Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CU62

Protein Details
Accession A0A550CU62    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
141-166LTTRDLRSKAKKRKRRAPVDKLAPREBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
147-168RSKAKKRKRRAPVDKLAPREPR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR037818  TAF8  
IPR019473  TFIID_su8_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF10406  TAF8_C  
Amino Acid Sequences MSQSQATYYHYTNANYSTPSVQYSNPISQPSQPTQYAAYQIPQYQTNLPAQPPPRGRSSPDPTPDLDPEVASHLMRRFIAREIKKKGFDTAENAEVLARFEREVAGHIQNIFSVAHEYANLSHRSYIAPPDVYQACQGEGLTTRDLRSKAKKRKRRAPVDKLAPREPRAPSPELLPSDEEDQPRSYQGASKAPATLQNLPSYLPMLPPKHTYLKTPPTSAQQRHEALPSLEKKLQTASLVQDSLRNLMANTEDTADLDSDVLGSYVNWEQNMYGHSRKRWKVKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.27
3 0.27
4 0.25
5 0.23
6 0.25
7 0.25
8 0.22
9 0.25
10 0.29
11 0.33
12 0.33
13 0.34
14 0.33
15 0.36
16 0.42
17 0.42
18 0.42
19 0.37
20 0.36
21 0.36
22 0.37
23 0.35
24 0.3
25 0.28
26 0.25
27 0.27
28 0.27
29 0.26
30 0.27
31 0.25
32 0.26
33 0.28
34 0.28
35 0.27
36 0.31
37 0.32
38 0.38
39 0.41
40 0.42
41 0.44
42 0.43
43 0.48
44 0.51
45 0.55
46 0.56
47 0.55
48 0.54
49 0.49
50 0.51
51 0.47
52 0.41
53 0.34
54 0.25
55 0.2
56 0.21
57 0.2
58 0.16
59 0.17
60 0.15
61 0.17
62 0.17
63 0.18
64 0.16
65 0.2
66 0.3
67 0.34
68 0.42
69 0.47
70 0.54
71 0.57
72 0.56
73 0.56
74 0.5
75 0.45
76 0.42
77 0.38
78 0.34
79 0.29
80 0.28
81 0.23
82 0.19
83 0.18
84 0.13
85 0.09
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.09
91 0.11
92 0.12
93 0.13
94 0.13
95 0.13
96 0.12
97 0.13
98 0.11
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.08
106 0.12
107 0.13
108 0.12
109 0.12
110 0.12
111 0.13
112 0.14
113 0.15
114 0.13
115 0.13
116 0.13
117 0.16
118 0.16
119 0.16
120 0.16
121 0.14
122 0.12
123 0.11
124 0.11
125 0.08
126 0.09
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.13
132 0.15
133 0.19
134 0.27
135 0.35
136 0.45
137 0.55
138 0.64
139 0.71
140 0.8
141 0.86
142 0.88
143 0.88
144 0.88
145 0.87
146 0.89
147 0.85
148 0.8
149 0.77
150 0.7
151 0.62
152 0.57
153 0.49
154 0.44
155 0.43
156 0.4
157 0.33
158 0.31
159 0.33
160 0.3
161 0.29
162 0.24
163 0.2
164 0.22
165 0.24
166 0.22
167 0.19
168 0.19
169 0.18
170 0.18
171 0.17
172 0.14
173 0.15
174 0.18
175 0.22
176 0.22
177 0.22
178 0.22
179 0.22
180 0.27
181 0.27
182 0.29
183 0.25
184 0.25
185 0.24
186 0.24
187 0.24
188 0.21
189 0.17
190 0.14
191 0.19
192 0.19
193 0.21
194 0.24
195 0.28
196 0.34
197 0.35
198 0.37
199 0.4
200 0.48
201 0.49
202 0.5
203 0.48
204 0.5
205 0.58
206 0.58
207 0.54
208 0.52
209 0.51
210 0.49
211 0.49
212 0.43
213 0.35
214 0.38
215 0.36
216 0.34
217 0.35
218 0.33
219 0.32
220 0.31
221 0.32
222 0.25
223 0.24
224 0.23
225 0.24
226 0.25
227 0.25
228 0.25
229 0.24
230 0.25
231 0.23
232 0.18
233 0.14
234 0.14
235 0.16
236 0.14
237 0.14
238 0.14
239 0.13
240 0.13
241 0.14
242 0.13
243 0.11
244 0.1
245 0.08
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.05
250 0.04
251 0.07
252 0.11
253 0.13
254 0.13
255 0.13
256 0.14
257 0.16
258 0.19
259 0.21
260 0.26
261 0.31
262 0.39
263 0.49
264 0.56