.15
290 0.17
291 0.18
292 0.17
293 0.18
294 0.2
295 0.16
296 0.16
297 0.16
298 0.15
299 0.14
300 0.14
301 0.13
302 0.09
303 0.08
304 0.07
305 0.06
306 0.04
307 0.04
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.1
323 0.12
324 0.12
325 0.13
326 0.15
327 0.16
328 0.18
329 0.24
330 0.3
331 0.3
332 0.32
333 0.34
334 0.33
335 0.32
336 0.31
337 0.26
338 0.19
339 0.17
340 0.15
341 0.13
342 0.12
343 0.1
344 0.09
345 0.07
346 0.06
347 0.05
348 0.06
349 0.05
350 0.04
351 0.04
352 0.05
353 0.04
354 0.05
355 0.05
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.03
360 0.03
361 0.03
362 0.04
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.06
371 0.05
372 0.06
373 0.08
374 0.08
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.05
381 0.04
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.06
394 0.09
395 0.15
396 0.16
397 0.16
398 0.16
399 0.17
400 0.17
401 0.16
402 0.14
403 0.09
404 0.09
405 0.08
406 0.07
407 0.07
408 0.06
409 0.06
410 0.05
411 0.04
412 0.04
413 0.03
414 0.03
415 0.04
416 0.05
417 0.09
418 0.09
419 0.11
420 0.11
421 0.12
422 0.13
423 0.14
424 0.19
425 0.18
426 0.25
427 0.33
428 0.38
429 0.43
430 0.44
431 0.45
432 0.43
433 0.49
434 0.45
435 0.43
436 0.48
437 0.47
438 0.5
439 0.54
440 0.51
441 0.46
442 0.44
443 0.42
444 0.41
445 0.39
446 0.36
447 0.3
448 0.29
449 0.26
450 0.25
451 0.2
452 0.12
453 0.09
454 0.08
455 0.08
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.09
460 0.08
461 0.08
462 0.08
463 0.08
464 0.09
465 0.09
466 0.1
467 0.08
468 0.08
469 0.11
470 0.11
471 0.12
472 0.17
473 0.17
474 0.18
475 0.2
476 0.21
477 0.19
478 0.19
479 0.17
480 0.14
481 0.16
482 0.17
483 0.16
484 0.16
485 0.22
486 0.27
487 0.37
488 0.42
489 0.45
490 0.52
491 0.58
492 0.63
493 0.65
494 0.66
495 0.59
496 0.55
497 0.54
498 0.48
499 0.42
500 0.37
501 0.34
502 0.27
503 0.25
504 0.22
505 0.2
506 0.26
507 0.29
508 0.31
509 0.32
510 0.32
511 0.37
512 0.38
513 0.39
514 0.4
515 0.4
516 0.37
517 0.35
518 0.36
519 0.32
520 0.32
521 0.33
522 0.22
523 0.18
524 0.17
525 0.16
526 0.14
527 0.13
528 0.13
529 0.14
530 0.15
531 0.16
532 0.23
533 0.24
534 0.28
535 0.37
536 0.45
537 0.51
538 0.61
539 0.69
540 0.72
541 0.79
542 0.81
543 0.82
544 0.8
545 0.73
546 0.66
547 0.65
548 0.58
549 0.5
550 0.46
551 0.37
552 0.32
553 0.35
554 0.35
555 0.26
556 0.29
557 0.29
558 0.3
559 0.38
560 0.45
561 0.43
562 0.45
563 0.5
564 0.53
565 0.61
566 0.62
567 0.61
568 0.59
569 0.61
570 0.61
571 0.6
572 0.59
573 0.5
574 0.49
575 0.48
576 0.49
577 0.45
578 0.48
579 0.44
580 0.4
581 0.42
582 0.46
583 0.49
584 0.51
585 0.54
586 0.55
587 0.61
588 0.64
589 0.61
590 0.55
591 0.47
592 0.37
593 0.35
594 0.26
595 0.21
596 0.17
597 0.17
598 0.16
599 0.15
600 0.15
601 0.12
602 0.11
603 0.1
604 0.13
605 0.14
606 0.15
607 0.16
608 0.2
609 0.21
610 0.23
611 0.23
612 0.2
613 0.18
614 0.17
615 0.15
616 0.11
617 0.1
618 0.09
619 0.07
620 0.06