FuNGI

A0A550C705

Protein Details

Accession

A0A550C705

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
8-32	LPPLGHSRRPQPPPPPSQRSQRPDA	Hydrophilic
779-799	TTRLPFFRTRHLRNPWNHDRE	Hydrophilic
831-863	PPGMPTLPRRMLRHRRHNPQRHPSVRPRPHESL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
839-859	RRMLRHRRHNPQRHPSVRPRP

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 9.5, mito 7, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR007275 YTH_domain IPR045168 YTH_prot
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF04146 YTH
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM PS50882 YTH
CDD	cd21134 YTH

Amino Acid Sequences

MAPDSGRLPPLGHSRRPQPPPPPSQRSQRPDAGQVGVVGPHPPFGSHSYGPTSSSPYNQGSGFAGQYTLAPQPQMSQQSMSLVHSTPAPYFPGYGLPPDSSLMPQNIHANYPMMQHHGNMYTYQRQSPPESAQGTHTQYSGAGPSQVYSPQVNASPPPLSPSHSGSPTYSASGQFHSLRYSTLSNAQYGYPPPSFPASPNIYQSPPYNPGYPTYSPSGDTEAQQQGTWWFLPHAASSYDSGQPPYQYTMGYPPASLPTHDSDTPPYTQRHTPAPVLSSPSPLPLPTASSSSTVRSPASSNAVGSVSSPLALSASSHQSPKPESASGSSAYRFGSERAPVRRSYHPNPPAHRSEWVMWVGNVPSDATHEELWRFFNVPYRSGDNTTTGVMSIFPISRSNCAFVNYSGQGPLEDSIKRFNGKQLRPADARCPALVCRVRKVDDDLKAGVGAQRGMGMHTKWIRDQKGKLKAGPPSVTSATSTTSEDVPTTPSSASGDAITGMSNLSISSDEHTTAGLKGHSSSSGSYASTNSSLLTSHFPKRYFILKSLTQYDLDLSVETGVWATQKHNEGILDQAFRTSKDVYLIFGVNKSGEFYGYARMSGPVKGERKVSWASRAGDFSPTSSLPTTSRHATGEEGSAPSTLKSPVSNFLSPASGRMVDQSPQPLGEATRSPIIRVPHPVQSAPPEFGPRGQLSVSKHPIERHTHEEQTSPEFALDENAPKRAVRGPVSATTDPHMRPSGEREHSEPVMPSAISTPLRGDDNGREESWGESFKVEWQCTTRLPFFRTRHLRNPWNHDREVKVSRDGTELEPIVGQRLLDEWEQLANSTSPPPGMPTLPRRMLRHRRHNPQRHPSVRPRPHESLAVGRRGAHDHDIRRSLKSISQPFTIPHKRIALITGINCIWVSIS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.64
3	0.71
4	0.74
5	0.73
6	0.76
7	0.79
8	0.83
9	0.83
10	0.79
11	0.82
12	0.84
13	0.81
14	0.79
15	0.76
16	0.7
17	0.68
18	0.67
19	0.59
20	0.49
21	0.43
22	0.36
23	0.29
24	0.25
25	0.2
26	0.15
27	0.14
28	0.13
29	0.13
30	0.14
31	0.17
32	0.24
33	0.23
34	0.27
35	0.3
36	0.31
37	0.34
38	0.32
39	0.35
40	0.3
41	0.32
42	0.34
43	0.31
44	0.33
45	0.3
46	0.3
47	0.26
48	0.26
49	0.23
50	0.18
51	0.16
52	0.13
53	0.14
54	0.14
55	0.15
56	0.13
57	0.13
58	0.13
59	0.15
60	0.21
61	0.26
62	0.25
63	0.24
64	0.24
65	0.28
66	0.29
67	0.29
68	0.25
69	0.21
70	0.19
71	0.2
72	0.21
73	0.18
74	0.18
75	0.18
76	0.16
77	0.17
78	0.17
79	0.19
80	0.19
81	0.21
82	0.21
83	0.2
84	0.2
85	0.2
86	0.21
87	0.18
88	0.2
89	0.19
90	0.18
91	0.19
92	0.25
93	0.25
94	0.25
95	0.24
96	0.22
97	0.21
98	0.24
99	0.23
100	0.22
101	0.21
102	0.21
103	0.23
104	0.24
105	0.24
106	0.22
107	0.26
108	0.29
109	0.32
110	0.35
111	0.35
112	0.36
113	0.4
114	0.43
115	0.43
116	0.42
117	0.42
118	0.39
119	0.4
120	0.43
121	0.43
122	0.38
123	0.34
124	0.26
125	0.24
126	0.24
127	0.22
128	0.15
129	0.13
130	0.11
131	0.12
132	0.13
133	0.14
134	0.16
135	0.14
136	0.15
137	0.15
138	0.17
139	0.18
140	0.18
141	0.2
142	0.19
143	0.18
144	0.2
145	0.19
146	0.21
147	0.23
148	0.27
149	0.29
150	0.3
151	0.32
152	0.3
153	0.33
154	0.3
155	0.3
156	0.26
157	0.23
158	0.22
159	0.22
160	0.25
161	0.23
162	0.23
163	0.22
164	0.21
165	0.19
166	0.2
167	0.2
168	0.18
169	0.24
170	0.24
171	0.23
172	0.24
173	0.23
174	0.23
175	0.23
176	0.26
177	0.19
178	0.18
179	0.19
180	0.22
181	0.22
182	0.21
183	0.26
184	0.27
185	0.29
186	0.33
187	0.34
188	0.32
189	0.33
190	0.34
191	0.32
192	0.32
193	0.32
194	0.31
195	0.28
196	0.3
197	0.34
198	0.33
199	0.31
200	0.3
201	0.28
202	0.27
203	0.27
204	0.29
205	0.24
206	0.23
207	0.26
208	0.26
209	0.25
210	0.24
211	0.23
212	0.18
213	0.19
214	0.19
215	0.13
216	0.1
217	0.1
218	0.11
219	0.11
220	0.12
221	0.11
222	0.12
223	0.14
224	0.16
225	0.18
226	0.18
227	0.2
228	0.19
229	0.19
230	0.19
231	0.2
232	0.18
233	0.15
234	0.15
235	0.18
236	0.22
237	0.22
238	0.2
239	0.18
240	0.21
241	0.22
242	0.21
243	0.19
244	0.18
245	0.22
246	0.23
247	0.23
248	0.23
249	0.26
250	0.28
251	0.28
252	0.26
253	0.26
254	0.29
255	0.3
256	0.32
257	0.33
258	0.33
259	0.32
260	0.33
261	0.3
262	0.33
263	0.31
264	0.28
265	0.25
266	0.24
267	0.22
268	0.19
269	0.19
270	0.13
271	0.16
272	0.14
273	0.16
274	0.15
275	0.17
276	0.18
277	0.19
278	0.2
279	0.18
280	0.17
281	0.16
282	0.17
283	0.17
284	0.21
285	0.19
286	0.17
287	0.17
288	0.17
289	0.16
290	0.15
291	0.14
292	0.09
293	0.08
294	0.08
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.07
300	0.12
301	0.13
302	0.15
303	0.16
304	0.18
305	0.2
306	0.22
307	0.23
308	0.19
309	0.19
310	0.2
311	0.22
312	0.21
313	0.21
314	0.19
315	0.17
316	0.16
317	0.16
318	0.14
319	0.13
320	0.14
321	0.16
322	0.22
323	0.27
324	0.29
325	0.31
326	0.35
327	0.42
328	0.46
329	0.47
330	0.52
331	0.55
332	0.59
333	0.61
334	0.63
335	0.59
336	0.54
337	0.51
338	0.44
339	0.37
340	0.34
341	0.32
342	0.26
343	0.21
344	0.2
345	0.18
346	0.15
347	0.13
348	0.09
349	0.06
350	0.07
351	0.08
352	0.08
353	0.09
354	0.1
355	0.11
356	0.11
357	0.13
358	0.12
359	0.13
360	0.12
361	0.18
362	0.19
363	0.2
364	0.22
365	0.25
366	0.26
367	0.27
368	0.28
369	0.22
370	0.22
371	0.2
372	0.18
373	0.13
374	0.11
375	0.09
376	0.08
377	0.07
378	0.06
379	0.06
380	0.09
381	0.1
382	0.12
383	0.13
384	0.14
385	0.14
386	0.15
387	0.16
388	0.14
389	0.18
390	0.16
391	0.16
392	0.15
393	0.14
394	0.12
395	0.11
396	0.11
397	0.09
398	0.09
399	0.09
400	0.12
401	0.13
402	0.14
403	0.14
404	0.2
405	0.27
406	0.28
407	0.36
408	0.37
409	0.41
410	0.43
411	0.44
412	0.42
413	0.38
414	0.37
415	0.29
416	0.26
417	0.21
418	0.26
419	0.3
420	0.27
421	0.27
422	0.29
423	0.3
424	0.3
425	0.35
426	0.33
427	0.32
428	0.34
429	0.29
430	0.26
431	0.25
432	0.24
433	0.19
434	0.14
435	0.09
436	0.06
437	0.07
438	0.06
439	0.08
440	0.09
441	0.07
442	0.11
443	0.14
444	0.15
445	0.17
446	0.23
447	0.26
448	0.3
449	0.36
450	0.4
451	0.48
452	0.49
453	0.49
454	0.48
455	0.48
456	0.49
457	0.44
458	0.37
459	0.3
460	0.29
461	0.26
462	0.23
463	0.19
464	0.15
465	0.15
466	0.15
467	0.12
468	0.11
469	0.11
470	0.1
471	0.1
472	0.1
473	0.09
474	0.1
475	0.09
476	0.09
477	0.09
478	0.1
479	0.1
480	0.07
481	0.07
482	0.06
483	0.06
484	0.06
485	0.05
486	0.05
487	0.04
488	0.04
489	0.03
490	0.04
491	0.04
492	0.04
493	0.06
494	0.07
495	0.07
496	0.07
497	0.08
498	0.08
499	0.08
500	0.09
501	0.08
502	0.07
503	0.08
504	0.08
505	0.08
506	0.09
507	0.09
508	0.1
509	0.11
510	0.11
511	0.1
512	0.1
513	0.11
514	0.11
515	0.11
516	0.09
517	0.08
518	0.08
519	0.08
520	0.12
521	0.15
522	0.2
523	0.24
524	0.25
525	0.26
526	0.28
527	0.33
528	0.31
529	0.31
530	0.3
531	0.3
532	0.33
533	0.35
534	0.34
535	0.29
536	0.26
537	0.23
538	0.18
539	0.15
540	0.12
541	0.08
542	0.07
543	0.06
544	0.06
545	0.05
546	0.04
547	0.05
548	0.05
549	0.06
550	0.1
551	0.13
552	0.13
553	0.14
554	0.15
555	0.14
556	0.17
557	0.19
558	0.16
559	0.13
560	0.15
561	0.14
562	0.15
563	0.17
564	0.14
565	0.12
566	0.14
567	0.15
568	0.13
569	0.15
570	0.16
571	0.14
572	0.14
573	0.13
574	0.1
575	0.1
576	0.1
577	0.08
578	0.07
579	0.08
580	0.08
581	0.13
582	0.13
583	0.13
584	0.13
585	0.14
586	0.15
587	0.15
588	0.17
589	0.19
590	0.22
591	0.23
592	0.26
593	0.25
594	0.28
595	0.32
596	0.31
597	0.3
598	0.34
599	0.34
600	0.34
601	0.36
602	0.32
603	0.31
604	0.29
605	0.24
606	0.2
607	0.18
608	0.18
609	0.16
610	0.17
611	0.14
612	0.18
613	0.2
614	0.19
615	0.21
616	0.2
617	0.2
618	0.21
619	0.2
620	0.19
621	0.17
622	0.15
623	0.14
624	0.14
625	0.13
626	0.12
627	0.12
628	0.1
629	0.1
630	0.11
631	0.12
632	0.18
633	0.23
634	0.24
635	0.23
636	0.23
637	0.25
638	0.24
639	0.23
640	0.2
641	0.15
642	0.14
643	0.16
644	0.17
645	0.15
646	0.17
647	0.19
648	0.17
649	0.16
650	0.17
651	0.15
652	0.13
653	0.15
654	0.14
655	0.13
656	0.18
657	0.18
658	0.19
659	0.21
660	0.23
661	0.24
662	0.29
663	0.31
664	0.32
665	0.35
666	0.34
667	0.33
668	0.37
669	0.37
670	0.32
671	0.3
672	0.26
673	0.25
674	0.25
675	0.28
676	0.22
677	0.21
678	0.2
679	0.22
680	0.24
681	0.33
682	0.37
683	0.35
684	0.37
685	0.39
686	0.45
687	0.48
688	0.48
689	0.46
690	0.46
691	0.48
692	0.47
693	0.46
694	0.42
695	0.4
696	0.36
697	0.29
698	0.23
699	0.18
700	0.17
701	0.17
702	0.16
703	0.18
704	0.18
705	0.19
706	0.2
707	0.2
708	0.22
709	0.24
710	0.28
711	0.25
712	0.29
713	0.31
714	0.36
715	0.44
716	0.43
717	0.39
718	0.36
719	0.38
720	0.34
721	0.33
722	0.3
723	0.24
724	0.25
725	0.29
726	0.36
727	0.36
728	0.38
729	0.38
730	0.41
731	0.41
732	0.41
733	0.36
734	0.28
735	0.25
736	0.22
737	0.18
738	0.14
739	0.18
740	0.17
741	0.16
742	0.16
743	0.16
744	0.18
745	0.18
746	0.2
747	0.22
748	0.26
749	0.29
750	0.28
751	0.26
752	0.25
753	0.26
754	0.25
755	0.21
756	0.17
757	0.14
758	0.14
759	0.2
760	0.27
761	0.26
762	0.26
763	0.27
764	0.3
765	0.33
766	0.39
767	0.39
768	0.37
769	0.41
770	0.49
771	0.49
772	0.56
773	0.63
774	0.65
775	0.68
776	0.72
777	0.76
778	0.75
779	0.82
780	0.82
781	0.79
782	0.75
783	0.71
784	0.66
785	0.65
786	0.63
787	0.56
788	0.52
789	0.47
790	0.44
791	0.42
792	0.4
793	0.34
794	0.33
795	0.3
796	0.24
797	0.23
798	0.21
799	0.21
800	0.19
801	0.16
802	0.1
803	0.11
804	0.13
805	0.12
806	0.13
807	0.11
808	0.13
809	0.13
810	0.13
811	0.14
812	0.12
813	0.13
814	0.14
815	0.14
816	0.13
817	0.13
818	0.16
819	0.17
820	0.19
821	0.26
822	0.32
823	0.4
824	0.48
825	0.54
826	0.57
827	0.65
828	0.72
829	0.76
830	0.79
831	0.8
832	0.83
833	0.89
834	0.94
835	0.94
836	0.94
837	0.94
838	0.91
839	0.9
840	0.9
841	0.9
842	0.89
843	0.86
844	0.84
845	0.8
846	0.75
847	0.72
848	0.64
849	0.63
850	0.6
851	0.58
852	0.5
853	0.45
854	0.44
855	0.42
856	0.41
857	0.39
858	0.4
859	0.4
860	0.47
861	0.54
862	0.54
863	0.54
864	0.53
865	0.48
866	0.46
867	0.49
868	0.5
869	0.46
870	0.47
871	0.46
872	0.47
873	0.54
874	0.58
875	0.5
876	0.48
877	0.49
878	0.47
879	0.46
880	0.45
881	0.4
882	0.37
883	0.36
884	0.35
885	0.3
886	0.29
887	0.28

A0A550C705

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer