FuNGI

A0A550CU83

Protein Details

Accession

A0A550CU83

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
264-411	EMERSNKKRKRKIESDSERPSKKKRKKAAVSSEDSDSESDSEDERRRKKRKRSRSKSKSKKVESDAEDEDDPPKRKSKKSRKRQLSDSDASDSEHERASKKTKKKKSRRSRSSDSSGSETESEDEERRQRQQKRKRKIDRSPSPDLLL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
268-291	SNKKRKRKIESDSERPSKKKRKKA
308-325	RRRKKRKRSRSKSKSKKV
335-347	PPKRKSKKSRKRQ
359-374	ERASKKTKKKKSRRSR
391-401	RQRQQKRKRKI

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 13, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MSARKATDLEKKVHKAALKASNKELSVEDVADIIPDAKTRTDALNFLLKVGLLRSLKNEKGKVSFRAITKEELTTTKDLTAEEGLVLNHIKASKNEGIWTKHLKAKTNLAQALIDKCLKTLTQKKLIKRVASVQHPTRKIYMLEGVDPSIALTGGPWYTDNELDVAFINTLSRACLKIVRDLSFPRHSTGDKQGALFPVGSQPDYPTAQKIRSALQRVHLTDTDLSEEHVESLLNVLILDGEIERIPVGISAPRHDDAESSEEEMERSNKKRKRKIESDSERPSKKKRKKAAVSSEDSDSESDSEDERRRKKRKRSRSKSKSKKVESDAEDEDDPPKRKSKKSRKRQLSDSDASDSEHERASKKTKKKKSRRSRSSDSSGSETESEDEERRQRQQKRKRKIDRSPSPDLLLGVNLDDSEGVFAYRAVRQEQLSLGWSQAPCSICPSFNFCKEGGPVNPTECVYYTDWLASANVQAVDEGEQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.51
3	0.55
4	0.58
5	0.57
6	0.56
7	0.58
8	0.59
9	0.56
10	0.53
11	0.45
12	0.39
13	0.33
14	0.29
15	0.23
16	0.17
17	0.17
18	0.15
19	0.14
20	0.1
21	0.08
22	0.08
23	0.09
24	0.1
25	0.11
26	0.13
27	0.17
28	0.19
29	0.2
30	0.23
31	0.29
32	0.29
33	0.28
34	0.26
35	0.22
36	0.2
37	0.19
38	0.23
39	0.16
40	0.17
41	0.23
42	0.3
43	0.36
44	0.43
45	0.46
46	0.44
47	0.51
48	0.55
49	0.54
50	0.54
51	0.53
52	0.49
53	0.53
54	0.5
55	0.47
56	0.44
57	0.4
58	0.35
59	0.32
60	0.34
61	0.28
62	0.27
63	0.24
64	0.23
65	0.21
66	0.21
67	0.19
68	0.15
69	0.13
70	0.13
71	0.11
72	0.12
73	0.12
74	0.09
75	0.1
76	0.11
77	0.13
78	0.12
79	0.2
80	0.23
81	0.23
82	0.28
83	0.33
84	0.35
85	0.4
86	0.46
87	0.43
88	0.44
89	0.46
90	0.48
91	0.46
92	0.52
93	0.54
94	0.55
95	0.53
96	0.49
97	0.47
98	0.43
99	0.41
100	0.35
101	0.29
102	0.2
103	0.19
104	0.19
105	0.18
106	0.23
107	0.3
108	0.35
109	0.43
110	0.49
111	0.55
112	0.64
113	0.69
114	0.64
115	0.59
116	0.59
117	0.57
118	0.59
119	0.6
120	0.58
121	0.61
122	0.6
123	0.59
124	0.52
125	0.47
126	0.4
127	0.34
128	0.32
129	0.25
130	0.24
131	0.23
132	0.21
133	0.18
134	0.18
135	0.15
136	0.09
137	0.07
138	0.05
139	0.04
140	0.05
141	0.05
142	0.05
143	0.06
144	0.07
145	0.09
146	0.09
147	0.09
148	0.09
149	0.09
150	0.09
151	0.09
152	0.08
153	0.06
154	0.06
155	0.06
156	0.06
157	0.06
158	0.06
159	0.07
160	0.07
161	0.08
162	0.12
163	0.13
164	0.2
165	0.24
166	0.25
167	0.27
168	0.29
169	0.35
170	0.37
171	0.37
172	0.32
173	0.3
174	0.29
175	0.3
176	0.35
177	0.36
178	0.3
179	0.3
180	0.3
181	0.29
182	0.29
183	0.24
184	0.17
185	0.14
186	0.13
187	0.13
188	0.11
189	0.11
190	0.13
191	0.15
192	0.15
193	0.15
194	0.17
195	0.17
196	0.19
197	0.2
198	0.22
199	0.26
200	0.3
201	0.28
202	0.32
203	0.36
204	0.35
205	0.37
206	0.32
207	0.28
208	0.25
209	0.24
210	0.19
211	0.14
212	0.13
213	0.1
214	0.1
215	0.08
216	0.08
217	0.07
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.03
225	0.03
226	0.04
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.04
236	0.06
237	0.06
238	0.08
239	0.11
240	0.12
241	0.13
242	0.13
243	0.12
244	0.12
245	0.15
246	0.14
247	0.12
248	0.12
249	0.11
250	0.11
251	0.12
252	0.13
253	0.15
254	0.19
255	0.27
256	0.32
257	0.41
258	0.5
259	0.58
260	0.66
261	0.71
262	0.74
263	0.76
264	0.8
265	0.8
266	0.81
267	0.8
268	0.75
269	0.69
270	0.71
271	0.71
272	0.71
273	0.71
274	0.71
275	0.74
276	0.79
277	0.86
278	0.87
279	0.85
280	0.82
281	0.74
282	0.67
283	0.56
284	0.47
285	0.37
286	0.26
287	0.17
288	0.12
289	0.1
290	0.09
291	0.13
292	0.18
293	0.25
294	0.33
295	0.43
296	0.52
297	0.61
298	0.72
299	0.78
300	0.84
301	0.88
302	0.91
303	0.93
304	0.94
305	0.96
306	0.96
307	0.96
308	0.95
309	0.92
310	0.89
311	0.84
312	0.82
313	0.74
314	0.69
315	0.6
316	0.52
317	0.45
318	0.37
319	0.33
320	0.3
321	0.29
322	0.25
323	0.3
324	0.33
325	0.41
326	0.52
327	0.61
328	0.65
329	0.74
330	0.83
331	0.87
332	0.89
333	0.9
334	0.89
335	0.87
336	0.82
337	0.74
338	0.67
339	0.56
340	0.49
341	0.41
342	0.32
343	0.24
344	0.21
345	0.19
346	0.16
347	0.21
348	0.29
349	0.37
350	0.45
351	0.54
352	0.63
353	0.73
354	0.82
355	0.89
356	0.91
357	0.94
358	0.95
359	0.94
360	0.93
361	0.91
362	0.88
363	0.84
364	0.76
365	0.7
366	0.6
367	0.52
368	0.43
369	0.34
370	0.27
371	0.22
372	0.21
373	0.17
374	0.21
375	0.24
376	0.28
377	0.35
378	0.43
379	0.51
380	0.59
381	0.68
382	0.75
383	0.8
384	0.87
385	0.9
386	0.92
387	0.93
388	0.94
389	0.94
390	0.91
391	0.89
392	0.82
393	0.73
394	0.64
395	0.54
396	0.43
397	0.33
398	0.25
399	0.16
400	0.12
401	0.09
402	0.08
403	0.07
404	0.06
405	0.06
406	0.06
407	0.05
408	0.05
409	0.06
410	0.08
411	0.11
412	0.14
413	0.15
414	0.18
415	0.19
416	0.21
417	0.22
418	0.22
419	0.22
420	0.2
421	0.19
422	0.21
423	0.2
424	0.19
425	0.22
426	0.21
427	0.19
428	0.24
429	0.26
430	0.22
431	0.25
432	0.32
433	0.34
434	0.38
435	0.4
436	0.35
437	0.37
438	0.38
439	0.42
440	0.38
441	0.36
442	0.34
443	0.33
444	0.36
445	0.32
446	0.31
447	0.26
448	0.27
449	0.24
450	0.23
451	0.22
452	0.2
453	0.2
454	0.18
455	0.18
456	0.14
457	0.13
458	0.15
459	0.14
460	0.13
461	0.13

A0A550CU83

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer