Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CMT0

Protein Details
Accession A0A550CMT0    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
300-324VQTIPTPLKKTKKSKKETKTPSTTVHydrophilic
330-352TDATAPKEKRRKMKKLPRSAGSAHydrophilic
561-590FVALAEKRARRKERKEKKRQEEKHAKKAEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
261-283PKGAKNAKQNPNPKATKKASEKV
308-315KKTKKSKK
335-347PKEKRRKMKKLPR
567-596KRARRKERKEKKRQEEKHAKKAEKERKKAG
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007689  AalphaY_mating_typ-dep-bd-dom  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017970  Homeobox_CS  
IPR001356  Homeobox_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0019953  P:sexual reproduction  
Pfam View protein in Pfam  
PF04611  AalphaY_MDB  
PF00046  Homeodomain  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00027  HOMEOBOX_1  
PS50071  HOMEOBOX_2  
CDD cd00086  homeodomain  
Amino Acid Sequences MEDLVPYLQRISSSAKDIVRIAHSRGIRATLPSQPTTISFTGLPCPAFHEIRSRLEQAGLPRKAVNDTIAVYQDACSRWRRDLEQAFNQAAVTISPHNLHLFDALRTRMYIQQIQKWAAQVLEIPLKWKEEMDKQRAHIAATMGDSPKKARPKFHSEYSPLLELYFHFNAYPTYADRRVLAQKTGMLMRQITVWFQNHRRRAKTLLPRMPPTAKIPMEEFEREREKMARKMLPILLPPHLQHLGLGNAKTPEPTPKTLPIPKGAKNAKQNPNPKATKKASEKVPRAGPSTFPGSMTSAEVQTIPTPLKKTKKSKKETKTPSTTVPDIEMTDATAPKEKRRKMKKLPRSAGSAPQSVPMDVDGRSEKMKMSKKAVTNTFDAAAERAFARAAYPAPSKYAYVHTRKPSARSEQQPSPLGKGRPTANASRSTVPARRVSSRLNAMRPPYAFPAPYDNTSVPMTFAAAQTHKFSFVSDSHSFGFKARSSSKPTARHVSVEDLVHKFDCMRLLCAETSAPRSITFSSFEQARLLACAAPLDSAVVDLPRALRLRQPVVQPDAFAPFVALAEKRARRKERKEKKRQEEKHAKKAEKERKKAGLTGRSPLSMDVDDTSSRASSTGSSSRTPSVASSGRTPSLSSVSSRRSSGMSMPDTPRQEQDLPIMATSDFALGGEHDITVTPNMMAQLFGDDVQEDNTLVFDPSMQHDGLALDMLSFTNSTTGALNDMTADVNMPDINGFCASQHSFDDMNWAANLGLDAQDSSAFGSFDGVSDVSNSDLTWLLGQGLHDQTTNWQDASFTTPPSGSSHVDALGETYSYKLGGDDSMDAPLSFNGLNFGFDASDGFTGFGTANFGNASLMT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.31
3 0.34
4 0.35
5 0.36
6 0.37
7 0.37
8 0.35
9 0.36
10 0.36
11 0.36
12 0.37
13 0.37
14 0.32
15 0.33
16 0.33
17 0.34
18 0.38
19 0.37
20 0.36
21 0.33
22 0.33
23 0.35
24 0.31
25 0.26
26 0.21
27 0.21
28 0.25
29 0.27
30 0.26
31 0.19
32 0.24
33 0.26
34 0.27
35 0.27
36 0.31
37 0.34
38 0.4
39 0.45
40 0.43
41 0.39
42 0.4
43 0.41
44 0.41
45 0.47
46 0.42
47 0.39
48 0.38
49 0.38
50 0.38
51 0.37
52 0.29
53 0.22
54 0.23
55 0.23
56 0.23
57 0.22
58 0.2
59 0.19
60 0.21
61 0.2
62 0.21
63 0.24
64 0.25
65 0.3
66 0.36
67 0.39
68 0.45
69 0.53
70 0.58
71 0.61
72 0.64
73 0.6
74 0.54
75 0.5
76 0.4
77 0.31
78 0.22
79 0.16
80 0.11
81 0.12
82 0.13
83 0.14
84 0.15
85 0.15
86 0.16
87 0.17
88 0.17
89 0.18
90 0.21
91 0.22
92 0.21
93 0.21
94 0.23
95 0.24
96 0.28
97 0.33
98 0.34
99 0.4
100 0.45
101 0.47
102 0.46
103 0.43
104 0.39
105 0.31
106 0.26
107 0.21
108 0.19
109 0.23
110 0.21
111 0.22
112 0.22
113 0.24
114 0.24
115 0.24
116 0.24
117 0.28
118 0.38
119 0.44
120 0.48
121 0.48
122 0.55
123 0.54
124 0.5
125 0.43
126 0.34
127 0.28
128 0.24
129 0.26
130 0.22
131 0.22
132 0.22
133 0.22
134 0.27
135 0.35
136 0.37
137 0.41
138 0.47
139 0.56
140 0.62
141 0.68
142 0.7
143 0.66
144 0.69
145 0.64
146 0.58
147 0.48
148 0.41
149 0.33
150 0.24
151 0.26
152 0.21
153 0.16
154 0.14
155 0.14
156 0.15
157 0.16
158 0.17
159 0.13
160 0.18
161 0.2
162 0.21
163 0.21
164 0.26
165 0.32
166 0.33
167 0.32
168 0.28
169 0.28
170 0.3
171 0.32
172 0.28
173 0.22
174 0.2
175 0.18
176 0.19
177 0.18
178 0.16
179 0.18
180 0.2
181 0.25
182 0.33
183 0.42
184 0.48
185 0.55
186 0.58
187 0.58
188 0.61
189 0.64
190 0.66
191 0.68
192 0.68
193 0.67
194 0.67
195 0.69
196 0.66
197 0.58
198 0.52
199 0.5
200 0.42
201 0.37
202 0.34
203 0.32
204 0.33
205 0.34
206 0.31
207 0.28
208 0.32
209 0.31
210 0.32
211 0.34
212 0.35
213 0.37
214 0.43
215 0.42
216 0.38
217 0.43
218 0.45
219 0.42
220 0.4
221 0.38
222 0.34
223 0.31
224 0.3
225 0.29
226 0.26
227 0.23
228 0.2
229 0.19
230 0.2
231 0.2
232 0.2
233 0.17
234 0.17
235 0.18
236 0.18
237 0.17
238 0.2
239 0.22
240 0.25
241 0.27
242 0.31
243 0.39
244 0.44
245 0.46
246 0.46
247 0.48
248 0.5
249 0.55
250 0.56
251 0.56
252 0.59
253 0.67
254 0.68
255 0.71
256 0.74
257 0.7
258 0.74
259 0.74
260 0.68
261 0.67
262 0.62
263 0.63
264 0.62
265 0.64
266 0.64
267 0.67
268 0.68
269 0.65
270 0.67
271 0.61
272 0.57
273 0.5
274 0.42
275 0.35
276 0.36
277 0.29
278 0.23
279 0.21
280 0.19
281 0.19
282 0.19
283 0.17
284 0.12
285 0.12
286 0.11
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.11
292 0.14
293 0.2
294 0.28
295 0.36
296 0.47
297 0.55
298 0.65
299 0.73
300 0.8
301 0.84
302 0.87
303 0.88
304 0.87
305 0.86
306 0.78
307 0.75
308 0.7
309 0.61
310 0.51
311 0.42
312 0.33
313 0.25
314 0.22
315 0.15
316 0.1
317 0.11
318 0.11
319 0.09
320 0.14
321 0.14
322 0.21
323 0.3
324 0.35
325 0.43
326 0.53
327 0.63
328 0.69
329 0.79
330 0.82
331 0.85
332 0.88
333 0.81
334 0.78
335 0.71
336 0.68
337 0.61
338 0.53
339 0.42
340 0.37
341 0.34
342 0.26
343 0.23
344 0.16
345 0.13
346 0.1
347 0.12
348 0.1
349 0.11
350 0.11
351 0.12
352 0.12
353 0.18
354 0.25
355 0.27
356 0.32
357 0.37
358 0.4
359 0.47
360 0.51
361 0.47
362 0.42
363 0.39
364 0.34
365 0.29
366 0.24
367 0.18
368 0.12
369 0.1
370 0.08
371 0.06
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.06
376 0.07
377 0.09
378 0.11
379 0.11
380 0.13
381 0.14
382 0.14
383 0.15
384 0.21
385 0.24
386 0.28
387 0.34
388 0.36
389 0.43
390 0.44
391 0.47
392 0.45
393 0.46
394 0.49
395 0.49
396 0.51
397 0.48
398 0.52
399 0.53
400 0.48
401 0.45
402 0.42
403 0.37
404 0.32
405 0.31
406 0.27
407 0.27
408 0.29
409 0.29
410 0.27
411 0.31
412 0.32
413 0.3
414 0.3
415 0.29
416 0.29
417 0.28
418 0.3
419 0.28
420 0.29
421 0.3
422 0.3
423 0.31
424 0.36
425 0.37
426 0.35
427 0.35
428 0.34
429 0.35
430 0.33
431 0.31
432 0.26
433 0.23
434 0.2
435 0.18
436 0.23
437 0.21
438 0.22
439 0.23
440 0.19
441 0.2
442 0.2
443 0.2
444 0.13
445 0.12
446 0.11
447 0.09
448 0.09
449 0.09
450 0.09
451 0.1
452 0.12
453 0.13
454 0.13
455 0.12
456 0.11
457 0.12
458 0.13
459 0.19
460 0.18
461 0.2
462 0.2
463 0.21
464 0.21
465 0.19
466 0.21
467 0.14
468 0.19
469 0.2
470 0.24
471 0.31
472 0.37
473 0.44
474 0.48
475 0.51
476 0.53
477 0.51
478 0.49
479 0.43
480 0.4
481 0.35
482 0.29
483 0.28
484 0.22
485 0.22
486 0.19
487 0.18
488 0.13
489 0.12
490 0.15
491 0.12
492 0.13
493 0.13
494 0.15
495 0.15
496 0.15
497 0.15
498 0.12
499 0.15
500 0.14
501 0.14
502 0.12
503 0.14
504 0.14
505 0.15
506 0.16
507 0.14
508 0.15
509 0.15
510 0.16
511 0.15
512 0.14
513 0.12
514 0.1
515 0.1
516 0.08
517 0.07
518 0.07
519 0.06
520 0.06
521 0.06
522 0.05
523 0.04
524 0.04
525 0.04
526 0.04
527 0.04
528 0.04
529 0.05
530 0.08
531 0.09
532 0.1
533 0.13
534 0.17
535 0.21
536 0.25
537 0.28
538 0.3
539 0.35
540 0.34
541 0.32
542 0.29
543 0.27
544 0.23
545 0.19
546 0.15
547 0.09
548 0.09
549 0.09
550 0.08
551 0.08
552 0.15
553 0.21
554 0.27
555 0.36
556 0.45
557 0.54
558 0.65
559 0.74
560 0.78
561 0.84
562 0.89
563 0.92
564 0.94
565 0.95
566 0.93
567 0.93
568 0.93
569 0.91
570 0.9
571 0.88
572 0.8
573 0.76
574 0.79
575 0.78
576 0.77
577 0.75
578 0.73
579 0.72
580 0.72
581 0.7
582 0.67
583 0.66
584 0.58
585 0.57
586 0.5
587 0.43
588 0.4
589 0.35
590 0.29
591 0.2
592 0.18
593 0.13
594 0.13
595 0.12
596 0.12
597 0.13
598 0.1
599 0.1
600 0.09
601 0.08
602 0.07
603 0.12
604 0.17
605 0.19
606 0.2
607 0.22
608 0.24
609 0.24
610 0.23
611 0.19
612 0.2
613 0.21
614 0.21
615 0.23
616 0.25
617 0.26
618 0.26
619 0.26
620 0.22
621 0.22
622 0.21
623 0.19
624 0.22
625 0.26
626 0.28
627 0.28
628 0.28
629 0.25
630 0.26
631 0.27
632 0.29
633 0.27
634 0.3
635 0.33
636 0.38
637 0.4
638 0.4
639 0.38
640 0.36
641 0.34
642 0.29
643 0.29
644 0.29
645 0.27
646 0.25
647 0.24
648 0.19
649 0.18
650 0.17
651 0.13
652 0.07
653 0.06
654 0.06
655 0.05
656 0.07
657 0.06
658 0.06
659 0.06
660 0.06
661 0.07
662 0.07
663 0.08
664 0.06
665 0.07
666 0.08
667 0.08
668 0.07
669 0.07
670 0.08
671 0.08
672 0.08
673 0.08
674 0.07
675 0.07
676 0.09
677 0.09
678 0.08
679 0.07
680 0.07
681 0.08
682 0.08
683 0.07
684 0.06
685 0.07
686 0.1
687 0.13
688 0.13
689 0.12
690 0.13
691 0.13
692 0.12
693 0.11
694 0.08
695 0.05
696 0.06
697 0.06
698 0.06
699 0.06
700 0.05
701 0.06
702 0.06
703 0.07
704 0.07
705 0.08
706 0.09
707 0.09
708 0.09
709 0.08
710 0.09
711 0.08
712 0.08
713 0.08
714 0.06
715 0.07
716 0.07
717 0.06
718 0.06
719 0.06
720 0.08
721 0.08
722 0.08
723 0.08
724 0.13
725 0.14
726 0.15
727 0.16
728 0.18
729 0.18
730 0.18
731 0.24
732 0.2
733 0.21
734 0.19
735 0.18
736 0.14
737 0.14
738 0.14
739 0.08
740 0.08
741 0.06
742 0.07
743 0.07
744 0.07
745 0.07
746 0.08
747 0.08
748 0.08
749 0.07
750 0.09
751 0.09
752 0.09
753 0.11
754 0.09
755 0.09
756 0.1
757 0.1
758 0.09
759 0.09
760 0.09
761 0.08
762 0.09
763 0.1
764 0.09
765 0.09
766 0.09
767 0.1
768 0.11
769 0.14
770 0.16
771 0.16
772 0.16
773 0.16
774 0.2
775 0.24
776 0.25
777 0.2
778 0.18
779 0.18
780 0.19
781 0.26
782 0.24
783 0.2
784 0.19
785 0.19
786 0.21
787 0.24
788 0.27
789 0.22
790 0.22
791 0.23
792 0.22
793 0.22
794 0.21
795 0.18
796 0.15
797 0.13
798 0.11
799 0.1
800 0.09
801 0.09
802 0.09
803 0.08
804 0.08
805 0.09
806 0.11
807 0.13
808 0.13
809 0.15
810 0.16
811 0.15
812 0.15
813 0.14
814 0.14
815 0.11
816 0.1
817 0.11
818 0.11
819 0.12
820 0.12
821 0.12
822 0.1
823 0.1
824 0.11
825 0.1
826 0.1
827 0.1
828 0.1
829 0.09
830 0.1
831 0.1
832 0.09
833 0.11
834 0.1
835 0.11
836 0.11
837 0.11