FuNGI

A0A550CY96

Protein Details

Accession

A0A550CY96

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
38-58	EYWVVQWRNPQTRKHKTWDED	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 9, cyto 5.5, mito 5, plas 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR038718 SNF2-like_sf IPR000330 SNF2_N
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005524 F:ATP binding GO:0140658 F:ATP-dependent chromatin remodeler activity GO:0016787 F:hydrolase activity
Pfam	View protein in Pfam PF00271 Helicase_C PF00176 SNF2-rel_dom
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18004 DEXHc_RAD54 cd18793 SF2_C_SNF

Amino Acid Sequences

MPAFQNPVVPTKRKSEVADGPSAKRHQSEAGPSGSNEEYWVVQWRNPQTRKHKTWDEDGVLQVAGGKATLYDMDGKISTFGKADLPLFPGKNFSVGGKDLELDRPLTKRDFLSGSCFGSSTFSVSTPGQRSPIKTSQKAYKAFKPPSISKPLLTPSVPSRGIPLQPVNLLATSPPSSQLKAFDDMEMQKDAVWSVVWRKPVCNKNKQTWDGDAYTTKSEDKLTMVSEEGKVMGSTSCKGHILCDGYRMYIGGKEVRFDSVIPRSQLPIPVRERLRNNEEDEDVEIVDAPSTKPEPVKPIAAVSFYGAPAKPKVPTALHDPQAEDAVVMKAPTKDHIKKFNTKNLPVVPVVIDPVLRRRLRPHQIEGVKFLYECVMGLRKHEGQGCILADEMGLGKTLQTITLVWTLLKQNPYAGVAPAVQKVLIVCPVSLVNNWKSEFHKWLGRDRVGVTVCDNSNKGLQTFLHGGKHQQVLIIGYERLRTVVNKITTCIPPVGLIICDEGHRLKSANNKTTTMFKALKTPRRVILSGTPIQNDLSEFHAMADFCNPGLLDDYNTFRRVYEAPIVKSRTPEATSKEVEIGEGRLAQLLTISNSFVLRRDATLLSNYLPPKHEHIVFVKPTALQLSMYRKILHPDKVDDFVNGSQADTLALLGTLKKVSNSPILVKAANDKVKEGSKASTSVARNAMVDALTVLQPDARIDDMTLSGKLILVSKLLKHVYEHTDEKVVFVSHYTSALNILAAYCDKKRYKYGRLDGDTATGKRQEYVNTFNKSSQRSNFVFLLSSKAGGVGINLTGASRLILFDCDWNPSYDLQSAARCHRDGQKRPVHIYRLMTAGLIDEKIYQRQVTKLGLSSSLMGSESSKDKSDSFTRKDLRDLFRVYADTGCNTHDLLECPCEAAVPSSSPDDEFPEDCESDEEDSIIRNGFMSASQVKSKDIGKVDKAELVKKKAALASLSEFKHINCLGPAAQNVSDGVLRSLLHREAAVSAPKSQLDTLLNIDLETLDAMDASKKFQALPGGTVTYVFEKSSSTTPEDVKDDQT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.53
2	0.54
3	0.56
4	0.57
5	0.63
6	0.6
7	0.58
8	0.6
9	0.59
10	0.53
11	0.45
12	0.42
13	0.38
14	0.39
15	0.44
16	0.42
17	0.43
18	0.42
19	0.41
20	0.43
21	0.38
22	0.31
23	0.24
24	0.2
25	0.16
26	0.15
27	0.23
28	0.2
29	0.22
30	0.3
31	0.38
32	0.47
33	0.52
34	0.61
35	0.64
36	0.73
37	0.78
38	0.8
39	0.81
40	0.76
41	0.79
42	0.79
43	0.74
44	0.66
45	0.6
46	0.52
47	0.42
48	0.36
49	0.29
50	0.2
51	0.13
52	0.09
53	0.07
54	0.06
55	0.07
56	0.07
57	0.07
58	0.11
59	0.12
60	0.14
61	0.15
62	0.15
63	0.17
64	0.17
65	0.17
66	0.13
67	0.14
68	0.14
69	0.16
70	0.17
71	0.17
72	0.2
73	0.26
74	0.26
75	0.26
76	0.27
77	0.25
78	0.26
79	0.25
80	0.22
81	0.21
82	0.21
83	0.23
84	0.19
85	0.2
86	0.2
87	0.22
88	0.23
89	0.2
90	0.22
91	0.22
92	0.25
93	0.27
94	0.28
95	0.26
96	0.29
97	0.3
98	0.29
99	0.33
100	0.33
101	0.33
102	0.31
103	0.3
104	0.25
105	0.24
106	0.23
107	0.19
108	0.16
109	0.14
110	0.16
111	0.18
112	0.24
113	0.25
114	0.27
115	0.29
116	0.31
117	0.35
118	0.4
119	0.49
120	0.51
121	0.53
122	0.57
123	0.61
124	0.66
125	0.71
126	0.69
127	0.69
128	0.7
129	0.7
130	0.7
131	0.68
132	0.67
133	0.66
134	0.69
135	0.61
136	0.52
137	0.52
138	0.5
139	0.47
140	0.4
141	0.36
142	0.32
143	0.37
144	0.37
145	0.31
146	0.32
147	0.32
148	0.33
149	0.34
150	0.33
151	0.28
152	0.28
153	0.29
154	0.26
155	0.22
156	0.2
157	0.15
158	0.16
159	0.16
160	0.15
161	0.18
162	0.18
163	0.2
164	0.21
165	0.26
166	0.25
167	0.27
168	0.27
169	0.24
170	0.27
171	0.28
172	0.29
173	0.26
174	0.22
175	0.18
176	0.17
177	0.16
178	0.12
179	0.1
180	0.09
181	0.15
182	0.18
183	0.24
184	0.25
185	0.29
186	0.38
187	0.46
188	0.54
189	0.59
190	0.63
191	0.67
192	0.76
193	0.77
194	0.73
195	0.69
196	0.65
197	0.57
198	0.52
199	0.45
200	0.37
201	0.33
202	0.3
203	0.25
204	0.21
205	0.19
206	0.17
207	0.16
208	0.15
209	0.15
210	0.15
211	0.15
212	0.17
213	0.16
214	0.15
215	0.14
216	0.12
217	0.11
218	0.1
219	0.1
220	0.09
221	0.11
222	0.12
223	0.13
224	0.14
225	0.15
226	0.15
227	0.19
228	0.22
229	0.2
230	0.25
231	0.23
232	0.22
233	0.22
234	0.22
235	0.17
236	0.14
237	0.16
238	0.16
239	0.16
240	0.17
241	0.17
242	0.19
243	0.18
244	0.17
245	0.2
246	0.22
247	0.26
248	0.27
249	0.27
250	0.28
251	0.29
252	0.35
253	0.32
254	0.34
255	0.33
256	0.39
257	0.42
258	0.46
259	0.5
260	0.51
261	0.55
262	0.52
263	0.53
264	0.49
265	0.46
266	0.4
267	0.36
268	0.3
269	0.22
270	0.17
271	0.13
272	0.09
273	0.09
274	0.08
275	0.06
276	0.08
277	0.09
278	0.1
279	0.12
280	0.14
281	0.19
282	0.22
283	0.25
284	0.23
285	0.25
286	0.25
287	0.24
288	0.22
289	0.18
290	0.17
291	0.14
292	0.16
293	0.13
294	0.14
295	0.15
296	0.16
297	0.16
298	0.16
299	0.2
300	0.19
301	0.21
302	0.28
303	0.33
304	0.36
305	0.37
306	0.36
307	0.32
308	0.32
309	0.29
310	0.2
311	0.13
312	0.1
313	0.08
314	0.08
315	0.09
316	0.09
317	0.1
318	0.14
319	0.21
320	0.28
321	0.34
322	0.44
323	0.49
324	0.57
325	0.63
326	0.7
327	0.7
328	0.65
329	0.65
330	0.59
331	0.56
332	0.46
333	0.41
334	0.32
335	0.23
336	0.21
337	0.15
338	0.12
339	0.09
340	0.14
341	0.22
342	0.21
343	0.22
344	0.27
345	0.37
346	0.45
347	0.51
348	0.51
349	0.53
350	0.59
351	0.59
352	0.57
353	0.49
354	0.4
355	0.34
356	0.28
357	0.19
358	0.13
359	0.11
360	0.09
361	0.12
362	0.11
363	0.13
364	0.17
365	0.18
366	0.21
367	0.24
368	0.23
369	0.19
370	0.22
371	0.21
372	0.17
373	0.15
374	0.12
375	0.09
376	0.08
377	0.08
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.07
388	0.09
389	0.09
390	0.09
391	0.11
392	0.13
393	0.16
394	0.17
395	0.15
396	0.14
397	0.14
398	0.16
399	0.15
400	0.13
401	0.11
402	0.11
403	0.12
404	0.13
405	0.12
406	0.1
407	0.09
408	0.09
409	0.08
410	0.1
411	0.09
412	0.07
413	0.08
414	0.09
415	0.09
416	0.1
417	0.14
418	0.13
419	0.17
420	0.18
421	0.19
422	0.21
423	0.23
424	0.26
425	0.25
426	0.28
427	0.26
428	0.33
429	0.38
430	0.36
431	0.36
432	0.33
433	0.35
434	0.31
435	0.3
436	0.23
437	0.2
438	0.19
439	0.19
440	0.18
441	0.13
442	0.15
443	0.15
444	0.14
445	0.12
446	0.11
447	0.13
448	0.17
449	0.18
450	0.18
451	0.18
452	0.19
453	0.21
454	0.23
455	0.2
456	0.16
457	0.15
458	0.13
459	0.13
460	0.14
461	0.1
462	0.09
463	0.09
464	0.09
465	0.09
466	0.09
467	0.08
468	0.1
469	0.16
470	0.19
471	0.19
472	0.2
473	0.23
474	0.23
475	0.24
476	0.21
477	0.15
478	0.12
479	0.12
480	0.11
481	0.07
482	0.07
483	0.07
484	0.07
485	0.07
486	0.07
487	0.07
488	0.07
489	0.08
490	0.08
491	0.09
492	0.18
493	0.25
494	0.31
495	0.33
496	0.34
497	0.34
498	0.39
499	0.38
500	0.35
501	0.31
502	0.24
503	0.31
504	0.37
505	0.43
506	0.43
507	0.44
508	0.42
509	0.43
510	0.43
511	0.36
512	0.35
513	0.33
514	0.33
515	0.31
516	0.28
517	0.24
518	0.24
519	0.22
520	0.17
521	0.12
522	0.1
523	0.09
524	0.09
525	0.09
526	0.1
527	0.1
528	0.09
529	0.1
530	0.07
531	0.06
532	0.07
533	0.06
534	0.05
535	0.07
536	0.07
537	0.07
538	0.08
539	0.11
540	0.13
541	0.14
542	0.14
543	0.13
544	0.15
545	0.14
546	0.16
547	0.2
548	0.23
549	0.24
550	0.3
551	0.33
552	0.32
553	0.32
554	0.3
555	0.26
556	0.24
557	0.25
558	0.24
559	0.26
560	0.26
561	0.26
562	0.26
563	0.22
564	0.2
565	0.18
566	0.14
567	0.09
568	0.09
569	0.08
570	0.07
571	0.07
572	0.06
573	0.06
574	0.06
575	0.06
576	0.06
577	0.06
578	0.06
579	0.07
580	0.07
581	0.07
582	0.09
583	0.09
584	0.09
585	0.12
586	0.12
587	0.13
588	0.14
589	0.14
590	0.13
591	0.17
592	0.17
593	0.16
594	0.17
595	0.17
596	0.21
597	0.23
598	0.23
599	0.21
600	0.24
601	0.29
602	0.29
603	0.28
604	0.25
605	0.21
606	0.2
607	0.19
608	0.16
609	0.1
610	0.13
611	0.18
612	0.21
613	0.22
614	0.22
615	0.22
616	0.27
617	0.31
618	0.33
619	0.29
620	0.3
621	0.31
622	0.33
623	0.33
624	0.28
625	0.26
626	0.2
627	0.2
628	0.15
629	0.13
630	0.1
631	0.1
632	0.09
633	0.07
634	0.06
635	0.04
636	0.03
637	0.04
638	0.04
639	0.05
640	0.06
641	0.06
642	0.06
643	0.07
644	0.1
645	0.14
646	0.16
647	0.18
648	0.21
649	0.23
650	0.23
651	0.22
652	0.25
653	0.27
654	0.29
655	0.27
656	0.24
657	0.25
658	0.27
659	0.29
660	0.25
661	0.21
662	0.18
663	0.2
664	0.2
665	0.24
666	0.22
667	0.25
668	0.25
669	0.24
670	0.22
671	0.21
672	0.2
673	0.13
674	0.12
675	0.08
676	0.07
677	0.06
678	0.06
679	0.06
680	0.05
681	0.05
682	0.06
683	0.06
684	0.06
685	0.06
686	0.06
687	0.07
688	0.08
689	0.1
690	0.1
691	0.09
692	0.08
693	0.08
694	0.09
695	0.09
696	0.08
697	0.08
698	0.1
699	0.1
700	0.15
701	0.16
702	0.16
703	0.16
704	0.2
705	0.23
706	0.27
707	0.29
708	0.25
709	0.29
710	0.28
711	0.27
712	0.24
713	0.2
714	0.15
715	0.13
716	0.13
717	0.1
718	0.11
719	0.1
720	0.09
721	0.09
722	0.1
723	0.09
724	0.07
725	0.06
726	0.06
727	0.07
728	0.09
729	0.1
730	0.17
731	0.19
732	0.22
733	0.32
734	0.39
735	0.47
736	0.55
737	0.63
738	0.65
739	0.67
740	0.68
741	0.59
742	0.56
743	0.51
744	0.42
745	0.35
746	0.28
747	0.24
748	0.22
749	0.23
750	0.23
751	0.23
752	0.31
753	0.36
754	0.38
755	0.4
756	0.43
757	0.46
758	0.47
759	0.48
760	0.44
761	0.43
762	0.4
763	0.43
764	0.4
765	0.35
766	0.33
767	0.27
768	0.29
769	0.22
770	0.2
771	0.15
772	0.14
773	0.14
774	0.11
775	0.11
776	0.06
777	0.06
778	0.06
779	0.06
780	0.05
781	0.05
782	0.05
783	0.05
784	0.04
785	0.05
786	0.05
787	0.07
788	0.07
789	0.11
790	0.12
791	0.16
792	0.16
793	0.18
794	0.19
795	0.18
796	0.2
797	0.18
798	0.19
799	0.17
800	0.21
801	0.23
802	0.27
803	0.3
804	0.28
805	0.31
806	0.38
807	0.46
808	0.51
809	0.57
810	0.61
811	0.63
812	0.69
813	0.73
814	0.69
815	0.64
816	0.58
817	0.5
818	0.44
819	0.37
820	0.31
821	0.24
822	0.2
823	0.16
824	0.12
825	0.1
826	0.11
827	0.12
828	0.15
829	0.17
830	0.17
831	0.17
832	0.2
833	0.24
834	0.24
835	0.25
836	0.25
837	0.24
838	0.24
839	0.23
840	0.22
841	0.18
842	0.16
843	0.14
844	0.11
845	0.11
846	0.12
847	0.15
848	0.15
849	0.17
850	0.18
851	0.18
852	0.23
853	0.31
854	0.37
855	0.4
856	0.47
857	0.52
858	0.53
859	0.59
860	0.62
861	0.59
862	0.57
863	0.56
864	0.49
865	0.45
866	0.45
867	0.39
868	0.34
869	0.3
870	0.24
871	0.21
872	0.2
873	0.18
874	0.16
875	0.17
876	0.16
877	0.16
878	0.17
879	0.18
880	0.17
881	0.17
882	0.17
883	0.15
884	0.13
885	0.13
886	0.13
887	0.12
888	0.14
889	0.15
890	0.16
891	0.16
892	0.17
893	0.19
894	0.21
895	0.2
896	0.21
897	0.23
898	0.23
899	0.23
900	0.23
901	0.21
902	0.2
903	0.19
904	0.16
905	0.12
906	0.13
907	0.14
908	0.13
909	0.1
910	0.08
911	0.08
912	0.08
913	0.08
914	0.12
915	0.15
916	0.18
917	0.22
918	0.22
919	0.23
920	0.26
921	0.28
922	0.3
923	0.33
924	0.36
925	0.37
926	0.42
927	0.43
928	0.46
929	0.46
930	0.48
931	0.49
932	0.48
933	0.48
934	0.43
935	0.45
936	0.42
937	0.42
938	0.36
939	0.33
940	0.33
941	0.36
942	0.35
943	0.33
944	0.32
945	0.29
946	0.34
947	0.31
948	0.26
949	0.2
950	0.22
951	0.21
952	0.24
953	0.26
954	0.23
955	0.22
956	0.21
957	0.2
958	0.19
959	0.18
960	0.15
961	0.15
962	0.12
963	0.12
964	0.13
965	0.18
966	0.17
967	0.17
968	0.16
969	0.16
970	0.17
971	0.21
972	0.26
973	0.23
974	0.25
975	0.27
976	0.27
977	0.29
978	0.26
979	0.27
980	0.22
981	0.23
982	0.24
983	0.25
984	0.24
985	0.22
986	0.22
987	0.17
988	0.15
989	0.13
990	0.09
991	0.05
992	0.05
993	0.06
994	0.1
995	0.1
996	0.13
997	0.15
998	0.15
999	0.16
1000	0.19
1001	0.26
1002	0.24
1003	0.27
1004	0.29
1005	0.29
1006	0.28
1007	0.28
1008	0.27
1009	0.23
1010	0.22
1011	0.19
1012	0.15
1013	0.14
1014	0.17
1015	0.21
1016	0.24
1017	0.25
1018	0.28
1019	0.3
1020	0.35
1021	0.38

A0A550CY96

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer