Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A550CH05

Protein Details
Accession A0A550CH05    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
192-250STSASDSTKKRKKEKKERTNHVLDVPDPKEDKRKRKVEKREKKEEKRRKEKGKGKETGPBasic
261-283MSEGREKKESRKRKSHSNEDTTIHydrophilic
288-337IGDAPAPEERPKKKRKKDDQDPSNGGVDAEAARKERKRLKREAKAAASLLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
200-248KKRKKEKKERTNHVLDVPDPKEDKRKRKVEKREKKEEKRRKEKGKGKET
264-274GREKKESRKRK
296-304ERPKKKRKK
318-332AARKERKRLKREAKA
Subcellular Location(s) nucl 20.5, mito_nucl 11.5, cyto 5
Family & Domain DBs
Amino Acid Sequences MVLNTHGYLVSQGWSGQGNGLRHGAIARPIIIAQKKNNKGLGKERDDGFQFWNHVFDAAVKTINIKIADSDDESDDKSDDNAPTLAALNRTSTGILSNRAPVLGVSALSSETSSGTSTPTVSMSIFAQAKRETAKRTLYGRFYRGAVIKSDDDDMLQHEVELAECSSSSSPPLATAVASESAVTLSISAAESTSASDSTKKRKKEKKERTNHVLDVPDPKEDKRKRKVEKREKKEEKRRKEKGKGKETGPAAVVEEPDTRMSEGREKKESRKRKSHSNEDTTIPIPDIGDAPAPEERPKKKRKKDDQDPSNGGVDAEAARKERKRLKREAKAAASLLEEEKRRDEQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.15
4 0.2
5 0.19
6 0.21
7 0.23
8 0.21
9 0.2
10 0.21
11 0.19
12 0.18
13 0.19
14 0.17
15 0.16
16 0.17
17 0.24
18 0.29
19 0.32
20 0.37
21 0.45
22 0.51
23 0.56
24 0.62
25 0.59
26 0.6
27 0.65
28 0.67
29 0.63
30 0.63
31 0.58
32 0.56
33 0.55
34 0.5
35 0.43
36 0.37
37 0.32
38 0.27
39 0.27
40 0.22
41 0.19
42 0.17
43 0.17
44 0.16
45 0.15
46 0.15
47 0.13
48 0.15
49 0.16
50 0.2
51 0.18
52 0.14
53 0.14
54 0.15
55 0.18
56 0.18
57 0.18
58 0.16
59 0.17
60 0.17
61 0.17
62 0.15
63 0.13
64 0.13
65 0.15
66 0.13
67 0.14
68 0.13
69 0.12
70 0.13
71 0.14
72 0.14
73 0.12
74 0.13
75 0.12
76 0.12
77 0.13
78 0.13
79 0.11
80 0.13
81 0.13
82 0.15
83 0.15
84 0.17
85 0.16
86 0.16
87 0.16
88 0.12
89 0.12
90 0.1
91 0.09
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.08
96 0.08
97 0.06
98 0.05
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.08
109 0.09
110 0.08
111 0.12
112 0.14
113 0.13
114 0.16
115 0.15
116 0.17
117 0.2
118 0.22
119 0.21
120 0.24
121 0.28
122 0.3
123 0.34
124 0.38
125 0.42
126 0.43
127 0.42
128 0.39
129 0.36
130 0.35
131 0.32
132 0.28
133 0.22
134 0.21
135 0.19
136 0.18
137 0.19
138 0.15
139 0.13
140 0.12
141 0.12
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.11
184 0.14
185 0.24
186 0.3
187 0.37
188 0.47
189 0.56
190 0.67
191 0.73
192 0.82
193 0.83
194 0.87
195 0.9
196 0.88
197 0.87
198 0.78
199 0.7
200 0.61
201 0.51
202 0.47
203 0.39
204 0.34
205 0.28
206 0.26
207 0.33
208 0.39
209 0.47
210 0.5
211 0.59
212 0.66
213 0.75
214 0.85
215 0.86
216 0.89
217 0.89
218 0.91
219 0.92
220 0.93
221 0.94
222 0.93
223 0.93
224 0.93
225 0.93
226 0.93
227 0.92
228 0.9
229 0.89
230 0.89
231 0.85
232 0.76
233 0.73
234 0.64
235 0.56
236 0.48
237 0.38
238 0.29
239 0.23
240 0.21
241 0.16
242 0.15
243 0.13
244 0.13
245 0.13
246 0.13
247 0.12
248 0.14
249 0.22
250 0.28
251 0.32
252 0.4
253 0.44
254 0.53
255 0.63
256 0.71
257 0.72
258 0.75
259 0.75
260 0.78
261 0.84
262 0.85
263 0.85
264 0.83
265 0.76
266 0.69
267 0.67
268 0.57
269 0.48
270 0.37
271 0.27
272 0.19
273 0.16
274 0.13
275 0.1
276 0.11
277 0.1
278 0.12
279 0.14
280 0.16
281 0.21
282 0.28
283 0.36
284 0.44
285 0.55
286 0.63
287 0.72
288 0.81
289 0.87
290 0.91
291 0.93
292 0.95
293 0.94
294 0.94
295 0.89
296 0.81
297 0.72
298 0.61
299 0.49
300 0.38
301 0.29
302 0.2
303 0.16
304 0.16
305 0.16
306 0.22
307 0.26
308 0.35
309 0.43
310 0.52
311 0.58
312 0.67
313 0.76
314 0.8
315 0.86
316 0.88
317 0.85
318 0.81
319 0.74
320 0.65
321 0.55
322 0.47
323 0.41
324 0.36
325 0.31
326 0.28