FuNGI

A0A550C8Q9

Protein Details

Accession

A0A550C8Q9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
956-980	LVAGAGAGRRKRKRTKGPAADLSAT	Hydrophilic
1024-1052	APPAVGAGDKPKKKKRKTGEGEKGPHFRA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
962-972	AGRRKRKRTKG
1032-1053	DKPKKKKRKTGEGEKGPHFRAP

Subcellular Location(s)

extr 9, cyto 8.5, cyto_nucl 7, mito 5, nucl 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002562 3'-5'_exonuclease_dom IPR012588 Exosome-assoc_fac_Rrp6_N IPR010997 HRDC-like_sf IPR044876 HRDC_dom_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR045092 Rrp6-like
Gene Ontology	GO:0000176 C:nuclear exosome (RNase complex) GO:0000175 F:3'-5'-RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000166 F:nucleotide binding GO:0000467 P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF01612 DNA_pol_A_exo1 PF08066 PMC2NT

Amino Acid Sequences

MALDQLALNSTRLAAALPRDIAFHRTIDDDLGDDLDDVSDRVHTLLARLLALARPAAPADPADFKQVVDTVDWLLEGADDTLDVLTGKKKLPQIAVAPAPVPTRIMPNPDPDNRDVPFAYDDRTHPCKSSLTRLVLPTQAFQPQEPVHPKDTASTAPNIAPLPTDPPSFHNVSVDMITTPDALDALLGRLRNYASLPDRELLLAIDLEHHSAHSYRGFVCLMQLTVRVRALDGNAPAEQADYLVDALALRHHLTALNEFTTDAHIIKVFHGAASDIPWLAENFNVHVVGMFDTYHAARALGALAAAEGRPAPPLSLGHLLKTYCDYDADKRLARSDWRVRPLPPPLLSYARSDTHFLPFIYDVLKGLLADAPPTLAADPHGEDGGETAIEVLVESGEEAPEGALRQVFEASARTCLRAPRWLTGATLPHAARALARRMNRPVLGEEGSLDHAVFLALYRWRDGAARGADEGVGTILPNSALLIIADRWRALMTGLDGASRETLASTVGFTPISGALTAPTASGASSSAVSGTSDVTSTTSTAGQPTLTPLAAAAPHAALASLVAPASLPGPARVRAGEIVRVVEGAVRGWVPVTSTRMNGVAAAEVEAGAMTEDGAAAIAEVDAGATTRTAQAIAGMATRTGDNVAAEASGPAPSVAASALFGGASAPAATTSALFGGAPAKGKSSLFGAGPAKAQSSIFGGAPAKAQSSLFGGVLGKKPEVAASAASDAAARTSASAPGATTSASGATMGTSVPGTTTSTLFGGTLHRNAASDSTLKTSTGATFASKDASSAASGVSITSVDPSSALRTGPSLAAIAARVHASFGLGPIGVPTPVNSQDVKAGAFNAGSTATPNPAATAEHAFVPAGQRSGQSRGTANSRAFTSTRKTVTGLTDADRNAFAVLEMESAEMEGVEGEDALEPRGDMNGQGEESRSRKPTKASLPSQAAPTIMDDALVAGAGAGRRKRKRTKGPAADLSATVDSTPSVGATASAVGGSTSSSTVADSATVTFDFASVPNILDAQAPPAVGAGDKPKKKKRKTGEGEKGPHFRAPAPAPAEVRGVKVNMAHTFK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.14
3	0.18
4	0.2
5	0.2
6	0.22
7	0.23
8	0.26
9	0.25
10	0.23
11	0.2
12	0.2
13	0.2
14	0.2
15	0.19
16	0.16
17	0.15
18	0.14
19	0.13
20	0.11
21	0.1
22	0.09
23	0.09
24	0.07
25	0.07
26	0.07
27	0.07
28	0.07
29	0.09
30	0.09
31	0.1
32	0.14
33	0.15
34	0.14
35	0.14
36	0.15
37	0.15
38	0.16
39	0.16
40	0.12
41	0.12
42	0.13
43	0.13
44	0.12
45	0.12
46	0.14
47	0.19
48	0.2
49	0.24
50	0.24
51	0.23
52	0.24
53	0.25
54	0.23
55	0.18
56	0.19
57	0.14
58	0.14
59	0.14
60	0.11
61	0.09
62	0.08
63	0.08
64	0.07
65	0.05
66	0.05
67	0.05
68	0.05
69	0.05
70	0.06
71	0.06
72	0.1
73	0.13
74	0.15
75	0.2
76	0.24
77	0.3
78	0.33
79	0.38
80	0.4
81	0.45
82	0.47
83	0.43
84	0.39
85	0.37
86	0.34
87	0.28
88	0.25
89	0.18
90	0.21
91	0.22
92	0.29
93	0.29
94	0.35
95	0.43
96	0.47
97	0.52
98	0.49
99	0.52
100	0.45
101	0.47
102	0.39
103	0.34
104	0.32
105	0.27
106	0.27
107	0.25
108	0.27
109	0.3
110	0.36
111	0.35
112	0.33
113	0.34
114	0.38
115	0.39
116	0.47
117	0.47
118	0.48
119	0.51
120	0.52
121	0.53
122	0.51
123	0.48
124	0.4
125	0.34
126	0.33
127	0.29
128	0.26
129	0.3
130	0.26
131	0.34
132	0.38
133	0.4
134	0.38
135	0.39
136	0.39
137	0.35
138	0.36
139	0.32
140	0.28
141	0.26
142	0.25
143	0.24
144	0.26
145	0.24
146	0.21
147	0.18
148	0.16
149	0.18
150	0.19
151	0.2
152	0.18
153	0.21
154	0.26
155	0.28
156	0.27
157	0.24
158	0.22
159	0.22
160	0.22
161	0.19
162	0.14
163	0.12
164	0.12
165	0.1
166	0.09
167	0.08
168	0.07
169	0.06
170	0.06
171	0.05
172	0.07
173	0.08
174	0.09
175	0.09
176	0.11
177	0.11
178	0.12
179	0.13
180	0.18
181	0.21
182	0.24
183	0.26
184	0.26
185	0.26
186	0.25
187	0.24
188	0.18
189	0.14
190	0.11
191	0.08
192	0.1
193	0.09
194	0.1
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.1
199	0.12
200	0.11
201	0.13
202	0.12
203	0.15
204	0.16
205	0.14
206	0.16
207	0.15
208	0.14
209	0.13
210	0.17
211	0.15
212	0.18
213	0.19
214	0.17
215	0.16
216	0.16
217	0.18
218	0.19
219	0.18
220	0.18
221	0.17
222	0.17
223	0.17
224	0.16
225	0.13
226	0.09
227	0.08
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.06
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.08
239	0.09
240	0.11
241	0.15
242	0.16
243	0.16
244	0.15
245	0.15
246	0.15
247	0.16
248	0.15
249	0.12
250	0.1
251	0.1
252	0.11
253	0.11
254	0.14
255	0.12
256	0.11
257	0.11
258	0.11
259	0.1
260	0.11
261	0.12
262	0.08
263	0.08
264	0.09
265	0.09
266	0.09
267	0.1
268	0.08
269	0.09
270	0.1
271	0.1
272	0.09
273	0.09
274	0.09
275	0.09
276	0.09
277	0.07
278	0.06
279	0.08
280	0.08
281	0.09
282	0.08
283	0.08
284	0.07
285	0.07
286	0.08
287	0.06
288	0.06
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.04
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.05
297	0.06
298	0.06
299	0.07
300	0.08
301	0.11
302	0.19
303	0.19
304	0.19
305	0.22
306	0.21
307	0.21
308	0.23
309	0.2
310	0.13
311	0.15
312	0.16
313	0.18
314	0.24
315	0.28
316	0.28
317	0.28
318	0.3
319	0.3
320	0.31
321	0.36
322	0.39
323	0.43
324	0.47
325	0.49
326	0.49
327	0.52
328	0.55
329	0.53
330	0.45
331	0.4
332	0.38
333	0.39
334	0.38
335	0.36
336	0.33
337	0.28
338	0.28
339	0.28
340	0.25
341	0.24
342	0.25
343	0.21
344	0.2
345	0.18
346	0.17
347	0.16
348	0.14
349	0.11
350	0.09
351	0.09
352	0.07
353	0.07
354	0.08
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.04
363	0.05
364	0.07
365	0.08
366	0.08
367	0.08
368	0.08
369	0.07
370	0.08
371	0.07
372	0.05
373	0.04
374	0.04
375	0.03
376	0.03
377	0.03
378	0.03
379	0.02
380	0.02
381	0.03
382	0.03
383	0.03
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.05
391	0.05
392	0.06
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.08
397	0.09
398	0.14
399	0.14
400	0.15
401	0.16
402	0.19
403	0.21
404	0.26
405	0.28
406	0.25
407	0.27
408	0.27
409	0.26
410	0.27
411	0.27
412	0.21
413	0.24
414	0.21
415	0.19
416	0.18
417	0.17
418	0.16
419	0.16
420	0.2
421	0.2
422	0.23
423	0.27
424	0.3
425	0.34
426	0.33
427	0.32
428	0.28
429	0.27
430	0.25
431	0.21
432	0.17
433	0.15
434	0.15
435	0.13
436	0.11
437	0.07
438	0.06
439	0.06
440	0.05
441	0.04
442	0.05
443	0.07
444	0.07
445	0.08
446	0.08
447	0.09
448	0.1
449	0.11
450	0.15
451	0.14
452	0.14
453	0.14
454	0.14
455	0.13
456	0.13
457	0.12
458	0.06
459	0.04
460	0.03
461	0.03
462	0.03
463	0.03
464	0.03
465	0.03
466	0.03
467	0.03
468	0.03
469	0.04
470	0.04
471	0.06
472	0.07
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.07
477	0.06
478	0.06
479	0.06
480	0.08
481	0.08
482	0.08
483	0.08
484	0.08
485	0.08
486	0.07
487	0.06
488	0.04
489	0.04
490	0.04
491	0.04
492	0.05
493	0.05
494	0.06
495	0.06
496	0.05
497	0.06
498	0.06
499	0.06
500	0.05
501	0.05
502	0.04
503	0.05
504	0.05
505	0.04
506	0.04
507	0.04
508	0.04
509	0.04
510	0.04
511	0.04
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.05
520	0.04
521	0.05
522	0.05
523	0.05
524	0.06
525	0.06
526	0.06
527	0.06
528	0.07
529	0.07
530	0.07
531	0.06
532	0.08
533	0.08
534	0.07
535	0.07
536	0.06
537	0.07
538	0.06
539	0.07
540	0.05
541	0.04
542	0.04
543	0.04
544	0.04
545	0.03
546	0.03
547	0.03
548	0.03
549	0.03
550	0.03
551	0.03
552	0.03
553	0.04
554	0.04
555	0.04
556	0.06
557	0.08
558	0.09
559	0.1
560	0.1
561	0.11
562	0.13
563	0.13
564	0.14
565	0.13
566	0.12
567	0.12
568	0.11
569	0.1
570	0.09
571	0.08
572	0.05
573	0.05
574	0.05
575	0.05
576	0.05
577	0.05
578	0.05
579	0.07
580	0.11
581	0.11
582	0.12
583	0.13
584	0.13
585	0.13
586	0.13
587	0.11
588	0.08
589	0.07
590	0.07
591	0.06
592	0.05
593	0.05
594	0.04
595	0.04
596	0.03
597	0.03
598	0.02
599	0.02
600	0.02
601	0.02
602	0.02
603	0.02
604	0.02
605	0.02
606	0.02
607	0.02
608	0.02
609	0.02
610	0.02
611	0.02
612	0.02
613	0.02
614	0.03
615	0.04
616	0.04
617	0.04
618	0.04
619	0.05
620	0.05
621	0.06
622	0.06
623	0.06
624	0.06
625	0.06
626	0.06
627	0.06
628	0.06
629	0.06
630	0.05
631	0.05
632	0.05
633	0.04
634	0.05
635	0.05
636	0.05
637	0.04
638	0.04
639	0.04
640	0.04
641	0.04
642	0.04
643	0.04
644	0.04
645	0.04
646	0.04
647	0.04
648	0.04
649	0.04
650	0.03
651	0.03
652	0.03
653	0.03
654	0.03
655	0.03
656	0.03
657	0.04
658	0.04
659	0.04
660	0.04
661	0.04
662	0.04
663	0.04
664	0.05
665	0.06
666	0.08
667	0.08
668	0.09
669	0.1
670	0.11
671	0.11
672	0.12
673	0.13
674	0.11
675	0.16
676	0.16
677	0.15
678	0.17
679	0.17
680	0.15
681	0.14
682	0.14
683	0.1
684	0.11
685	0.11
686	0.1
687	0.11
688	0.11
689	0.11
690	0.12
691	0.12
692	0.11
693	0.1
694	0.1
695	0.09
696	0.1
697	0.11
698	0.1
699	0.1
700	0.1
701	0.12
702	0.15
703	0.16
704	0.14
705	0.13
706	0.13
707	0.12
708	0.13
709	0.11
710	0.09
711	0.09
712	0.1
713	0.1
714	0.1
715	0.09
716	0.08
717	0.07
718	0.07
719	0.05
720	0.05
721	0.06
722	0.07
723	0.08
724	0.08
725	0.08
726	0.08
727	0.09
728	0.07
729	0.07
730	0.06
731	0.06
732	0.06
733	0.06
734	0.05
735	0.05
736	0.05
737	0.04
738	0.05
739	0.04
740	0.04
741	0.04
742	0.05
743	0.06
744	0.07
745	0.08
746	0.09
747	0.09
748	0.09
749	0.09
750	0.09
751	0.12
752	0.13
753	0.14
754	0.14
755	0.14
756	0.14
757	0.15
758	0.15
759	0.13
760	0.13
761	0.12
762	0.15
763	0.15
764	0.15
765	0.15
766	0.15
767	0.14
768	0.14
769	0.13
770	0.11
771	0.12
772	0.12
773	0.14
774	0.13
775	0.13
776	0.12
777	0.12
778	0.11
779	0.09
780	0.09
781	0.07
782	0.07
783	0.06
784	0.06
785	0.05
786	0.05
787	0.06
788	0.06
789	0.06
790	0.06
791	0.07
792	0.09
793	0.1
794	0.1
795	0.09
796	0.1
797	0.11
798	0.11
799	0.11
800	0.09
801	0.08
802	0.09
803	0.09
804	0.09
805	0.08
806	0.08
807	0.08
808	0.08
809	0.07
810	0.08
811	0.07
812	0.07
813	0.07
814	0.06
815	0.06
816	0.07
817	0.08
818	0.07
819	0.07
820	0.08
821	0.11
822	0.13
823	0.16
824	0.15
825	0.15
826	0.18
827	0.19
828	0.19
829	0.16
830	0.14
831	0.13
832	0.12
833	0.11
834	0.09
835	0.08
836	0.07
837	0.09
838	0.09
839	0.09
840	0.1
841	0.1
842	0.1
843	0.1
844	0.11
845	0.12
846	0.15
847	0.14
848	0.14
849	0.14
850	0.13
851	0.13
852	0.16
853	0.15
854	0.13
855	0.12
856	0.14
857	0.17
858	0.22
859	0.24
860	0.23
861	0.24
862	0.26
863	0.31
864	0.35
865	0.34
866	0.31
867	0.3
868	0.31
869	0.3
870	0.3
871	0.31
872	0.32
873	0.34
874	0.32
875	0.33
876	0.33
877	0.35
878	0.37
879	0.32
880	0.27
881	0.3
882	0.28
883	0.28
884	0.25
885	0.22
886	0.17
887	0.14
888	0.12
889	0.08
890	0.08
891	0.07
892	0.07
893	0.07
894	0.06
895	0.06
896	0.06
897	0.05
898	0.04
899	0.04
900	0.04
901	0.03
902	0.03
903	0.04
904	0.06
905	0.06
906	0.07
907	0.07
908	0.07
909	0.07
910	0.08
911	0.08
912	0.07
913	0.09
914	0.11
915	0.12
916	0.13
917	0.14
918	0.19
919	0.21
920	0.26
921	0.3
922	0.32
923	0.35
924	0.4
925	0.47
926	0.52
927	0.6
928	0.6
929	0.64
930	0.67
931	0.66
932	0.63
933	0.55
934	0.45
935	0.35
936	0.31
937	0.24
938	0.17
939	0.14
940	0.11
941	0.1
942	0.1
943	0.09
944	0.07
945	0.03
946	0.05
947	0.06
948	0.11
949	0.16
950	0.26
951	0.34
952	0.44
953	0.54
954	0.64
955	0.74
956	0.81
957	0.87
958	0.89
959	0.91
960	0.91
961	0.87
962	0.78
963	0.67
964	0.6
965	0.49
966	0.38
967	0.28
968	0.19
969	0.13
970	0.11
971	0.1
972	0.06
973	0.06
974	0.05
975	0.06
976	0.06
977	0.07
978	0.06
979	0.06
980	0.06
981	0.05
982	0.05
983	0.06
984	0.06
985	0.06
986	0.07
987	0.07
988	0.07
989	0.08
990	0.08
991	0.08
992	0.08
993	0.08
994	0.1
995	0.1
996	0.1
997	0.09
998	0.09
999	0.09
1000	0.09
1001	0.11
1002	0.1
1003	0.1
1004	0.1
1005	0.11
1006	0.11
1007	0.12
1008	0.12
1009	0.13
1010	0.13
1011	0.13
1012	0.12
1013	0.12
1014	0.12
1015	0.1
1016	0.12
1017	0.19
1018	0.27
1019	0.35
1020	0.45
1021	0.55
1022	0.65
1023	0.75
1024	0.83
1025	0.84
1026	0.86
1027	0.9
1028	0.92
1029	0.93
1030	0.93
1031	0.92
1032	0.9
1033	0.86
1034	0.77
1035	0.69
1036	0.6
1037	0.51
1038	0.48
1039	0.44
1040	0.43
1041	0.4
1042	0.42
1043	0.41
1044	0.41
1045	0.44
1046	0.37
1047	0.36
1048	0.31
1049	0.28
1050	0.25
1051	0.26
1052	0.29

A0A550C8Q9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer