FuNGI

A0A550C0B4

Protein Details

Accession

A0A550C0B4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
774-798	ADNEQAKGKKDKRRKDLGSKINVLR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
780-788	KGKKDKRRK

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto 9, mito 4, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MSKTVADLTTVKSVGTSFPDTLEDVPDVRPVELEKIQKNEENPDGSPKTVSEMPFNLSTLRKHLSQITLARRVLPDDLVARQKLIEDSVYDVARQRLEHEYETMKNLDVSKTLKDKRIQRWMWEWHLKLRDRITNEIKSITAFEKKNYAYGKPKAHLKYQAEMISPYLALVNAERLSLLTIMELMTLHDTGGVTDGMKTARAVIQVGKAVEAEYKAQMCKRNHIAVPSSTRSSDLSVFSNLGYSNLLERRVAAARLMEDGEAWTAPWSVHTRARVGGVLIDCLMDTAKVQRSAVDKKDGSIVTEDQPAFFHSYEYQQGQRLGVIKLNQEVAVHMANEWSVDTVHPRHLPMLVKPKPWLNYNDGGYLYHKTYAMRFKGSREQQAYLKHASDAGQCELVYAGLDVLGSTPWKINRKVFDVVLDVWNRGDRWGKLPPASFDEPEPEPLSPDADSRTRANWTLSMKHYNQQKQSNHSHRCSVNYKIEIARTFLGETFYQPHNLDFRGRAYPVPPHLNHIGDDLSRGMLMFAEKKPLGERGFRWLKIHIANLYGFDKASFDERVQWVEDRLADVYDSAENPINGRRWWLNADDPWQCLAAAIELRDAIESGNPLEYESSLPVHQDGTCNGLQHYAALGGDPEGAAQVNLQKADRPSDVYTYVGRMVERLMEEDEKRGDPMAILLKGKISRKVVKQTVMTTVYGVTFIGARDQIERQLRDRKDIPAEHCWGAATYLARKVLACIGDLFYGAKHIMTWLNLCARLIAKSIPMDRLQEMIVADNEQAKGKKDKRRKDLGSKINVLRREQMTSVVWTTPMGLPIAQPYRKATRKQVKTALQTVLITDPNSLAEVNSSKQATAFPPNFIHSLDATHMMLTALECRQQNLTFASVHDSYWTHASSIDQMSGIIRDTFIALHSSDVLMRLHKEFLTRYANYKIPLISLGAPKFMKDLRGAGARIYATPEQAQKLQGIRELLEISETATTVDESKAQDTVQRLLGKDAAALDDAARLKKLAQMLKGDSKRDADDEDADDELAEDPADDEDAVDKKAMVELLGKFVNLTDILPPLPPKGTFRVEDIKDSPYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.23
3	0.24
4	0.19
5	0.2
6	0.22
7	0.23
8	0.24
9	0.24
10	0.2
11	0.17
12	0.17
13	0.2
14	0.2
15	0.18
16	0.18
17	0.17
18	0.22
19	0.26
20	0.33
21	0.34
22	0.39
23	0.43
24	0.46
25	0.47
26	0.48
27	0.48
28	0.45
29	0.41
30	0.45
31	0.43
32	0.4
33	0.39
34	0.32
35	0.31
36	0.31
37	0.31
38	0.28
39	0.28
40	0.3
41	0.31
42	0.31
43	0.3
44	0.28
45	0.29
46	0.29
47	0.3
48	0.28
49	0.29
50	0.34
51	0.35
52	0.39
53	0.45
54	0.48
55	0.53
56	0.52
57	0.53
58	0.48
59	0.46
60	0.4
61	0.33
62	0.27
63	0.22
64	0.27
65	0.3
66	0.3
67	0.28
68	0.26
69	0.27
70	0.24
71	0.23
72	0.19
73	0.14
74	0.18
75	0.22
76	0.22
77	0.21
78	0.22
79	0.23
80	0.24
81	0.23
82	0.22
83	0.25
84	0.29
85	0.3
86	0.31
87	0.33
88	0.34
89	0.37
90	0.35
91	0.29
92	0.27
93	0.27
94	0.24
95	0.23
96	0.23
97	0.26
98	0.34
99	0.39
100	0.44
101	0.49
102	0.58
103	0.63
104	0.72
105	0.69
106	0.67
107	0.71
108	0.72
109	0.74
110	0.74
111	0.67
112	0.64
113	0.69
114	0.65
115	0.63
116	0.61
117	0.58
118	0.54
119	0.6
120	0.6
121	0.57
122	0.55
123	0.51
124	0.44
125	0.38
126	0.37
127	0.32
128	0.32
129	0.27
130	0.26
131	0.32
132	0.33
133	0.38
134	0.38
135	0.4
136	0.42
137	0.48
138	0.55
139	0.52
140	0.61
141	0.59
142	0.63
143	0.66
144	0.61
145	0.59
146	0.57
147	0.56
148	0.49
149	0.45
150	0.39
151	0.31
152	0.26
153	0.21
154	0.14
155	0.1
156	0.09
157	0.09
158	0.11
159	0.1
160	0.1
161	0.1
162	0.1
163	0.11
164	0.11
165	0.1
166	0.06
167	0.06
168	0.06
169	0.07
170	0.06
171	0.06
172	0.07
173	0.07
174	0.07
175	0.08
176	0.07
177	0.07
178	0.09
179	0.08
180	0.07
181	0.07
182	0.09
183	0.08
184	0.09
185	0.09
186	0.1
187	0.12
188	0.12
189	0.13
190	0.14
191	0.17
192	0.2
193	0.2
194	0.19
195	0.17
196	0.16
197	0.16
198	0.15
199	0.13
200	0.13
201	0.15
202	0.17
203	0.21
204	0.28
205	0.29
206	0.36
207	0.41
208	0.46
209	0.46
210	0.49
211	0.49
212	0.47
213	0.53
214	0.49
215	0.45
216	0.38
217	0.37
218	0.33
219	0.31
220	0.28
221	0.22
222	0.2
223	0.19
224	0.19
225	0.18
226	0.18
227	0.15
228	0.13
229	0.12
230	0.1
231	0.13
232	0.14
233	0.16
234	0.14
235	0.15
236	0.18
237	0.19
238	0.19
239	0.16
240	0.15
241	0.15
242	0.17
243	0.16
244	0.13
245	0.11
246	0.11
247	0.1
248	0.09
249	0.08
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.1
254	0.13
255	0.15
256	0.2
257	0.22
258	0.23
259	0.24
260	0.26
261	0.23
262	0.2
263	0.21
264	0.17
265	0.15
266	0.13
267	0.12
268	0.1
269	0.09
270	0.09
271	0.05
272	0.05
273	0.09
274	0.14
275	0.15
276	0.15
277	0.19
278	0.24
279	0.31
280	0.35
281	0.39
282	0.34
283	0.34
284	0.4
285	0.37
286	0.33
287	0.29
288	0.27
289	0.21
290	0.27
291	0.26
292	0.2
293	0.2
294	0.2
295	0.2
296	0.18
297	0.17
298	0.12
299	0.15
300	0.18
301	0.2
302	0.21
303	0.21
304	0.22
305	0.21
306	0.22
307	0.22
308	0.19
309	0.2
310	0.2
311	0.18
312	0.19
313	0.19
314	0.18
315	0.15
316	0.14
317	0.14
318	0.12
319	0.11
320	0.09
321	0.08
322	0.08
323	0.08
324	0.07
325	0.06
326	0.05
327	0.05
328	0.09
329	0.1
330	0.15
331	0.16
332	0.17
333	0.17
334	0.21
335	0.22
336	0.25
337	0.34
338	0.34
339	0.35
340	0.37
341	0.41
342	0.4
343	0.42
344	0.4
345	0.35
346	0.37
347	0.36
348	0.37
349	0.33
350	0.31
351	0.28
352	0.26
353	0.22
354	0.17
355	0.16
356	0.13
357	0.17
358	0.24
359	0.25
360	0.29
361	0.29
362	0.32
363	0.41
364	0.45
365	0.49
366	0.45
367	0.45
368	0.44
369	0.48
370	0.48
371	0.41
372	0.37
373	0.29
374	0.26
375	0.25
376	0.23
377	0.2
378	0.17
379	0.16
380	0.15
381	0.14
382	0.13
383	0.12
384	0.09
385	0.06
386	0.04
387	0.03
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.06
395	0.11
396	0.16
397	0.19
398	0.24
399	0.28
400	0.32
401	0.35
402	0.33
403	0.31
404	0.29
405	0.27
406	0.28
407	0.24
408	0.2
409	0.17
410	0.18
411	0.15
412	0.14
413	0.16
414	0.13
415	0.16
416	0.21
417	0.24
418	0.26
419	0.28
420	0.28
421	0.31
422	0.33
423	0.29
424	0.24
425	0.25
426	0.23
427	0.24
428	0.23
429	0.16
430	0.15
431	0.15
432	0.15
433	0.12
434	0.12
435	0.12
436	0.12
437	0.14
438	0.14
439	0.16
440	0.17
441	0.17
442	0.18
443	0.19
444	0.21
445	0.24
446	0.26
447	0.31
448	0.3
449	0.34
450	0.41
451	0.43
452	0.46
453	0.5
454	0.5
455	0.51
456	0.59
457	0.65
458	0.64
459	0.6
460	0.59
461	0.52
462	0.54
463	0.51
464	0.47
465	0.43
466	0.37
467	0.37
468	0.33
469	0.34
470	0.29
471	0.27
472	0.22
473	0.16
474	0.15
475	0.13
476	0.14
477	0.11
478	0.11
479	0.13
480	0.13
481	0.15
482	0.15
483	0.15
484	0.15
485	0.16
486	0.17
487	0.14
488	0.16
489	0.16
490	0.16
491	0.16
492	0.16
493	0.19
494	0.21
495	0.27
496	0.24
497	0.25
498	0.27
499	0.27
500	0.26
501	0.23
502	0.2
503	0.14
504	0.14
505	0.1
506	0.08
507	0.07
508	0.06
509	0.05
510	0.04
511	0.05
512	0.07
513	0.07
514	0.11
515	0.11
516	0.12
517	0.13
518	0.17
519	0.19
520	0.19
521	0.2
522	0.25
523	0.3
524	0.31
525	0.31
526	0.28
527	0.29
528	0.28
529	0.29
530	0.21
531	0.17
532	0.17
533	0.17
534	0.17
535	0.14
536	0.11
537	0.09
538	0.09
539	0.07
540	0.09
541	0.08
542	0.08
543	0.11
544	0.12
545	0.14
546	0.15
547	0.15
548	0.13
549	0.13
550	0.13
551	0.1
552	0.1
553	0.08
554	0.07
555	0.07
556	0.07
557	0.06
558	0.06
559	0.07
560	0.07
561	0.07
562	0.08
563	0.11
564	0.12
565	0.11
566	0.14
567	0.13
568	0.14
569	0.16
570	0.18
571	0.18
572	0.19
573	0.24
574	0.23
575	0.23
576	0.22
577	0.2
578	0.18
579	0.14
580	0.12
581	0.08
582	0.07
583	0.07
584	0.06
585	0.06
586	0.06
587	0.06
588	0.06
589	0.05
590	0.04
591	0.05
592	0.05
593	0.06
594	0.05
595	0.06
596	0.06
597	0.06
598	0.07
599	0.07
600	0.08
601	0.07
602	0.08
603	0.08
604	0.09
605	0.09
606	0.09
607	0.08
608	0.12
609	0.13
610	0.13
611	0.13
612	0.13
613	0.12
614	0.11
615	0.11
616	0.07
617	0.06
618	0.05
619	0.05
620	0.04
621	0.05
622	0.04
623	0.04
624	0.03
625	0.03
626	0.03
627	0.04
628	0.06
629	0.07
630	0.08
631	0.08
632	0.1
633	0.11
634	0.15
635	0.15
636	0.17
637	0.17
638	0.19
639	0.2
640	0.19
641	0.19
642	0.17
643	0.18
644	0.15
645	0.13
646	0.11
647	0.1
648	0.11
649	0.1
650	0.1
651	0.11
652	0.13
653	0.13
654	0.15
655	0.17
656	0.15
657	0.15
658	0.14
659	0.12
660	0.09
661	0.12
662	0.14
663	0.14
664	0.14
665	0.14
666	0.16
667	0.2
668	0.22
669	0.24
670	0.25
671	0.29
672	0.35
673	0.44
674	0.46
675	0.48
676	0.49
677	0.46
678	0.47
679	0.43
680	0.37
681	0.28
682	0.24
683	0.19
684	0.16
685	0.14
686	0.07
687	0.06
688	0.05
689	0.07
690	0.06
691	0.07
692	0.09
693	0.1
694	0.15
695	0.21
696	0.23
697	0.26
698	0.34
699	0.35
700	0.39
701	0.41
702	0.4
703	0.42
704	0.45
705	0.46
706	0.44
707	0.47
708	0.41
709	0.39
710	0.34
711	0.27
712	0.22
713	0.19
714	0.13
715	0.11
716	0.13
717	0.14
718	0.14
719	0.14
720	0.14
721	0.16
722	0.15
723	0.13
724	0.11
725	0.12
726	0.12
727	0.12
728	0.11
729	0.08
730	0.09
731	0.08
732	0.07
733	0.06
734	0.07
735	0.08
736	0.09
737	0.1
738	0.12
739	0.15
740	0.15
741	0.15
742	0.15
743	0.15
744	0.15
745	0.15
746	0.13
747	0.12
748	0.15
749	0.18
750	0.19
751	0.2
752	0.22
753	0.21
754	0.21
755	0.19
756	0.17
757	0.15
758	0.14
759	0.13
760	0.11
761	0.11
762	0.12
763	0.12
764	0.13
765	0.14
766	0.16
767	0.25
768	0.32
769	0.41
770	0.49
771	0.58
772	0.65
773	0.75
774	0.8
775	0.82
776	0.85
777	0.84
778	0.83
779	0.81
780	0.78
781	0.73
782	0.68
783	0.59
784	0.55
785	0.47
786	0.42
787	0.35
788	0.32
789	0.28
790	0.27
791	0.27
792	0.21
793	0.19
794	0.16
795	0.17
796	0.15
797	0.14
798	0.11
799	0.1
800	0.09
801	0.15
802	0.23
803	0.22
804	0.22
805	0.26
806	0.35
807	0.41
808	0.46
809	0.51
810	0.54
811	0.61
812	0.69
813	0.73
814	0.72
815	0.73
816	0.74
817	0.66
818	0.58
819	0.49
820	0.42
821	0.35
822	0.29
823	0.22
824	0.16
825	0.14
826	0.12
827	0.12
828	0.11
829	0.08
830	0.09
831	0.11
832	0.11
833	0.15
834	0.15
835	0.14
836	0.15
837	0.17
838	0.18
839	0.25
840	0.25
841	0.25
842	0.27
843	0.29
844	0.3
845	0.28
846	0.27
847	0.18
848	0.19
849	0.17
850	0.17
851	0.15
852	0.14
853	0.13
854	0.11
855	0.11
856	0.09
857	0.11
858	0.09
859	0.13
860	0.14
861	0.15
862	0.18
863	0.19
864	0.21
865	0.2
866	0.21
867	0.17
868	0.18
869	0.22
870	0.19
871	0.19
872	0.18
873	0.17
874	0.16
875	0.19
876	0.19
877	0.13
878	0.14
879	0.15
880	0.17
881	0.18
882	0.18
883	0.14
884	0.14
885	0.14
886	0.14
887	0.15
888	0.1
889	0.08
890	0.08
891	0.08
892	0.08
893	0.08
894	0.1
895	0.08
896	0.09
897	0.1
898	0.1
899	0.1
900	0.11
901	0.11
902	0.12
903	0.14
904	0.15
905	0.17
906	0.17
907	0.2
908	0.19
909	0.25
910	0.31
911	0.3
912	0.33
913	0.36
914	0.39
915	0.37
916	0.39
917	0.32
918	0.26
919	0.25
920	0.23
921	0.22
922	0.26
923	0.25
924	0.28
925	0.27
926	0.26
927	0.28
928	0.27
929	0.26
930	0.21
931	0.23
932	0.23
933	0.28
934	0.28
935	0.26
936	0.29
937	0.26
938	0.25
939	0.27
940	0.23
941	0.2
942	0.23
943	0.26
944	0.25
945	0.27
946	0.28
947	0.26
948	0.29
949	0.29
950	0.29
951	0.27
952	0.25
953	0.25
954	0.24
955	0.2
956	0.18
957	0.16
958	0.13
959	0.12
960	0.11
961	0.09
962	0.08
963	0.09
964	0.09
965	0.1
966	0.12
967	0.14
968	0.15
969	0.16
970	0.15
971	0.19
972	0.2
973	0.23
974	0.26
975	0.28
976	0.28
977	0.29
978	0.31
979	0.28
980	0.26
981	0.23
982	0.18
983	0.15
984	0.15
985	0.12
986	0.15
987	0.17
988	0.16
989	0.16
990	0.15
991	0.15
992	0.18
993	0.25
994	0.26
995	0.28
996	0.34
997	0.4
998	0.51
999	0.55
1000	0.55
1001	0.51
1002	0.49
1003	0.47
1004	0.42
1005	0.39
1006	0.32
1007	0.31
1008	0.3
1009	0.29
1010	0.26
1011	0.23
1012	0.2
1013	0.18
1014	0.15
1015	0.11
1016	0.08
1017	0.06
1018	0.06
1019	0.07
1020	0.08
1021	0.07
1022	0.06
1023	0.09
1024	0.11
1025	0.12
1026	0.12
1027	0.12
1028	0.11
1029	0.14
1030	0.14
1031	0.11
1032	0.15
1033	0.15
1034	0.21
1035	0.21
1036	0.2
1037	0.18
1038	0.18
1039	0.2
1040	0.15
1041	0.14
1042	0.11
1043	0.12
1044	0.13
1045	0.16
1046	0.17
1047	0.18
1048	0.21
1049	0.22
1050	0.24
1051	0.29
1052	0.34
1053	0.34
1054	0.39
1055	0.46
1056	0.45
1057	0.5
1058	0.48
1059	0.47
1060	0.43

A0A550C0B4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer