FuNGI

A0A550CUG8

Protein Details

Accession

A0A550CUG8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
104-123	GVAPRAKMNQQRSRRFRASQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 11.5, cyto_nucl 9, mito 8, nucl 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSKKYPKIVEPVVEEEPREIGDELVPIDCTGPNPNGTEFDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPETEEEMMVEIFAYTERVVNMVRPRKLLFMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRASQEAQEKEEARVESLAIWQAMGKPLTDEMKNPKQAWDSNAITPGTPFMTLLANALRYWTVQKMNSDPAWKGIQVIISDASVPGEGEHKIMDFIRRQRVNPGHDPNTEHVIYGLDADLIMLSLATHEPHFRVLREDVFNQDVSSTACRKCGKEGHYAAQCTTPEGEAKEKPKDSKKPFIFLDVSVLREYLEVELDVPNTPFPFDLERAIDDWVMLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLLKIWKNELPRMGGYLTNNGEIERDRAQVILTGIGQREADIFRRRREAEQRQDHNAKRRKLEQEQRKNATVSVGPSPSLNLGAPMNGTSSIHPSLPQRPDFASRADSLGLGAPVPPPAMQSNSDIVNNRGAIRTANLDAANKLKDQLFDLIPLKQSKNNSKPTPPKLDPSLPDKPVTPVEYAALTTPLSASGPVTAANSMDEDDMIPGFYSQSTVISTEPGSLATIDGDEAIKVEQVETTQVVVQEVPAAANGNVKVEDNSDMDADGDADAEGEVDMEDGTEETADGEAPPVAGKKRKLEEGPGEESNSTEEEEEDEAAANASLYTMKKNSDGSIEQADHVQLWEPGYKERYYRHKFGKEATDAEFRKEITTKYMEGLAWVLQYYYQGTPSWKWYYPYHFAPFAEDFENIVEMDLKFEIGQPFKPFEQLMGVFPAASRKHIPSIFHPLMTEAESPISDFYPTEFLIDMNGKKMAWQGVAILPFIDERRLLEAMAEGYPSLSGDEVHRNRWGNNVIFASDEHPVYPMYEALYGKRKVEDPVPLDVKLTKGISGSVQRNPDCLPGSTYESPLPSIPDLCDIPNDRSLSVLYFFPKQLTPHRSVLLPGLVPPRRQLTSADLSATRNGGRPPRKGYDNRNTGRGGGWRDAGDRSRDEPRSGGGYRGGRGAPPYQRDTRPYPSRGGGPPQNSYGYGGGGRGGGGYGGGGARPPPRSSEYGAGGYSGGGYNSYSSGPPANGGAYAQGGYGSAPPSGGYGGYGAAAGGAAGGYGAPPGGGGYGGYGGYGNNQSNAGGYGAAGGGARGGYQNGGGYGNARGGYGGGYNNAGGRGRGW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.62
3	0.66
4	0.67
5	0.65
6	0.61
7	0.59
8	0.57
9	0.49
10	0.46
11	0.38
12	0.33
13	0.27
14	0.24
15	0.19
16	0.14
17	0.13
18	0.14
19	0.14
20	0.14
21	0.14
22	0.11
23	0.12
24	0.12
25	0.12
26	0.15
27	0.17
28	0.18
29	0.2
30	0.22
31	0.23
32	0.25
33	0.28
34	0.25
35	0.26
36	0.24
37	0.23
38	0.22
39	0.19
40	0.17
41	0.13
42	0.12
43	0.1
44	0.09
45	0.09
46	0.09
47	0.1
48	0.13
49	0.17
50	0.2
51	0.2
52	0.27
53	0.33
54	0.36
55	0.41
56	0.41
57	0.41
58	0.39
59	0.42
60	0.36
61	0.33
62	0.28
63	0.24
64	0.22
65	0.17
66	0.14
67	0.1
68	0.09
69	0.06
70	0.07
71	0.06
72	0.08
73	0.08
74	0.1
75	0.1
76	0.16
77	0.26
78	0.33
79	0.36
80	0.38
81	0.4
82	0.42
83	0.43
84	0.42
85	0.34
86	0.3
87	0.29
88	0.25
89	0.25
90	0.21
91	0.22
92	0.18
93	0.16
94	0.12
95	0.14
96	0.2
97	0.27
98	0.37
99	0.46
100	0.55
101	0.66
102	0.74
103	0.8
104	0.81
105	0.78
106	0.75
107	0.76
108	0.74
109	0.74
110	0.76
111	0.7
112	0.66
113	0.67
114	0.61
115	0.52
116	0.48
117	0.38
118	0.3
119	0.26
120	0.23
121	0.18
122	0.19
123	0.2
124	0.14
125	0.14
126	0.13
127	0.14
128	0.18
129	0.17
130	0.15
131	0.13
132	0.16
133	0.2
134	0.21
135	0.24
136	0.29
137	0.38
138	0.45
139	0.44
140	0.46
141	0.48
142	0.5
143	0.5
144	0.49
145	0.43
146	0.4
147	0.44
148	0.39
149	0.33
150	0.3
151	0.27
152	0.2
153	0.16
154	0.13
155	0.09
156	0.11
157	0.11
158	0.12
159	0.12
160	0.12
161	0.12
162	0.13
163	0.13
164	0.12
165	0.14
166	0.18
167	0.21
168	0.23
169	0.27
170	0.31
171	0.37
172	0.39
173	0.41
174	0.36
175	0.35
176	0.35
177	0.31
178	0.28
179	0.23
180	0.22
181	0.19
182	0.2
183	0.16
184	0.14
185	0.14
186	0.12
187	0.11
188	0.08
189	0.08
190	0.06
191	0.08
192	0.08
193	0.08
194	0.09
195	0.08
196	0.1
197	0.11
198	0.16
199	0.21
200	0.27
201	0.37
202	0.4
203	0.41
204	0.49
205	0.56
206	0.58
207	0.61
208	0.64
209	0.6
210	0.6
211	0.63
212	0.56
213	0.54
214	0.47
215	0.37
216	0.28
217	0.22
218	0.19
219	0.16
220	0.13
221	0.07
222	0.06
223	0.06
224	0.06
225	0.04
226	0.04
227	0.03
228	0.03
229	0.04
230	0.04
231	0.05
232	0.06
233	0.08
234	0.09
235	0.14
236	0.17
237	0.16
238	0.21
239	0.23
240	0.28
241	0.31
242	0.32
243	0.3
244	0.31
245	0.31
246	0.26
247	0.23
248	0.18
249	0.16
250	0.18
251	0.19
252	0.17
253	0.23
254	0.27
255	0.28
256	0.34
257	0.39
258	0.39
259	0.45
260	0.49
261	0.51
262	0.55
263	0.55
264	0.49
265	0.46
266	0.42
267	0.34
268	0.29
269	0.22
270	0.17
271	0.18
272	0.22
273	0.23
274	0.28
275	0.34
276	0.37
277	0.43
278	0.51
279	0.59
280	0.62
281	0.67
282	0.66
283	0.66
284	0.63
285	0.62
286	0.55
287	0.45
288	0.45
289	0.36
290	0.33
291	0.26
292	0.25
293	0.19
294	0.16
295	0.17
296	0.09
297	0.08
298	0.06
299	0.07
300	0.08
301	0.09
302	0.09
303	0.09
304	0.09
305	0.09
306	0.09
307	0.08
308	0.09
309	0.12
310	0.12
311	0.15
312	0.16
313	0.17
314	0.18
315	0.19
316	0.17
317	0.13
318	0.12
319	0.09
320	0.07
321	0.05
322	0.04
323	0.03
324	0.03
325	0.03
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.06
330	0.06
331	0.07
332	0.07
333	0.08
334	0.08
335	0.09
336	0.12
337	0.13
338	0.13
339	0.12
340	0.13
341	0.12
342	0.12
343	0.12
344	0.08
345	0.06
346	0.09
347	0.11
348	0.1
349	0.1
350	0.12
351	0.15
352	0.19
353	0.23
354	0.23
355	0.24
356	0.24
357	0.26
358	0.25
359	0.25
360	0.21
361	0.23
362	0.22
363	0.2
364	0.19
365	0.17
366	0.17
367	0.15
368	0.17
369	0.14
370	0.13
371	0.12
372	0.12
373	0.12
374	0.14
375	0.14
376	0.12
377	0.1
378	0.11
