Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CY03

Protein Details
Accession A0A550CY03    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
95-118VELSRLRRDIRKRRRPPSPESPLPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
101-111RRDIRKRRRPP
Subcellular Location(s) mito 7, cyto 6.5, cyto_nucl 6, nucl 4.5, plas 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021627  Mediator_Med27  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF11571  Med27  
Amino Acid Sequences MAANIPSAGHTDATNKASALQSQIHALTGLYSQVSGLRQLPAHVLSPAPSFGNPPSATSEDFEQLKAFQAALATAHVQDALKHAQLRDGLGKADVELSRLRRDIRKRRRPPSPESPLPYNAEQQPAEKAVFPRAEGGPLGVSEMAAFVRDFNRTRTSGPVRVHIWTRRREDGQRTLEQAERARPVVLRVTIASVLTAYIAFGVEDDERRTLCVESVAVFGPREKKAPHQQSEFAVFRNLSQQVAKMVQAYPRVACQSLVQAISAYESLFIEQCCRCARVLSTEGHMPPTARVWVDGADGQAGRWVARHVMCRGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.2
3 0.21
4 0.22
5 0.23
6 0.24
7 0.22
8 0.2
9 0.23
10 0.23
11 0.21
12 0.19
13 0.17
14 0.14
15 0.12
16 0.12
17 0.08
18 0.08
19 0.07
20 0.1
21 0.11
22 0.12
23 0.13
24 0.15
25 0.15
26 0.16
27 0.19
28 0.19
29 0.19
30 0.18
31 0.16
32 0.15
33 0.17
34 0.17
35 0.15
36 0.13
37 0.15
38 0.15
39 0.22
40 0.21
41 0.21
42 0.25
43 0.26
44 0.27
45 0.26
46 0.27
47 0.24
48 0.24
49 0.23
50 0.18
51 0.17
52 0.18
53 0.17
54 0.14
55 0.1
56 0.1
57 0.09
58 0.09
59 0.1
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.11
67 0.12
68 0.14
69 0.16
70 0.16
71 0.18
72 0.19
73 0.21
74 0.21
75 0.2
76 0.18
77 0.17
78 0.17
79 0.14
80 0.16
81 0.14
82 0.12
83 0.15
84 0.17
85 0.19
86 0.21
87 0.24
88 0.27
89 0.38
90 0.47
91 0.55
92 0.64
93 0.71
94 0.78
95 0.86
96 0.85
97 0.84
98 0.84
99 0.82
100 0.78
101 0.74
102 0.69
103 0.62
104 0.59
105 0.52
106 0.45
107 0.37
108 0.33
109 0.28
110 0.24
111 0.22
112 0.21
113 0.2
114 0.17
115 0.17
116 0.18
117 0.18
118 0.17
119 0.18
120 0.17
121 0.17
122 0.15
123 0.14
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.06
128 0.05
129 0.04
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.05
136 0.08
137 0.09
138 0.12
139 0.16
140 0.16
141 0.18
142 0.24
143 0.28
144 0.32
145 0.32
146 0.34
147 0.32
148 0.32
149 0.36
150 0.35
151 0.37
152 0.38
153 0.41
154 0.41
155 0.43
156 0.47
157 0.5
158 0.53
159 0.52
160 0.48
161 0.46
162 0.44
163 0.42
164 0.4
165 0.34
166 0.28
167 0.24
168 0.22
169 0.2
170 0.18
171 0.17
172 0.18
173 0.16
174 0.14
175 0.12
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.11
180 0.07
181 0.07
182 0.06
183 0.05
184 0.04
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.08
193 0.09
194 0.09
195 0.1
196 0.11
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.13
207 0.16
208 0.17
209 0.19
210 0.19
211 0.27
212 0.37
213 0.47
214 0.52
215 0.52
216 0.54
217 0.55
218 0.61
219 0.54
220 0.44
221 0.37
222 0.3
223 0.25
224 0.27
225 0.24
226 0.18
227 0.17
228 0.18
229 0.18
230 0.2
231 0.2
232 0.16
233 0.17
234 0.2
235 0.23
236 0.24
237 0.21
238 0.23
239 0.25
240 0.23
241 0.22
242 0.19
243 0.2
244 0.22
245 0.21
246 0.18
247 0.16
248 0.16
249 0.16
250 0.15
251 0.11
252 0.08
253 0.07
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.13
258 0.13
259 0.17
260 0.19
261 0.21
262 0.2
263 0.22
264 0.25
265 0.28
266 0.32
267 0.3
268 0.31
269 0.36
270 0.37
271 0.36
272 0.35
273 0.28
274 0.25
275 0.26
276 0.25
277 0.19
278 0.19
279 0.18
280 0.18
281 0.2
282 0.2
283 0.17
284 0.17
285 0.16
286 0.15
287 0.17
288 0.16
289 0.14
290 0.13
291 0.14
292 0.17
293 0.21
294 0.27