Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CJH5

Protein Details
Accession A0A550CJH5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
311-331APPTKTARNNKRSPAKRPRVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
295-374IPRPPRSKTLKRKRAAAPPTKTARNNKRSPAKRPRVESDPPAASKSRASSSRKPTGRTKRETPKAATPPAGGRGGSRAAK
610-723RKRSSRIAVKESEKEEARLEARRRAEEREKNSRAKRHEARQTKEEERGRDARESAREQRKREREEREERAQREQDEKELAERAKAEEAQRKPAAGDTPAKANGSARSRSSRKRK
Subcellular Location(s) nucl 10mito 10mito_nucl 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028938  Rsf1-like  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0031213  C:RSF complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
CDD cd15489  PHD_SF  
Amino Acid Sequences MAPRRQAAPLAPPPPPQQPAWLTPHIQKLPEPLALLRTNWKWAAFGQFFFTFNHLFNMEDVTLDAIEDDLHHNTSLVLPRVMQRLLWTLTYDRKSTSNAWQNVLRRQYAKRDPAANPIGPDPSLATRNGSASRHNTAEPSASHDNSSPAPHITHSTDDVKMDESSAHVDMSASDPANIPTEATTEDVKPDAEERVDEHADAVTAPADSVKASEEVPEDVQSTEESKDWLQLPMLEKLDCLHLLTEWQFQNPSRLRQLMKSDDETATWRIEPIGYDVKKNAYWFIGADRLWIQRAIPRPPRSKTLKRKRAAAPPTKTARNNKRSPAKRPRVESDPPAASKSRASSSRKPTGRTKRETPKAATPPAGGRGGSRAAKAQANIKLDAQAKELAELQRQAQLNGARSTGTRISSRLRGRDEDEEWQQVPDEWLTVDDVETGGRRAATNGRSTRSSVRHAVGADKTRTTVATENARAAAKRRRAPESDEEDEESDAEDEKAMDSDGVSELTELSDDEGEEEQDESHLDGAQDEEQAVPQENNEPAEQPLPEGFVEWETIAVTLDEWEHVADPFENATHYLEKALYKALTKGIVPFVVEDLRAVERKRQIEEAVVHRKRSSRIAVKESEKEEARLEARRRAEEREKNSRAKRHEARQTKEEERGRDARESAREQRKREREEREERAQREQDEKELAERAKAEEAQRKPAAGDTPAKANGSARSRSSRKRKITTGIPASEITLLPAPSAGTRTPEWELDCEVCLRRGINIDDGIPMMCCGSCSRWQHITCHDRLDVAAGRPKRDWNAVDFVCNKCRVRQQEYAYAAQQQQQQQQAYYGAAAARPAYAPHQYAIGQPGAYAYGNGWTPAAGAGTPPYAGAYHNGHAAGYTGQPAYGHYQHQAPYAPVVNGALANGTNPAGGSGIANGTYLGQAQPDSAKWAMHTPPAPPPVQNPYTQTYAESSRYLHTQPGYGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.54
3 0.45
4 0.44
5 0.45
6 0.48
7 0.5
8 0.51
9 0.47
10 0.49
11 0.58
12 0.54
13 0.5
14 0.45
15 0.45
16 0.44
17 0.43
18 0.39
19 0.31
20 0.34
21 0.34
22 0.34
23 0.34
24 0.32
25 0.35
26 0.35
27 0.34
28 0.29
29 0.3
30 0.38
31 0.33
32 0.31
33 0.32
34 0.31
35 0.32
36 0.32
37 0.33
38 0.24
39 0.22
40 0.25
41 0.19
42 0.18
43 0.18
44 0.21
45 0.18
46 0.16
47 0.15
48 0.14
49 0.13
50 0.12
51 0.11
52 0.06
53 0.06
54 0.07
55 0.1
56 0.1
57 0.11
58 0.12
59 0.12
60 0.12
61 0.16
62 0.21
63 0.22
64 0.2
65 0.21
66 0.25
67 0.29
68 0.3
69 0.26
70 0.22
71 0.26
72 0.27
73 0.27
74 0.25
75 0.25
76 0.33
77 0.37
78 0.35
79 0.31
80 0.31
81 0.34
82 0.36
83 0.42
84 0.44
85 0.44
86 0.47
87 0.51
88 0.54
89 0.58
90 0.6
91 0.54
92 0.49
93 0.51
94 0.57
95 0.6
96 0.63
97 0.61
98 0.63
99 0.61
100 0.65
101 0.67
102 0.59
103 0.51
104 0.45
105 0.41
106 0.33
107 0.31
108 0.24
109 0.21
110 0.21
111 0.2
112 0.2
113 0.19
114 0.23
115 0.27
116 0.26
117 0.28
118 0.31
119 0.35
120 0.35
121 0.34
122 0.32
123 0.29
124 0.32
125 0.26
126 0.29
127 0.3
128 0.28
129 0.29
130 0.28
131 0.29
132 0.27
133 0.29
134 0.23
135 0.19
136 0.19
137 0.19
138 0.22
139 0.22
140 0.23
141 0.25
142 0.27
143 0.26
144 0.26
145 0.26
146 0.24
147 0.21
148 0.19
149 0.15
150 0.12
151 0.14
152 0.13
153 0.12
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.12
158 0.15
159 0.12
160 0.12
161 0.13
162 0.14
163 0.16
164 0.15
165 0.13
166 0.1
167 0.11
168 0.11
169 0.13
170 0.14
171 0.12
172 0.13
173 0.14
174 0.13
175 0.13
176 0.13
177 0.14
178 0.13
179 0.13
180 0.14
181 0.19
182 0.2
183 0.19
184 0.18
185 0.16
186 0.15
187 0.14
188 0.12
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.09
200 0.1
201 0.12
202 0.14
203 0.14
204 0.14
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.13
209 0.12
210 0.11
211 0.12
212 0.11
213 0.15
214 0.16
215 0.16
216 0.15
217 0.17
218 0.2
219 0.24
220 0.25
221 0.21
222 0.2
223 0.2
224 0.22
225 0.18
226 0.16
227 0.11
228 0.09
229 0.12
230 0.13
231 0.19
232 0.17
233 0.18
234 0.2
235 0.2
236 0.29
237 0.31
238 0.34
239 0.33
240 0.37
241 0.38
242 0.41
243 0.48
244 0.46
245 0.47
246 0.46
247 0.44
248 0.39
249 0.38
250 0.36
251 0.31
252 0.25
253 0.2
254 0.17
255 0.13
256 0.13
257 0.13
258 0.14
259 0.22
260 0.21
261 0.22
262 0.23
263 0.26
264 0.27
265 0.27
266 0.24
267 0.16
268 0.16
269 0.15
270 0.16
271 0.18
272 0.16
273 0.17
274 0.18
275 0.18
276 0.19
277 0.18
278 0.16
279 0.16
280 0.22
281 0.28
282 0.35
283 0.42
284 0.49
285 0.52
286 0.6
287 0.65
288 0.7
289 0.73
290 0.75
291 0.77
292 0.74
293 0.79
294 0.78
295 0.79
296 0.79
297 0.77
298 0.72
299 0.7
300 0.73
301 0.7
302 0.69
303 0.69
304 0.7
305 0.69
306 0.7
307 0.7
308 0.74
309 0.75
310 0.79
311 0.81
312 0.81
313 0.78
314 0.78
315 0.74
316 0.71
317 0.69
318 0.63
319 0.59
320 0.54
321 0.48
322 0.44
323 0.39
324 0.33
325 0.29
326 0.27
327 0.25
328 0.27
329 0.33
330 0.39
331 0.47
332 0.56
333 0.57
334 0.6
335 0.65
336 0.69
337 0.71
338 0.7
339 0.71
340 0.72
341 0.77
342 0.78
343 0.72
344 0.71
345 0.68
346 0.64
347 0.57
348 0.48
349 0.41
350 0.39
351 0.35
352 0.25
353 0.18
354 0.17
355 0.2
356 0.19
357 0.17
358 0.16
359 0.17
360 0.19
361 0.19
362 0.23
363 0.24
364 0.25
365 0.26
366 0.24
367 0.27
368 0.28
369 0.28
370 0.24
371 0.22
372 0.19
373 0.19
374 0.22
375 0.18
376 0.16
377 0.16
378 0.15
379 0.18
380 0.18
381 0.17
382 0.18
383 0.2
384 0.22
385 0.22
386 0.21
387 0.16
388 0.16
389 0.2
390 0.18
391 0.17
392 0.14
393 0.15
394 0.19
395 0.26
396 0.3
397 0.32
398 0.33
399 0.33
400 0.36
401 0.39
402 0.38
403 0.35
404 0.33
405 0.31
406 0.28
407 0.26
408 0.22
409 0.17
410 0.16
411 0.11
412 0.09
413 0.05
414 0.05
415 0.06
416 0.06
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.07
427 0.11
428 0.13
429 0.2
430 0.23
431 0.25
432 0.26
433 0.28
434 0.33
435 0.32
436 0.34
437 0.3
438 0.28
439 0.29
440 0.28
441 0.29
442 0.27
443 0.28
444 0.25
445 0.22
446 0.21
447 0.19
448 0.19
449 0.18
450 0.16
451 0.14
452 0.18
453 0.19
454 0.19
455 0.2
456 0.2
457 0.19
458 0.2
459 0.24
460 0.26
461 0.3
462 0.33
463 0.36
464 0.38
465 0.43
466 0.48
467 0.48
468 0.45
469 0.41
470 0.38
471 0.34
472 0.32
473 0.26
474 0.18
475 0.1
476 0.08
477 0.06
478 0.05
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.03
485 0.04
486 0.04
487 0.05
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.04
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.06
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.04
506 0.04
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.05
516 0.06
517 0.07
518 0.06
519 0.05
520 0.08
521 0.09
522 0.1
523 0.1
524 0.1
525 0.1
526 0.12
527 0.12
528 0.09
529 0.09
530 0.09
531 0.09
532 0.08
533 0.08
534 0.07
535 0.08
536 0.07
537 0.07
538 0.05
539 0.06
540 0.05
541 0.05
542 0.04
543 0.04
544 0.04
545 0.04
546 0.04
547 0.04
548 0.04
549 0.05
550 0.05
551 0.05
552 0.05
553 0.06
554 0.06
555 0.06
556 0.06
557 0.08
558 0.08
559 0.08
560 0.09
561 0.1
562 0.1
563 0.1
564 0.11
565 0.11
566 0.1
567 0.12
568 0.12
569 0.12
570 0.12
571 0.13
572 0.13
573 0.12
574 0.12
575 0.11
576 0.11
577 0.1
578 0.1
579 0.08
580 0.08
581 0.1
582 0.12
583 0.13
584 0.17
585 0.22
586 0.24
587 0.26
588 0.27
589 0.26
590 0.28
591 0.32
592 0.36
593 0.41
594 0.41
595 0.4
596 0.4
597 0.42
598 0.39
599 0.4
600 0.4
601 0.38
602 0.42
603 0.47
604 0.52
605 0.54
606 0.57
607 0.53
608 0.5
609 0.42
610 0.37
611 0.31
612 0.28
613 0.25
614 0.27
615 0.28
616 0.3
617 0.32
618 0.36
619 0.37
620 0.41
621 0.49
622 0.5
623 0.55
624 0.6
625 0.63
626 0.67
627 0.72
628 0.72
629 0.68
630 0.7
631 0.7
632 0.68
633 0.72
634 0.72
635 0.71
636 0.7
637 0.72
638 0.66
639 0.67
640 0.62
641 0.55
642 0.52
643 0.52
644 0.49
645 0.44
646 0.42
647 0.38
648 0.39
649 0.42
650 0.45
651 0.5
652 0.53
653 0.55
654 0.64
655 0.68
656 0.71
657 0.73
658 0.73
659 0.72
660 0.76
661 0.79
662 0.79
663 0.78
664 0.72
665 0.73
666 0.67
667 0.59
668 0.56
669 0.49
670 0.43
671 0.38
672 0.35
673 0.29
674 0.3
675 0.27
676 0.23
677 0.22
678 0.2
679 0.2
680 0.22
681 0.25
682 0.28
683 0.31
684 0.37
685 0.37
686 0.36
687 0.33
688 0.33
689 0.31
690 0.26
691 0.29
692 0.22
693 0.26
694 0.28
695 0.28
696 0.25
697 0.25
698 0.27
699 0.27
700 0.29
701 0.28
702 0.34
703 0.4
704 0.5
705 0.59
706 0.63
707 0.67
708 0.71
709 0.74
710 0.73
711 0.75
712 0.76
713 0.73
714 0.65
715 0.58
716 0.51
717 0.45
718 0.39
719 0.31
720 0.22
721 0.16
722 0.13
723 0.11
724 0.1
725 0.1
726 0.09
727 0.11
728 0.1
729 0.12
730 0.12
731 0.16
732 0.18
733 0.2
734 0.21
735 0.21
736 0.23
737 0.21
738 0.21
739 0.2
740 0.19
741 0.18
742 0.18
743 0.16
744 0.15
745 0.18
746 0.2
747 0.21
748 0.21
749 0.21
750 0.2
751 0.2
752 0.18
753 0.14
754 0.12
755 0.08
756 0.07
757 0.07
758 0.08
759 0.11
760 0.19
761 0.23
762 0.29
763 0.37
764 0.39
765 0.44
766 0.52
767 0.56
768 0.5
769 0.51
770 0.46
771 0.38
772 0.36
773 0.36
774 0.31
775 0.27
776 0.31
777 0.28
778 0.31
779 0.32
780 0.36
781 0.35
782 0.38
783 0.36
784 0.34
785 0.4
786 0.38
787 0.43
788 0.43
789 0.43
790 0.42
791 0.46
792 0.42
793 0.38
794 0.46
795 0.47
796 0.51
797 0.56
798 0.56
799 0.6
800 0.63
801 0.62
802 0.55
803 0.52
804 0.46
805 0.43
806 0.42
807 0.38
808 0.39
809 0.41
810 0.41
811 0.37
812 0.37
813 0.34
814 0.29
815 0.23
816 0.19
817 0.13
818 0.12
819 0.12
820 0.1
821 0.1
822 0.09
823 0.1
824 0.12
825 0.15
826 0.16
827 0.16
828 0.19
829 0.18
830 0.21
831 0.23
832 0.22
833 0.17
834 0.16
835 0.16
836 0.15
837 0.14
838 0.12
839 0.09
840 0.1
841 0.11
842 0.11
843 0.1
844 0.09
845 0.09
846 0.09
847 0.1
848 0.06
849 0.07
850 0.08
851 0.09
852 0.09
853 0.09
854 0.09
855 0.09
856 0.09
857 0.13
858 0.16
859 0.16
860 0.19
861 0.19
862 0.18
863 0.17
864 0.18
865 0.15
866 0.12
867 0.13
868 0.11
869 0.11
870 0.11
871 0.13
872 0.18
873 0.2
874 0.22
875 0.21
876 0.26
877 0.27
878 0.3
879 0.31
880 0.25
881 0.27
882 0.28
883 0.26
884 0.22
885 0.21
886 0.19
887 0.16
888 0.15
889 0.12
890 0.08
891 0.08
892 0.09
893 0.09
894 0.08
895 0.07
896 0.08
897 0.07
898 0.07
899 0.07
900 0.07
901 0.08
902 0.08
903 0.08
904 0.08
905 0.08
906 0.09
907 0.09
908 0.08
909 0.08
910 0.08
911 0.1
912 0.12
913 0.12
914 0.17
915 0.17
916 0.17
917 0.18
918 0.24
919 0.25
920 0.3
921 0.31
922 0.29
923 0.37
924 0.42
925 0.42
926 0.38
927 0.41
928 0.43
929 0.44
930 0.45
931 0.41
932 0.4
933 0.43
934 0.42
935 0.38
936 0.33
937 0.35
938 0.34
939 0.31
940 0.28
941 0.27
942 0.31
943 0.3
944 0.32
945 0.28