379	0.11
380	0.12
381	0.12
382	0.09
383	0.1
384	0.1
385	0.15
386	0.22
387	0.26
388	0.28
389	0.35
390	0.37
391	0.42
392	0.52
393	0.57
394	0.59
395	0.66
396	0.68
397	0.69
398	0.76
399	0.74
400	0.74
401	0.72
402	0.66
403	0.61
404	0.63
405	0.63
406	0.65
407	0.7
408	0.71
409	0.74
410	0.79
411	0.79
412	0.74
413	0.66
414	0.57
415	0.49
416	0.39
417	0.3
418	0.25
419	0.2
420	0.17
421	0.16
422	0.16
423	0.14
424	0.13
425	0.11
426	0.08
427	0.07
428	0.07
429	0.07
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.07
434	0.07
435	0.1
436	0.11
437	0.11
438	0.12
439	0.15
440	0.22
441	0.27
442	0.28
443	0.26
444	0.27
445	0.32
446	0.32
447	0.31
448	0.26
449	0.22
450	0.21
451	0.2
452	0.17
453	0.13
454	0.12
455	0.1
456	0.07
457	0.07
458	0.06
459	0.06
460	0.06
461	0.06
462	0.06
463	0.07
464	0.1
465	0.11
466	0.13
467	0.14
468	0.15
469	0.17
470	0.17
471	0.17
472	0.17
473	0.17
474	0.15
475	0.14
476	0.13
477	0.11
478	0.11
479	0.13
480	0.11
481	0.12
482	0.12
483	0.12
484	0.13
485	0.15
486	0.15
487	0.13
488	0.13
489	0.12
490	0.12
491	0.13
492	0.15
493	0.13
494	0.15
495	0.17
496	0.17
497	0.19
498	0.21
499	0.2
500	0.2
501	0.25
502	0.31
503	0.38
504	0.45
505	0.46
506	0.53
507	0.61
508	0.65
509	0.69
510	0.62
511	0.58
512	0.54
513	0.55
514	0.49
515	0.47
516	0.48
517	0.4
518	0.39
519	0.35
520	0.32
521	0.3
522	0.29
523	0.22
524	0.15
525	0.14
526	0.14
527	0.13
528	0.11
529	0.09
530	0.07
531	0.06
532	0.06
533	0.05
534	0.05
535	0.05
536	0.05
537	0.04
538	0.04
539	0.05
540	0.05
541	0.05
542	0.05
543	0.05
544	0.06
545	0.06
546	0.05
547	0.05
548	0.05
549	0.05
550	0.05
551	0.04
552	0.04
553	0.03
554	0.04
555	0.04
556	0.04
557	0.04
558	0.05
559	0.05
560	0.06
561	0.06
562	0.07
563	0.07
564	0.07
565	0.07
566	0.07
567	0.06
568	0.06
569	0.05
570	0.05
571	0.04
572	0.04
573	0.04
574	0.04
575	0.03
576	0.03
577	0.03
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.04
582	0.04
583	0.05
584	0.05
585	0.06
586	0.06
587	0.06
588	0.06
589	0.06
590	0.06
591	0.06
592	0.06
593	0.05
594	0.04
595	0.05
596	0.05
597	0.06
598	0.07
599	0.06
600	0.07
601	0.07
602	0.07
603	0.07
604	0.09
605	0.08
606	0.09
607	0.08
608	0.08
609	0.08
610	0.08
611	0.07
612	0.05
613	0.04
614	0.04
615	0.04
616	0.03
617	0.03
618	0.03
619	0.03
620	0.03
621	0.03
622	0.03
623	0.02
624	0.03
625	0.02
626	0.03
627	0.02
628	0.02
629	0.03
630	0.03
631	0.03
632	0.03
633	0.03
634	0.03
635	0.04
636	0.04
637	0.05
638	0.08
639	0.12
640	0.15
641	0.2
642	0.23
643	0.28
644	0.29
645	0.33
646	0.38
647	0.4
648	0.42
649	0.38
650	0.36
651	0.31
652	0.3
653	0.25
654	0.18
655	0.13
656	0.08
657	0.07
658	0.07
659	0.08
660	0.08
661	0.07
662	0.06
663	0.06
664	0.06
665	0.06
666	0.04
667	0.03
668	0.03
669	0.05
670	0.05
671	0.07
672	0.08
673	0.09
674	0.11
675	0.12
676	0.12
677	0.15
678	0.15
679	0.17
680	0.2
681	0.2
682	0.18
683	0.18
684	0.17
685	0.13
686	0.12
687	0.1
688	0.07
689	0.07
690	0.09
691	0.09
692	0.11
693	0.14
694	0.15
695	0.16
696	0.22
697	0.32
698	0.36
699	0.42
700	0.49
701	0.53
702	0.54
703	0.56
704	0.59
705	0.52
706	0.48
707	0.45
708	0.45
709	0.39
710	0.39
711	0.36
712	0.27
713	0.26
714	0.25
715	0.21
716	0.17
717	0.19
718	0.18
719	0.17
720	0.19
721	0.17
722	0.16
723	0.16
724	0.12
725	0.09
726	0.09
727	0.08
728	0.05
729	0.06
730	0.08
731	0.07
732	0.08
733	0.09
734	0.11
735	0.12
736	0.18
737	0.22
738	0.22
739	0.25
740	0.27
741	0.33
742	0.36
743	0.4
744	0.39
745	0.36
746	0.35
747	0.36
748	0.34
749	0.29
750	0.25
751	0.2
752	0.16
753	0.14
754	0.15
755	0.1
756	0.09
757	0.08
758	0.07
759	0.08
760	0.07
761	0.07
762	0.06
763	0.09
764	0.12
765	0.12
766	0.14
767	0.15
768	0.18
769	0.18
770	0.2
771	0.18
772	0.16
773	0.18
774	0.17
775	0.16
776	0.16
777	0.15
778	0.13
779	0.14
780	0.19
781	0.15
782	0.16
783	0.18
784	0.17
785	0.22
786	0.25
787	0.27
788	0.26
789	0.36
790	0.35
791	0.33
792	0.31
793	0.27
794	0.26
795	0.26
796	0.21
797	0.12
798	0.11
799	0.1
800	0.11
801	0.1
802	0.09
803	0.07
804	0.07
805	0.07
806	0.1
807	0.1
808	0.1
809	0.1
810	0.09
811	0.11
812	0.15
813	0.14
814	0.13
815	0.14
816	0.13
817	0.13
818	0.16
819	0.15
820	0.12
821	0.12
822	0.12
823	0.14
824	0.15
825	0.15
826	0.12
827	0.11
828	0.11
829	0.11
830	0.1
831	0.08
832	0.08
833	0.11
834	0.12
835	0.11
836	0.1
837	0.11
838	0.12
839	0.12
840	0.11
841	0.07
842	0.07
843	0.07
844	0.07
845	0.06
846	0.04
847	0.05
848	0.07
849	0.17
850	0.19
851	0.22
852	0.27
853	0.28
854	0.28
855	0.34
856	0.37
857	0.29
858	0.31
859	0.3
860	0.25
861	0.25
862	0.25
863	0.21
864	0.17
865	0.16
866	0.11
867	0.11
868	0.11
869	0.1
870	0.11
871	0.09
872	0.08
873	0.12
874	0.12
875	0.15
876	0.23
877	0.23
878	0.24
879	0.26
880	0.26
881	0.25
882	0.29
883	0.33
884	0.28
885	0.35
886	0.37
887	0.35
888	0.35
889	0.33
890	0.3
891	0.26
892	0.23
893	0.16
894	0.13
895	0.14
896	0.16
897	0.23
898	0.26
899	0.27
900	0.34
901	0.33
902	0.35
903	0.35
904	0.36
905	0.31
906	0.28
907	0.25
908	0.21
909	0.28
910	0.28
911	0.29
912	0.26
913	0.25
914	0.25
915	0.23
916	0.23
917	0.16
918	0.16
919	0.15
920	0.16
921	0.16
922	0.16
923	0.2
924	0.21
925	0.23
926	0.27
927	0.27
928	0.23
929	0.23
930	0.23
931	0.2
932	0.19
933	0.18
934	0.15
935	0.17
936	0.17
937	0.18
938	0.2
939	0.22
940	0.29
941	0.34
942	0.37
943	0.39
944	0.4
945	0.38
946	0.37
947	0.37
948	0.31
949	0.25
950	0.23
951	0.28
952	0.3
953	0.3
954	0.31
955	0.33
956	0.31
957	0.32
958	0.31
959	0.29
960	0.33
961	0.33
962	0.34
963	0.3
964	0.3
965	0.31
966	0.3
967	0.24
968	0.2
969	0.23
970	0.29
971	0.35
972	0.39
973	0.45
974	0.5
975	0.58
976	0.63
977	0.69
978	0.7
979	0.74
980	0.71
981	0.69
982	0.63
983	0.55
984	0.51
985	0.46
986	0.41
987	0.33
988	0.32
989	0.28
990	0.29
991	0.32
992	0.32
993	0.31
994	0.29
995	0.29
996	0.36
997	0.37
998	0.37
999	0.34
1000	0.33
1001	0.36
1002	0.34
1003	0.33
1004	0.3
1005	0.31
1006	0.3
1007	0.33
1008	0.31
1009	0.25
1010	0.27
1011	0.32
1012	0.32
1013	0.34
1014	0.4
1015	0.43
1016	0.47
1017	0.52
1018	0.55
1019	0.59
1020	0.6
1021	0.58
1022	0.57
1023	0.54
1024	0.56
1025	0.55
1026	0.57
1027	0.54
1028	0.5
1029	0.5
1030	0.48
1031	0.47
1032	0.41
1033	0.39
1034	0.31
1035	0.25
1036	0.21
1037	0.17
1038	0.14
1039	0.12
1040	0.11
1041	0.09
1042	0.08
1043	0.06
1044	0.05
1045	0.04
1046	0.04
1047	0.04
1048	0.05
1049	0.05
1050	0.08
1051	0.12
1052	0.16
1053	0.17
1054	0.21
1055	0.25
1056	0.29
1057	0.34
1058	0.37
1059	0.38
1060	0.38
1061	0.37
1062	0.33
1063	0.28
1064	0.24
1065	0.2
1066	0.14
1067	0.1
1068	0.07
1069	0.07
1070	0.08
1071	0.09
1072	0.1
1073	0.09
1074	0.11
1075	0.13
1076	0.13
1077	0.14
1078	0.14
1079	0.14
1080	0.13
1081	0.13
1082	0.12
1083	0.11
1084	0.11
1085	0.09
1086	0.08
1087	0.08
1088	0.08
1089	0.1
1090	0.1
1091	0.09
1092	0.08
1093	0.08
1094	0.09
1095	0.1
1096	0.09
1097	0.08
1098	0.07
1099	0.07
1100	0.07
1101	0.07
1102	0.06
1103	0.05
1104	0.05
1105	0.04
1106	0.03
1107	0.03
1108	0.02
1109	0.02
1110	0.02
1111	0.02
1112	0.03
1113	0.03
1114	0.03
1115	0.03
1116	0.03
1117	0.04
1118	0.04
1119	0.04
1120	0.05
1121	0.06
1122	0.06
1123	0.07
1124	0.07
1125	0.06
1126	0.1
1127	0.15
1128	0.15
1129	0.15
1130	0.15
1131	0.15
1132	0.16
1133	0.17
1134	0.14
1135	0.1
1136	0.09
1137	0.08
1138	0.08
1139	0.08
1140	0.07
1141	0.06
1142	0.05
1143	0.05
1144	0.06
1145	0.06
1146	0.06
1147	0.07
1148	0.08
1149	0.09
1150	0.09
1151	0.11
1152	0.1
1153	0.11
1154	0.12
1155	0.14
1156	0.14
1157	0.13
1158	0.12
1159	0.11
1160	0.12
1161	0.13
1162	0.13
1163	0.11
1164	0.12
1165	0.13
1166	0.14
1167	0.16
1168	0.16

A0A550CUG8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer